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肠道小鼠模型中的肠道菌群和代谢产物变化
偏头痛是一种普遍的临床疾病，其特征是复发性单侧跳动头痛发作，并伴随着恶心，呕吐，恐惧症和恐惧症等症状。尽管发生了常见，但偏头痛的诊断，病理生理和治疗仍然存在争议。广泛的研究已将肠道微生物群涉及各种中枢神经系统疾病，包括焦虑症，抑郁症和帕金森氏病。一些研究还表明，偏头痛可能源于对神经激素和代谢的中断。这项研究旨在研究偏头痛小鼠模型和正常小鼠之间肠道微生物群和代谢产物的差异，以阐明潜在的机制和潜在的治疗方法。在偏头痛小鼠模型和正常小鼠之间观察到肠道微生物组成的明显差异，表明这些变化与偏头痛的发病机理之间存在潜在的相关性。这项研究提供了肠道菌群组成和偏头痛小鼠模型和正常小鼠之间代谢物差异的证据，这表明Akkermansiaceae构成了假注射小鼠组中最丰富的分类群，而Lachnospiraceae构成了迁移小鼠模型组中最普遍的组。Akkermansia Muciniphila和Lachnospileceae细菌与代谢产物的丰富性之间的关联表明它们在偏头痛发病机理中的潜在作用。在偏头痛的小鼠中观察到的lachnospileaceae的丰度及其与代谢物变化的相关性表明它可能会影响宿主的健康。因此，益生菌治疗是偏头痛的可能治疗方法。此外，在偏头痛小鼠和正常小鼠之间观察到肠道代谢产物的显着差异。这些变化涵盖了多种代谢途径，表明代谢障碍也可能有助于偏头痛的发展。
量化人类肠道菌群的每日发酵产物的每日收获
肠道菌群释放的发酵产品为宿主提供了能量和重要的调节功能。 然而，关于微生物群和人类宿主之间的代谢物交换的定量信息很少，因此发酵产物的有效剂量。 在这里，我们引入了一个综合框架，将主要肠道细菌的实验表征与人类消化生理学的定量分析相结合，以对这种交换及其对饮食和微生物群组成的依赖进行数字。 从加油菌群生长的复杂碳水化合物中，我们发现大多数碳最终都以宿主大量利用的发酵产品结束。 混合发酵产品的这种收获随饮食的差异很大，从美国人口内的100-700 mmol介于饮食之间，到坦桑尼亚的Hadza人的1300人。 因此，发酵产品覆盖了人类宿主每日能量需求的2％至12％，大大低于实验室小鼠估计的21±4％。 相比之下，微生物群的组成对每日的总收获几乎没有影响，但决定了特定发酵产物的收获。 丁酸酯以促进上皮健康而闻名，显示出最大的变化。 因此，我们的框架确定并量化了驱动代谢相互作用的主要因素，并在微生物群和宿主之间进行信息交换，这对于机械学上至关重要的是剖析微生物群在健康和疾病中的作用。肠道菌群释放的发酵产品为宿主提供了能量和重要的调节功能。然而，关于微生物群和人类宿主之间的代谢物交换的定量信息很少，因此发酵产物的有效剂量。在这里，我们引入了一个综合框架，将主要肠道细菌的实验表征与人类消化生理学的定量分析相结合，以对这种交换及其对饮食和微生物群组成的依赖进行数字。从加油菌群生长的复杂碳水化合物中，我们发现大多数碳最终都以宿主大量利用的发酵产品结束。混合发酵产品的这种收获随饮食的差异很大，从美国人口内的100-700 mmol介于饮食之间，到坦桑尼亚的Hadza人的1300人。因此，发酵产品覆盖了人类宿主每日能量需求的2％至12％，大大低于实验室小鼠估计的21±4％。相比之下，微生物群的组成对每日的总收获几乎没有影响，但决定了特定发酵产物的收获。丁酸酯以促进上皮健康而闻名，显示出最大的变化。因此，我们的框架确定并量化了驱动代谢相互作用的主要因素，并在微生物群和宿主之间进行信息交换，这对于机械学上至关重要的是剖析微生物群在健康和疾病中的作用。
晚期神经胶质瘤与小鼠肠道细菌代谢产物的有害变化有关
