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大米是全球一半人口的主食。基于表型的传统和标记辅助选择方法已用于稻米改进,但它们既耗时,昂贵又富有劳动力。因此,提高水稻产量的新型育种策略的研究和实施是一个很高的优先事项。基因组选择(GS)为克服这些局限性铺平了道路(Yu等,2016)。有效应用GS育种模型的主要因素是建造具有涵盖目标选择材料的基因组多样性的大规模培训人群(Fu等,2022)。然而,在应用水稻育种计划中的一般人群的实际实施仍处于新生阶段,并且对各种特征的基因组可预测性的全面评估尚未进行。为建造一个普遍代表的培训人群,我们编制了第一个中国耕种的水稻人口(CCRP),其中包括来自25个中国省份的4015个水稻加入,涵盖了五个主要的水稻种植地区,这些地区占中国年总水稻种植面积的99%以上(图1A; tables S1和S2)。这些加入包括1943年的Indica和2072 Japonica水稻加入,其中96%以上是品种和育种线(图1B;表S1和

DEEPCCR:改善水稻育种的大型基因组学深度学习方法

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