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World File Search System凝胶电泳
通过变性梯度凝胶电泳分析聚合酶链反应扩增的基因编码复杂微生物种群
我们描述了一种分析复杂微生物种群遗传多样性的新型分子方法。该技术基于通过变性梯度凝胶电泳 (DGGE) 分离编码 16S rRNA 的聚合酶链式反应扩增基因片段，这些片段的长度相同。对不同微生物群落的 DGGE 分析表明，分离模式中存在多达 10 个可区分的条带，这些条带很可能来自构成这些种群的许多不同物种，从而生成了种群的 DGGE 图谱。我们表明，可以识别仅占总种群 1% 的成分。使用针对硫酸盐还原菌 16S rRNA 的 V3 区特异性的寡核苷酸探针，可以通过杂交分析识别某些微生物种群的特定 DNA 片段。对在有氧条件下生长的细菌生物膜的基因组 DNA 进行分析表明，尽管硫酸盐还原菌具有厌氧性，但它们仍存在于这种环境中。我们获得的结果表明，该技术将有助于我们了解未知微生物种群的遗传多样性。
琼脂糖凝胶电泳的DNA质量控制
处理化学药品和生物剂时，您需要始终穿安全设备，包括实验室外套，手套和安全护目镜。虽然用于小麦感染的主要生物学剂是澳大利亚常见的病原体，但您必须将它们视为普遍关注的感染剂。谨慎对待他们。请勿将其从实验室中删除。不要通过衣服散布它们。使用专用的笔记本和笔在迷你研究项目中做笔记。在实验室中不要将任何东西放在嘴里。每次离开实验室时洗手。
出版日期：2025/01/28摘要：十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）是蛋白质和蛋白质的基石技术
出版日期：2025/01/28摘要：十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）是蛋白质分析中的基石技术，可根据其分子量提供精确的蛋白质分离和蛋白质的表征。本综述提供了SDS-PAGE的全面概述，作为Western印迹分析的关键一步，重点讨论了其在营养研究和食品质量评估中的应用。本文强调了SDS-PAGE在识别和量化饮食蛋白，评估蛋白质修饰以及评估各种食品基质中功能蛋白的完整性中的作用。特别强调实验参数的优化，例如凝胶组成，样品制备和电泳条件，以确保在复杂的蛋白质混合物中高分辨率和可重复性。此外，该评论探讨了SDS-PAGE协议中最新的进步，包括提高检测灵敏度和与下游分析的兼容性。通过解决常见的技术挑战并提出最佳实践，这项工作旨在在食品和营养科学的背景下提高SDS-PAGE的可靠性和准确性，为其在蛋白质表征，过敏原检测和质量控制中继续使用铺平道路。关键字：SDS-PAGE;蛋白质表征；分子量分离；食品和营养科学；电泳优化。如何引用：Omogbolahan Samson Idowu； David Oche Idoko； Samuel O. Ogundipe;伊曼纽尔·门萨（Emmanuel Mensah）。（2025）。在营养研究和食品质量评估中优化SDS-PAGE以进行准确的蛋白质表征。国际创新科学与研究技术杂志，第10（1）期，1008-1045。 https://doi.org/10.5281/Zenodo.14744563。
DNA 分子量标准简介凝胶电泳操作注意事项
A -1 DNA 降解 —— 避免核酸酶污染。 电泳缓冲液陈旧 —— 电泳缓冲液多次使用后，离子强度降低， pH 值上升，缓冲能力减弱，从而影响电泳效 果。建议经常更换电泳缓冲液。 所用电泳条件不合适 ——电泳时电压不应超过 10 V/cm ，温度小 于 30 ℃，核查所用电泳缓冲液是否有足够的 缓冲能力和凝胶浓度是否正确。 DNA 上样量过多 ——减少凝胶中 DNA 上样量，建议电泳样 品根据孔的宽度加样。 DNA 样含盐过高 ——电泳前通过乙醇沉淀去除过多的盐。 有蛋白污染 ——电泳前酚抽提去除蛋白。 琼脂糖质量 ——选用高质量的琼脂糖 (TIANGEN 公司 ) 。
