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World File Search System高通量
技术说明全血样品的HIFI全基因组测序的高通量DNA剪切
库以相等的摩尔方式合并，并使用具有85 pm加载浓度的单个SMRT®细胞在续集®IIE系统上进行测序。QC和测序结果（图3-4，表2）表明1,400 rpm速度设置产生了最佳的HIFI读取长度轮廓。剪切240秒产生的平均HIFI读取长度为17,703 bp，而剪切480秒的平均读数为16,855 bp的平均读取长度。在240和480秒时，更快的1,800 rpm设置覆盖了DNA，导致平均HIFI读取长度分别为13,184 bp和11,658 bp。通常，当使用FastPrep-96剪切DNA时，较小的工作速度较小的时间将导致较大的平均片段长度。
高通量微量滴定板筛选测定法，以量化和区分双物种生物膜中的物种
摘要：致病性细菌在感染过程中形成生物膜，而多生物生物膜是最常见的表现。生物膜附着，成熟和/或抗生素敏感性主要通过微量滴定板测定进行评估，其中将细菌染色以通过光吸光度或荧光发射来实现生物量的定量。但是，目前不可能使用这些方法在双物种或多种物种生物膜中区分不同物种。菌落形成单位从选择性琼脂培养基上的均质双物种生物膜计数允许物种分化，但在高通量筛选方面很耗时。因此，迫切需要使用可靠，可行和快速的方法来研究多种物种和双物种群落的行为。这项研究表明，铜绿假单胞菌和Burkholderia cenocepacia菌株表达了特定的荧光或生物发光蛋白，与依赖于测量总生物群的其他方法相比，双重物种生物纤维的有效研究更加有效。结合荧光和生物发光测量值可以独立地分析生物膜内不同微生物物种，表明在双物种生物膜生长期间，每个人的存在程度随着时间的流逝而存在。这项工作中开发的定量策略是可重现的，建议使用可以组成构成表达泛光或生物发光蛋白的菌株进行高通量微量液板方法的生物膜研究。
高通量 DNA 条形码技术用于测定禁食期间圈养极度濒危马来虎 (Panthera tigris jacksoni) 的肠道微生物组
马来虎 ( Panthera tigris jacksoni ) 是马来西亚半岛的极度濒危物种。为了模拟老虎不每天捕猎的野外环境，许多野生动物保护区并不每天喂食老虎。然而，禁食对圈养马来虎肠道菌群的影响仍然未知。这项研究旨在通过比较禁食和正常喂养条件下圈养马来虎的微生物群落来表征其肠道菌群。这项研究是在马来西亚半岛的马六甲动物园进行的，马来虎每周一禁食。总共收集了 10 个马来虎粪便样本、2 个孟加拉虎（外群）和 4 个狮子（外群）的粪便样本，并进行了针对 16S rRNA V3-V4 区域的宏条形码分析。总的来说，我们在马来虎样本中确定了 14 个门、87 个科、167 个属和 53 种肠道微生物组。本研究发现的潜在有害细菌属包括梭杆菌、拟杆菌、狭义梭菌 1、
一种针对SMAD4-SMAD3-DNA复合物的多重时间分辨荧光共振能量转移超高通量筛选分析
未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者（此版本于 2023 年 7 月 15 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.07.15.549169 doi：bioRxiv preprint
人类剪接体的定向高通量诱变揭示了其体内工作原理
剪接体是一种极其复杂的机器，在人类中由 5 种 snRNA 和 150 多种蛋白质组成。我们扩展了单倍体 CRISPR-Cas9 碱基编辑以靶向整个人类剪接体，并使用 U2 snRNP/SF3b 抑制剂 pladienolide B 研究了突变体。超敏替换定义了含有 U1/U2 的 A 复合物中的功能位点，但也定义了在 SF3b 解离后的第二化学步骤中起作用的成分中的功能位点。可行的抗性替换不仅映射到 pladienolide B 结合位点，还映射到 SUGP1 的 G-patch 结构域，该结构域在酵母中缺乏直系同源物。我们使用这些突变体和生化方法将剪接体解离酶 DHX15/hPrp43 鉴定为 SUGP1 的 ATPase 配体。这些数据和其他数据支持一种模型，即 SUGP1 通过在动力学阻滞下触发早期剪接体分解来促进剪接保真度。我们的方法为分析人类细胞中必不可少的机器提供了一个模板。
高通量 PRIME 编辑筛选可识别人类基因组中的功能性 DNA 变异
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可，根据未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者（此版本于 2023 年 7 月 12 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.07.12.548736 doi：bioRxiv 预印本
ENA/VASP蛋白的心血管功能 PRDM6通过调节神经rest细胞分化和迁移来控制心脏发育 微生物和生物炭提高了papapalum caginatum和pennisetum alopecuroides在镉污染的土壤上的补救效率 人类机器人互动心理学中的情感识别孟野Zhao 高通量锂离子电池研究的自动电解质配方和硬币电池组件
