机器学习模型,以预测AAV Capsids基因治疗的适应性

人类基因疗法的一项新研究描述了一种机器学习(ML)模型,该模型可以用作繁琐的体外实验的替代物。在硅方法中,这旨在提高临床腺相关病毒(AAV)衣壳的适应性,以使基因疗法对患者的经济更加可行。

来源:英国物理学家网首页
Capsid-蛋白质语言模型(CAP-PLM)预测AAV2突变体的适应性。学分:人类基因疗法(2025)。 doi:10.1089/hum.2024.227
人类基因疗法

人类基因疗法的一项新研究描述了一种机器学习(ML)模型,该模型可以用作繁琐的体外实验的替代物。在硅方法中,这旨在提高临床腺相关病毒(AAV)衣壳的适应性,以使基因疗法对患者的经济更加可行。

开发具有提高产量或健身性的AAV CAPSID是降低制造成本以使基因疗法更实惠的关键策略。

基因疗法

Christian Mueller和Sanofi的合着者描述了一种最先进的ML模型,该模型可预测基于衣壳单体的氨基酸序列AAV2 CAPSID突变体的适应性。

研究人员说,通过结合蛋白质语言模型(PLM)和经典的ML技术,我们的模型实现了CapSID适应性的明显高预测准确性(Pearson相关性= 0.818)。” “重要的是,对完全独立的数据集进行的测试显示了我们模型的鲁棒性和概括性,即使对于多突变的AAV CAPSIDS也是如此。”

“基于人工智能(AI)的方法是Capsid工程中的令人兴奋的发展,它具有比传统的定向进化和基于理性设计的策略更具系统性,全面和成本效益的潜力。Wu等人的研究是为基因治疗领域的AI工具开发的伟大一步。马萨诸塞州陈医学院。

capsid

更多信息:Jason Wu等人,使用基于蛋白质语言的机器学习模型,人类基因治疗的腺相关病毒适应性的预测(2025)。 doi:10.1089/hum.2024.227

更多信息: doi:10.1089/hum.2024.227

期刊信息:人类基因疗法

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