化学家证实“高能水”可以增强将分子结合在一起的键

限制在分子腔内的水可以增强化学键,并可能重塑药物设计。

来源:ZME科学
水分子是分子键形成的驱动力,例如在蛋白质中。图片来源:INT、KIT。

水有人格分裂。当它在玻璃杯或河流中自由流动时,它就是我们都知道的随和液体。但如果把它困在蛋白质或合成分子的微小口袋里,它就会发生变化。它变成了“能量水”——分子被挤进如此狭小的空间,以至于它们拥有额外的能量并渴望逃脱。可以把它想象成困在气球里的空气:把它挤得太紧,一旦有开口,它就会破裂。

在《Angewandte Chemie 国际版》上发表的一项新研究中,卡尔斯鲁厄理工学院 (KIT) 和不来梅建筑大学的研究人员表明,这种受限的高能水可以主动驱动分子键合,而不仅仅是袖手旁观。

应用化学国际版

“通常,水分子之间的相互作用最为强烈。然而,实验获得的数据表明,水在如此狭窄的空腔中表现得异常,”卡尔斯鲁厄理工学院的 Frank Biedermann 博士说道。

这意味着当被困的水最终被取代时 - 例如,当另一个分子取代它时 - 其存储的能量的释放会加强新的键。它是一种分子动力辅助装置,直接根据 H2O 的特性而构建。

被困的水,被压抑的能量

为了理解这一现象,研究小组(Jeffry Setiadi、Michael K. Gilson、Werner M. Nau 和 Frank Biedermann)在分子水平上研究了限制。他们建立了一种名为 cucurbit[8]uril (CB8) 的分子的计算机模型。 CB8 的形状像一个空心南瓜,充当分子“宿主”,能够在其空腔内捕获更小的“客体”分子。

团队希望了解在客人到达之前,该空间内积存的水会发生什么情况。通过分子动力学模拟,他们发现将水从这些小笼子中排出的能量成本差异很大,从几乎没有到每摩尔 37 卡路里。