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自动化方法提高了生物活性天然产品发现的效率
从咖啡因到青霉素,天然产品已成为现代社会中的中流,并用于多种应用,例如医学和农药。有成千上万的未开发的天然产品,但是识别具有生物活性的新化合物可能很困难,尤其是在低量生产时。
来源:英国物理学家网首页从咖啡因到青霉素,天然产品已成为现代社会中的中流,并用于多种应用,例如医学和农药。有成千上万的未开发的天然产品,但是识别具有生物活性的新化合物可能很困难,尤其是在低量生产时。
为了克服这一点,伊利诺伊大学Urbana-Champaign的研究人员开发了快速NP,这是一种加速链霉菌中生物活性天然产品的发现和扩展的新方法。该作品发表在“单元系统”杂志上。
天然产品 已发布天然产物是由生物体生产的化学物质,这些化学物质要么对生物生存或提供次要功能,例如保护感染或捕食者。发现源自细菌,真菌和植物的天然产物对救生药物的开发特别有利,包括从链霉菌中分离出的抗生素,如红霉素,达托霉素和万古霉素。
随着计算技术和基因组测序的进步,研究人员可以使用微生物基因组挖掘来更有效地发现新的天然产品,与需要直接与生物体隔离的传统方法相比。但是,仍然可以对这些过程进行改进,因为并非所有天然产品都表现出生物活性的特性,并且许多天然产品的生产量很低,因此很难检测到它们。
“在这项工作中,我们试图解决自然产品发现中的两个挑战。第一个挑战是我们如何有效地识别生物活性的新化合物。 “第二个挑战是我们如何使用机器人系统扩展捕获方法。”
挑战 基因 成功率