主席负责该机构的全面运作,主要以该机构的名义行事,并正式代表该机构。主席任命董事,董事负责监督该机构任务的执行情况,筹备管理委员会会议,并确保委员会的决定得到执行。主席负责法国政府对核威慑力量的控制和国防所需核资产的管理。主席还担任由总理主持的核出口委员会和由法国总统主持的核政策委员会的成员,并担任政府的核政策顾问。原子能高级专员担任主席的科学和技术顾问,并可受主席或政府部长的委托,负责 CEA 感兴趣的领域的各种咨询和专业知识任务以及与国防和教育有关的任务。两人均由政府通过部长理事会任命正式任命。