1 1，歌德大学分子医学中心，60596，德国法兰克福市，德国2德国心血管研究中心（DZHK），合作伙伴现场莱茵 - 莱因 - 莱茵 - 梅因，60596 Frankfurt Am Main AM AM，德国3号研究所3. 60596德国5号法兰克福5分子医学中心，心血管再生研究所，Goethe-University，60596 Frankfurt Am Main，Dermany 6 Amsterdam心血管科学系，VU大学医学中心，1081 HZ Amsterdam，Nelllands 7 Interlants intherlands intherlands intherlands intherlands interliit forrriit forri forrriit forr。 23562吕贝克，德国8德国心血管研究中心（DZHK），合作伙伴网站汉堡/基尔/吕贝克，23562吕贝克，德国9号，9。汉堡大学医学中心临床化学和实验室医学研究所，汉堡 - 埃平多夫，20246汉堡，汉堡10.医疗中心，55131德国Mainz，11爱尔兰血管生物学中心，药房与生物分子科学学院，爱尔兰皇家外科医生学院，D02 VN51爱尔兰都柏林 *通信：Peter.m.m.benz@gmail.com†当前地址：Cardiememememememememess Research＆Boahe＆Boahe＆Boahem inshe＆Boe kelim inshim ymhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemheim inmhemhemheim 88400德国Biberach。1，歌德大学分子医学中心，60596，德国法兰克福市，德国2德国心血管研究中心（DZHK），合作伙伴现场莱茵 - 莱因 - 莱茵 - 梅因，60596 Frankfurt Am Main AM AM，德国3号研究所3. 60596德国5号法兰克福5分子医学中心，心血管再生研究所，Goethe-University，60596 Frankfurt Am Main，Dermany 6 Amsterdam心血管科学系，VU大学医学中心，1081 HZ Amsterdam，Nelllands 7 Interlants intherlands intherlands intherlands intherlands interliit forrriit forri forrriit forr。 23562吕贝克，德国8德国心血管研究中心（DZHK），合作伙伴网站汉堡/基尔/吕贝克，23562吕贝克，德国9号，9。汉堡大学医学中心临床化学和实验室医学研究所，汉堡 - 埃平多夫，20246汉堡，汉堡10.医疗中心，55131德国Mainz，11爱尔兰血管生物学中心，药房与生物分子科学学院，爱尔兰皇家外科医生学院，D02 VN51爱尔兰都柏林 *通信：Peter.m.m.benz@gmail.com†当前地址：Cardiememememememememess Research＆Boahe＆Boahe＆Boahem inshe＆Boe kelim inshim ymhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemhemheim inmhemhemheim 88400德国Biberach。
高通量锂离子电池研究
zainab.alansari@utas.edu.om *通信：riyaz@gpcet.ac.in收到：2023年4月16日；接受：2023年6月20日；发表：2023年7月1日摘要：在本文中，我们介绍了一种新的方法，用于使用主成分分析（PCA）和逻辑回归（LR）的组合来预测糖尿病的风险。我们的方法提供了一种独特的解决方案，可以导致对糖尿病风险的更准确和有效的预测。要开发一个预测糖尿病的有效模型，重要的是要考虑有助于疾病发育的各种临床和人口统计学因素。这种方法通常涉及在包括这些因素的大型数据集上训练该模型。这样做，我们可以更好地理解不同的特征如何影响糖尿病的发展，并为处于危险中的个人创造更准确的预测。采用PCA方法来减少数据集的尺寸并增强模型的计算功效。LR模型然后将患者分为糖尿病或非糖尿病患者。准确性，精度，召回，F1得分和ROC曲线下的面积（AUC）只是用于评估所提出模型性能的少数指标。PIMA印度糖尿病数据（PIDD）用于评估模型，结果证明了对最新方法的显着改善。该建议的模型提出了一种预测糖尿病风险的有效方法，这可能对改善医疗保健结果和降低医疗保健成本具有重要意义。所提出的PCA-LR模型优于其他算法，例如SVM和RF，尤其是在精度方面，同时优化了计算复杂性。这种方法可能有可能为大型糖尿病筛查计划提供实用有效的解决方案。
用于高通量筛选的标准化转座子工具
随着合成生物学研究的规模越来越大，在活细胞中设计预定义功能需要越来越精确的工具。此外，遗传构建体表型性能的表征需要细致的测量和广泛的数据采集，以便在设计-构建-测试生命周期中为数学模型提供信息并匹配预测。在这里，我们开发了一种简化高通量转座子插入测序 (TnSeq) 的遗传工具：携带 Himar1 Mariner 转座酶系统的 pBLAM1-x 质粒载体。这些质粒源自 mini-Tn5 转座子载体 pBAMD1- 2，并按照标准欧洲载体结构 (SEVA) 格式的模块化标准构建。为了展示它们的功能，我们分析了 60 个土壤细菌 Pseudomonas putida KT2440 克隆的测序结果。新的 pBLAM1-x 工具已经包含在最新的 SEVA 数据库版本中，我们在这里使用实验室自动化工作流程描述了它的性能。
高通量计算筛选具有单斜对称性的新型硅同素异形体
采用随机策略结合群论、图论和高通量计算，系统地扫描了共87种新的单斜硅同素异形体。新的同素异形体中，13种具有直接或准直接带隙，12种具有金属特性，其余为间接带隙半导体。这些新型单斜硅同素异形体中有30多种表现出大于或等于80 GPa的体积模量，其中3种表现出比金刚石硅更大的体积模量。只有两种新的硅同素异形体表现出比金刚石硅更大的剪切模量。详细研究了所有87种Si单斜同素异形体的晶体结构、稳定性（弹性常数、声子谱）、力学性能、电子性能、有效载流子质量和光学性能。五种新的同素异形体的电子有效质量ml小于金刚石硅的电子有效质量。所有这些新型单斜硅同素异形体在可见光谱区都表现出强吸收。结合它们的电子带隙结构，这使它们成为光伏应用的有前途的材料。这些研究极大地丰富了目前对硅同素异形体的结构和电子特性的认识。