血液感染(BSI)是由抗菌抗菌(AMR)革兰氏阴性菌(GNB)引起的,是发病率和死亡率的重要原因。第三代头孢菌素(3GC)多年来一直用作BSI和其他侵入性感染的经验治疗;但是,它们的过度使用可以促进扩展的光谱β-乳乳糖酶(ESBLS)的出现。 因此,这项研究旨在确定流行病学,临床和微生物学特征,以及抗菌耐药性对赞比亚卢萨卡一家推荐医院BSI结果的影响。 这是在赞比亚卢萨卡的一家转诊医院进行的六个月前瞻性研究。 作为常规诊断和患者护理的一部分,从发烧的患者中收集了细菌培养的血液样本,并使用Vitek 2紧凑型仪器进行了病原体鉴定和抗菌敏感性测试。 使用聚合酶链反应方法确定 ESBL和质粒介导的喹诺酮抗性(PMQR)相关基因。 使用结构化数据收集表收集患者信息,并在CSPRO 7.6中输入。 在Whonet和Stata版本14中分析了数据。 总共分离了88个GNB,其中76%为肠杆菌,14%的鲍曼尼杆菌和8%的铜绿假单胞菌。 对第三代和第四代头孢菌素的抵抗力分别为75%和32%。 值得注意的是,侵入性经验治疗,碳青霉烯耐药性(7%),多药耐药性(83%)和ESBL产生剂(76%)的高患病率(68%)。 与e相比。第三代头孢菌素(3GC)多年来一直用作BSI和其他侵入性感染的经验治疗;但是,它们的过度使用可以促进扩展的光谱β-乳乳糖酶(ESBLS)的出现。因此,这项研究旨在确定流行病学,临床和微生物学特征,以及抗菌耐药性对赞比亚卢萨卡一家推荐医院BSI结果的影响。这是在赞比亚卢萨卡的一家转诊医院进行的六个月前瞻性研究。作为常规诊断和患者护理的一部分,从发烧的患者中收集了细菌培养的血液样本,并使用Vitek 2紧凑型仪器进行了病原体鉴定和抗菌敏感性测试。使用聚合酶链反应方法确定 ESBL和质粒介导的喹诺酮抗性(PMQR)相关基因。使用结构化数据收集表收集患者信息,并在CSPRO 7.6中输入。在Whonet和Stata版本14中分析了数据。总共分离了88个GNB,其中76%为肠杆菌,14%的鲍曼尼杆菌和8%的铜绿假单胞菌。对第三代和第四代头孢菌素的抵抗力分别为75%和32%。值得注意的是,侵入性经验治疗,碳青霉烯耐药性(7%),多药耐药性(83%)和ESBL产生剂(76%)的高患病率(68%)。与e相比。大肠杆菌是BSI的病因,感染鲍曼尼杆菌(OR = 3.8)的患者的死亡几率明显更高。在接受3GC的患者中,死亡的几率也更高。
o生牛奶可以被多种微生物污染(Ledenbach和Marshall,2009年)。挤奶后,乳酸细菌(包括乳酸菌,乳酸杆菌,白细胞杆菌,肠球菌和链球菌)立即在牛奶中发现(Wouters等,2002,Machado等,2017,2017,Fusco等,2020)。这些生物中的许多生物在发酵乳制品中起重要的功能作用(Wouters等,2002),但如果不保留牛奶,这些生物可能会导致牛奶中的损坏。一旦牛奶被冷却和冷藏,精神营养的生长(包括芽孢杆菌,微球菌,假单胞菌,动物杆菌,气球杆菌等)受到青睐,并且它们成为存在的主要微生物(Muir,2011,Quigly,2011,Quigley,2011,Quigley et al.,2013年,2013年,YAA)。o最近的一项评论指出,生奶的菌群主要由革兰氏阴性菌(Pseudomonas,serratia,serratia,eeromonas和entobacter)和革兰氏阳性孢子形成剂组成,芽孢杆菌(Bacillus,bacillus,aneurinibacillus,brevibaCillus,brevibacillus and geobacacilus and geobacIllus and GeobacIllus and Geobacillus and divebaCillus al al ail ail ail al o Another review comments that “Storage of raw milk at refrigerator temperature for several days