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缺乏 Sry 的 Amami 棘鼠的哺乳动物性染色体的周转是由于雄性特异性的 Sox9 上调
哺乳动物的性染色体是高度保守的，性别由 Y 染色体上的 SRY 决定。两种特殊的啮齿动物群（其中一些物种缺少 Y 染色体和 Sry）为我们了解新的性基因如何产生并取代 Sry ，从而导致性染色体周转提供了见解。然而，30 多年的深入研究未能揭示这两个谱系中新的性基因的身份。我们在此报告在奄美刺鼠 Tokudaia osim- ensis 中发现了雄性特异性的 Sox9 增强子重复，这种大鼠的雄性和雌性都只有一条 X 染色体（XO/XO），而 Y 染色体和 Sry 完全丢失。我们进行了全面的调查以检测刺鼠中性别特异性的基因组区域。性别相关的基因组差异仅限于雄性特异性的 17 kb 单位重复，该重复位于常染色体上 Sox9 上游 430 kb 处。使用雄性刺鼠细胞进行的 Hi-C 分析表明，重复区域具有与 Sox9 的潜在染色质相互作用。重复单元含有一个与小鼠增强子 14 (Enh14) 同源的 1,262 bp 元件，Enh14 是一种候选 Sox9 增强子，在小鼠中功能冗余。转基因报告小鼠表明，刺鼠 Enh14 可作为小鼠胚胎睾丸增强子发挥作用。用重复的刺鼠 Enh14 替换 Enh14 的 XX 小鼠的胚胎生殖腺显示 Sox9 表达增加，Foxl2 表达减少。我们提出，这种 Sox9 增强子的雄性特异性重复取代了 Sry 功能，从而定义了刺鼠中的一种新型 Y 染色体。
抑制 DNA 甲基化和 RNA 编辑可上调免疫原性 RNA，从而改变肿瘤微环境并延长卵巢癌患者的生存期
摘要 背景 卵巢癌 (OC) 是女性第五大致命癌症，迫切需要新型疗法。临床前研究表明，DNA 甲基转移酶抑制剂 (DNMTis) 可以逆转 OC 中的免疫抑制肿瘤微环境。抑制 DNA 甲基转移酶可激活双链 (ds)RNA 的转录，包括转座因子。这些 dsRNA 激活细胞质中的传感器并触发 I 型干扰素 (IFN) 信号传导，招募宿主免疫细胞杀死肿瘤细胞。腺苷脱氨酶 1 (ADAR1) 由 IFN 信号传导诱导，并通过 A 到 I 核苷酸变化编辑哺乳动物 dsRNA，这在测序数据中读取为 A 到 G 的变化。这些编辑后的 dsRNA 无法被 dsRNA 传感器感知，因此 ADAR1 在负反馈回路中抑制 I 型 IFN 反应。我们假设减少 ADAR1 编辑将增强 DNMTi 诱导的免疫反应。方法用 DNMTi 体外处理人类 OC 细胞系，然后进行 RNA 测序以测量 RNA 编辑。Adar1 在 ID8 Trp53 -/- 小鼠 OC 细胞中被稳定敲低。用模拟或 DNMTi 处理测试对照细胞 (shGFP) 或 shAdar1 细胞。使用流式细胞术对肿瘤浸润免疫细胞进行免疫表型分析，并分析细胞培养上清液中分泌的趋化因子/细胞因子。给小鼠注射同源 shAdar1 ID8 Trp53 -/- 细胞并用四氢尿苷/DNMTi 处理，同时每 3 天给予抗干扰素 α 和 β 受体 1、抗 CD8 或抗 NK1.1 抗体。结果我们表明，在体外 DNMTi 处理后，ADAR1 会编辑人类 OC 细胞系中的转座因子。与单独干扰相比，将 ADAR1 敲低与 DNMTi 相结合可显著增加促炎性细胞因子/趋化因子的产生和对 IFN- β 的敏感性。此外，DNMTi 治疗和 Adar1 缺失可减轻肿瘤负担并延长 OC 免疫功能正常的小鼠模型的生存期。将 Adar1 缺失和 DNMTi 相结合可引发最强大的抗肿瘤反应，并通过增加 CD8+ T 细胞的募集和激活来改变免疫微环境。
