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World File Search System鞭毛
寄生虫生存与宿主免疫之间的战争拖船
寄生疾病在热带和亚热带国家造成重大伤害，导致死亡率，发病率和社会经济差异。感染的结果和疾病的严重程度通常取决于寄生虫生存策略与宿主免疫反应之间的相互作用。强大而有效的宿主免疫反应可以限制寄生虫的复制，降低疾病的严重程度并促进康复。相反，如果寄生虫可以逃避或抑制免疫反应，则感染可能会持续并导致慢性或严重疾病。有时，宿主免疫反应本身可以通过寄生虫感染引发的过度或失调的免疫反应会导致疾病病理，从而导致组织损伤，炎症和免疫介导的疾病。寄生虫和宿主免疫之间的这场战争是由协同进化动力学驱动的。寄生虫不断适应托管免疫反应，然后托管又制定了应对寄生虫逃避策略的新策略。这种共同进化过程可以导致具有增强的免疫逃避能力（从而促进耐药性）和宿主遗传变异的新寄生虫菌株的出现，从而赋予耐药性或对特定寄生虫的敏感性。因此，了解这场正在进行的战斗中涉及的复杂机制和动态对于开发更有效的方法来管理和打击寄生疾病至关重要。它涉及研究寄生虫采用的机制，以逃避免疫检测和开发可以增强宿主免疫反应的干预措施。Nguyen等人的研究论文。此外，探索宿主对寄生虫感染的遗传因素的遗传因素可以帮助识别较高风险的人并为有针对性的预防或治疗方法提供信息。该研究主题旨在为我们的理解 - 寄生虫相互作用做出贡献，从而导致寄生虫学领域的进步和人类健康的改善。它包括四个原始研究文章和一篇评论文章，重点介绍锥虫病，利什曼病，疟疾，贾第鞭毛病毒（原生动物感染）和血吸虫病（蠕虫感染）。重点是由细胞外原生动物寄生虫锥虫埃文西（Trypanosoma evansi）引起的感染，该寄生虫在牲畜和游戏动物中导致致命的慢性浪费疾病。这项研究已建立了一个实验疾病模型
基因组报告示例
基因组坐标位置渗透载体表型基因覆盖g.8003996666delc（Chr17，grch38）外显子3高3个高note note note note note note note note 15倍变体解释：p.ala83valfsx84在CCDC40中的p.ala83valfsx84变异，先前在19个雄性和7型杂质的helel helesozygous and pc n hymozygous and pc contia和7 compio and syzygous and；在1个纯合受影响的亲戚中与疾病隔离（Becker-Heck 2011 PMID：21131974，Nakhleh 2012 PMID：22499950，Antony 2013 PMID：23255504，Zariwala，2013 PMID：23891469）。该变体已在gnomad（http://gnomad.broadinstitute.org）中鉴定出0.074％（860/1167354）的非欧洲欧洲染色体。但是，此频率足够低，可以与隐性等位基因频率保持一致。在Clinvar中也报道了这种变体（变体ID 31069）。该变体被预测会引起移架，从而改变蛋白质的氨基酸序列，从位置83开始，并导致下游的过早终止密码子84氨基酸。然后预测这种改变会导致截短或不存在的蛋白质。功能研究表明，CCDC40功能的丧失导致纤毛结构和运动异常（Becker-Heck 2011 PMID：21131974）。总而言之，该变体符合标准，该标准被归类为常染色体隐性原发性睫状运动障碍的致病性。ACMG/AMP标准应用：PVS1，PM3_VERYSTRONG，PM2_SUPPORTING，PP1。疾病信息：原发性睫状运动障碍是一种罕见的遗传病，在遗传上是异质的。它与复发性呼吸道感染，内脏异常定位以及不育有关。这是由于器官和组织衬里发现的纤毛和鞭毛的运动性异常。呼吸道感染，粘液清除率降低，鼻塞和慢性咳嗽始于幼儿，可能导致支气管扩张。Situs Inversus Totalis是所有内脏器官的镜像逆转，在40-50％的个体中发现。雌性运动障碍的雄性由于精子运动异常而经常是不育的，而患有这种疾病的女性有时可能是由于输卵管中的纤毛异常引起的。其他症状可能包括大脑中的复发性耳朵感染和脑积水。Pathogenic variants in CCDC40 contribute to 3-4% of primary ciliary dyskinesia (Medline Plus: https://medlineplus.gov/genetics/condition/primary-ciliary-dyskinesia, GeneReviews: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1122).家族性和生殖风险疾病患病率（估计）载体频率（估计）生殖风险（估计）1/16000（https://medlineplus.gov/genetics/conditics/condition/primary-ciliary-ciliary-ciliary-dyskinesia）
PUCAT-2024的教学大纲
生物的生物学多样性：生命世界什么是生物？生物多样性；需要分类；生命的三个领域；物种和分类层次结构的概念；二项式命名法。生物分类五个王国分类； Monera，Protista和Fungi分为主要群体的显着特征和分类；地衣，病毒和病毒。植物王国的显着特征和植物分为主要群体 - 藻类，苔藓植物，pteridophyta和Gymnospermae。（显着和区分特征以及每个类别的一些示例）。动物界的显着特征和动物的分类，直接到门水平的非配合物以及弦弦到班级水平（显着特征和区分每个类别示例的特征）。（不应显示活动物或标本。）动物和植物中的结构组织：花序和花朵的开花植物形态的形态，01家族的描述：茄科或莉莉亚科（与实践课程的相关实验一起处理）。动物组织中的结构组织。细胞：结构和功能细胞 - 生命细胞理论和细胞的单位，作为生命的基本单位，原核和真核细胞的结构；植物细胞和动物细胞；细胞包膜；细胞膜，细胞壁；细胞细胞器 - 结构和功能；内膜系统，内质网，高尔基体，溶酶体，液泡，线粒体，核糖体，质体，微生物；细胞骨架，纤毛，鞭毛，中心菌（超微结构和功能）；核。生物分子活细胞的化学成分：蛋白质，碳水化合物，脂质，核酸的生物分子，结构和功能；酶类型，性质，酶作用。单元格：结构和功能；细胞周期和细胞分裂细胞周期，有丝分裂，减数分裂及其意义。植物生理学的光合作用在高等植物的光合作用中，作为自养营养的一种手段；光合作用的位点，参与光合作用的颜料（基本思想）；光合作用的光化学和生物合成阶段；循环和非循环的辐射磷酸化；化学含量假设；光振动; C3和C4途径；影响光合作用的因素。植物中气体交换的呼吸；细胞呼吸 - 糖酵解，发酵（厌氧），TCA循环和电子传输系统（有氧）；能量关系 - 产生的ATP分子的数量；两性途径；呼吸商。植物 - 生长和发育生长调节剂 - 生长素，吉布素，细胞分裂素，乙烯，ABA。人类生理学呼吸和交换动物中气体的气体呼吸器官（仅回想）；人类的呼吸系统；呼吸机制及其在人类中的调节 - 气体的交换，气体的运输和呼吸的调节，呼吸体积；与呼吸有关的疾病 - 哮喘，肺气肿，职业呼吸系统疾病。体液和血液的循环组成，血液组，血液凝结；淋巴的组成及其功能；人类循环系统 - 人心脏和血管的结构；心脏周期，心输出量，心电图；双循环；心脏活动的调节；
