†这些作者同样贡献了 *对应:bennie.lemmens@ki.se摘要DNA复制对于生活至关重要,并确保了遗传信息的准确传播,这在癌症发育和化学疗法中受到了严重干扰。虽然DNA复制在时间和空间中受到严格控制,但缺乏可视化和量化3D人类细胞内复制动力学的方法。在这里,我们引入了3D空间测定,以进行复制动力学(3D Spark),这是一种实现DNA合成动力学的纳米级分析的方法。3D Spark与超分辨率显微镜相结合,以检测,分类和量化单细胞中的复制纳米结构。通过将免疫荧光技术与基于化学的新生DNA标记和荧光核苷酸衍生物转染的转染相结合,我们绘制了与已建立的复制蛋白,局部RNA-蛋白辅助蛋白或大型亚核域相关的多色DNA合成事件。我们证明了化学治疗,CDC6癌基因表达和染色质组织者RIF1的尺寸,相对丰度和空间排列的定量变化。3D Spark的灵活性,精度和模块化设计有助于弥合空间细胞生物学,基因组学和基于2D纤维的健康和疾病的复制研究。引言DNA复制是一个基本的生物学过程,对于细胞增殖,基因组稳定性和整体生物体健康至关重要。它确保每个细胞周期一次完全,准确地重复基因组,并遵循定义的时间和空间顺序,称为复制时序(RT)程序。该程序在脊椎动物物种中是高度保守的(Masai和Foiani,2017年),并引起在早期,中期和晚期S-相细胞中观察到的特征复制焦点模式
寡脱氧核苷酸的杂交特性已经以多种技术为特征(1-4)。在适当条件下,寡核苷酸与DNA中的特定位点杂交(4,5)。此外,可以将完美的碱基配对的核苷酸双链体与包含单个不匹配的碱基对(4-6)的复式区分开。我们利用寡核苷酸的杂交特性在开发一种分离特定克隆的DNA序列的方法中(5)。我们的一般方法是化学合成寡核苷酸的混合物,这些寡核苷酸代表给定蛋白的一小部分氨基酸序列的所有可能的密码子组合。在该混合物中必须是与蛋白质该部分编码的DNA相结合的一个序列。这种互补的寡核苷酸将与来自蛋白质的编码区域的DNA形成完美的基础复式,而混合物中的其他寡核苷酸将形成不匹配的双链体。在严格的杂交结合下,只有完美匹配的双链体将形成,从而允许将寡核苷酸的混合物用作特定的杂交探针。混合序列寡核苷酸探针应允许分离出已知氨基酸序列的任何蛋白质的克隆DNA序列。我们已将这种方法应用于人A2-微球蛋白(AM)的克隆cDNA序列的分离。AM是一种从尿液中分离出来的小蛋白(分子量11,800)。随后,发现A3〜m与主要组织相容性基因座的细胞表面抗原相关(8、9)。A2M的确切功能尚不清楚,尽管最近的证据表明该分子可以稳定辅助蛋白的三级结构(10)。氨基酸序列已从包括人类在内的四个物种中定位为F2M(11)。我们已经使用氨基酸序列来设计探针,以分离到人类2M的克隆cDNA。
背景虽然DES -γ-羧基凝血酶蛋白在肝细胞癌诊断中的诊断中的价值已被广泛认可,但是否可以将DES -γ-羧基辅助凝结蛋白用于复发评估,这在很大程度上仍未得到探索。方法我们进行了多中心回顾性分析,包括探索队列(1074例患者,5133例DES -γ-羧基辅助蛋白蛋白测量值)和验证组(263例患者,612例,612例DES -γ-γ-碳纤维蛋白测量值),以调查Des -γ-γ-碳辅助剂是否可以评估患者是否可以评估。我们引入了DES -γ-羧基凝血酶动态速率,作为DES -γ-羧基凝血酶动态变化的归一化定量测量。des-γ-羧基凝血酶蛋白动态率进一步应用于高风险的肝肝硬化患者队列(Precar coohort,542个肝肝硬化患者,2023 DES-γ-γ-羧基辅助凝固蛋白测量值)。在这里的结果,我们在勘探队列中显示了DES-γ-羧基凝血蛋白的术后减少,这使得诊断不适合诊断的DES-γ-γ-羧基凝血蛋白阈值,而DES-γ-γ-氨基辅助辅助型原抗凝血酶动态率有明显的重复依赖性。根据DES-γ-羧基凝血酶原动力率和最终浓度对患者进行分类,表明患者均表现出最佳的中值无复发生存率,并且患者的患者呈阳性,这两者都表现出最差的无复发生存期。与恢复为阴性的患者相比,始终如一的正状态患者的无复发生存率明显较低。 这些发现在验证队列中已验证。与恢复为阴性的患者相比,始终如一的正状态患者的无复发生存率明显较低。这些发现在验证队列中已验证。此外,prect precar群中的DES -γ-羧基凝血酶蛋白动态率可以识别出额外的28%的肝硬化患者,发展为肝细胞癌。结论这些结果扩展了肝细胞癌诊断生物标志物,DES -γ-羧基辅助凝血酶,通过提出对DES -γ -γ-碳二羧基凝血酶动力学的定量测量,以监测肝细胞脑脑瘤的复发,通过提议进行定量测量测量。这种测量不限于预后,还可以提高早期肝细胞癌筛查的敏感性。
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