新型的交联剂简化活细胞中的蛋白质复合物分析

蛋白质通过构象变化和相互作用在细胞中具有特定的生物学功能。因此,精确的原位分析蛋白质复合物变化对于理解细胞功能,揭示疾病机制并识别潜在的药物靶标至关重要。

来源:英国物理学家网首页
基于连接信息与格拉姆对接结合的交联信息获得了HMG-17和H2B1F之间的相互作用接口信息。绿蛋白是HMG-17,橙蛋白为H2B1F。学分:Angewandte Chemie International Edition(2025)。 doi:10.1002/anie.202501845
Angewandte Chemie国际版

蛋白质通过构象变化和相互作用在细胞中具有特定的生物学功能。因此,精确的原位分析蛋白质复合物变化对于理解细胞功能,揭示疾病机制并识别潜在的药物靶标至关重要。

体内交联质谱法(XL-MS)已成为研究活细胞中蛋白质复合物的强大技术。然而,在富集交联肽的过程中,复杂的步骤会导致相当大的样本损失,这限制了有限样品的分析,并阻碍了定量分析中的可重复性。

质谱

在一项由Angewandte Chemie International Edition发表的研究中,由中国科学院达利安化学物理学研究所(DICP)的Zhang Lihua教授领导,开发了一个新型的基于二甲基吡啶胺的交叉链接,可实现蛋白质复合物的一步和定量分析。

定量分析

使用二甲基哌啶作为富集手柄,研究人员设计了一个交联的2,6-二甲基二甲基二酰胺二酰胺二酰亚胺三甲苯二烷酸酯(DPST)。 DPST表现出细胞膜的通透性,富集能力和定量功能。

通过利用串联质量标签抗体,DPST实现了一步富集和可逆的交联肽的可逆洗脱,从而消除了传统多步骤过程中的样本损失。这允许在体内XL-MS分析使用少于10,000个细胞。

蜂窝级 生物医学研究 更多信息: doi:10.1002/anie.202501845

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