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World File Search System共表达
在植物转化，再生和基因...
图1：旨在评估P ESR1驱动基因158激活的基因构建体的实验验证。烟草芽片段用159个农杆菌（GV3101）转化，其中包含cmylcv :: ruby（a）和p在esr1 :: ruby 160（b）显示有限或没有愈伤组织形成。虽然35s :: AtWind1 - 161 AteSr1 :: Ruby（c）的共表达显示出更大的愈伤组织形成和ATESR1 162启动子的激活。（d）愈伤组织形成的定量分析，如区域所示（MM 2）。Explants 163用CAMV 35S :: AtWind1转换出来，显示出大约3-4倍的愈伤组织形成。164（e）在ATESR1启动子下方的IPT等发育调节基因及其165通过ATWIND1激活的表达诱导了快速的愈伤组织诱导，并形成了芽根尖分生组织，166个导致了phytohormone-fime Hormone培养基中的De从头寄生虫的诱导。167
使用酶的化学合成的最新进展
生物催化剂赋予高区域和对映选择性酶特性，可以通过工程化蛋白质序列来调整工业应用。默克研究人员最近的工作解决了与-Ketoglutarate依赖性二氧酶（A -kGD）在制造量表上有关的挑战，包括较低的总周转次数（TTN），有氧反应条件，低稳定性，酶降低，酶灭活酶会因自我 - 羟基化和过度氧化的非氧化剂而灭绝。一个工程的-kGD用直接酶促羟基化取代了五个合成步骤，从而从1中使用1的1中产生手性中间体2，以高的映选择性和制备性产量（图2 a）[ *5]。与血红素依赖性的氧酶相比，A-kgd仅需要与-Ketogoglutarate组合铁，并且不需要复杂的共同因素或还原酶域的共表达。酶的高选择性还使它们能够针对特定的
高度冗余的神经肽体积共同传输是 GnRH 神经元树突间歇性激活的基础
摘要 神经递质共传递的必要性和功能意义仍不清楚。谷氨酸能“KNDy”神经元共表达 kisspeptin、神经激肽 B (NKB) 和强啡肽，并表现出高度刻板的同步行为，该行为读取促性腺激素释放激素 (GnRH) 神经元树突以驱动偶发性激素分泌。使用扩展显微镜，我们显示 KNDy 神经元与 GnRH 神经元树突进行大量紧密的非突触对接。电生理学和共聚焦 GCaMP6 成像表明，尽管所有三种神经肽都从 KNDy 终端释放，但只有 kisspeptin 能够激活 GnRH 神经元树突。从 KNDy 神经元中选择性删除 kisspeptin 的小鼠未能表现出脉动性激素分泌，但保持了同步的偶发性 KNDy 神经元行为，这被认为取决于反复的 NKB 和强啡肽传递。这表明 KNDy 神经元通过高度冗余的神经肽共传递来驱动间歇性激素分泌，而这一过程由 GnRH 神经元树突和 KNDy 神经元上的差异突触后神经肽受体表达所协调。
CD34+ ...
我们的HB G-Makassar直接编辑策略显示了电穿孔后CD34 +细胞的单个碱基的高编辑效率，这是通过红细胞分化持续的。我们证明，在较高的编辑效率下，可以通过将HBS球蛋白水平降低到<15％，并且降低了暴露于低氧条件的细胞的体外疾病，可以实现高双重编辑。通过对纯化的重组Makassar蛋白的全面评估，我们能够证明正常的生化和生物物理特性，与Makassar Globin一致，与正常的血红蛋白功能兼容。我们进一步证明了麦卡萨球蛋白不会在体外聚合，并且共表达的麦卡萨尔球蛋白和镰状球蛋白具有类似于镰状性状细胞的特性。最后，我们脱离了某种低频，非同义旁观者的编辑，该编辑由目标基础编辑产生。再加上自体干细胞移植，将病因镰状细胞突变直接编辑为天然发生的，无症状的HB G-makassar是SCD患者的有希望的新治疗范式。
遗传形态和亨廷顿氏病连接发育和神经变性的皮质细胞损失