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4。地衣：-4.1类型； 4.2繁殖； 4.3经济重要性。4.4地衣在植物继承和污染监测中的作用。5。经济和药用重要性：-5.1蘑菇 - 印度属品种的食品价值和二项式 - agaricus，calocybe，pleurotus和volvariella; 5.2真菌来源和用途 - SCP，贝克酵母，乙醇，柠檬酸，色氨酸， - 淀粉酶，核黄素，Griseofulvin，nystatin和Cyclosporin; 5.3医学真菌学 - 结局的定义；在菌丝中用作“环虫”或滴虫病和念珠菌病的因果生物和抗生素。微生物学1。微生物和微生物学研究 - 主要概念； 1.1原核生物（原核生物）和真核生物的微生物和王国的分类（G. E. Murray 1968＆R。H. Whittaker 1969）[初步想法]； 1.2现代分类，签名密码子，三个领域的分类概念（Carl R. Woese 1978）和通用系统发育树的概念（Norman R. Pace 1997）[仅基本概念]。2。古细菌：-2.1特征（简短概述）； 2.2细胞壁； 2.3发生。3。4。病毒：-4.1病毒和植物病毒的类型； 4.2植物病毒的传播； 4.3 TMV - 理化特征及其繁殖模式； 4.4 T 4噬菌体 - 结构，感染和裂解周期； 4.5 lambda（）噬菌体 - 溶酶体的机制和意义； 4.6病毒和王室。5。细菌：-3.1一般特征； 3.2细菌生长 - 二进制裂变，指数生长和生长曲线（具有单个碳源的封闭系统中的一般模式 - 单相）3.3化学本质，糖卵形，粘液层，果皮层，鞭毛，pili，pili和fimbriae的化学性质，超结构和功能； 3.4细胞壁 - 革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌之间的化学性质和差异； 3.5细菌基因组和质粒； 3.6遗传重组 - 转化[DNA摄取的一般过程，自然和诱导的能力和机制]，结合['F'因子，F +和HFR男性以及染色体动员]和转导[一般概念和适用性]； 3.7细菌多样性 - 以下组的一般概念和系统位置： - 光合细菌（蓝绿色，紫色和绿色细菌，氧合和氧合群的概念），衣原体，氮固定细菌（符号和非肌生物）（符号和非肌生元），结实和结构细菌，又有细菌，又有元素，且异常，且群体，以及构成的，构成的，构成的，构成的，构成的，构成的，以及构造的群体，及其群体和群体，构造和群体及其群体，放线菌科。应用细菌学：-5.1来源（仅名称）和用途 - 杆菌蛋白，新霉素，链霉素，氯霉素，两性霉素B，淀粉酶，纤维酶，纤维素酶，蛋白酶，赖氨酸，赖氨酸和右旋烷； 5.2生物肥料，生物气体和生物农药的生产中使用的细菌（仅）； 5.3霍乱，细菌痢疾，伤寒，白喉，结核病，结核病，瘟疫和肺炎的因果生物（只有名称）。
Milady 美容学 第 5 章 pdf
微生物世界，也称为病菌或微生物。这些微小的单细胞生物可以是细菌、病毒、真菌，甚至是寄生虫。让我们深入了解这些微观奇迹的一些关键事实。首先，你知道细菌有不同的类型吗？例如，引起疾病的细菌被称为致病细菌，而以死亡物质为生的细菌被称为腐生细菌。还有螺旋菌，如导致梅毒的白纹螺旋体。现在，让我们谈谈细菌的一般情况。你知道它们可以分为不同的形状和大小吗？例如，一些细菌呈球形，而另一些呈螺旋形或棒状。但这些微小的生物到底能做什么？首先，它们可以引起植物和动物的各种疾病。事实上，2000 年，一种通常无害的细菌偶发分枝杆菌导致 100 多名修脚客户感染！你知道吗，有些细菌会利用被称为鞭毛的细小毛发状延伸物来移动？它们就像拥有自己的个人推进系统一样！现在，让我们来谈谈这些微生物是如何繁殖的。你知道有丝分裂是细菌分裂和生长的过程吗？但是当细菌感染我们时会发生什么？那么，你知道它会引起各种症状吗？从发烧到充满脓液的脓肿？如果不及时治疗，一些细菌感染甚至会危及生命。现在，让我们换个话题，谈谈病毒。你知道它们是由遗传物质组成的微小颗粒，周围有一层蛋白质外壳吗？你知道吗，病毒会导致各种疾病，从普通感冒到艾滋病毒/艾滋病？更可怕的是，有些病毒无法治愈，只能控制。但别担心，有办法防止这些微生物对我们造成伤害。你知道吗，避免生病的方法之一是经常洗手？您是否知道，消毒剂的效力太强，不适合日常使用，只能在医院环境中使用？更重要的是，确保您使用的任何消毒剂都经过州卫生部门的批准。总之，微生物可能很小，但在引起疾病方面却威力巨大。所以，让我们控制自己的健康，学习如何避免感染！为了达到医院标准，消毒剂必须杀死假单胞菌、细菌、真菌以及结核病或 HIV/HBV。OSHA 要求在沙龙服务期间，任何与客户接触的工具都必须有效杀死这些微生物。为了有效，超声波浴缸清洁器必须与适当的消毒剂一起使用。使用苯酚消毒时，浸泡 10-15 分钟就足够了。但是，要求医院级消毒的州禁止使用次氯酸钠溶液对器具进行消毒。器具应存放在消毒过的容器中，以保持清洁并防止交叉污染。混合消毒剂时务必遵循制造商的说明，因为不正确的比例可能会导致无效或潜在的有害后果。使用后，应使用消毒液清洗器具，然后再存放。足部水疗需要使用 EPA 注册的杀菌、杀真菌、杀病毒（在某些州是杀结核病）消毒剂。还建议使用放置过夜的 5% 漂白剂溶液进行足部水疗消毒。如果发生血液溢出，必须将棉球或湿巾装入双层袋子中再丢弃。疾病控制和预防中心发布的感染控制指南规定了处理客户接触工具的严格协议，以防止疾病传播。每次服务前后用肥皂正确洗手对于保持清洁的沙龙环境至关重要。
动物和植物生物学
课程计划 - 化学和生活。原子，分子和键。<分为分子间力。极性。生物学兴趣的主要化合物：水，氨基酸，碳水化合物，脂质和蛋白质。结构和功能原理。- 单元格。突发性和真核细胞，质膜的特性和功能，渗透，主动转运，被动运输，质子泵，胞吞作用和内吞作用。核心，细胞骨架（微管，微丝，中间细丝），Centrioli，睫毛，鞭毛。<动物细胞和植物细胞之间的DIVA比较。植物细胞：细胞壁；细胞壁的成分；细胞壁的层，细胞壁的生长； plasmodesmi。质体：先知；白细胞。 ezioplasti;染色体；叶绿体。液泡。- 细胞的能量交换。热力学和动力学的基本原理。ATP结构和功能。 线粒体和叶绿体的作用。 发酵。 有氧方法：克雷布斯循环，电子传输链。 植物细胞：光合作用：发光阶段，色素，光系统的作用；黑暗阶段。 光官。 C4光合作用和CAM光合作用。 - 细胞及其繁殖。 核酸的聚合物结构。 rebiosomes。ATP结构和功能。线粒体和叶绿体的作用。发酵。 有氧方法：克雷布斯循环，电子传输链。 植物细胞：光合作用：发光阶段，色素，光系统的作用；黑暗阶段。 光官。 C4光合作用和CAM光合作用。 - 细胞及其繁殖。 核酸的聚合物结构。 rebiosomes。发酵。有氧方法：克雷布斯循环，电子传输链。植物细胞：光合作用：发光阶段，色素，光系统的作用；黑暗阶段。光官。C4光合作用和CAM光合作用。- 细胞及其繁殖。核酸的聚合物结构。rebiosomes。各种形式的DNA。染色体中的DNA组织。遗传物质的复制。ARN的转录和成熟。<遗传密码的女主角。遗传信息翻译系统的结构。多肽链的生物合成：开始，延长和终止。蛋白质的转染后修饰。在分类蛋白质中，内质网和高尔基体复合物。细胞周期及其相。la Meiosi。 减数分裂的生物学含义。 - 遗传学注释。 基因型和表型。 <门德尔的遗传和原则。 国王。 不完全的主导和代码。 不同基因之间的相互作用。 多局部。 多帕拉·阿里亚。 遗传技术注释：CRISPR-CAS9。 - 活生物体。 二项式系统；物种；其他分类群体；主要的生物群。 le植物：briofite，pteridofite，gimnosperme和Angiosperme。 植物中的性周期。 植物的织物。 组织学：茎，根，叶，花，果实。 植物的代谢产物。 蔬菜激素。 药物和活性成分。 推荐的文本和教学材料 - 所罗门，马丁，马丁，伯格“生物学”，VII ed。 书面考试和口试评估方法。la Meiosi。减数分裂的生物学含义。- 遗传学注释。基因型和表型。<门德尔的遗传和原则。国王。不完全的主导和代码。不同基因之间的相互作用。多局部。多帕拉·阿里亚。遗传技术注释：CRISPR-CAS9。- 活生物体。二项式系统；物种；其他分类群体；主要的生物群。le植物：briofite，pteridofite，gimnosperme和Angiosperme。植物中的性周期。植物的织物。组织学：茎，根，叶，花，果实。植物的代谢产物。蔬菜激素。药物和活性成分。推荐的文本和教学材料 - 所罗门，马丁，马丁，伯格“生物学”，VII ed。书面考试和口试评估方法。根据该计划进行了编写的任何其他大学级文本 - 网站教师教学方法/组织教学讲座，PowerPoint演示和课堂讨论的课程和幻灯片的注释。 最终投票以30年代表示：编写的任何其他大学级文本 - 网站教师教学方法/组织教学讲座，PowerPoint演示和课堂讨论的课程和幻灯片的注释。最终投票以30年代表示：
