摘要:特异性抗体对于蛋白质复合物的细胞和组织表达、生化和功能分析必不可少。然而,制备特异性抗体通常费时费力。将内源性蛋白质的表位标记在适当的位置可以克服这个问题。在这里,我们使用 AlphaFold2 蛋白质结构预测研究了表位标签位置,并结合 CRISPR-Cas9 基因组编辑和电穿孔 (i-GONAD) 开发了 Flag/DYKDDDDK 标签敲入 CaMKII α 和 CaMKII β 小鼠。使用 i-GONAD,可以将长达 200 bp 的小片段插入目标基因的基因组中,从而实现高效便捷的小表位标记。使用市售的抗 Flag 抗体进行实验,可以通过蛋白质印迹、免疫沉淀和免疫组织化学轻松检测内源性 CaMKII α 和 β 蛋白。我们的数据表明,通过 i-GONAD 生成 Flag/DYKDDDDK 标签敲入小鼠是一种有用且方便的选择,特别是在没有特定抗体的情况下。
摘要 扩大可用于蛋白质可视化和操作的试剂库将有助于了解其功能。与目标蛋白质相连并被现有结合剂(如纳米抗体)识别的短表位标签有助于进行蛋白质研究,因为无需分离针对它们的新抗体。纳米抗体比传统抗体有几个优势,因为它们可以表达并用作体内蛋白质可视化和操作的工具。在这里,我们描述了两个短(<15aa)纳米标签表位 127D01 和 VHH05,以及它们相应的高亲和力纳米抗体。我们展示了它们在果蝇体内蛋白质检测和重新定位、直接和间接免疫荧光、免疫印迹和免疫沉淀中的应用。我们进一步表明,CRISPR 介导的基因靶向提供了一种用纳米标签标记内源性蛋白质的直接方法。纳米标签的单个副本,无论其位置如何,都足以进行检测。这种多功能且经过验证的标签和纳米抗体工具箱将作为广泛应用的资源,包括果蝇及其他物种的功能研究。