要通过分子方法研究海洋环境中的微生物群落,重要的是要以足够的量和纯度提取DNA。样品中抑制剂的存在可能导致虚假的阴性结果或信息丢失,但可以通过实验中的过程控制来突出显示。我们比较了海洋样品上的七种细菌DNA提取方法:鱼皮,g和胆量,软体动物肉,浮游植物和浮游动物。在一半的样品中添加了一个过程控制(单核细胞增生李斯特菌)。比较了DNA提取方法的性能,以产生针对细菌TUF基因和过程控制Hlya基因的QPCR扩增的更纯和浓缩的DNA。通过分光光度法测定测定DNA的纯度和浓度。结果表明,使用PowerBiofilm和Purelink微生物组试剂盒获得了最高纯度和浓度DNA。QPCR数据证实了这些试剂盒以更高的扩增效率产生了更好的细菌DNA纯度和浓度。在某些样品中,通过靶向Hlya基因的QPCR检测到抑制剂的存在,表明样品是被抑制剂污染的异质性。DNA提取物适用于海洋环境中的遗传下游应用。
摘要:蜗牛养殖(Helicanture)在世界许多地方被认为是重要的农业部门,因为它在动物蛋白的生产中作用。然而,对蜗牛研究全球研究状况的整体图片进行了更少的研究。我们旨在根据使用RSTUDIO软件在1949年至2023年间发表的有关蜗牛研究的总共212篇研究文章进行文献评估。关于蜗牛研究的研究与年数(r 2 = 0.474; y = 0.1162x – 228.03)呈正相关,这表明该领域正在受到全球关注。在出版和引文数字方面,最有生产力的国家是美国,而出版物最多的组织是日本的九州大学。“ Snail/s”是最相关的主题的关键字,软体动物研究杂志是主要的学术来源,A,Staikou和Neiman M是蜗牛研究中最有影响力的作者。生产,繁殖,生长,生物柴油,腹足类和粮食安全是该领域最重要的关键字热点。这些发现可以帮助科学家和其他利益相关者更好地理解蜗牛研究的方向,这对于未来的调查和该领域的农业实践很有价值。关键词:文献计量学,腹足动物,旋转,rstudio,可视化分析简介
序言:包括牡蛎和贻贝在内的双壳类软体动物贝类(BMS)是过滤器喂食器,已知会从周围水中浓缩病原微生物。与过滤喂养BMS相比,帕鲁(Paua),基纳(Kina)和pupu(catseyes)等放牧贝类通常对人类健康风险较低。为了最大程度地减少商业种植或娱乐收获的贝类的消费人类疾病的风险,贝类安全性继续围绕两类旋转a)贝类生长的水质以及,b)b)收获和加工后的贝类的肉体条件。这两个类别都使用粪便指标的水平来最大程度地减少贝类消费人类健康疾病的风险。在烹饪前将肠道(Hua)从贝类中丢弃并进一步降低了风险1。商业贝类的标准是由多个市场标准驱动的,出口贝类需要遵守基于贝类肉体中大肠杆菌的标准(例如,在欧盟中),以及用于对生长区域进行分类(例如在美国的粪便)的标准[1]。用于贝类的休闲收获,指南仅指使用粪大肠菌群来确定水质的质量,并评估buct虫收获区域的粪便污染风险[2]。
红色列表评估者和审稿人,我们要感谢物种专家,包括IUCN物种生存委员会(SSC)的成员,他们通过在红色列表评估过程中充当评估者和/或审稿人来分享他们的知识。直接参与该项目的个人是:Neil Cumberlidge(Decapods); Eugidio Gobo,Geoffrey Kanyerere,Ad Konings,BélaNagy,Titus Phiri,Asilatu Shechonge,Jos Snoeks,Denis Tweddle,Brian Watters(Fishes);克里斯蒂安·阿尔布雷希特(Christian Albrecht),马丁·格纳(Martin Genner),德克·范·达姆(Dirk van Damme)(软体动物);查尔斯·克拉克(Charles Clarke),理查德·兰斯(Richard Lansdown),伊莎贝尔·拉里登(Isabel Larridon),扎卡里亚·马格博(Zacharia Magombo),格拉迪斯·姆瓦帕蒂拉(Gladys Mkwapatira),伊丽莎白·姆瓦富戈(Elizabeth Mwafongo),蒙特福德·姆万尼姆博(Montford Mwanyambo),马林·里弗斯(Malin Rivers)和彼得·威尔基(Peter Wilkie)(工厂)。特别要感谢上面列出的专家,他们还共同撰写了本报告的分类摘要章节。
基因组分化图景(即基因组中不同种群或物种之间差异的分布)越来越多地被描述,以了解自然选择和重组等微进化力量在导致和维持遗传分化方面所起的作用。这方面研究还表明,染色体结构变异是塑造适应性遗传变异图景的重要因素。由于染色体结构变异的普遍性及其固着性质所必需的强大局部适应压力,双壳类软体动物是探索染色体结构变异与局部适应之间关系的理想分类单元。在这里,我们报告了使用最近的染色体水平基因组组装对东北大西洋自然分布范围内的大扇贝 (Pecten maximus) 进行的种群基因组调查。我们报告了至少三个较大的(12 – 22 Mb)染色体倒位,这些染色体倒位与海面温度有关,其频率与中性种群结构形成对比。这些结果强调了重组抑制染色体倒位在局部适应中可能发挥的巨大作用,并提出了一个假设来解释在相对较小的空间尺度上在王扇贝种群中发现的生殖时间差异的维持。
