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新工具揭示了 24,000 种以前未知的微生物的基因组
昆士兰科技大学的研究人员已经恢复了超过 24,000 种以前未知的微生物物种的基因组，其中一些来自可能在植物和动物之前进化的全新生命分支。 《自然生物技术》和《自然方法》发表的两项研究详细介绍了这些微生物。
来源:英国物理学家网首页昆士兰科技大学的研究人员已经恢复了超过 24,000 种以前未知的微生物物种的基因组，其中一些来自可能在植物和动物之前进化的全新生命分支。 《自然生物技术》和《自然方法》发表的两项研究详细介绍了这些微生物。
自然生物技术 自然方法来自昆士兰科技大学微生物组研究中心和布里斯班转化研究所生物医学科学学院的本·伍德克罗夫特 (Ben Woodcroft) 副教授表示，细菌和古细菌的微生物群落在支持地球上所有生命方面发挥着至关重要的作用。
“我们知道肠道微生物对于消化和健康至关重要，但微生物在更广泛的环境中也同样重要——从支持土壤中的植物生长到产生我们在海洋中呼吸的氧气，”伍德克罗夫特教授说。 “尽管经过数十年的研究，超过 99% 的微生物物种仍然未知。
肠道微生物 植物生长 微生物种类宏基因组学和寻找新生命
“我们寻找新微生物生命的工具箱中的一个关键工具是“宏基因组学”，其中 DNA 序列数据直接从环境样本中提取。该过程非常有用，因为它几乎可以应用于任何环境中的任何地方。挑战在于处理数据，将我们从宏基因组学中获得的短 DNA 片段拼凑成完整的基因组。
“为了帮助缩小这一差距，我们开发了两种软件工具来识别和分析宏基因组数据中的未知微生物。”
第一个工具 SingleM 可以快速扫描微生物样本并识别存在的生物体，包括与以前见过的任何生物都极其不同的物种。该团队将 SingleM 应用于超过 700,000 个公开的宏基因组数据集，发现环境样本中约 75% 的细胞属于未知物种。
环境样本