利用 CRISPR-Cas9 和体外组装的核糖核蛋白操纵全局调节器 mcrA 上调温曲霉中的次级代谢产物
摘要：丝状真菌基因组测序表明，大多数次级代谢物生物合成基因簇 (BGC) 在标准实验室条件下处于沉默状态。在这项研究中，我们在温氏曲霉中建立了一个体外 CRISPR-Cas9 系统。为了激活原本沉默的 BGC，我们删除了负转录调节因子 mcrA 。当菌株在马铃薯葡萄糖培养基 (PDA) 上培养时，mcrA (mcrA Δ) 的缺失导致总共产生 17 种 SM。在 15 种 SM 中，有 9 种已得到充分表征，包括大黄素 ( 1 )、大黄酸乙酯 ( 2 )、sulochrin ( 3 )、大黄酸乙酯二蒽酮 ( 4 )、14- O-脱甲基sulochrin ( 5 )、( 反式 / 顺式 )-大黄素二蒽酮 ( 6 和 7 ) 和 ( 反式 / 顺式 )-大黄素大黄酸乙酯二蒽酮 ( 8 和 9 )。经发现，这些化合物均由相同的聚酮合酶 (PKS) BGC 产生。随后，我们在 mcrA Δ 背景下针对该 PKS 簇进行了二次敲除。双敲除菌株的代谢物谱揭示了先前未在 mcrA Δ 亲本菌株中检测到的新代谢物。从双敲除菌株中纯化出另外两种 SM，并被鉴定为曲霉酸 B ( 16 ) 和一种结构相关但之前未鉴定的化合物 ( 17 )。这项工作首次提出了一种能够在 A.wentii 中进行靶向基因编辑的简便遗传系统。这项工作还说明了进行双敲除以消除主要代谢产物的实用性，从而能够发现更多的 SM。■ 简介
一种基于RISC-V处理器的片上调试新方法
RISC-V孵化于加州大学伯克利分校，是基于精简指令集原理的第五代指令集架构，其应用涉及IOT（物联网）、高性能计算等。现行的指令集架构大多受专利保护，这对小公司是一种打击，限制了处理器产业的发展和创新。RISC-V的开源、免费特性为处理器的发展注入了新的活力。随着处理器面积和频率的增加，软件的开发和调试变得更加复杂，对调试手段的要求也越来越高[1]。良好的调试特性可以帮助软件开发人员快速定位错误，因此调试设计对推广RISC-V处理器的使用非常重要，可以有效促进RISC-V处理器生态的发展。
胰岛素诱发的反复低血糖上调化学诱发糖尿病大鼠大脑皮层葡萄糖代谢
摘要：糖尿病是一种严重危害人类健康的慢性代谢疾病。各种研究都强调了维持大脑充足的葡萄糖供应并随后保障大脑葡萄糖代谢的重要性。本研究的目的是阐明和揭示长期高血糖背景下反复低血糖引起的代谢改变，以进一步了解除大脑损害之外的影响。为此，化学诱发的糖尿病大鼠经历了反复胰岛素诱发的低血糖发作。通过分光光度法测量了大脑皮层组织提取物或分离的线粒体中糖酵解、戊糖磷酸途径和克雷布斯循环的关键酶的活性。使用蛋白质印迹分析来测定葡萄糖和单羧酸转运蛋白的蛋白质含量，它们是胰岛素信号通路和线粒体生物合成和动力学的参与者。我们观察到复发性低血糖会上调线粒体己糖激酶和克雷布斯循环酶（即丙酮酸脱氢酶、α-酮戊二酸脱氢酶和琥珀酸脱氢酶）的活性以及线粒体转录因子 A (TFAM) 的蛋白水平。这两种损伤都会增加核因子红细胞 2 相关因子 2 (NRF2) 的蛋白含量，并引起线粒体动力学的不同影响。发现胰岛素信号下游通路被下调，并且发现糖原合酶激酶 3 beta (GSK3 β ) 通过 Ser9 磷酸化降低和 Y216 磷酸化增加而被激活。有趣的是，低血糖和/或高血糖不会导致在神经元可塑性和记忆中起关键作用的 cAMP 反应元件结合蛋白 (CREB) 水平发生变化。这些发现提供了实验证据，表明在慢性高血糖的情况下，复发性低血糖能够引发大脑皮层的协调适应性反应，最终有助于维持脑细胞健康。
早期炎症通过上调 IL-1 b 导致体内神经回路形成失调