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生活的来源。细胞的化学组成。从世界加速到细胞世界的通道。通用共享（Luca）。氧光合物。微生物的发现。<2> van Leuwenhoek。显微镜技术人员。。这一代人，弗朗西斯和路易斯·巴斯特。罗伯特·科赫（Robert Koch）。M.W.北京和S. Wingruf。代谢。<2>微生物的营养分类。自身萎缩，杂交，趋化性和光营养。Procasy细胞。forma和细胞的大小。细胞膜：研究，组成和功能。<潜水>细胞。阳性和负克之间的差异。单击拱门。<2> S. S.内部兄弟细胞的兄弟：核苷，包含兵，gassoes，外观海峡：章节和粘液。鞭毛，比尔和比尔。locanism机制。Motity将标志带动。滑动的移动性。趋化和其他税收。调整。Susone;游戏；令人不安的。<2>细胞奶油蛋白酶。世代的青少年。组。微生物生长：总数，有益，动态性。<2>微生物生长结合：Physic Mezi，Carore（Acuplaves），辐射，门膜，化学剂。环境对生长的影响。symptrofits。温度，pH，渗透性，氧气。环境 - 栖息地。<划分主要的陆生栖息地。表面和生物膜。生物之间的相互作用。 法定人数。 共同主义。 地衣。 rizobi和豆类。 微生物和昆虫之间的共生。 隆隆。 <细菌的神圣多样性。 物种的概念。 系统发育树。 蓝细菌； proteobacteria：Alphaproteoobacteri，beta-专业，gamaprotateobacteri，deltapotateobacteria，epsilonprotateobacteri，zetaptaptateobacteria;肌细菌； Tennericutes；企业；细菌特征；衣原体； plancomycetes; verrucomicrobia; Thermotogae;热硫杆菌； aquificae; Deinococcus-Thermus;酸性杆菌；硝基螺旋体。 <纪念者的多样性。 <考古学家的神圣特征。 euryarcheota; thaumarcheota; Nanoarcheota; Koraecheota； crenarcheota; Lokiarcheota。 真核细胞。 真核细胞的进化，内共生理论；继发性内膜；真核细胞：核，线粒体，氢化体，叶绿体，内质网，高尔基体，溶酶体，过氧化物酶体，细胞骨骼。 植物细胞。 细胞分裂成真核生物。 转向多细胞世界的真核微生物的主要群体。生物之间的相互作用。法定人数。共同主义。地衣。 rizobi和豆类。 微生物和昆虫之间的共生。 隆隆。 <细菌的神圣多样性。 物种的概念。 系统发育树。 蓝细菌； proteobacteria：Alphaproteoobacteri，beta-专业，gamaprotateobacteri，deltapotateobacteria，epsilonprotateobacteri，zetaptaptateobacteria;肌细菌； Tennericutes；企业；细菌特征；衣原体； plancomycetes; verrucomicrobia; Thermotogae;热硫杆菌； aquificae; Deinococcus-Thermus;酸性杆菌；硝基螺旋体。 <纪念者的多样性。 <考古学家的神圣特征。 euryarcheota; thaumarcheota; Nanoarcheota; Koraecheota； crenarcheota; Lokiarcheota。 真核细胞。 真核细胞的进化，内共生理论；继发性内膜；真核细胞：核，线粒体，氢化体，叶绿体，内质网，高尔基体，溶酶体，过氧化物酶体，细胞骨骼。 植物细胞。 细胞分裂成真核生物。 转向多细胞世界的真核微生物的主要群体。地衣。 rizobi和豆类。 微生物和昆虫之间的共生。 隆隆。 <细菌的神圣多样性。 物种的概念。 系统发育树。 蓝细菌； proteobacteria：Alphaproteoobacteri，beta-专业，gamaprotateobacteri，deltapotateobacteria，epsilonprotateobacteri，zetaptaptateobacteria;肌细菌； Tennericutes；企业；细菌特征；衣原体； plancomycetes; verrucomicrobia; Thermotogae;热硫杆菌； aquificae; Deinococcus-Thermus;酸性杆菌；硝基螺旋体。 <纪念者的多样性。 <考古学家的神圣特征。 euryarcheota; thaumarcheota; Nanoarcheota; Koraecheota； crenarcheota; Lokiarcheota。 真核细胞。 真核细胞的进化，内共生理论；继发性内膜；真核细胞：核，线粒体，氢化体，叶绿体，内质网，高尔基体，溶酶体，过氧化物酶体，细胞骨骼。 植物细胞。 细胞分裂成真核生物。 转向多细胞世界的真核微生物的主要群体。地衣。rizobi和豆类。微生物和昆虫之间的共生。隆隆。<细菌的神圣多样性。物种的概念。系统发育树。蓝细菌； proteobacteria：Alphaproteoobacteri，beta-专业，gamaprotateobacteri，deltapotateobacteria，epsilonprotateobacteri，zetaptaptateobacteria;肌细菌； Tennericutes；企业；细菌特征；衣原体； plancomycetes; verrucomicrobia; Thermotogae;热硫杆菌； aquificae; Deinococcus-Thermus;酸性杆菌；硝基螺旋体。<纪念者的多样性。<考古学家的神圣特征。euryarcheota; thaumarcheota; Nanoarcheota; Koraecheota； crenarcheota; Lokiarcheota。真核细胞。真核细胞的进化，内共生理论；继发性内膜；真核细胞：核，线粒体，氢化体，叶绿体，内质网，高尔基体，溶酶体，过氧化物酶体，细胞骨骼。植物细胞。细胞分裂成真核生物。 转向多细胞世界的真核微生物的主要群体。细胞分裂成真核生物。转向多细胞世界的真核微生物的主要群体。转向多细胞世界的真核微生物的主要群体。excavata：外载体，帕拉巴西利亚，运动质体，euglenoidaa；肺泡：Ciliati，Dinoflagellata，Apicomplexa； Heteroconti/stramenopili：Diatomee，Oomycota，Golden藻类，棕色藻类；里扎里亚：氯拉拉赫氏菌科，有孔虫，放射性虫； Amoebozoa;蘑菇：Microsportidia，Chytridiomycota，Mucoromycota，Glomeromycota，ascomycota，basidomycota;古细菌；红藻；绿藻。
