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2024-student-project-booklet.pdf - 儿童癌症中心
原住民奖学金 STARS 学生奖学金 作为研究所对原住民儿童和家庭承诺的一部分，STARS 学生奖学金项目旨在帮助为下一代原住民研究人员奠定基础。成功获得该奖学金的人将获得一次性 30,000 澳元的资助，以资助和鼓励原住民和托雷斯海峡岛民学生在研究所的研究重点领域之一进行研究生学习。 SNAP-PY 原住民博士奖学金 Telethon Kids Institute 很高兴与澳大利亚和世界各地的医学研究机构、大学和多家医院合作，开展金黄色葡萄球菌领域最大的研究项目。该研究旨在为整个生命过程中金黄色葡萄球菌血流感染的最佳实践治疗提供信息，试验结果预计原住民儿童将减少离开乡村的时间，并改善因金黄色葡萄球菌血流感染引起的复杂骨骼、皮肤、肺和心脏感染的长期预后。原住民暑期奖学金根据学院的原住民就业和职业发展战略，Telethon Kids Institute 很高兴首次宣布为有兴趣在 11 月至 2 月大学假期期间获得研究经验的原住民本科生提供两个带薪暑期工作实习机会。
成功扩增了富含磷的DNA序列加上DNA聚合酶
图3。增加MGCL₂浓度对目标下90％的扩增的影响。富裕的s。金黄色葡萄球菌gDNA靶序列使用Phusion Plus Plus DNA聚合酶在Proflex PCR系统上进行扩增。每个20 µL反应含有10 ng的s。金黄色葡萄球菌和另外1 mm，1.5 mm，2 mm或2.5 mmmgcl₂。热循环条件：98°C的30秒；在98°C，最佳退火温度下10秒的10秒循环（表4），在64°C时为1分钟/kb；在64°C下5分钟。PCR产品以2％E-Gel 48含Sybr安全染色的琼脂糖凝胶运行。车道M：E-GEL 1 KB Plus Express DNA梯子。
细胞外囊泡和基因型特征在糖尿病足综合征患者病原菌群中临床金黄色葡萄球菌分离株抗生素耐药性形成中的作用
有研究表明，对抗大生物体免疫因素的防御是通过形成对革兰氏阳性菌有溶解作用的膜囊泡来实现的，而这反过来可能导致微生物产生抗生素耐药性。金黄色葡萄球菌 ( S. aureus ) 是引起糖尿病足综合征 (DFS) 的常见病原体。我们描述了抗生素耐药性以及溶解囊泡作为金黄色葡萄球菌分离株和金黄色葡萄球菌参考菌株培养物中抗生素耐药性的作用。此外，我们使用枯草芽孢杆菌 ( B. subtilis ) 来确定囊泡在 36 名不同年龄的缺血性和混合性 DFS 患者中的溶解作用。这项研究的结果是，我们发现膜囊泡具有溶解作用，在金黄色葡萄球菌参考菌株及其临床分离株的囊泡周围以及枯草芽孢杆菌参考菌株的囊泡周围均形成了溶解区。在编码对多种抗生素耐药性的基因中，16.7%的临床菌株检测到blaCTX-M-2基因，11.1%的菌株检测到Erm和Tet基因，5.5%的菌株检测到Mec-1基因，5.5%的菌株检测到VanA和VanB基因。5.5%的菌株还检测到了质粒介导的喹诺酮类药物耐药基因qnrB。同时，11.1%的金黄色葡萄球菌临床菌株检测到多重耐药。进一步的研究应分析所述基因对粘附和膜囊泡形成的贡献及其在DFS患者和其他来源的伤口和感染的伤口愈合发病机制中的意义。
针对细菌组氨酸激酶抑制剂的抗多药抗葡萄球菌感染
金黄色葡萄球菌是世界上最致命的病原体之一，这种生物体的抗性菌株的升高导致许多威胁生命的医疗状况。这种革兰氏阴性菌可能会引起一系列疾病，从轻微的皮肤感染到严重感染，例如毒性休克综合征或心内膜炎，并且在美国导致的死亡人数比任何其他耐药性病原体都要多。每年由于虫球菌感染而在美国每年在美国发生1,2个门诊和急诊室就诊和464 000次住院。3随着抗生素的使用正在上升，医院中多药的抗菌菌株正在出现，最值得注意的是耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌（MRSA），事实证明，传统抗生素的感染是徒劳的。
LMU-CSC奖学金候选人的开放位置