在加纳琼脂糖中用于DNA的凝胶电泳
Felix Zoiku，Ameyaw Prince，Agyekum Boateng，Prince Fordjour，Nana Aba Ennuson，Malvin Forson，Mina Ansomaa，Sena Matrevi，Donkor王子，Nancy Duah-Quashie和Neils Quashie and Neils Quashie doi：Quashie doi：： https://doi.org/10.22271/tpi.2024.v13.i2c.25380摘要这项研究探索了当地加纳海藻在生产琼脂糖中的潜力，生产琼脂糖的进口琼脂糖的替代品，用于DNA片段分离中的凝胶电泳。从KPONE和LABADI收集的Gracilaria cervicornis和Hydropuntia dentata等海藻进行处理，使用聚乙二醇，二乙基氨基乙基纤维素和二甲基磺氧化物等方法提取琼脂糖。这些红色藻类表现出高琼脂含量，与Hydropuntia dentata相比，颈颈治疗剂具有更好的琼脂糖，具有更好的凝胶强度和温度性能。从Ulva fasciata和Caulerpa Tastifolia中获得了琼脂。这项研究证明了局部产生的琼脂糖在脱氧核糖核酸分离中的有效性，这表明可能用于分子工作的“加纳琼脂糖”商业生产的潜力。关键字：琼脂，琼脂糖，琼脂蛋白，海藻，凝胶1。引言使用可生物降解和生物相容性材料的使用正在变成当前时代的真正必要性，这是由于不断增长的环境问题以及建立可持续的未来的全球努力。在这方面，长期以来一直在研究海藻多糖用于生产生物材料，这些生物材料涵盖了诸如食品，生物技术，药理和生物学领域的广泛行业[1]。这些海藻中的许多是可食用的，用于商业目的[3]。就像我们在加纳[5]一样。海藻沿着海洋，盐水和淡水发现，它们有各种品种；红色，绿色和棕色海洋藻类[2]。用作食物，化妆品，肥料和提取工业化学品[4]。海藻大多在中国，印度尼西亚和腓立比人群中被利用：这些国家都有水生地区，例如池塘，溪流等。然而，在加纳，没有给予这种勤奋的水生植物的关注，因此其重要性尚未得到足够的利用来经济地帮助该国[6]。Ralfsia expansa, Ulva flexuosa, Hydropuntia dentata, Hypnea musciformis, Lithothamnion bi sp orum, Ulva fasciata, Centroceras clavulatum, Ulva lactuca, Chaetomorpha linum, and Caulerpa taxifolia are the most abundant seaweed in Ghana and they all play key roles in affecting the spatial社区组织[7]。在各种海藻中，明智的种类和红色海藻的gracilaria物种故意用于制备琼脂糖，这是由于它们中发现的琼脂含量高[8]。琼脂在红色海藻的细胞壁上发现[9]。生物技术应用中使用最多的多糖是海藻化合物琼脂和琼脂糖[10]。琼脂有两个主要成分：琼脂糖和琼脂蛋白[11]。大多数琼脂是由琼脂糖组成的，是一种中性胶凝杂菌含糖。它是含有糖苷键的线性聚合物，如图1。在提取琼脂糖时，它是从海藻中直接提取的，或从琼脂中提取，该琼脂由70％琼脂糖和30％琼脂蛋白组成，但琼脂蛋白两种单糖为3，6-雄酸半乳吡喃糖和β-D-半乳糖吡喃糖，通过糖苷链接（1-4）在β-d-甲基乳糖酸之间的糖苷链接（1-4）连接在一起，在3、6-α-α-l-甲基乳糖酸之间，导致disagob and cons nocag ob，并导致了dis-3-糖的基本单位量。 3,6-氨基甲酸酯和β-D-半乳吡喃糖。采用复杂或多步纯化程序从高质量琼脂和低级琼脂糖中生产琼脂糖的许多程序和研究。