10种微生物
微生物是没有显微镜的微小生命形式。他们约占地球生物的60％。“微生物”一词是指各种微观生物，包括细菌，真菌，病毒，古细菌和生物。这些微生物可能对人类无害或有害。一些微生物会引起严重的感染和疾病，而另一些微生物有助于维持环境平衡。古细菌是单细胞原核生物，具有与细菌不同的细胞壁结构。它们包含独特的脂质，使它们能够在极端环境中蓬勃发展。古细菌也可以在人类的肠道和皮肤中找到。微生物，包括微生物，是作为单细胞或簇存在的微观生命形式。有七种主要类型：细菌，古细菌，原生动物，藻类，真菌，病毒和多细胞动物寄生虫（Helminths）。古细菌由于其独特的细胞壁结构和缺乏肽聚糖而与真实细菌区分开。它们是可在极端条件下生存的原核细胞。一些古细菌组包括甲烷基因，卤素，热疗法和精神病/冷冻剂。这些生物使用各种能源，例如氢气，二氧化碳，硫或阳光（光营养形式）来存活。真核生物是包含核和复杂细胞器的单细胞或多细胞细胞。他们使用专业结构通过光合作用或吸收/摄入获得滋养。大多数真核细胞具有真实的核，并且主要是多细胞的。在数量，生物量和多样性方面，最大的微生物群是真核生物。鞭毛使用类似鞭子的结构进行运动；纤毛具有微小的跳动头发； Amoeboids采用伪虫； Sporozoans是非运动的。由几丁质组成的细胞壁支持各种营养方法：分解器吸收有机材料，共生体与植物形成关系，寄生虫与宿主有害相互作用。真菌产生称为菌丝的丝状管，骨料形成菌丝体。繁殖是通过释放孢子而发生的。非细胞实体由核酸核心组成，这些核酸核心被蛋白质涂层包围，缺乏繁殖外宿主细胞或独立代谢的能力。他们可以感染原核细胞和真核细胞，从而导致疾病。真核生物（如扁虫和round虫）共同称为蠕虫，在技术上不是微生物，而是微生物生命阶段，对于临床目的而言很重要。微生物的生物实体太小，无法用肉眼看到。例子包括细菌，古细菌，藻类，原生动物和微观动物（如尘螨）。尽管它们的重要性，但这些生物在历史上被低估了，直到Antonie van Leeuwenhoek发明了显微镜。发现微生物的发现使路易斯·巴斯德（Louis Pasteur）意识到许多疾病是由它们引起的，促进了巴氏杀菌的实践以确保食品安全。今天，我们认识到微生物在各种环境中的作用，包括水，土壤，动物皮肤和消化道。这种理解强调了免疫系统在预防疾病中的重要性。微生物在生态系统中起着重要作用，就像其他生物一样。细菌，特别是与引起疾病的病原体有关，但也具有帮助人类的有益特性。研究表明，古细菌与Eubacteria明显不同，甚至可能与人类更紧密相关。古细菌可以在各种环境中找到，包括水，土壤和我们的消化系统，它们有助于维持我们的健康。他们也可以在极端条件下繁衍生息，例如高温，酸度或咸味，使其成为温泉的常见居民和大多数生物体敌对的其他地区。几种动物物种以微观形式出现，包括节肢动物，旋转膜，loricifera，nematodes和原生动物。原生动物是一组单细胞的真核生物，其比细菌或古细菌的细菌更像动物和植物。它们会引起几种严重的人类疾病，例如疟疾，弓形虫病，贾第鞭毛虫，非洲卧铺疾病和chagas病。像酵母一样的微观真菌对人类无害，但在烘烤和酿造中起着至关重要的作用。酵母以糖为食，并将其转化为二氧化碳和乙醇，这会导致烘焙食品上升和发酵饮料变得陶醉。模具是微生物，与真菌具有某些特征但不是真正的真菌。它们包括感染植物并在过去引起毁灭性作物失败的致病霉菌。粘液模具是能够令人印象深刻的合作的单细胞生物，许多细胞聚集在一起以作为一个实体运行。科学家已经使用粘液模具来研究智能和解决问题。微观藻类曾经被认为是植物，但现在被认为是导致陆地植物的谱系的亲属。这些光合生物在整个历史中都很重要，有助于将氧气泵入大气中。藻类既可以通过清洁水，产生氧气或产生最终在我们的海鲜和饮用水中产生的有毒化合物来受益和伤害人类。科学家正在努力进行分类的其他许多微观生物。过去，许多微生物被聚集在“生物学家”的类别下，但是许多科学家现在认为该系统不足。在这里，科学家曾经使用文章文本，曾经使用一个称为“ Protista”的王国对无法识别为植物，动物或真菌的真核生物进行分类。然而，遗传分析揭示了该群体的许多成员与其他王国更紧密相关，而不是彼此之间的关系。不同的微生物可能对人类无害或有害，例如链球菌细菌，会导致链球菌喉咙和猩红热，以及乳酸杆菌，这有助于抵抗诸如胃流感之类的疾病。微生物提出的新发现已经根据光学显微镜研究推翻了先前的假设，揭示了对微生物的更复杂的理解。研究的进步导致了过去十年来我们对这些微小生命形式的理解的重大转变，并继续迅速发展。
微生物学中的属是什么
nlm提供了对科学文献的访问，而无需暗示与内容的认可或一致。分类法涉及根据特征对微生物进行分类，细菌通过革兰氏染色反应分为两个主要组，并表现出各种形状和大小。在临床实践中，细菌是通过形态学，氧的需求和生化测试对细菌进行分类的。基因探针和基于PCR的技术等诊断测试系统检测特定细菌。细菌物种通常根据基因重组频率表现出不同的种群结构。键入分离株对于流行病学研究和监视至关重要。微生物可以分为七个大型生物群：藻类，原生动物，粘液霉菌，真菌，细菌，古细菌和病毒。藻类，原生动物，粘液霉菌和真菌是真核微生物，具有类似于动植物的细胞结构。细菌，包括支原体，立克群和衣原体组，具有原核组织。古细菌是一群独特的原核生物，与其他生物没有密切的祖先关系。只有细菌和病毒在医学或兽医上被认为是重要的。病毒是具有简单结构和不同繁殖模式的最小传染剂。病毒，无蛋白质的RNA片段，引起植物的疾病，而prion是动物和人类致命神经退行性疾病的病因。传染性同工型中发生构成变化（第60章）。系统学也称为系统发育学。分类法包括三个组成部分：分类，命名和识别。分类以有序的方式群体群体，而命名法则涉及命名这些生物，要求国际协议以持续使用。命名法的更改可能会引起混乱，并受到国际商定的规则。在临床实践中，微生物学家主要专注于根据商定的分类系统识别分离株。这些组成部分以及分类法构成了与进化，遗传学和物种有关的系统学的总体学科。原生动物，真菌和蠕虫是根据卡尔·冯·林纳（Carl vonLinné）开创性工作后的标准规则分类和命名的。大类（阶级，秩序，家庭）进一步分为由拉丁二项式指定的单个物种。细菌表现出比所有其他细胞寿命的多样性更大，这使刚性分类具有挑战性。识别主要是通过基于密钥的系统来实现的，该系统基于生化性能测试系统的生长或活动来组织细菌性状。有些测试明确鉴定了属或物种，例如葡萄球菌属的过氧化氢酶产生。和细胞色素c由铜绿假单胞菌C。其他特征可能是单个物种独有的，将它们与具有相似生化谱的人区分开来。某些细菌在实验室中不生长（麻风细菌，treponemes），需要遗传学方法鉴定。如图它们可能构成一个属。随着遗传分析技术变得越来越容易获得，它们和其他快速分析方法正在取代传统的生化方法以识别。细菌分类中使用的分类等级包括王国（原核），分区（Gracilicutes），阶级（Betaproteobacteria），订单（Burkholderiales），家庭（Burkholderiaceae），属（Burkholderia）（Burkholderia）和物种（Burkholderia cepacacia）。通过DNA同源性分析将一些属（例如动杆菌）细分为基因组物种。细菌和病毒的分类构成了挑战，这是由于表型测试在区分某些基因组物种时的局限性。