(a)使用SUP-B15 Cas9单克隆,SGRNA库的慢病毒转导效率。(b)使用KOPN-8 CAS9单个克隆在CRISPR屏幕的“初始”和“最终”点收集的NGS样品中SGRNA读数的分布。(c)使用SUP-B15 Cas9单个克隆在CRISPR屏幕的“初始”和“最终”点收集的NGS样品中SGRNA读数的分布。(d)使用KOPN-8 CAS9单个克隆在CRISPR屏幕上收集的NGS样品的PCA分析。(E)使用SUP-B15 Cas9单个克隆在CRISPR屏幕的“初始”和“最终”点收集的NGS样品的PCA分析。(f)使用KOPN-8 CAS9单个克隆,针对CRISPR屏幕中36个RNA和DNA甲基化机械基因的SGRNA的CRISPR得分。CRISPR得分已针对阴性对照SGRNA的平均得分进行标准化(设置为0.0)。(g)使用SUP-B15 Cas9单克隆,针对CRISPR筛选中36个RNA和DNA甲基化机械基因的SGRNA的CRISPR得分。CRISPR得分已针对阴性对照SGRNA的平均得分进行标准化(设置为0.0)。(h)在KOPN-8 CAS9克隆#2中靶向Znf217的25个SGRNA的计数。(i)读取针对SUP-B15 Cas9克隆#1中Znf217的25个SGRNA的计数。(j)读取25个针对Znf217的SGRNA的计数,SUP-B15 Cas9克隆#2。(k)ZnF217在不同的B-ALL亚型和健康的骨髓中的表达。Znf217表达数据来自白血病(MILE)研究的微阵列创新(登录GSE13159)。n = 70,MLL-R; BCR-ABL1 n = 122; n = 237,类似于bcr- abl1; n = 40用于高二倍体; TCF3-PBx1的n = 36; ETV6-RUNX1的n = 58; n = 73用于健康的BM。使用两尾t检验计算p值。** p <0.01; *** p <0.001。
主要关键词