方案1- gacose凝胶电泳
GAROSE是一种线性聚合物，由A-（L-73）和糖苷键连接的交替残基和L-半乳糖组成。L-半乳糖残留物具有三个至六个位置之间的避别桥（请参见图5-1）。琼脂糖的链形成螺旋纤维，将半径为20-30 nm的超螺旋结构聚集。琼脂糖的凝胶化会导致三维通道的网格，其直径从50 nm到> 200 nm（Norton等人。1986;有关审查，请参见Kirkpatrick 1990）。 商业制备的琼脂糖聚合物被认为每个链中包含半乳糖残基。 但是，琼脂糖不是均匀的：多糖链的平均长度因批量而异，从制造商到制造商。 此外，琼脂糖的较低等级可能会被其他多糖以及盐和蛋白质污染。 这种变异能力可以影响琼脂糖溶液的胶凝温度，DNA的筛分以及从凝胶中回收的DNA的能力，可作为酶促反应中的底物。 可以使用特殊的琼脂糖等级来最大程度地减少这些潜在的问题，这些琼脂糖被筛选为抑制剂和核酸酶的存在以及用溴化乙锭染色后的最小背景荧光。1986;有关审查，请参见Kirkpatrick 1990）。商业制备的琼脂糖聚合物被认为每个链中包含半乳糖残基。但是，琼脂糖不是均匀的：多糖链的平均长度因批量而异，从制造商到制造商。此外，琼脂糖的较低等级可能会被其他多糖以及盐和蛋白质污染。这种变异能力可以影响琼脂糖溶液的胶凝温度，DNA的筛分以及从凝胶中回收的DNA的能力，可作为酶促反应中的底物。可以使用特殊的琼脂糖等级来最大程度地减少这些潜在的问题，这些琼脂糖被筛选为抑制剂和核酸酶的存在以及用溴化乙锭染色后的最小背景荧光。
利用 PCR 毛细管凝胶电泳高通量基因分型追踪苹果中 CRISPR/Cas12a 介导的基因组编辑事件
摘要：使用新型 CRISPR/Cas12a 系统具有优势，因为它与常用的 CRISPR/Cas9 系统相比具有不同的特点，从而扩展了基因组编辑 (GE) 应用的可能性。在这项工作中，CRISPR/Cas12a 系统首次应用于苹果，以研究其在 GE 应用中的普遍可用性。通过体外切割试验预先筛选出针对内源报告基因 MdPDS 不同外显子的有效引导 RNA，该基因的破坏会导致白化表型。将一个构建体转移到苹果中，该构建体编码 CRISPR/Cas12a 系统，该系统同时靶向 MdPDS 中的两个基因座。使用荧光 PCR 毛细管电泳和扩增子深度测序，所有已鉴定的再生白化芽的 GE 事件都被描述为缺失。未观察到两个相邻靶位点之间的大量缺失。此外，还经常观察到表现出多个 GE 事件的再生体和芽的嵌合组成。通过比较两种分析方法，结果表明荧光 PCR 毛细管凝胶电泳是一种灵敏的高通量基因分型方法，可以同时准确预测多个位点的插入/缺失突变的大小和比例。特别是对于表现出高嵌合频率的物种，可以推荐将其作为有效选择同型组蛋白 GE 系的经济有效的方法。
执行DNA凝胶电泳 - 实验室设备
凝胶基质和凝胶铸琼脂是核酸电泳中使用的最常见的凝胶基质。琼脂糖是一种多糖，由半乳糖的重复单位和3,6-综合乳糖糖组成。该结构的一致性在整个凝胶中产生了均匀的孔隙度。结合了整个DNA分子的均匀电荷分布，可以精确确定通过凝胶动员的DNA片段的大小。可以通过改变琼脂糖的浓度来进一步调整迁移率和分辨率。增加琼脂糖浓度会在低分子量下增加带分辨率 - 大的DNA片段会通过琼脂糖和缓慢行进的方式具有更大的抵抗力，将更多的凝胶用于小带分辨率。降低琼脂糖的浓度可改善高分子重量下的条带分辨率（见表1）。