在visium工作流程期间，捕获了两种主要数据类型：组织图像和BCL或FASTQ格式的测序数据。太空游侠分析管道使用这两个数据输入将visium测序数据与图像对齐。根据相关的空间条形码，将捕获的每个检测到的基因转录物分配给组织图像上的空间位置。处理数据后，您可以使用Loupe浏览器可视化软件轻松询问空间基因表达数据的不同视图。Loupe浏览器允许您询问显着基因，表征和完善簇并执行差异表达分析。另外，您可以使用第三方工具进一步处理数据。