当前方法识别物种复合物，这些物种复合物使用多重分类学方法分为基因组群。例如，头囊菌络合物包括从植物病原体到人类病原体的各种生物。尽管没有普遍接受的分类系统，但Bergey的手册被广泛用作权威来源。国际系统细菌学委员会控制细菌命名法，并在《国际系统和进化微生物学杂志》中发布批准的细菌名称清单。病毒由国际病毒分类学委员会（ICTV）归类，并在病毒学档案中发表。在细菌分类中，主要组以基本特征（例如细胞形状，革兰氏染色反应和孢子形成）区分。属和物种通常通过发酵反应，营养需求和致病性等性质进行区分。不同字符的相对重要性通常是任意的，而Adansonian系统则使用考虑广泛字符的统计系数来确定菌株之间的关系程度。此方法可用于分类共享主要字符的较大分组中的菌株。通过评分多个表型特征，可以估计相似性或匹配系数，这些系数可以在计算机上计算以确定生物体之间相似性的程度。3.1，可以使用相似性矩阵或树状图来构建层次分类树。这种方法允许根据相似性水平（用虚线x和y表示）将生物体分离为属和物种。DNA中鸟嘌呤 - 胞嘧啶（G-C）碱基对之间的氢键强度大于腺嘌呤 - 胸腺胺（A-T）碱基对之间的强度，从而影响DNA熔化的温度。DNA序列以确定G+C含量，该含量在细菌属之间差异很大，但在物种中仍然相对一致。另一种分类方法涉及基于其DNA碱基序列的同源性进行分组。此方法利用了在受控冷却过程中的重新形态，并在互补区域之间产生混合配对。可以通过信使RNA（mRNA）结合研究获得有关相关性的遗传证据。尽管具有不同G+C比的生物不太可能显示出明显的DNA同源性，但具有相似或相同的G+C比的生物可能不一定具有同源性。系统发育相关性。已经开发了一种实时PCR方法来估计G+C含量。核糖体RNA（rRNA）的结构似乎在进化过程中是保守的，反映了系统发育关系。核苷酸测序相对简单，并导致了许多在线医学上重要的细菌物种的DNA序列的可用性。注意：我应用了“添加拼写错误（SE）”方法，其中有10％的概率引入错误。如果您要我以不同的方式重塑它，请让我知道！在此处给定文章的分枝杆菌物种鉴定对于理解其系统发育关系至关重要。尽管rDNA序列中的高相似性（> 97％），但可以使用Microseq（Applied Biosystems）等商业系统来区分不同的物种。但是，核糖体基因可能无法提供足够的变化来区分紧密相关的物种。替代候选基因（例如RECA）已被探索，并且似乎有望用于系统发育分析。在系统发育研究中也使用了其他家政基因，包括RPOB，GROEL和GYRB。这些基因定义了与RRNA基因观察到的基因一致的进化树。分类法的主要目标是促进在临床和公共卫生环境中的个人和团体的有效管理。然而，由于基因组序列数据揭示了微生物之间的相互关系，因此对与基本理解保持一致性是必要的。表3.1根据共享特征概述了简化的分类方案。门A（属）是正确的。这些群体已与最近确定的系统发育命名法对服。可以通过补充测试，有时在物种水平上进一步识别生物。形态标准足以鉴定原生动物，蠕虫和真菌。The classification of cellular micro-organisms is as follows: Eukaryotes: Protozoa - Sporozoa Plasmodium, Isospora, Toxoplasma, Cryptosporidium Flagellates Giardia, Trichomonas, Trypanosoma, Leishmania Amoebae Entamoeba, Naegleria, Acanthamoeba Other: Babesia, Balantidium Fungi: Mould-like Epidermophyton, Trichophyton, Microsporum, Aspergillus Yeast-like Candida Dimorphic Histoplasma, Blastomyces, Coccidioides True yeast: Cryptococcus Prokaryotes: Bacteria: Actinobacteria (High G+C Gram positives) - Actinomyces, Streptomyces, Corynebacterium, Nocardia,分枝杆菌，微球菌（低g-c gram阳性） - 李斯特菌，芽孢杆菌，梭状芽孢杆菌*，乳酸杆菌*，Eubacterium*革兰氏阳性杆菌，杆菌，芽孢杆菌，芽孢杆菌* Enterococcus Gram-negative cocci: Veillonella*, Mycoplasma Proteobacteria (a very large group with 5 sub-divisions) - Neisseria, Moraxella Gram-negative bacilli: Enterobacteria – Escherichia, Klebsiella, Proteus, Salmonella, Shigella, Yersinia Pseudomonads – Pseudomonas, Burkholderia, Stenotrophomonas Haemophilus, Bordetella, Brucella, Pasteurella Rickettsia, Coxiella Gram-negative curved and spiral bacilli: Vibrio, Spirillum, Campylobacter, Helicobacter Bacteroidetes - Bacteroides*, Prevotella* Borrelia, Treponema, Brachyspira, Leptospira衣原体衣原体这些单细胞生物是非斑型生物的，具有独特的核和细胞质。它们的大小从直径2-100 µm变化，其表面膜的复杂性和刚度有所不同。有些物种在内部捕获食物颗粒，而另一些物种则以细菌为食。原生动物被认为是最低的动物生命形式，它通过二元裂变或多重裂变无性繁殖。某些鞭毛原生动物与光合藻类密切相关。最重要的医学原生动物组包括Sporozoa，Amoebae和鞭毛。这些生物具有相对刚性的细胞壁，可能是腐生的或寄生的。霉菌随着分支丝的生长而生长，称为菌丝，形成了称为菌丝体的网状作品。通过形成从营养或空中菌丝体发展的性和无性孢子来繁殖。酵母是卵形细胞，通过萌芽并形成性孢子无性繁殖。二态真菌在人造培养中产生营养菌丝体，但在感染病变中类似酵母。主要的细菌组通过微观观察到其形态和染色反应来区分。革兰氏阴性程序将细菌分为两个伟大的分区：革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌。然而，较旧的分类系统与较新的基于DNA序列的系统发育分类之间的关系是复杂的且仍在发展的。随着细菌组之间的系统发育关系开始解体，出现异常。文本描述了根据其形态学特征和染色反应对细菌和病毒进行分类的各种组。尽管如此，在临床实验室中采用的实际鉴定方案很大程度上取决于细菌的形状革兰氏阳性还是阴性，杆菌或球菌的形状，以及它们在有氧或厌氧上生长的能力。医学上有意义的细菌的主要系统发育组包括静脉细菌，其革兰氏阳性具有较高的G+C含量，具有丝状生长和菌丝体的产生； Firmicutes，一组低的G+C革兰氏阳性细菌，其中包括细菌，球菌和孢子形成器；蛋白质细菌，一大群革兰氏阴性细菌；细菌植物，革兰氏阴性厌食症；螺旋体，其特征是带有内部鞭毛的螺旋形细胞；衣原体，严格的细胞内寄生虫产生抗生素并具有非常重要的病原体。