can lead to growth of psychrotrophic species of several bacterial genera: Aerococcus , Bacillus , Lactobacillus , Leuconostoc , Microbacterium , Micrococcus , Propionibacterium , Proteus , Pseudomonas , Streptococcus , coliforms, and others (Erkmen and Bozoglu,2016年)。 o“生牛奶中形成的孢子细菌主要是芽孢杆菌属。 (例如B. cereus,B。licheniformis,B。megaterium和B. uttilis)。 梭状芽胞杆菌。 在低水平的生牛奶中存在。o Another review comments that “Storage of raw milk at refrigerator temperature for several days can lead to growth of psychrotrophic species of several bacterial genera: Aerococcus , Bacillus , Lactobacillus , Leuconostoc , Microbacterium , Micrococcus , Propionibacterium , Proteus , Pseudomonas , Streptococcus , coliforms, and others (Erkmen and Bozoglu,2016年)。o“生牛奶中形成的孢子细菌主要是芽孢杆菌属。(例如B. cereus,B。licheniformis,B。megaterium和B. uttilis)。梭状芽胞杆菌。在低水平的生牛奶中存在。o “A wide variety of genera including Gram-negative genera ( Pseudomonas, Aeromonas, Alcaligenes, Acromobactor Acinetobacter, Flavobacterium, Chryseobacterium, Enterobacteriaceae such as Serratia, Hafnia, Klebsiella, Enterobacter and Rahnella ) and Gram-positive genera ( Bacillus,在生乳中经常发现梭状芽孢杆菌,小杆菌,微球菌,葡萄球菌,微区,乳酸菌和乳酸杆菌)(Vithanage等,2016)。生牛奶中孢子形成细菌的种群季节性变化。芽孢杆菌和梭状芽孢杆菌。在冬季收集的原始牛奶中的水平高于夏季,因为在冬季,奶牛躺在孢子污染的床上用品材料上,并消耗含孢子的青贮饲料”(Erkmen and Bozoglu,2016年)。o假单胞菌属。被认为是牛奶变质的最常见原因(Quigley等,2013)。serratia liquefaciens也可以在生乳中造成变质(Bagliniere等,2017)。o由于乳糖是牛奶中的主要碳水化合物,因此可以水解乳糖的微生物(具有乳糖酶或β-半乳糖苷酶等酶的生物)比无法(Erkmen and Bozoglu,2016年)具有优势。
第 1 部分:概述 百日咳是由革兰氏阴性菌百日咳杆菌引起的急性呼吸道疾病。疾病表现的严重程度取决于年龄、既往感染和疫苗接种状况,未接种疫苗的婴儿病情最为严重。其典型表现是痉挛性咳嗽,伴有咳嗽后呕吐、吸气性哮鸣和发绀。白喉、破伤风和全细胞百日咳 (wP) 疫苗于 20 世纪 40 年代至 50 年代在一些国家开发和推出。目前,根据世界卫生组织 (WHO, 2015b;WHO, 2019) 的数据,全球百日咳疫苗覆盖率约为 86%。全球约 64% 的国家使用 wP 疫苗,占 WHO 东南亚区域的所有国家和非洲区域的 96% (WHO, 2015a)。