1 Angers University，Nantes UniversitÉ，Chu Angers，Inserm，CNRS，CRCI2NA，SFR ICAT，F-49000 Angers，法国； aglae.herbreteau@univ-angers.fr（A.H.）; yves.delneste@univ-angers.fr（y.d。）; dominique.couez@univ-angers.fr（D.C.）2 NantesUniversité，Inserm，Tens，肠道和脑疾病中的肠神经系统，IMAD，F-44000 Nantes，法国； philippe.aubert@univ-nantes.fr（p.a.）; philippe.naveilhan@univ-nantes.fr（p.n.）; michel.neunlist@inserm.fr（M.N.）3 Chu Nantes，CNRS，CNRS，Inserm，L'Institut du Thorax，F-44000 Nantes，法国； mikael.croyal@univ-nantes.fr（M.C.）; stephanie.crossouard@univ-nantes.fr（S.B.-C.）4 Chu Nantes，UniversitédeNantes大学，CNRS，CNRS，SfrSanté，Inserm UMS 016，CNRS UMS 3556，F-44000 Nantes，F-44000 Nantes，法国5 CRNH-OUEST质量群核心核心核心核心范围 * FR FR-44000 NANTARTINES，F-44000 00000 NANTERY：444000 00000 NANTAINTINE，F-44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444400号laetitia.aymeric@univ-angers.fr†这些作者同样为这项工作做出了贡献。
液态金属快中子增殖反应堆 (LMFBR) 中的裂变和腐蚀产物行为
在其专家会议计划中，讨论了液态金属快中子增殖反应堆 (LMFBR) 中的裂变和腐蚀产物行为这一主题。当时很明显，随着美国、苏联、法国和英国实验性快中子增殖反应堆系统的出现，支持性研究计划的扩展以及这些不同活动产生的信息的碎片化性质，在国际层面上协调某些主题将是有益的。
肠道微生态：自然产物调节尿酸代谢的有效靶标
肠道微生态学是由微生物及其在胃肠道中的微生物组成的复杂社区，在维持整体健康和调节各种生理和病理过程中起着至关重要的作用。最近的研究强调了肠道微生态学对调节尿酸代谢的显着影响。天然产物，包括植物，动物和微生物等天然来源的中药配方，包括单体，提取物和传统的中药制剂，也已被研究，以调查其在调节尿酸代谢中的潜在作用。根据研究，肠道微生态的稳定性是维持健康的尿酸代谢并减少与高尿素相关疾病的自然产物的关键联系。在此，我们回顾了最近的高级证据，揭示了肠道微生态和尿酸代谢之间的双向调节。并分别总结了自然提取物和草药制剂的关键证据，以调节这两个方面。此外，我们阐明了天然产物在调节尿酸代谢和继发性疾病中的重要机制，尤其是通过调节肠道微生物群的组成，肠粘膜屏障，肠道粘膜屏障，渗透性反应，嘌呤催化剂和相关的转运者。本综述可能会提供对尿酸及其相关疾病管理的新见解，并强调了从天然产物中探索其潜在治疗药物的观点。
采用酶促碎裂法制备文库所得的测序产物
DNA 片段化是基于杂交捕获的短读测序中文库制备过程中的一个基本步骤。迄今为止，人们一直使用超声波来制备适当大小的 DNA，但这种方法会导致大量 DNA 样本损失。最近，研究采用了依赖于 DNA 内切酶酶促片段化的文库制备方法来最大限度地减少 DNA 损失，尤其是在纳米量样本中。然而，尽管它们被广泛使用，但酶促片段化对所得序列的影响尚未得到仔细评估。在这里，我们对使用超声波和酶促片段化方法制备的相同肿瘤 DNA 样本的体细胞变异进行了成对比较。我们的分析显示，与通过超声波创建的文库相比，内切酶处理的文库中反复出现的人工 SNV/indel 数量要多得多。这些人工制品以基因组背景下的回文结构、测序读取中的位置偏差和多核苷酸替换为标志。利用这些独特的特性，我们开发了一种过滤算法，可以高特异性和灵敏度地区分真正的体细胞突变和人为噪声。噪声消除恢复了肿瘤样本中突变特征的组成。因此，我们提供了一种信息学算法来解决因内切酶介导的碎片化而产生的测序错误，这是本研究中首次强调的。
与肠道相关的代谢产物与呼吸道症状的关联19：概念验证研究