其他值得注意的组包括放线菌，链霉菌，分枝杆菌，诺卡氏菌，corynebacterium，链球菌，葡萄球菌，分枝杆菌，尿不质质，叶绿体，veillonella，veillonella，veillonella，gram阳性孢子形成的孢子形成杆菌和近亲，可能会变成gram- cortridium-new cortridiul cortridur cortriver cortridge cortridge cortridg corlam-infram-negam-inform-Gram-ne Gram-ne Gramne。例如，梭状芽胞杆菌的末端孢子具有独特的球形形状。革兰氏阳性的非孢子芽孢杆菌，包括甲ip骨和乳杆菌，倾向于在链或细丝中生长。相反，一些细菌具有使运动能力的鞭毛，例如李斯特菌。细菌可以根据其细胞壁组成，包括α-肾上腺细菌（包括人力赛组和布鲁氏菌），以及贝贝氏菌，包括静脉和伯克霍尔德里亚。尽管具有优势，但核酸测定并非没有局限性。此外，gamaproteobacteria包括大肠杆菌等肠杆菌，以及假单胞菌和军团菌。一些细菌的独特特性（例如弯曲的颤音，包括弧形霍乱）是值得注意的。divaproteobacteria群体在医学上并不显着，而Epsilonproteobacteria包括螺旋杆菌和弯曲杆菌，它们表现出螺旋形状。革兰氏阴性的非腐蚀性厌氧菌（如杆菌和prevotella）以其细长的柔性螺旋而区别。病毒，重点是它们对宿主细胞复制的依赖。某些病毒可能会包裹在脂蛋白中，而另一些病毒缺乏该外层。提出了一个分类系统，根据其遗传物质和衣壳结构对病毒进行分组。引起人类疾病的主要病毒类型包括RNA病毒，例如流感，paramyxoviruse和Flaviviviruses，以及picornaviruses和paciviruses。许多类型的病毒，包括艾滋病毒，HTLV和疱疹病毒会导致人类疾病。DNA病毒，例如痘病毒，轮状病毒和腺病毒，也感染了人。微生物学家在识别细菌时由于精确识别所需的耗时过程而面临挑战。通常，它们依赖于显微镜和培养物等简单方法，可以通过其他测试进行推定识别来支持。但是，这些方法通常至少需要24小时，因此在开始识别之前必须获得单个分离株的纯培养。与文化方法不同，非文化检测技术（例如抗原或基于核酸的检测）没有需要纯培养的缺点，但可能具有特异性的局限性。形态和染色反应可以作为将未知物种置于其适当的生物群中的初步标准。诸如革兰氏阴性，深色地面照明和阴性染色之类的技术可用于观察细菌形态，运动性和胶囊形成。在某些情况下，病理标本中某些生物体的微观特征可能足以进行假定的鉴定，例如痰液中的结节芽孢杆菌或渗出液中的T. pallidum T. pallidum。但是，许多细菌具有相似的形态特征，需要进一步测试以区分它们。固体培养基上殖民增长的出现还可以提供特征信息，包括菌落大小，形状，高程和透明度。微生物生长和特征的变化，包括透明度，不透明和颜色，可能会显着影响结果。生长所需的条件范围特定于某些生物，有些需要氧气，其他厌氧环境，而另一些则对二氧化碳水平或pH值敏感。为了区分相似的物种，可以采用评估代谢差异的测试，例如产生特定碳水化合物的酸性和气态终产物的能力。但是，现在许多实验室都使用了结合简单性和准确性的市售微磨合。此过程导致可见细菌生长的抑制作用。Some common tests used in identification include: - Production of indole or hydrogen sulphide - Presence of oxidase, catalase, urease, gelatinase, or lecithinase enzyme activities - Utilization of various carbon sources Traditionally, these tests have been performed individually according to standard guidelines.套件也可用于特定的生物组，例如肠杆菌和厌氧菌。在某些情况下，可以使用更先进的程序来分析代谢产物或全细胞脂肪酸。A fully automated system using high-resolution gas chromatography and pattern recognition software is widely used, allowing for the rapid identification of various bacterial species.Mass spectrometry also holds promise for rapid identification through matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometry.由于细菌的多样性和复杂性，对细菌的检测和鉴定可能具有挑战性。Many organisms may not grow in culture, or they may require specialized nutrients, making traditional methods time-consuming and labor-intensive.然而，核酸技术的进步彻底改变了该领域，提供了更灵敏和快速的检测方法。Commercially available systems, including PCR, transcription-mediated amplification, and hybridization with specific probes, can identify a wide range of bacterial species with high accuracy.These technologies enable the detection of multiple species simultaneously, making them ideal for epidemiological investigations and antimicrobial susceptibility testing.此方法允许进行定量和形态评估。污染，操作员技能，底漆设计以及标本中抑制性化合物的存在都会影响结果。对这些结果的解释需要仔细考虑生物体的自然栖息地和共生主义的潜力。The development of new technologies, such as peptide nucleic acid (PNA) assays, holds promise for even more rapid and sensitive detection methods.These techniques use PNA molecules with DNA binding capacity to detect and identify bacterial species on microscope slides, and can be amplified using PCR to accelerate testing times.也已经开发出高密度寡核苷酸阵列，从而可以同时分析数千种不同的探针。This enables researchers to quickly identify specific genetic markers associated with antimicrobial resistance, paving the way for more targeted treatment strategies.Recent advancements include DNA sequencing, strain genotyping, and identifying gene functions, as well as locating resistance genes and changes in mRNA expression.