皮质细胞损失是亨廷顿氏病（HD）的核心特征，从临床运动诊断之前多年开始，在先前阶段之前。但是，尚不清楚遗传形态与皮质细胞损失有何关系。在这里，我们探讨了这种关系的生物学过程和细胞类型，并使用细胞特异性验尸数据验证它们。平均有15年的疾病发作和71个对照的八十个premifest参与者。 使用体积和扩散MRI，我们提取了HD特异性的全脑图，其中较低的灰质体积和较高的灰质平均扩散率相对于对照组，用作皮质细胞损失的代理。 这些地图与来自艾伦人脑图集（AHBA）的基因分类数据相结合，以研究与遗传折叠和皮质细胞损失有关的生物学过程。 皮质细胞损失与发育基因的表达呈正相关（即 较高的表达与更大的萎缩和增加的扩散率相关），并且与已与神经变性有关的突触和代谢基因的表达负相关。 这些发现对于扩散MRI和容积HD特异性脑图是一致的。 作为野生型亨廷汀在神经发育中起着作用，我们探索了整个AHBA野生型亨廷顿（HTT）表达（HTT）表达与发育基因表达之间的关联。 还进行了134个没有神经退行性疾病的人脑中的共表达网络分析。 这些事件导致跨脑细胞类型的年龄相关细胞死亡。八十个premifest参与者。使用体积和扩散MRI，我们提取了HD特异性的全脑图，其中较低的灰质体积和较高的灰质平均扩散率相对于对照组，用作皮质细胞损失的代理。这些地图与来自艾伦人脑图集（AHBA）的基因分类数据相结合，以研究与遗传折叠和皮质细胞损失有关的生物学过程。皮质细胞损失与发育基因的表达呈正相关（即较高的表达与更大的萎缩和增加的扩散率相关），并且与已与神经变性有关的突触和代谢基因的表达负相关。这些发现对于扩散MRI和容积HD特异性脑图是一致的。作为野生型亨廷汀在神经发育中起着作用，我们探索了整个AHBA野生型亨廷顿（HTT）表达（HTT）表达与发育基因表达之间的关联。还进行了134个没有神经退行性疾病的人脑中的共表达网络分析。这些事件导致跨脑细胞类型的年龄相关细胞死亡。htt表达与神经发育中涉及的基因的表达相关，而共表达网络分析还表明，HTT的表达与发育生物学过程有关。表达加权细胞类型富集（EWCE）分析用于探索哪些特定细胞类型与HD皮层细胞损失相关，并使用来自邮政损坏的HD脑的细胞特异性单核RNASEQ（SNRNASEQ）数据验证了这些关联。在星形胶质细胞和内皮细胞中富含皮质细胞损失的发育转录组谱，而神经退行性转录组谱则富含神经元和小胶质细胞。在HD后大脑中相对于使用SNRNASEQ的对照组差异表达的星形胶质细胞特异性基因富集于Devel-Opmental转录组谱，而神经胶质细胞和小胶质细胞特异性基因在神经变性转录组中富集。我们的发现表明，PreHD中的皮质细胞损失可能是由双重病理过程引起的，这是神经发育变化的一种结合，在生命开始时，随后是成年后的神经变性，靶向突触表达和代谢基因表达降低的区域。
Prime editor 整合酶系统促进靶向 DNA 插入及其他
转录模板和引物结合位点（图 1 A) [1]。无需诱导 DSB 和提供 DNA 供体，prime editing 是一种很有前途的精准基因组编辑技术。Prime edit 最初效率较低 [1]。令人鼓舞的是，通过共表达占主导地位的负错配修复 (MMR) 蛋白来抑制 MMR 去除 prime edit 的异源双链 DNA 产物 [2]，或通过使用具有多核苷酸替换 [3] 或减少 3′ 端降解 [4] 的 pegRNA，取得了改进。Prime edit 通过所有 12 个碱基替换和不同长度的删除，大大提高了基因组编辑能力 [1,5]。然而，一个挑战是使用 PE 插入超过 40 bp 的长 DNA，这部分是由于 pegRNA 3′延伸的长度限制和较长 RNA 的转录效率降低 [1]。为了克服目前 Prime Editing 对长 DNA 插入的限制，最近的两项研究报道了 Prime Editor 整合酶 (PEI) 系统，该系统无缝结合了 Prime Editing 和基于丝氨酸整合酶的重组 [ 6 , 7 ]。
SSTR2与EGFR积极地关联，并预测鼻咽癌的预后不良
摘要目标表皮生长因子受体（EGFR）属于受体酪氨酸激酶家族，而EGFR的过表达与预后不良和癌症进展有关。生物抑制素受体2（SSTR2）是人类中具有多种生物学功能的G蛋白偶联受体（GPCR），并且通过鼻咽癌癌（NPC）中的NF-KB信号通路进行了上调。但是，尚无研究检查NPC中的EGFR和SSTR2。这项研究旨在研究SSTR2是否与NPC中的EGFR和临床病理学特征有关。进行了生物信息学分析，以评估基于GEO数据库的EGFR和SSTR2之间的相关性。通过免疫组织化学（IHC）评估了491例NPC和50例非癌性鼻咽上皮的表达。结果生物信息学分析和IHC在NPC中显示出SSTR2和EGFR之间的正相关。与非癌性鼻咽上皮相比，NPC患者的SSTR2和EGFR的高表达显着增加。