Amplicon宏基因组学是基于微生物RRNA基因的NGS测序。由于ngs读取长度受到限制,因此只能放大和测序rRNA基因的一部分。对于原核生物,该分析靶向16S rRNA基因的高变量区域(V1-9),而对于真菌,内部转录的间隔区域(ITS)用于分类分析(见图1)。理想的底漆系统应该足够通用,以涵盖广泛的分类群体,而随之而来的扩增子必须提供足够的分类信息来进行可靠的分类学分类。根据我们的经验和16S/ITS分析管道的验证,我们建议表1中显示的引物系统。我们的服务不仅限于显示的标记基因和底漆系统,还限于其他系统发育标记基因(例如,细胞色素C氧化酶I)和底漆系统可以使用。试点研究对于为您的特定研究问题找到最佳的底漆系统非常有帮助。