一种创新的方法涉及在Eppendorf管中开发的选定基因靶标的阵列。The chip embedded in the tube contains optimized sets of oligonucleotide probes specific to certain organisms or antimicrobial resistance genes.这允许自定义单个细菌或组的芯片。从样品制备到检测的测定过程在单个管中在6-8小时内完成。实时PCR已广泛开发，使用荧光在单个反应管中结合了扩增和检测。该系统比常规PCR具有显着优势，包括速度，简单性和减少手动程序。基于荧光的方法可以检测DNA产物或通过与荧光标记的探针杂交提高特异性。对靶DNA的定量也是可能的，可以估计样品中的病毒或细菌数。 此外，针对16S核糖体RNA的荧光原位杂交（FISH）已用于直接在临床标本中检测细菌，而无需培养。 可以通过血清学反应来鉴定微生物的种类和类型，这些反应依赖于特有的特定物种或类型的抗体或类型的抗体，这些抗体以特征性的方式与微生物反应。 抗体在检测细菌产生的毒素和抗原以及鉴定特定病毒方面起着至关重要的作用。 基于乳胶的试剂盒广泛用于血清学组和毒素检测。 在ELISA中，特异性抗体附着在塑料孔上，并添加了测试抗原。 通过添加更特异性的抗体检测到抗原的存在，并用启动颜色反应的酶标记。 ELISA方法可以反向使用以定量检测抗体。 在Mac-Elisa中，纯化的抗原被吸附到井中，并添加了测试血清。 任何IgM与捕获试剂结合，并添加纯化的抗原以用标记的抗体检测。 某些病毒，例如流感，在红细胞上充当桥梁的受体，形成可见的团块。 但是，这种方法缺乏可重复性。对靶DNA的定量也是可能的，可以估计样品中的病毒或细菌数。此外，针对16S核糖体RNA的荧光原位杂交（FISH）已用于直接在临床标本中检测细菌，而无需培养。可以通过血清学反应来鉴定微生物的种类和类型，这些反应依赖于特有的特定物种或类型的抗体或类型的抗体，这些抗体以特征性的方式与微生物反应。抗体在检测细菌产生的毒素和抗原以及鉴定特定病毒方面起着至关重要的作用。基于乳胶的试剂盒广泛用于血清学组和毒素检测。在ELISA中，特异性抗体附着在塑料孔上，并添加了测试抗原。通过添加更特异性的抗体检测到抗原的存在，并用启动颜色反应的酶标记。ELISA方法可以反向使用以定量检测抗体。在Mac-Elisa中，纯化的抗原被吸附到井中，并添加了测试血清。任何IgM与捕获试剂结合，并添加纯化的抗原以用标记的抗体检测。某些病毒，例如流感，在红细胞上充当桥梁的受体，形成可见的团块。但是，这种方法缺乏可重复性。Haemagglutinins can be detected in tissue culture, and red cells can be coated with specific antibodies to agglutinate in the presence of homologous virus particles.荧光染料可用于染色组织或生物体，从而在紫外线下可视化。Antibody molecules can be labeled with fluorochrome dyes, enabling direct immunofluorescence procedures for highly sensitive antigen identification.该技术将抗体技术与PCR方法相结合，以增强抗原检测能力。分子生物学中的一种新方法涉及将DNA分子与抗原抗体复合物联系起来，从而产生特定的结合物。此附件允许通过PCR扩增，验证抗原的存在。免疫-PCR的增强灵敏度超过ELISA的105倍，因此检测到只有580个抗原分子。细菌种群表现出不同的结构，从高度多样化到非常相似。Recombination frequency is the primary determinant of population structure, with some species experiencing high recombination rates and others exhibiting rare recombination events.Species such as Neisseria gonorrhoeae are naturally transformable, displaying high recombination frequencies, while Salmonella enterica populations exhibit low recombination rates.细菌克隆可能显示出瞬态或持久特征。Panmictic与克隆人群的概念突出了这两种类型之间的繁殖，重组，等位基因排列和选择性压力的差异。In each family lie many genera of each type.键入分离株可以与参考标记，识别细菌物种中的菌株和分离株进行比较。区分类似菌株的能力在追踪社区或医院环境中感染的来源或传播方面具有重要意义。已经开发了各种键入方法来帮助这一过程，这可能涉及从相同起源菌株之间识别较小的差异。尽管单个打字方法可以证明相同的响应，但这不是两种菌株相同的结论性证据。但是，使用多种打字方法大大提高了相似性的置信度。键入技术可以在不同的流行病学水平上应用，包括微流行病学，宏观流行病学和种群结构分析。从键入中得出的数据可以通过识别共同或点源，区分混合应变感染以及识别再感染与复发与复发来帮助控制感染。一些方法还有助于识别与疾病相关的特定类型，例如大肠杆菌O157和溶血性尿毒症综合征。为了使方法被认为是可靠的，必须在实验室环境和临床上可以重现。在流行病学研究的背景下，首选多种键入方法，因为它们可以针对不同的特征。这些包括生物化学测试，这些测试定义了物种内的生物型，抗性分型检测对化学物质敏感性的变化以及基于营养需求的生长需求的辅助分型。可以使用此方法分析质粒和染色体DNA。此外，许多细菌的表面结构都是抗原性的，可以使用针对它们提出的抗体将分离株分为定义的血清型。物种可以根据其独特特征分为几种抗原类型。对于某些物种，血清分型是一种识别和区分不同菌株的高效方法。在其他情况下，抗原表位的保存使血清型对流行病学目的的有用程度降低。例如，沙门氏菌的物种可以通过其体细胞和鞭毛血清型来定义。研究表明，囊抗原可能在某些生物的致病性中起作用，许多疫苗通过刺激对这些抗原的抗体来起作用。噬菌体键入是一种用于识别和区分细菌菌株的方法。这涉及使用特定噬菌体的凝集或降水反应，如果适当地适应，这可能具有很高的歧视性。但是，某些噬菌体集缺乏稳定性会导致广泛的噬菌体组，而不是定义的类型。此外，控制噬菌体分型结果解释的关键因素是歧视和可重复性。噬菌体与细菌之间的相互作用是一个复杂的过程，涉及吸附，DNA注射以及裂解或复制。裂解或有毒的噬菌体可以在复制循环结束时裂解宿主细胞，从而释放可能感染相邻细胞的新噬菌体颗粒。但是，其有效性取决于噬菌体的适应和系统的稳定性。噬菌体键入已用于包括微生物学和流行病学在内的各个领域，以识别和跟踪细菌菌株。尽管存在这些局限性，但噬菌体打字仍然是理解不同细菌菌株及其特性之间关系的重要工具。只有在两个强烈的裂解反应表现出两种不同的菌株时，才能识别出两种不同的菌株。细菌素是大多数细菌物种产生的自然存在的抗菌物质，主要靶向与生产菌株同一属内的菌株。通过分析产生的细菌素的光谱或对标准面板细菌素的敏感性，细菌素键入可以定义不同类型的细菌。