项目描述：人类微生物组从根本上与人类健康和疾病有关。一个方面是，病原体可以隐藏在健康人的微生物中，如果他们得到改变，可能会引起疾病。在这方面的一个主要例子是金黄色葡萄球菌。侵略性病原体在1/3人口的前鼻孔中定居，每年造成与感染相关的死亡> 1.000.000> 1.000.000。金黄色葡萄球菌形成的位移人类微生物组是防止感染的有前途的策略。我们对使金黄色葡萄球菌殖民某些人的个人的原因缺乏核心理解，但已知微生物组的组成很重要。在我们的实验室中，我们拥有代表健康和金黄色葡萄球菌感染的微生物组的广泛应变收集。我们评估无害微生物组成员与鉴定预防病原体定植的益生菌共生的病原体之间相互作用的分子机制。在这个项目中，我们将使用数百种鼻分离株，并使用自动化系统研究它们对病原体生长和生理的影响。将使用转座子突变库以及转录组和代谢组学方法来鉴定与金黄色葡萄球菌促进协作/竞争的遗传特征，然后研究分子和生化水平。最后，使用具有人源化微生物组的无菌动物模型在体内将在体内测试菌株的能力。鼻气质通过限制铁载体的可用性来减少金黄色葡萄球菌的增殖。（2021）。参考文献：1）Zhao，Y.，Bitzer，A.，Power，J.J.，Belikova，D.，Salazar，B.O。T.，Adolf，L。A.，Gerlach，D.L.，Krismer，B。，＆Heilbronner，S。（2024）。isme J. https://doi.org/10.1093/ismejo/wrae123 2）Heilbronner，S.，Krismer，B.，Brotz-Oesterhelt，H。，H。，＆Peschel，＆Peschel，A。细菌素的微生物组作用。nat rev microbiol。https://doi.org/10.1038/s41579-021-00569-W 3）Adolf，L。A.和Heilbronner，S。（2022）。 细菌物种之间的营养相互作用定植人类鼻腔：当前的知识和未来前景。 代谢物，12（6）。 https://doi.org/10.3390/metabo12060489https://doi.org/10.1038/s41579-021-00569-W 3）Adolf，L。A.和Heilbronner，S。（2022）。细菌物种之间的营养相互作用定植人类鼻腔：当前的知识和未来前景。代谢物，12（6）。https://doi.org/10.3390/metabo12060489
在计算机设计的金黄色葡萄球菌B细胞多雌性疫苗中没有引起针对靶抗原的抗体，提示多域方法
肺动脉高压（PAH）是一种复杂的多因素疾病，预后较差，其特征是肺循环的功能和结构改变，导致肺血管耐药性明显增加（PVR），最终导致心脏失败和死亡。编码骨形态发生蛋白受体2型（BMPR2）的基因中的突变，一种转化生长因子β（TGF-β）超家族的受体，占PAH家庭的70％以上，大约20％的零星病例。近年来，在其他基因中已经发现了较少或罕见的突变。本综述将考虑这些新发现的PAH基因如何有助于更好地理解肺血管完整性的维持的分子和细胞基础，以及它们在肺中动脉闭塞的PAH发病机理中的作用。我们还将讨论如何对这些新的PAH相关基因的遗传贡献的见解为目前无法治愈的心肺疾病打开新的治疗靶标。
技术公告ISO 22196AMGARD®
该测试涉及将特定数量的细菌引入抗菌治疗的塑料上，并在未经治疗的情况下引入塑料样品。两个塑料测试斑块均覆盖以防止蒸发并在95°F和90％的相对湿度（促进细菌生长的条件）24小时内孵育。在塑料表面孵育结束时，使用一系列稀释液和琼脂孵育和定殖对细菌进行计数。该结果据报道是在处理过的抗菌和未处理样品之间的细菌减少。使用金黄色葡萄球菌（金黄色葡萄球菌）和大肠杆菌（大肠杆菌）作为两种细菌分类（革兰氏阳性和革兰氏阴性）的代表的ISO标准参考，但也可以测试不同的微生物。
基于聚合物的双重药物递送系统用于氟喹诺酮类耐药金黄色葡萄球菌介导感染的靶向治疗
负载水凝胶显示出再上皮化事件，而负载 CIP 的水凝胶显示出与患病对照相似的感染事件。发现用负载 CIP 的水凝胶治疗的小鼠的感染率较高。在研究结束时测量了脾脏的重量，在感染对照组中观察到体重和长度的增加，这是由于感染期间发生的炎症。此外，在诱导之前和进行尸检之前对动物的体重进行了比较，发现感染对照组的动物体重减轻，而在治疗组中没有观察到由于感染清除而导致的体重减轻，如图 14 所示。本研究是探索和利用新型支架作为外排泵抑制剂和佐剂的开创性一步
