Diffusion model predicts 3D genomic structures
此图显示了 Dip-C 研究中报告的几条染色体的三维基因组结构，这些染色体用于训练新的 ChromoGen 模型。图片来源：研究人员提供，由 MIT News 编辑。作者：Anne Trafton 您体内的每个细胞都包含相同的基因序列，但每个细胞仅表达其中的一部分 […]
Delectopecten thermus Lin，载于 Lin, Peng, Chen, Xu et Qiu，2025。DOI：doi.org/10.1071/IS24091 Researchgate.net/publication/388836581 x.com/squamiferum摘要Delectopecten 是扇贝科（双壳纲：扇贝科）的一个小属，其形态学和系统发育研究仍很少。本文，我们根据从冲绳海槽北部东远成喷口区（962 米深）采集的样本的形态学研究和分子分析，描述了该属的第一个来自深海热液喷口生态系统的成员，D. thermus sp. nov.。从形态学上讲，这个新物种的壳大
When the old just won’t do: Unlocking the full potential of optical genome mapping
来自 CSIR 细胞和分子生物学中心的研究人员将光学基因组图谱 (OGM) 与端粒到端粒 (T2T) 参考基因组相结合，提供了完整、无间隙的基因组视图。这种创新方法解决了重复区域的结构变异，彻底改变了基因诊断和研究。
服务科学领域的全球领导者赛默飞世尔科技宣布推出 Olink® Reveal，为经济实惠、高复杂性的蛋白质组学树立了新标准，使研究人员能够以更低的成本和设置要求识别一系列应用的循环生物标记物。 Olink Reveal 代表了一种强大的蛋白质组学研究新工具，可测量约 1,000 种精心挑选的人类蛋白质，以广泛筛选蛋白质组，同时还能深入表征关键的炎症过程……
With generative AI, MIT chemists quickly calculate 3D genomic structures
一种新方法只需几分钟而不是几天，就可以预测特定 DNA 序列在细胞核中的排列方式。
布提达科 (Scorpiones) 线粒体基因组比较分析：基因重排和系统发育意义摘要蝎子是一类多样化的蛛形纲动物，由 2,000 多个有效物种组成，但其完整线粒体基因组 (mitogenome) 的研究关注有限。为了增加基于线粒体基因组可供研究的物种分类采样频率，我们重建了布提达科五种蝎子的完整线粒体基因组，它们是 Androctonus amoreuxi (Audouin, 1826)、Hottentotta tamulus (Fabricius, 1798)、Leiurus quinquestriatus (Ehrenberg, 1828)、Lychas mucronatus (Fabri
两种近缘狼蛛的基因组和甲基化特征与维持基因组稳定性和适应性进化有关摘要帕多萨蜘蛛属于狼蛛科，由于其在害虫控制方面的作用，在维持森林和农业生态系统的健康方面发挥着至关重要的作用。这项研究展示了两种近缘帕多萨蜘蛛物种 P. laura 和 P. agraria 的染色体水平基因组组装。这两个物种的基因组都显示出 helitron 转座因子的显著扩增，这导致它们的基因组尺寸较大。甲基化组分析表明，与 P. agraria 相比，P. laura 具有更高的整体 DNA 甲基化水平。DNA 甲基化不仅可能有助于转座因子驱动的基因组扩增，而且还会在转座子扩增后对 P. laura 的三维组织产生积极影响
Microbial diversity mapped: 42% of bacteria lack genomic data, study finds
美国能源部 (DOE) 联合基因组研究所 (JGI)（位于伯克利实验室的 DOE 科学用户设施办公室）的研究人员在《科学进展》上发表了一项研究，评估了微生物基因组生物多样性的现状。他们的研究利用过去三十年产生的公开可用的基因组序列数据，评估了我们已知的微生物多样性比例，并提出了管理和培育未知物种的途径。
Ancient genomes reveal an Iron Age society centred on women
一项国际研究揭示了英国铁器时代社会通过母系血统赋予女性权力，挑战了先前关于性别角色的叙述。古代基因组揭示了一个以女性为中心的铁器时代社会一文首次出现在《科学探究者》。
Ancient Genomes Reveal Iron Age Society Centered on Women
都柏林圣三一学院 由圣三一学院的遗传学家领导的国际遗传学家团队与伯恩茅斯大学的考古学家联手破译了英国的结构......
Analyzing diversity of reverse-transcriptase-containing viruses through global metagenomics
病毒逆转录酶 (RT) 在复制（例如，逆转录病毒将 RNA 模板逆转录成互补 DNA）和基因组突变（例如，噬菌体中产生多样性的逆转录元件）中起着关键作用。与逆转录病毒不同，细菌病毒（噬菌体）不是使用 RT 进行基因组复制，而是使用病毒基因在产生多样性的逆转录元件 (DGR) 内变异，或用于其他多样化的生物功能（例如，CRISPR-RT）。
基于蜘蛛线粒体基因组的分子系统发育关系：揭示进化和对极端环境的适应性摘要本研究对共 255 个蜘蛛线粒体基因组和 4 个外群进行了比较分析，其中 39 个物种的线粒体基因组是从头组装的，以探索线粒体基因组的系统发育关系和适应性进化。结果表明，水生银线蛛的线粒体长度最长，密码子偏好性最明显，为 UUA，其次是 CCU。不同科的密码子使用频率相似，蜘蛛线粒体基因组中的密码子使用主要受自然选择压力而非 G/C 突变偏向的影响。我们的系统发育拓扑结构清楚地解释了蜘蛛之间的进化关系，分歧时间估计表明蜘蛛起源于早泥盆世，中皮蜘蛛和后皮蜘蛛两个分支在晚石炭世分离。祖先范围和性状重建结果支持蜘蛛的祖先起源于泥
Will genome editing transform our children's health? Some have doubts
一组科学家声称，通过在胚胎阶段编辑人类基因组，可以大幅降低心脏病等常见疾病的风险 - 但其他生物学家强烈反对
Azenta Obtains Regulatory Approval for Clinical Long-Read Whole Genome Sequencing Test
Azenta, Inc. 宣布推出用于临床应用的长读长全基因组测序 (WGS) 测试。Azenta 成为第一家获得监管部门批准在美国提供此测试的商业供应商。传统的短读长测序方法通常难以识别基因组重复区域中的遗传变异，而这些变异是许多罕见疾病的基础，阻碍了准确诊断和有针对性的治疗……
1,500 ancient European genomes reveal previously hidden waves of migration, study finds
研究人员开发了一种更精确的方法来从古代 DNA 中了解祖先，并用它来识别以前未知的迁徙浪潮。
Semisulcospira egretta Y.-Z. Meng，载 Xu, Meng, Zeng, Wang, Zhong, Yang, Zhou et Glasby，2025。 DOI：doi.org/10.3897/zse.101.136882 摘要在研究中国半沟螺科（Semisulcospira egretta）的多样性和系统发育过程中，我们在福建省厦门市的山溪中根据形态学和分子证据发现了一个推测的新种。该新种半沟螺属（Semisulcospira egretta sp. nov.）的特点是其壳薄而光滑，育儿囊中保留了约0.5毫米长的胚壳，并且其舌状形态具有独特特征。线粒体标记
