京兆唇形鳅(Theraphosidae:Chilobrachys)核型及基因组特征分析

京兆唇鳖(Theraphosidae:Chilobrachys)核型及基因组特征分析 摘要:京雉唇形鳅药物制剂具有抗炎、解毒、镇痛、抗水肿等多种治疗作用。然而,由于缺乏染色体核型和基因组数据,对其遗传背景和毒素机制的研究受到阻碍。在本研究中,我们利用染色体制备技术分析了京兆虫的核型,利用流式细胞术和K-mer分析估计了基因组大小,并利用第二代和第三代单分子实时测序技术进行了基因组测序和组装。结果表明,京兆二倍体染色体数目为2n=68,核型式为2n=46m+18sm+4st,染色体补数为2n=10L+18M2+38M1+2S。使用 Solanum lycopersicum 和 Trichonephila clavata 作为参考,流式细胞术估计基因组大小分别为 7,775.49 Mb 和 7,680.26 Mb。 19 聚体分析还估计基因组大小为 7,626.00 Mb,与流式细胞术结果一致。进一步分析表明,京兆虫基因组杂合度较高(8.45%),重复序列比例较高(67.10%),属于超高杂合度、高重复基因组。 C. jingzhao 的初始基因组组装大小为 8,804.93 Mb,重叠群 N50 为 55.55 Mb,BUSCO 完整性为

来源:Arácnido

京兆唇形鳅(Theraphosidae:Chilobrachys)核型及基因组特征分析

摘要

京兆蝽药制剂具有多种治疗功效,包括抗炎、解毒、镇痛、抗水肿等作用。然而,由于缺乏染色体核型和基因组数据,对其遗传背景和毒素机制的研究受到阻碍。在本研究中,我们利用染色体制备技术分析了京兆虫的核型,利用流式细胞术和K-mer分析估计了基因组大小,并利用第二代和第三代单分子实时测序技术进行了基因组测序和组装。结果表明,京兆二倍体染色体数目为2 n=68,核型式为2 n=46m+18sm+4st,染色体补数为2 n=10L+18M2+38M1+2S。使用 Solanum lycopersicum 和 Trichonephila clavata 作为参考,流式细胞术估计基因组大小分别为 7,775.49 Mb 和 7,680.26 Mb。 19 聚体分析还估计基因组大小为 7,626.00 Mb,与流式细胞术结果一致。进一步分析表明,京兆虫基因组杂合度较高(8.45%),重复序列比例较高(67.10%),属于超高杂合度、高重复基因组。 C. jingzhao 的初始基因组组装大小为 8,804.93 Mb,重叠群 N50 为 55.55 Mb,BUSCO 完整性评分为 95.9%,表明组装质量较高。该研究首次揭示了京兆虫的核型和基因组信息,为其全基因组、毒素机制、遗传学、起源、进化和分类学研究提供了重要数据。