与肠道相关的代谢产物与呼吸道疾病有关。肠道和肺之间的串扰表明，肠道健康可能在Covid-19中受到损害。本研究的目的是分析与肠道相关的代谢产物（乙酰-l-肉碱，甜菜碱，胆碱，L-肉碱，三甲基胺和三胺N-氧化物N-氧化物）的患者，与健康的个体和非concovid-19呼吸症状相匹配的患者，与健康的患者相匹配。作为结果，该小组的代谢产物在COVID-19患者中受到损害，并且与呼吸困难和温度的症状有关，并且可以区分Covid-19和哮喘。初步结果表明，较低水平的Betaine似乎与Covid-19患者的结局差有关，这表明BETAINE是肠道微生物组健康的标志。©2022 Elsevier Inc.保留所有权利。
跨黑色素瘤亚型和免疫疗法反应者的血清氧基代谢产物
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年2月6日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.05.636637 doi：Biorxiv Preprint
肠道少生型和血清代谢产物的特征变化：多词分析
抽象的慢性耳鸣是一种中枢神经系统疾病。当前，肠道菌群对耳鸣的影响仍未探索。为了探索肠道菌群与耳鸣之间的联系，我们在70名耳鸣和30名健康志愿者的患者组中进行了16S rRNA测序，对粪便菌群和血清代谢组分分析进行了16s rRNA测序。我们使用加权基因共表达网络方法来分析肠道菌群与血清代谢产物之间的关系。随机森林技术被用来选择代谢物和肠道分类单元来构建预测模型。耳鸣组中明显的肠道营养不良，其特征是细菌多样性降低，富公司/细菌的比率增加，并且包括气或细菌在内的一些机会性细菌富含。相比之下，一些有益的肠道益生菌减少了，包括乳杆菌和乳杆菌科。在血清MIC分析中，耳鸣患者和这些差异代谢产物的血清代谢障碍富含神经炎症，神经递质活性和突触功能的途径。预测模型在测试集中表现出出色的诊断性能，达到0.94（95％CI：0.85-0.98）和0.96（95％CI：0.86-0.99）。我们的研究表明，肠道微生物群的变化可能会影响耳鸣的发生的出身和慢性，并通过血清代谢产物的变化发挥调节作用。总体而言，这项研究提供了对肠道微生物群和血清代谢产物在耳鸣的发病机理中潜在作用的新看法，并提出了“肠道 - 脑耳 - 耳朵”的概念，作为耳鸣的病理机制，具有明显的临床诊断含义和治疗潜力。
根相关的细菌群落和根代谢产物组成与高粱的氮使用效率有关
摘要以高氮利用效率（NUE）的谷物作物的开发是全球农业的优先事项。除了传统的植物育种和基因工程外，植物微生物组的使用还提供了另一种改善作物nue的方法。可以深入了解与多高粱线不同的细菌群落，设计了一个现场实验，比较了足够且缺乏氮（N）下的24种多样的高粱双色线。Amplicon sequencing and untargeted gas chromatography–mass spectrometry were used to characterize the bacterial communities and the root metabolome associated with sorghum genotypes varying in sensitivity to low N. We demonstrated that N stress and sorghum type (energy, sweet, and grain sorghum) significantly impacted the root-associated bacte rial communities and root metabolite composition of sorghum.我们发现高粱和细菌的丰富性和多样性之间存在正相关。高NUE线中的较大α多样性与主要细菌分类群假单胞菌的丰度降低有关。响应低N胁迫，在根代谢产物和根际细菌群落之间检测到了多个强相关性。这表明由于低N引起的高粱微生物组的变化与宿主植物的根代谢产物有关。综上所述，我们的发现表明，根代谢产物的宿主遗传调节在定义与根高粱基因型的根相关微生物组方面发挥了作用，而高粱基因型的NUE和对低N胁迫的耐受性有所不同。