摘要:纳米晶钙碳酸钙(CACO 3)和无定形可CACO 3(ACC)是越来越多的技术兴趣的材料。如今,它们主要是由稳定剂存在的Caco 3试剂湿反应产生的。 但是,最近发现可以通过计算机来产生ACC。 方解石和/或arogonite是由ACC前体形成的软体壳的矿物相。 在这里,我们调查了以潜在的工业规模转换的可能性,即从废物软体动物贝壳中转换为纳米晶体Caco 3和ACC的生物性可可3(BCC)。 使用了水产养殖物种的废物贝壳,即使用牡蛎(Crassostrea gigas,低毫克方解石),扇贝(Pecten jacobaeus,Medive-mg方解石)和蛤(Chamelea Gallina,Aragonite)。 通过使用不同的分散溶剂和潜在的ACC稳定剂来进行球铣削过程。 使用了结构,形态和光谱表征技术。 结果表明,机械化学过程产生了晶体域大小和ACC结构域的形成的降低,而ACC域的形成是在微覆盖骨料中共存的。 有趣的是,BCC的行为与地球CACO 3(GCC)的行为不同,在较长的铣削时间(24小时)时,ACC重新延伸为结晶阶段。 在机械化学处理的BCC的各种环境中的衰老产生了方解石和aragonite的混合物,以特异性的质量比,而GCC的ACC仅转化为方解石。 ■简介如今,它们主要是由稳定剂存在的Caco 3试剂湿反应产生的。但是,最近发现可以通过计算机来产生ACC。方解石和/或arogonite是由ACC前体形成的软体壳的矿物相。在这里,我们调查了以潜在的工业规模转换的可能性,即从废物软体动物贝壳中转换为纳米晶体Caco 3和ACC的生物性可可3(BCC)。使用了水产养殖物种的废物贝壳,即使用牡蛎(Crassostrea gigas,低毫克方解石),扇贝(Pecten jacobaeus,Medive-mg方解石)和蛤(Chamelea Gallina,Aragonite)。通过使用不同的分散溶剂和潜在的ACC稳定剂来进行球铣削过程。使用了结构,形态和光谱表征技术。结果表明,机械化学过程产生了晶体域大小和ACC结构域的形成的降低,而ACC域的形成是在微覆盖骨料中共存的。有趣的是,BCC的行为与地球CACO 3(GCC)的行为不同,在较长的铣削时间(24小时)时,ACC重新延伸为结晶阶段。在机械化学处理的BCC的各种环境中的衰老产生了方解石和aragonite的混合物,以特异性的质量比,而GCC的ACC仅转化为方解石。■简介总而言之,这项研究表明,BCC可以产生纳米晶CaCO 3和具有物种特异性特征的ACC复合材料或混合物。这些材料可以扩大从医学到材料科学的CACO 3的应用程序的广泛领域。
参考文献1。Shafique M,Khurshid M,Muzammil S,Arshad MI,Malik IR,Rasool MH等。穿越气候变化和一种健康的动态。环境科学欧元。2024; 36(1):135。 doi:10.1186/ s12302-024-00931-8。2。liao H,Lyon CJ,Ying B,Hu T.气候变化,其对新兴传染病的影响和应对挑战的新技术。新兴微生物感染。2024; 13(1):2356143。 doi:10.1080/22221751.2024.2356143。3。Turner WC,Kamath PL,Van Heerden H,Huang YH,Barandongo ZR,Bruce SA等。环境变化和寄生虫生存在毒力传播关系中的作用。r Soc Open Sci。2021; 8(6):210088。 doi:10.1098/rsos.210088。4。awad da,Masoud HA,Hamad A.气候变化和食物传播的病原体:对人类健康和缓解策略的影响。攀登变化。2024; 177(6):92。 doi:10.1007/s10584-024-03748-9。5。CisséG。低收入和中等收入国家的气候变化下的食物传播和水传播疾病:降低环境健康风险所需的进一步努力。acta trop。2019; 194:181-8。 doi:10.1016/j。 actatropica.2019.03.012。 6。 lópezUreñaNM,Chaudhry U,Calero Bernal R,Cano Alsua S,Messina D,Evangelista F等。 用弓形虫卵囊污染土壤,水,新鲜农产品和双壳类软体动物:系统评价。 微生物。 2022; 10(3):517。 doi:10.3390/微生物10030517。 7。 谁; 2021。2019; 194:181-8。 doi:10.1016/j。