在高收入国家,由于对无细胞百日咳 (aP) 疫苗的反应原性的担忧,该疫苗取代了 wP 疫苗。尽管疫苗几乎覆盖全民婴儿,但在这些国家推出 aP 疫苗后,报告的百日咳发病率却稳步上升。美国的上市后效果数据证实了 DTaP 疫苗在相对较短的时间内预防百日咳的上市前效果估计。但是,国家百日咳监测数据和上市后效果研究结果显示,在接种第五剂 DTaP 疫苗后,疫苗效果每年都在逐渐下降( Misegades 等人,2010 年;Klein 等人,2012 年;Tartof 等人,2013 年),并表明在青少年期接种 Tdap 疫苗后,保护作用相对较早地减弱。 2013 年 3 月 6 日,来自学术界、政府机构和制药公司的百日咳专家在马里兰州贝塞斯达举行了百日咳工作组会议 ( Burns 等人,2014 )。工作组确定了百日咳报告增多的潜在原因,包括 (1) 免疫后获得性免疫力短暂,(2) 免疫反应不平衡(例如,偏向 T 辅助细胞 2 [Th2] 反应),(3) 需要额外的疫苗抗原才能获得最佳保护,(4) 抗原数量不足或平衡不正确,(5) 抗原与流行菌株不匹配,(6) 时间表或人群覆盖率不理想,(7) 目前使用的疫苗效果不同,以及 (8) 认识提高、诊断方法更好和/或报告更完整。工作组的共识是,需要长期解决方案来从根本上改变百日咳流行病学,并且最佳疫苗将提供长期保护,预防疾病和传播。为改善百日咳控制而确定的潜在策略包括改变已获许可的联合疫苗的接种时间表,开发无细胞百日咳 (aP) 疫苗以增加剂量,以及开发可能提供更持久保护并减少传播的新疫苗。引入新百日咳疫苗的一个重大挑战在于证明有效性的实质性证据,因为由于百日咳疾病的不可预测和零星发生以及所需的样本量大,前瞻性临床终点疗效研究可能不可行。因此,可能需要采用替代方法来提供新百日咳疫苗有效性的实质性证据。这种方法的一个组成部分可能是使用百日咳控制人类感染模型 (CHIM)。本次 VRBPAC 会议的目的是
微生物学基础:临床方法 - 第三版 由 Johana Meléndez 教授等编写 医学微生物学简介,作者:Andrew Dodgson 博士 本书是了解医学微生物学的综合资源,涵盖了基本概念和临床方法。 关键概念包括: - 研究导致人类疾病的微生物(病毒、细菌、真菌和寄生虫) - 正常菌群:人体皮肤和粘膜上有益微生物的存在 - 污染:培养物中存在在采集样本时不存在的生物 - 定植:生物在某个部位存在但没有引起疾病或症状 - 感染:生物侵入身体部位、繁殖并引起组织反应、症状或疾病 将生物分类为界、门、属、种对于理解医学微生物学也至关重要。其中包括: - 病毒:体型小,无法独立复制,难以治疗(例如流感、艾滋病毒/艾滋病) - 细菌:能够独立复制,导致医院中见到的大多数感染,并用抗生素治疗 - 真菌:复杂、大型生物,也会导致疾病(例如肺炎、尿路感染) 了解这些概念对于医疗保健专业人员有效地诊断、预防和治疗感染至关重要。 细菌可分为真菌和霉菌,导致一系列疾病,例如鹅口疮、足癣、侵袭性和过敏性曲霉病。许多疾病都是机会性的。 对细菌进行分类至关重要,因为不同类型的细菌会导致不同的疾病,并且对抗生素有不同的反应。为了对细菌进行分类,我们根据它们的微观外观对它们进行分组,然后根据生化反应等特性进一步将它们分为不同种类。 革兰氏染色法通过使用结晶紫和其他化学物质对载玻片进行染色来帮助区分细菌。这种方法可以确定细菌是革兰氏阳性还是革兰氏阴性,这会影响其抗生素耐药性。革兰氏染色还提供有关细菌细胞壁形状的信息,将它们分为四个主要类别:G+ 杆菌、G+ 球菌、G- 杆菌和 G- 球菌。这种初步鉴定对于诊断疾病和选择适当的抗生素很有用。 微生物学是研究微生物(包括细菌、病毒、真菌和其他微观生命形式)的科学分支。医学微生物学领域专门研究人类传染病的原因和影响。 微生物分类 ----------------------------- 微生物分为几类: * **原生生物**:包括原生动物等单细胞生物的群体。 * **病毒**:此类包括病毒,它们是可导致人类传染病的非细胞生命系统。 * **DNA 病毒和 RNA 病毒**:病毒类别的子类别,以其遗传物质(DNA 或 RNA)区分。 * **真核生物**:包括单细胞真核生物(如藻类和原生动物)的群体。 * **原核生物**:此类别包括细菌,即没有细胞核的原核细胞。 * **真菌**:一类微生物,包括对人类有致病性的真菌。 * **蓝藻**:蓝藻的一个子类别。 * **藻类**:一组光合真核生物。 * **细菌**:此类包括革兰氏阴性细菌,其具有特征性的细胞壁结构,由外膜和含有胞壁酸的薄内肽聚糖层组成。 * **原生动物**:原生生物的一个子类别,包括对人类有致病性的单细胞动物生物。细菌类内的分类 --------------------------- -- 细菌类进一步分为三个亚类: 1. **暗细菌**:此类细菌的细胞壁为革兰氏阴性,由外膜和含有胞壁酸的薄内肽聚糖层组成。 2. **无氧光合细菌和有氧光合细菌**:暗细菌亚类的子类别。 微生物命名法 ------------------------------ 在微生物学中,使用二名法来识别物种。该系统为每种物种分配一个通用名称和一个特定名称。例如,*炭疽芽孢杆菌* 和 *破伤风梭菌* 分别是炭疽杆菌和破伤风杆菌的科学名称。 细菌的大小 ------------------ 细菌的大小通常以微米 (μm) 或毫米 (mm) 为单位。大多数致病菌的尺寸在 0.1 到 10 μm 之间。用于测量微生物的其他单位包括纳米和埃。 细菌的形态 ------------------------- 细菌是通过二分裂繁殖的原核细胞,二分裂是一种无性繁殖,细胞分成两个相同的子细胞。它们同时具有 DNA 和 RNA,可根据形状进行分类: 1. **球形(球菌)**:此类细菌呈球形。 2. **杆状(细菌、杆菌和梭菌)**:细菌类的子类别,包括长度不一的杆状体。 3. **螺旋形(弧菌、螺旋体、螺旋体)**:杆状细菌的一个子类别。 淋病奈瑟菌的电子显微照片 ---------------------------------------------- 电子显微照片是使用电子显微镜拍摄的高分辨率图像。这张显微照片显示的是*淋病奈瑟菌*的形态,它是一种导致淋病的致病菌。杆状细菌的排列 -------------------------------------- 杆状细菌可以排列成不同的形状,包括: 1. **单杆**:单个杆状细菌。 2. **链杆菌**:一种具有特征形状的杆状细菌。螺旋形式 ---------- ---- 弧菌是一种螺旋状的细菌,外观类似逗号。细菌有各种形式,包括霍乱弧菌和螺旋体,它们都是盘绕的形状。致病菌种如小螺旋体会导致鼠咬热,而幽门螺杆菌会导致胃溃疡。螺旋体是一类细菌,包括密螺旋体、钩端螺旋体和伯氏疏螺旋体,其特征是细胞薄而柔韧,有规则的扭曲。细胞壁对于细菌的刚性和渗透保护至关重要,由革兰氏阳性菌中的肽聚糖组成。所讨论的细菌不能运动,也没有荚膜,属于革兰氏阴性。它们对各种抗生素高度敏感,需要活细胞才能在其中繁殖。从形态上看,这些立克次体与某些细菌有相似之处,具有包围原生质物质和致密颗粒的限制膜。另一方面,衣原体也是革兰氏阴性菌,缺乏必要的能量产生机制,因此是细胞内寄生虫。它们表现出两种不同的形态:原生体和初始体。实验室诊断采用多种方法:1. 细菌镜检 2. 常规细菌学检测 3. 抗生素敏感性检测,以检测细菌对药物的反应 4. 血清学评估抗体存在 5. 生物技术,用于识别特定的生物过程 6. DNA 技术检测,如 PCR(聚合酶链反应),可检测各种生物体的 DNA 或 RNA,例如 HIV。血清学评估抗体的存在 5. 用于识别特定生物过程的生物技术 6. DNA 技术测试,如 PCR(聚合酶链反应),可检测来自各种生物体(例如 HIV)的 DNA 或 RNA。血清学评估抗体的存在 5. 用于识别特定生物过程的生物技术 6. DNA 技术测试,如 PCR(聚合酶链反应),可检测来自各种生物体(例如 HIV)的 DNA 或 RNA。