课程描述:击败游戏玩家或比人类更好地识别图像的深度学习模型是否也能帮助我们理解基因组学?这项跨学科研究将在多大程度上帮助我们治愈癌症?在基因组学数据以比摩尔定律更快的速度呈指数增长的时代(Berger 等人,2016 年),深度学习方法终于能够帮助解决该领域的基本问题。然而,这些令人兴奋的发展也面临着处理来自我们 DNA 的数据所特有的挑战。作为试图将深度学习与基因组学结合起来的研究人员,我们必须仔细考虑如何将这些模型有效地应用于基因组学任务。在我们的应用中使用深度学习是否合适?我们应该使用什么模型?我们的方法是否会提高我们对数据或问题的理解?在本课程中,您将通过阅读最近的研究文献并在课堂上讨论来回答这些问题。您将了解不同的基因组学任务、深度学习模型以及它们如何结合在一起。本课程旨在培养批判性思维,并允许学生共同应用这些模型。