actatropica.2019.03.012。6。lópezUreñaNM,Chaudhry U,Calero Bernal R,Cano Alsua S,Messina D,Evangelista F等。用弓形虫卵囊污染土壤,水,新鲜农产品和双壳类软体动物:系统评价。微生物。2022; 10(3):517。 doi:10.3390/微生物10030517。7。谁; 2021。世界卫生组织(WHO)。气候变化和健康。可从:https://www.who.int/ news-room/fact-seats/delead/climate-change-change-and-Health。2024年12月17日访问。8。Neira M,Erguler K,Ahmady-Birgani H,Al-Hmoud ND,Fears R,Gogos C等。地中海东部和中东的气候变化和人类健康:文献综述,研究重点和政策建议。环境。2023; 216(PT 2):114537。 doi:10.1016/j.envres.2022.114537。9。Waha K,Krummenauer L,Adams S,Aich V,Baarsch F,Coumou D等。气候变化影响中东和北非地区(MENA)地区及其对脆弱人群群体的影响。reg Environ Change。2017; 17(6):1623-38。 doi:10.1007/s10113-017-1144-2。 10。 Garedaghi Y. 保护寄生虫对COVID-19和的保护2017; 17(6):1623-38。 doi:10.1007/s10113-017-1144-2。10。Garedaghi Y.保护寄生虫对COVID-19和
CRISPR 基因驱动可以通过加速限制野生种群中寄生虫传播的工程性状的传播,彻底改变传染病的控制。尽管淡水蜗牛作为寄生吸虫的宿主,每年导致 2 亿例血吸虫病,但软体动物的基因驱动技术却很少受到关注。蜗牛中成功的驱动必须克服自体受精,这是宿主蜗牛的一个共同特征,可以阻止驱动的传播。在这里,我们开发了一个新颖的群体遗传模型,该模型考虑了蜗牛的混合交配和种群动态、受多个等位基因调控的对寄生虫感染的易感性、基因型之间的适应度差异以及一系列驱动特征。我们将该模型与血吸虫病传播的流行病学模型相结合,以表明针对感染免疫的蜗牛种群改造驱动可能受到多种生物和生态因素的阻碍;然而,在一系列条件下,人类通过化疗实现的疾病减少可以通过驱动来维持。单独使用改变蜗牛免疫力的驱动可以在释放几年后显著减少人类疾病。这些结果表明,基因驱动与现有的公共卫生措施相协调,可能成为在选定的传播环境中通过有效的 CRISPR 构建体设计和对遗传和生态景观的评估来减少血吸虫病负担的有用工具。
CRISPR 基因驱动可以通过加速限制野生种群中寄生虫传播的工程性状的传播,彻底改变传染病的控制。尽管淡水蜗牛作为寄生吸虫的宿主,每年导致 2 亿例血吸虫病,但软体动物的基因驱动技术却很少受到关注。蜗牛中成功的驱动必须克服自体受精,这是宿主蜗牛的一个共同特征,可以阻止驱动的传播。在这里,我们开发了一个新颖的群体遗传模型,该模型考虑了蜗牛的混合交配和种群动态、受多个等位基因调控的对寄生虫感染的易感性、基因型之间的适应度差异以及一系列驱动特征。我们将该模型与血吸虫病传播的流行病学模型相结合,以表明针对感染免疫的蜗牛种群改造驱动可能受到多种生物和生态因素的阻碍;然而,在一系列条件下,人类通过化疗实现的疾病减少可以通过驱动来维持。单独使用改变蜗牛免疫力的驱动可以在释放几年后显著减少人类疾病。这些结果表明,基因驱动与现有的公共卫生措施相协调,可能成为在选定的传播环境中通过有效的 CRISPR 构建体设计和对遗传和生态景观的评估来减少血吸虫病负担的有用工具。
福建牡蛎(Crassostrea Angulate)是具有较高经济价值的重要海洋双壳类软体动物。基因功能研究和基因编辑技术在牡蛎中具有广泛的应用前景。群集的定期间隔短的短质体重复(CRISPR)/CRISPR相关蛋白9(CAS9)系统已广泛用于许多物种的基因组工程。CRISPR介导的基因编辑也通过微注射直接递送CRISPR/CAS9成分将CRISPR/CAS9成分直接递送到牡蛎胚胎中成功地用于了Paciifif的牡蛎。但是,与显微注射相关的低吞吐量和操作困难是限制CRISPR/CAS9在牡蛎中广泛应用的因素之一。在这项研究中,我们试图将CRISPR/CAS9系统传递到C.通过电穿孔的角度。在本研究中,将一个多合一的CRISPR/CAS9载体质粒用作CRISPR/CAS9系统。使用鸡蛋和胚芽幼虫进行电穿孔。电穿孔后大量幼虫变形或死亡。在电穿孔卵中发育的D-larvae中检测到单个碱基取代突变。我们的结果表明,CRISPR/CAS9系统可以传递到C的胚胎中,用于通过电穿孔进行基因编辑,该系统提供了参考,并将进一步有助于Mollusks中电穿孔的未来应用。