SSTR2和/或EGFR的高表达与较差的结果和更高的进展风险有关。 研究发现，接受化学放疗（CR）的患者高表达SSTR2，EGFR高表达以及SSTR2和EGFR的高共表达在无进展的无进展生存（PFS）和总生存期（OS）的预后较差。 有趣的是，SSTR2高表达，EGFR的高表达，EGFR和SSTR2的高表达以及EGFR/SSTR2的NPC患者的任何高表达都可以更好地预后，而CR结合了靶向治疗。SSTR2和/或EGFR的高表达与较差的结果和更高的进展风险有关。研究发现，接受化学放疗（CR）的患者高表达SSTR2，EGFR高表达以及SSTR2和EGFR的高共表达在无进展的无进展生存（PFS）和总生存期（OS）的预后较差。有趣的是，SSTR2高表达，EGFR的高表达，EGFR和SSTR2的高表达以及EGFR/SSTR2的NPC患者的任何高表达都可以更好地预后，而CR结合了靶向治疗。COX多元分析将SSTR2和EGFR识别为PFS的独立预测指标。结论我们的研究是第一个阐明NPC中SSTR2和EGFR之间复杂关系的研究，并为EGFR靶向治疗的潜在益处提供了对高SSTR2表达患者的潜在益处的新见解。此外，SSTR2具有NPC患者预后不良的新生物标志物。
利用药物重新定位发现针对 PKLR 的 NAFLD 治疗药物
此前，我们已经生成了肝脏和其他 45 种主要人体组织基因共表达网络 (CN)，并确定了丙酮酸激酶 L/R (PKLR) 作为靶点，抑制该酶可选择性抑制肝脏中的 DNL (Lee et al., 2017)。丙酮酸激酶是糖酵解中的关键酶，PKLR 基因编码该酶的肝脏 (PKL) 和红细胞 (PKR) 同工型，并催化磷酸烯醇式丙酮酸和 ADP 生成丙酮酸和 ATP。PKL 和 PKR 同工型分别在肝脏和红细胞中特异表达。一项独立的小鼠群体研究也证实了 PKLR 在 NAFLD 发展中的驱动作用 (Chella Krishnan et al., 2018)。最近，我们在 HepG2 细胞中进行了抑制和过表达 PKLR 的体外实验，发现 PKLR 的表达与 FASN 、 DNL 、 TAG 水平的表达以及细胞生长呈显著正相关 (Liu et al., 2019)。基于这些发现，综合分析表明，可以针对 PKLR 开发一种对其他人体组织副作用最小的 NAFLD 治疗策略。
Jain R等。 5G无线技术对云计算和物联网（IoT）的影响。 Adv Rob Tec 2024，2（1）：000107。
我们先天免疫反应的关键部分是反应的演变，这一过程通常在肿瘤恶性肿瘤中被操纵。与产生免疫抑制气候的TME不同，免疫反应的修饰抑制了T细胞增殖和多样化。这通常从包括CTLA-4和PD-1在内的IC的过表达开始。在获得CTLA-4和PD-1 IC疗法的耐药性的情况下，已经观察到替代IC的过表达。交替的IC受体包括粘蛋白结构域-3蛋白（TIM-3）和淋巴细胞激活基因3（LAG-3），B和T淋巴细胞衰减剂（BTLA），T细胞免疫受感染者免疫抑制基抑制型抑制型（TIGIT）（TIGIT），以及V-D抑制（COMAN IMINUNOMOG抑制）。多种IC的共同表达导致严重耗尽的T细胞状态，导致效应子功能受损，T细胞功能的逐渐丧失，转录状态改变和抗原持久性。在上调，共表达IC的情况下，靶向或共同定位这些替代检查点受体可能是防止获得抗性的潜在解决方案。
转录组学数据的综合网络分析揭示了急性放射综合征的潜在药物靶点
最近的政治动荡凸显了了解伽马射线暴露对人类健康和生存能力的短期和长期影响的重要性。在这方面，在发生核灾难的情况下，对急性放射综合征 (ARS) 进行有效治疗是必要的。在这里，我们提出了 20 个 ARS 治疗靶点，这些靶点是使用系统方法确定的，该方法整合了人类和小鼠在放射治疗下获得的基因共表达网络、药物数据库、疾病基因关联、辐射诱导的差异基因表达和文献挖掘。通过选择具有现有药物的基因靶点，我们确定了药物再利用的潜在候选基因。其中八个基因 (BRD4、NFKBIA、CDKN1A、TFPI、MMP9、CBR1、ZAP70、IDH3B) 已通过文献证实在扰动时显示出放射保护作用。这项研究为使用集成多种生物信息的系统级基因关联治疗 ARS 提供了一个新的视角。所确定的基因可能为 ARS 的潜在药物再利用提供高可信度的药物靶点候选基因。