发育过程中的神经免疫相互作用与神经发育障碍的发病机制密切相关，但导致神经回路失调的机制尚不清楚。我们对斑马鱼幼鱼正在发育的视网膜顶盖系统进行了体内成像，以表征免疫系统激活对原型感觉处理回路细化的影响。急性炎症损伤诱导了鱼幼鱼正在发育的视网膜轴突的超动态重塑，并在几天内增加了轴突树突的精细化。使用 GCaMP6s 转基因鱼中的钙成像，我们发现这些形态变化伴随着顶盖细胞视力下降的转变。视觉引导行为任务中较差的表现支持了这一发现。我们进一步发现，促炎细胞因子白细胞介素-1b (IL-1b) 因炎症刺激而上调，而 IL-1b 的下调则消除了炎症对轴突动力学和生长的影响。此外，IL-1b 变形动物的视网膜神经节细胞树突基线分支与对照幼虫有显著差异，并且它们在捕食试验中的表现受损，表明该细胞因子在正常神经元发育中发挥作用。这项研究建立了一个简单而有效的非哺乳动物发育免疫激活模型，并证明了 IL-1b 在介导炎症对神经元回路发育的病理影响方面的作用。
β2-肾上腺肾上腺受体信号传导通过上调MCL1
有积累的证据表明，由于社会心理压力引起的交感神经系统的连续激活会增加对治疗的抵抗力，并通过β2-肾上腺受体信号传导加速肿瘤的生长（ADRB2）。但是，效应机制似乎特定于肿瘤类型。在这里我们表明，肾上腺素对ADRB2的激活对固定应激的响应增加，延迟了前列腺癌细胞中细胞毒性药物诱导的MCL1凋亡调节剂（MCL1）蛋白表达的丧失。因此，增加了前列腺癌异种移植对细胞毒性疗法的耐药性。肾上腺素对MCL1蛋白的影响取决于蛋白激酶A（PKA）活性，但与雄激素受体表达无关。此外，血液肾上腺素水平升高与人类前列腺活检中MCL1蛋白的表达呈正相关。总而言之，我们证明了压力会触发
在运动图像期间用fMRI神经反馈对补充运动区域激活的上调
11 RH, Medial Frontal Gyrus 2 -11 51 1683 12 LH, Medial Frontal Gyrus -10 -8 48 1520 13 LH, Medial Frontal Gyrus -7 -17 51 1539 14 LH, Medial Frontal Gyrus -4 -5 57 1344 15 LH, Cingulate Gyrus -10 -11 45 1408 16 LH, Medial Frontal Gyrus -7 -5 57 2086 17 LH，内侧正面回-4 -4 57 1792 18 RH，扣带回8 -2 48 2072 19 RH，内侧额回8 -8 54 54 1848 20 LH，内侧额回-4 -4 -4 -10 49 1268 183 183 183
靶向蛋白质降解是胎儿血红蛋白表观遗传上调的有前途的工具
在肺和所有其他器官之间转运氧气和二氧化碳，红细胞依赖于成人血红蛋白（HBA），一种含有两个α-珠蛋白和两个β-环球蛋白亚基的四聚体蛋白。患有功能障碍或β-珠蛋白量不足的患者患有世界上最常见的生命遗传疾病，共同称为β-血红蛋白疾病。这些疾病的分子病理生理，例如镰状细胞疾病，已经闻名了多年，但治疗选择仍然非常有限。[1]镰状细胞疾病是由编码基因HBB的点突变引起的，该基因HBB导致受影响的镰状血红蛋白（HBS）在低氧条件下聚合。结果，红细胞变成镰状的，倾向于阻塞毛细血管，这会导致整个体内缺血性损害的积累。基因治疗对治疗治疗有很大的希望，[2]但是，大多数居住在低收入和中等收入国家的患者[3]大多数患者无法获得基因治疗所需的医疗基础设施。迫切需要以口服药物的形式进行治疗。出生前，红细胞表达胎儿血红蛋白（HBF），其中包含两个α-珠蛋白和两个γ-珠蛋白亚基。出生后，从γ-珠蛋白转换为β -Globin