开发了纳米孔测序策略，用于检测突变，在金黄色葡萄球菌菌株中赋予万古霉素中间耐药性
摘要金黄色葡萄球菌是菌血症和其他医院感染的主要原因。细胞壁活性抗生素万古霉素通常用于治疗耐甲氧西林（MRSA）和敏感（MSSA）感染。万古霉素中间的金黄色葡萄球菌（Visa）变体可以通过从头突变产生。在这里，我们进行了试点实验，以开发一种基于PCR/长阅读测序的合并的方法，用于检测先前已知的签证突变。引物旨在生成10个含量涵盖与签证表型相关的16个基因。我们对牛津纳米孔衔接子的读数长期读取，我们对据和and go骨流通量进行了测序。然后，我们通过映射读取读取的父母共识或已知参考序列，并比较称为变体与实验室选择中已知签证突变的数据库进行了比较。池中的每个扩增子被测序为高（。1,000）覆盖范围，并且在扩增子长度和覆盖范围之间未发现任何关系。我们还能够检测到因果突变（步行646c。g）在源自USA300菌株的签证突变体中（来自父母菌株N384的N384-3）。将突变体（N384-3）和父母（N384）DNA从0到1个突变体以不同的比例（N384）DNA表明平均次要等位基因频率（6.5％）的突变检测阈值在95％侧置（两个标准的差异高于平均突变频率高于平均值的频率））。该研究奠定了直接的金黄色葡萄球菌抗生素抗生素基因型基因型推断，并使用临床样品的快速纳米孔测序。
奥沙西林敏感性测试策略在改变MEC的情景中的作用A阳性金黄色葡萄球菌分离株（OS-MRSA）检测
葡萄球菌金黄色葡萄球菌菌株是MEC A和PBP2A阳性，但在表观上容易受到奥沙西林的影响，据世界各地的研究变得越来越丰富。 金黄色葡萄球菌（OS-MRSA）的奥沙西林易感性导致了由于常规易感性测试的错误识别而导致的治疗失败。 因此，当前研究的目的是确定位于印度南部迈索尔的三级护理机构中OSMRSA的普遍性。 395个从不同临床样本中收集的MRSA分离株被包括在基于实验室的前瞻性研究中。 这些分离株通过标准盘扩散测试在表型上使用oxacillin1μg椎间盘进行测试，并同时通过Vitek2系统确定MIC至Oxacillin。 此外，将MRSA特异性MEC A基因检测应用于这些分离株，以便在基因型上确认其MRSA状态。 PCR的发现表明65％的分离株是MRSA。 VITEK2系统检测到4.06％OS-MRSA分离株，奥沙西林MIC ≤2µg/ml。 椎间盘扩散方法总共确定了13.75％的分离株，因为阿氧林敏感和10％分离株是阿氧林敏感的。 使用VITEK2和DISC扩散技术显示了1.87％的MEC A阳性MRSA分离株的 oxacillin敏感性。 该分析发现较低的奥沙西林MIC分离株，但OS-MRSA发病率相对降低。 使用奥沙西林盘进行常规实验室MRSA检测可能有时会产生虚假的阴性结果，这可能导致抗生素给药和治疗失败不当。葡萄球菌金黄色葡萄球菌菌株是MEC A和PBP2A阳性，但在表观上容易受到奥沙西林的影响，据世界各地的研究变得越来越丰富。金黄色葡萄球菌（OS-MRSA）的奥沙西林易感性导致了由于常规易感性测试的错误识别而导致的治疗失败。因此，当前研究的目的是确定位于印度南部迈索尔的三级护理机构中OSMRSA的普遍性。395个从不同临床样本中收集的MRSA分离株被包括在基于实验室的前瞻性研究中。这些分离株通过标准盘扩散测试在表型上使用oxacillin1μg椎间盘进行测试，并同时通过Vitek2系统确定MIC至Oxacillin。此外，将MRSA特异性MEC A基因检测应用于这些分离株，以便在基因型上确认其MRSA状态。PCR的发现表明65％的分离株是MRSA。VITEK2系统检测到4.06％OS-MRSA分离株，奥沙西林MIC ≤2µg/ml。椎间盘扩散方法总共确定了13.75％的分离株，因为阿氧林敏感和10％分离株是阿氧林敏感的。oxacillin敏感性。该分析发现较低的奥沙西林MIC分离株，但OS-MRSA发病率相对降低。使用奥沙西林盘进行常规实验室MRSA检测可能有时会产生虚假的阴性结果，这可能导致抗生素给药和治疗失败不当。为了将OS-MRSA与MRSA区分开，结合表型和基因型技术至关重要。