蛋白质组学分析，涉及具有强洗涤剂的丙烯酰胺凝胶中的凝胶电泳，也可以通过可视化数千种蛋白质并比较分离物之间的带模式来鉴定细菌物种。另外，研究人员已使用凝胶电泳来分析代谢酶，可以使用特定底物检测到该酶，用于物种内的克隆分析。限制性核酸内切酶是在特定序列识别位点切下DNA的酶。这些切割的频率取决于寡核苷酸序列，限制位点的频率以及所检查的物种的G+C含量的百分比。频繁切割的核酸内切酶产生许多小片段，可以通过琼脂糖凝胶中的常规电泳解决，并通过用染料染色检测。通过引入脉冲或在电场方向上变化，可以分开碎片至10 MB。相比之下，不经常的切割酶产生的大型DNA片段需要脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行分离。该技术涉及将细菌包裹在琼脂糖塞中，用蛋白酶K酶消化细胞，然后用酶消化DNA。CORTOUR夹具均匀的电场（Chef）设备通常用于PFGE，并具有在六角形阵列中排列的24个电极。运行时间通常在30到40小时范围内，尽管已经描述了较短的协议。几个因素影响了这些分析的结果，包括正在检查的DNA类型，酶和反应条件的选择以及所使用的设备质量。DNA样品的质量和浓度，琼脂糖凝胶电压和脉冲时间，缓冲液强度和温度会影响脉冲场凝胶电泳（PFGE）的结果。虽然解释PFGE曲线可能是由于不同物种之间的带状模式的变化而具有挑战性的，但已通过Tenover确定了特定的标准以确定差异的重要性。通常，与显示剖面无差异的单个事件中的分离物被认为是无法区分的。一到三个频段差异的人密切相关。四到六个乐队可能表明可能的关系；七个或更多的差异表明不同的菌株。但是，该规则应谨慎应用，因为即使在同一克隆的成员之间，某些物种也会表现出显着差异。Pearson系数是另一种常用的方法，具有不需要定义特定带位置的优势。可以使用计算机辅助分析软件包来计算菌株之间相似性的系数，例如jaccard和骰子系数，这些系数使用配置文件中的一致频段来确定百分比相似性。经常使用85％相似性的截止点，但应通过实验相关且无关的应变集设置。DNA探针可以根据克隆的特异性，随机序列或通用序列检测靶DNA中的限制位点异质性。rubotyping检测rDNA基因基因座的变化，并已普遍应用于各种物种。其他常用的探针是可能定义种群克隆结构的插入序列。PCR（聚合酶链反应）是一种允许在受控条件下放大特定DNA序列的技术。可以通过使用PCR的重复放大循环来制作由特定寡核苷酸引物定义的基因组区域的多个副本。该方法已广泛用于DNA指纹和键入，利用DNA分子中的可变区域，例如串联重复区域的可变数量或具有限制性核酸内切酶识别序列的区域。两种方法都有局限性，这是由于错误启动，不同的带强度以及电泳迁移差异引起的可重复性问题。基于重复序列的PCR（REP-PCR）索引在整个基因组中多个重复序列中的变化，而自动化的REP-PCR系统对应变键入显示了有望，并且可以提供与PFGE相似的歧视。狼在can属中，而狐狸则处于喧嚣中。放大的片段长度多态性结合了限制性核酸内切酶消化与PCR，以优化基因组之间单碱基对差异的可重复性和分辨率。该技术使用核苷酸测序来分析管家基因，该基因慢慢多样化，不受选择性的作用。多焦点序列分型（MLST）可以视为确定的基因分型。但是，MLST可能对诸如结核分枝杆菌等高度均匀的物种没有效。为了增加歧视，由于环境变化，毒力相关的基因提供了较高的序列变化，因此已经针对了毒力相关的基因。通过PCR扩增基因间区域，并测序了500 bp的内部片段以识别等位基因多态性。多焦点限制输入引入了放大管家基因的限制消化，从而消除了对测序的需求。可变数字串联重复序（VNTR）是拷贝数变化的短核苷酸序列，可用于快速且可再现的键入。识别其他遗传基因座可以提供进一步的见解，但随着时间的流逝，它们的稳定性仍然存在争议。DNA测序技术的最新进展使得分析整个基因组序列成为可能，从而可以更精确的比较和细菌的键入。这种方法涉及生成可以组装并与先前分离株进行比较的短核苷酸序列读取。与这些高级分析相关的成本与传统方法变得越来越具竞争力。这样的分析可以在同期和历史分离株之间建立进化关系，从而对细菌进化有更明确的理解。此外，这项技术通过提供明确的流行病学信息并确定有助于抗生素耐药性和抗原选择压力来转化医学细菌学的重要潜力。资料来源：Barrow Gi，Feltham RKA，编辑；加里斯总经理，编辑； Kaufmann我； Murray PR，Baron EJ，Jorgensen JH，编辑；欧文·RJ； Schleifer KH; Spratt BG，Feil EJ，Smith NH； Tenover FC，Arbeit Rd，Goering RV； Van Regenmortel MHV，Fauquet CM，Bishop DHL，编辑； Woese Cr。分类类别是称为分类单元的层次组，其中包含一小部分物种，该物种来自一个相对较新的共同祖先。可以在下面可视化整体层次结构以供参考：尽管研究不同生物体的科学家在分类方案中有所不同，但属背后的一般概念是它代表物种祖先相关的物种，并且与其他属不同，不包括不必要的物种。确定这在于每个研究者，但是这些一般指南在属属方面保持分类相当狭窄。属属的分类单元通常包括群体之间可识别的身体形式。例如，Felidae和Canidae分别代表类似猫的生物和类似狗的生物。最后一步，物种定义了在连续单位中共同繁殖的人群和群体。在一起，这些名字告诉您有关生物体的很多信息。在大多数情况下，由于遗传，行为或形态学差异，不同的属将不会繁殖。Carl Linnaeus通过他的生物生物命名计划（二项式命名法）普及了“属”一词，尽管他对属的定义与我们的现代观点有所不同，但在二项式命名法中使用通用epithets在二项式术语中的使用仍在继续。通用称呼是二项式命名法中描述有机体所属属的动物名称的两个单词。第二个单词或特定的称呼描述了有机体所属的生物或物种更紧密相关的群体。通过了解一个人也知道家庭，秩序和所有其他分类分类。由于分层群体是由生物之间的相似性安排的，所以这些关系告诉了我们很多有关单个动物的信息。知道该物种可以告知我们动物与该属中其他动物的独特性。例如，Honey Badger具有科学名称Mellivora Capensis。有时，属可能包含数百种物种，尤其是在鱼类和无脊椎动物中。这种品种具有误导性，因为它应该反映进化。进化多样性决定了属内生物的数量。如果许多物种随着属的传播而出现，将会有许多物种。相反，如果只有一个物种幸存，则只有一个物种。分类分类是一个持续的过程，每天都描述了新的属。一些新发现的生物从未被命名，而另一些有机体则根据DNA分析重新分类。通过分析DNA，比较性状并提出系统发育，科学家假设最可能的进化进展。这将为命名惯例提供信息，并确定哪些物种可以成为独特的属。物种代表属内生殖分离并与其他群体独特的群体。家庭是分层分类中属的分类单元。分类单元是指具有相似特征的群体。两条鱼一起游泳可能不会繁殖，而是具有类似的特征，与其他任何海洋鱼不同。如果它们可以杂交，则将被视为物种。北极熊和棕熊在同一属中是不同的物种，但仍可以成功繁殖。这是因为它们占据了独特的生态位，很少彼此遇到繁殖。生态障碍可以阻止它们自然繁殖，即使它们的后代是可行的。随着气候变化耗尽冰盖，可以将北极熊推向较低的纬度，并可能与棕熊杂交。科学家辩论是否应基于进化连接和物理特征将新物种添加到属中。如果两组共有共同的血统，则它们应属于同一属，即使它们在细胞外基质产生等特征上有所不同。在Fakus细菌的情况下是一种具有相似DNA但缺乏定义该属的独特基质的新物种，分类学家必须权衡多个领域的证据。通过分析解剖学，行为和遗传数据，科学家可以重建生物体之间的关系，并就分类做出明智的决定。