微生物群落都是在所有宜居环境中都发现的,并且经常在随着时间的推移而自组织的空间结构中进行组合。只能通过将实验与数学建模相结合,才能理解,预测和管理。如果个人异质性,局部相互作用和适应性行为引起人们的关注,基于个体的模型特别适合。 在这里,我们介绍了完全过度拖拉的软件平台,这是微生物群落的基于个体的动态,模拟Idynomics 2.0,它使研究人员能够指定一系列不同的模型而无需编程。 关键的新功能和改进是:(1)实质上增强的易用性(图形用户界面,模型规范的编辑器,单位转换,数据分析和可视化等)。 (2)提高性能和可伸缩性,可实现3D生物膜中多达1000万代理的模拟。 (3)动力学可以用任何算术函数指定。 (4)代理属性可以从正交模块中组装出来,以进行挑选和混合灵活性。 (5)基于力的机械互动框架,实现了吸引力和非球员形态,作为推动算法的替代方案。 新的Ildynomics 2.0进行了一次密集测试,从单位测试到一组日益复杂的数值测试以及基于硝基化生物膜的标准基准3。基于个体的模型特别适合。在这里,我们介绍了完全过度拖拉的软件平台,这是微生物群落的基于个体的动态,模拟Idynomics 2.0,它使研究人员能够指定一系列不同的模型而无需编程。关键的新功能和改进是:(1)实质上增强的易用性(图形用户界面,模型规范的编辑器,单位转换,数据分析和可视化等)。(2)提高性能和可伸缩性,可实现3D生物膜中多达1000万代理的模拟。(3)动力学可以用任何算术函数指定。(4)代理属性可以从正交模块中组装出来,以进行挑选和混合灵活性。(5)基于力的机械互动框架,实现了吸引力和非球员形态,作为推动算法的替代方案。新的Ildynomics 2.0进行了一次密集测试,从单位测试到一组日益复杂的数值测试以及基于硝基化生物膜的标准基准3。第二个测试案例是基于在BACSIM中实施的“生物膜促进利他主义”研究,因为由于合作个体之间的积极反馈,竞争结果对发展的空间结构非常敏感。我们通过添加形态来扩展了这一案例研究,以发现(i)丝状细菌构成球形细菌,无论生长策略如何,以及(ii)在竞争竞争的不合作丝中,因为细丝可以逃脱彼此之间更强大的竞争。总而言之,新的改进的Idynomics 2.0加入了越来越多的平台,用于基于微生物社区的基于个人的模型,具有我们讨论的特定优势和缺点,为用户提供了更广泛的选择。
2。b i amass发酵:使用高蛋白含量和微生物的快速生长来有效地制造大量富含蛋白质的食物。例如,Quorn通过发酵生长丝状真菌,以用作其产品中的主要成分。
大气气溶胶(例如雾中的水滴)会通过散射和吸收干扰激光传播。飞秒光丝已被证明可以清除雾区,从而改善后续脉冲的传输。但其详细的除雾机理尚未确定。在本文中,我们直接测量并模拟了在飞秒光丝特有的光学和声学相互作用影响下,半径约为 5 μ m(典型的雾)的水滴的动态。我们发现,对于由准直近红外飞秒脉冲崩溃产生的光丝,主要的液滴清除机制是激光光学破碎。对于此类光丝,光丝能量沉积在空气中发射的单周期声波不会对液滴造成影响,并且几乎不会产生横向位移,因此对雾的清除作用也几乎不会产生影响。仅对于紧密聚焦的非丝状脉冲,其中局部能量沉积大大超过丝状脉冲,声波才会显著取代气溶胶。
1 Universite Paris-Saclay, CNRS, AgroParisTech, Ecologie Systématique et Evolution, 91190, Gif-sur- Yvette, France *Corresponding authors: samuel.a.odonnell@gmail.com , jeanne.ropars@cnrs.fr S. O'Donnell : Conceptualization, Data Curation, Formal Analysis, Investigation, Methodology, Software, Validation,可视化,写作草稿,写作评论和编辑。G. Rezende:调查。J.-P。 Vernadet:数据策划,调查,软件。 A. SNIRC:调查。 J. Ropars:概念化,数据策划,资金获取,调查,方法论,项目管理,资源,监督,验证,写作原始草案,写作评论和编辑。 orcids samuel O'Donnell:https://orcid.org/0000-0000-0003-2447-1993 Jeanne Ropars:https://orcid.org/0000-0000-0000-0002-3740-9673关键字适应;转座元素;模具;丝状真菌;发酵食品;临床;青霉;曲霉;人造环境;准确的系统发育; HGTJ.-P。 Vernadet:数据策划,调查,软件。A. SNIRC:调查。 J. Ropars:概念化,数据策划,资金获取,调查,方法论,项目管理,资源,监督,验证,写作原始草案,写作评论和编辑。 orcids samuel O'Donnell:https://orcid.org/0000-0000-0003-2447-1993 Jeanne Ropars:https://orcid.org/0000-0000-0000-0002-3740-9673关键字适应;转座元素;模具;丝状真菌;发酵食品;临床;青霉;曲霉;人造环境;准确的系统发育; HGTA. SNIRC:调查。J. Ropars:概念化,数据策划,资金获取,调查,方法论,项目管理,资源,监督,验证,写作原始草案,写作评论和编辑。orcids samuel O'Donnell:https://orcid.org/0000-0000-0003-2447-1993 Jeanne Ropars:https://orcid.org/0000-0000-0000-0002-3740-9673关键字适应;转座元素;模具;丝状真菌;发酵食品;临床;青霉;曲霉;人造环境;准确的系统发育; HGT
步骤 4:将混合物通过咖啡滤纸或粗棉布过滤到透明塑料杯中,去除固体部分。步骤 5:小心地将冷外用酒精倒入杯壁,在草莓液体顶部形成一层。DNA 将开始在两种液体之间的边界处沉淀。步骤 6:使用搅拌棒收集形成的白色丝状 DNA。
大量使用石油产品是环境污染中最重要的问题之一。他们污染了水,土壤和空气。由于这些原因,寻找有效的石油生物降解方法对于解决环境问题非常重要。该研究旨在隔离和选择降解微生物,并调查其在油污染土壤“前situ”中的有效性。使用从受污染的土壤中分离出的微生物,由细菌,酵母和丝状真菌组成生物制备。使用MALDI-TOF质谱法(美国布鲁克)鉴定出微生物分离株。在GVT LT,Ltd的土壤处理地点(KiškėnaiVillage,Dovilai Enpripsion,Klaipėda区)在两个测试变体中测试了生物制备。在研究开始时,在两周和之后的每个月结束之前,通过培养基中的培养基中的媒介方法确定了土壤中微生物(CFU/G)的数量,直到清洁季节的结束。根据LST EN ISO 16703确定石油产品(G/kg)的含量(g/kg)。已经开发了有效的生物制作,以降解油烃的降解。在5个月内,它的石油产品量减少到了61,7%的变体1和58.7%的变体2。关键字:油,生物降解,细菌,酵母,丝状真菌
DNA是遗传质量组成的化学物质。所有具有细胞核的细胞。在瑞典语中,DNA代表脱氧纤维核酸,是一个长丝状分子,由糖和磷酸盐链上的氮碱基组成。可以从动物和植物的多种组织和细胞类型中提取分子。在本实验室中,您应该能够在一些盐,洗涤剂和乙醇的帮助下参与提取和观看自己的DNA!