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病毒无处不在，做着神秘的事情——人工智能可以帮助研究人员了解它们在海洋和肠道中的情况
作者：Libusha Kelly，爱因斯坦医学院 病毒是微生物生态系统中一种神秘且鲜为人知的力量。研究人员知道，它们可以在从海洋到肠道的几乎所有环境中感染、杀死和操纵人类和细菌细胞。但科学家们还没有完全了解病毒如何影响其周围环境 […]
来源:ΑΙhub作者：Libusha Kelly，爱因斯坦医学院
作者：Libusha Kelly，爱因斯坦医学院 Libusha Kelly 爱因斯坦医学院 爱因斯坦医学院病毒是微生物生态系统中一种神秘且鲜为人知的力量。研究人员知道，它们可以在从海洋到肠道的几乎所有环境中感染、杀死和操纵人类和细菌细胞。但科学家尚未全面了解病毒如何影响其周围环境，这在很大程度上是由于其非凡的多样性和快速进化的能力。
几乎所有环境 快速进化的能力微生物群落很难在实验室环境中研究。许多微生物难以培养，它们的自然环境具有许多影响其成败的特征，科学家无法在实验室中复制。
更多功能因此，像我这样的系统生物学家经常对样本中存在的所有 DNA 进行测序 - 例如，患者的粪便样本 - 分离出病毒 DNA 序列，然后注释编码蛋白质的病毒基因组部分。这些关于基因位置、结构和其他特征的注释有助于研究人员了解病毒可能在环境中发挥的功能，并有助于识别不同种类的病毒。研究人员通过将样本中的病毒序列与病毒基因序列公共数据库中先前注释的序列进行匹配来注释病毒。
像我这样的系统生物学家 分离出 病毒 DNA 序列 注释部分 公共数据库 病毒基因序列然而，科学家们正在以远远超过我们注释这些基因的能力的速度识别从环境中收集的 DNA 中的病毒序列。这意味着研究人员正在使用极小的可用数据发表有关微生物生态系统中病毒的研究结果。
远远超过的速度 开发了一种新方法