了解医学研究中使用哪些数学模型

儿童医学研究所的一个团队开发了一种方法,让科学家知道哪种方法最适合哪个数据集,从而使在医学研究中使用数学建模的复杂世界变得更加容易。

来源:Scimex

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来自: 儿童医学研究所(CMRI)

儿童医学研究所(CMRI)

近年来,使用数学模型来理解复杂的生物系统已经改变了医学研究的游戏规则,推动了创新。现在,儿童医学研究所 (CMRI) 的团队开发了一种方法,让科学家能够了解哪种建模方法最适合哪个数据集。

这项新研究今天发表在《自然方法》上,由 CMRI 计算系统生物学负责人、杨鹏毅副教授 (A/Prof) 领导。

自然方法

杨教授的团队专注于开发计算和统计模型,以更多地了解体内的细胞以及它们如何协同工作。他们还使用这些模型来比较不同疾病的不同治疗方法对个体的影响。令人惊叹的技术发展使得测量数千个单个细胞中的数千种不同分子成为可能,这为生物学提供了新的见解,但也提出了如何处理大量数据的挑战。

“单细胞生物技术推动了许多不同数据集成方法的快速创新和发展,”杨教授说。“这导致了对其系统分类、评估和基准测试的迫切需求。了解每种方法执行多项任务的效果如何将有助于指导决定使用哪种方法。

杨教授的团队发现缺乏比较方法和评估的信息。

“这项研究开发了一个系统,通过对可用方法进行彻底分类和综合基准测试,选择最合适的单细胞多模式组学数据分析方法,”他说。

这项工作包括来自 CMRI 的 Chunlei Liu、Sichang Ding、Hani Jieun Kim、Siqu Long 和 Di Xiao 以及来自悉尼大学的 Shila Ghazanfar 博士。

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