图 1. CTS HiFi Cas9 蛋白 (CTS HF Cas9) 显著降低了原代 T 细胞中脱靶效应的发生率。将三种 Cas9 蛋白与三种 Invitrogen ™ TrueGuide ™ 合成 sgRNA 混合,形成九种复合物(RNP:50 pmol sgRNA、38 pmol Cas9、50 pmol dsTag,用于 Invitrogen ™ Neon ™ 转染系统中的 1.5 x 10⁶ T 细胞(100 µL)*)。使用 Neon 转染系统将每个 RNP 复合物递送到原代 T 细胞中。从 NGS TEG-seq 检测(点图)中获得每个 gRNA 的在靶和脱靶效应读数。每个脱靶/在靶比(蓝点)是根据单个脱靶的每百万读数 (RPM) 除以相应在靶的 RPM 计算得出的。红点代表相应的在靶,并标准化为 100%。 x 轴是任意的。CTS WT Cas9 是 CTS TrueCut Cas9 蛋白。
已经对CSB的所有这些特征进行了研究,主要采用了各种CS,中国仓鼠卵巢和小鼠模型衍生的原代细胞的患者的皮肤纤维细胞。单型细胞系通常非常适合初始基因功能分析和结构 - 功能关系研究,但无法完全说明多功能蛋白(例如具有多系统表现的CSB)的影响。在1997年,描述了CS的第一个小鼠模型[17],从而可以研究受影响组织和整个生物体研究的原代细胞。从那时起,已经建立了所有CS相关基因,CSB,CSA,XPB,XPD和XPG的小鼠模型[18-22]。CS小鼠模型(XPG除外)通常发挥轻度的CS表型,其体重,紫外线敏感性,轻度神经退行性变化以及皮肤肿瘤发生的令人惊讶的增加,在CS的人类患者中找不到症结。对于严重CS的建模,CSA-或CSB-有效的小鼠可以与缺少TC-NER机械基因的小鼠交叉,例如XPA或XPC [19,23]。
采购单元是培养肉类生产的工作流程的第一阶段。栽培的肉取决于从动物那里收集细胞。原代成年干细胞是一种选择,是从组织活检或验尸组织获得的。多能细胞来源 - 胚胎干细胞(ESC)或诱导的多能干细胞(IPSC) - 是另一种选择。原代细胞也可以从动物中分离出来。在成年干细胞中,从动物中收集的骨骼肌组织可用于分离肌肉常驻祖细胞。作为胚胎干细胞是多能细胞的,它们可以引起任何非生殖细胞类型。iPSC需要通过区分中胚层细胞谱系以获得肌肉居民祖细胞细胞类型8,将IPSC重新编程回到类似的多能状态。干细胞可以分化为制造肉类的细胞类型,包括成肌细胞/成肌细胞,脂肪细胞(脂肪细胞)和成纤维细胞9。一旦获得了足够数量的细胞,报告说10 12-10 13个细胞10至100 kg肉10,祖细胞可以终止分化为成熟的细胞或组织。
* 对于不想将 FBS 与静息原代 T 细胞一起使用的用户,建议使用以下培养基成分:CTS OpTmizer T 细胞扩增 SFM(货号 A1048501)+ 2.6% CTS OpTmizer T 细胞扩增 SFM 补充剂 + 5% CTS 免疫细胞血清替代品 (SR)(货号 A2596101)+ 3% GlutaMAX 补充剂(货号 35050061)+ IL-7 和 IL-15。
摘要:我们试图探索 HIV-1 复制所需的宿主因子也在潜伏期逆转中发挥作用的假设。利用假定 HIV 依赖因子的 CRISPR 基因库,我们进行了筛选以确定潜伏期再激活所需的基因。我们确定了几个在 HIV-1 潜伏期再激活中起关键作用的 HIV-1 依赖因子,包括 ELL、UBE2M、TBL1XR1、HDAC3、AMBRA1 和 ALYREF。敲除 Cyclin T1 (CCNT1) 是 P-TEFb 复合物的一个组成部分,对转录延长很重要,是筛选中的最佳结果,对使用多种潜伏期逆转剂的 HIV 潜伏期逆转具有最大的影响。此外,CCNT1 敲除可防止 HIV 潜伏期原代 CD4+ T 细胞模型中的潜伏期再激活,而不会影响这些细胞的激活。 RNA 测序数据显示,CCNT1 调节 HIV-1 前病毒基因的程度比任何其他宿主基因都要大,并且在激活后对原代 T 细胞中的 RNA 转录没有显著影响。我们得出结论,CCNT1 功能在 T 细胞中不是必需的,但对于逆转 HIV 潜伏期来说绝对是必需的。
摘要 基因组编辑技术的进步为治疗罕见遗传疾病创造了机会,而这些疾病在治疗开发方面往往被忽视。尽管如此,仍然存在重大挑战:即在正确的细胞类型中实现对治疗有益的编辑水平和种类。在这里,我们描述了 FIVER(荧光体内编辑报告基因)的开发——这是一种模块化工具包,用于体内检测基因组编辑,具有非同源末端连接(NHEJ)、同源定向修复(HDR)和同源独立的靶向整合(HITI)的不同荧光读数。我们证明荧光结果可靠地报告在原代细胞、类器官和体内使用不同基因组编辑器编辑后的遗传变化。我们展示了 FIVER 在高通量无偏筛选中的潜力,从原代细胞中基因组编辑结果的小分子调节剂到全基因组体内 CRISPR 癌症筛选。重要的是,我们展示了其在基因治疗感兴趣的出生后器官系统(视网膜和肝脏)中的体内应用。FIVER 将广泛地帮助加快许多遗传疾病的治疗性基因组手术的发展。
1。在密歇根州立大学的研究技术支持机构(RTSF)上进行了二级扩增和NGS。将每种纯化的原代PCR产物的20μL等分试样送到MSU的RTSF基因组核心,以用于临时PCR扩增,该引物针对主要PCR产物的CS1/CS2末端,并添加了双重索引,具有双重指标的,光明的,光明的兼容型适配器与酒吧尺度。
Aumsilence Asos是使用最先进的化学修饰设计和制造的,在没有转染试剂的情况下,可以高效的细胞递送,从而消除与脂质转染试剂和电动膜相关的细胞毒性。Aumsilence ASO具有有效的自我传递和出色的性能,并且在各种细胞类型,难以转化的原代细胞(B细胞,T细胞,T细胞,神经元等)中起作用。)以及体内研究模型。
图3压力治疗下的藜麦表皮膀胱细胞(EBC)的一级代谢组分析。通过GC - MS测量了五组分类的64个原代代谢产物,分为五组。 (a)主成分分析(PCA)scoresplot,在所有压力植物的EBC代谢物谱之间显示出相似性和差异。群集以95%的置信度显示。地块由代谢分析家产生。缺水治疗未显示,因为不能仅对两个生物学重复进行统计分析。(b)条形图代表改变代谢物的百分比,数量,每个类别和压力治疗。(c)原代代谢产物的log2倍变化,用于热,冷和高光处理的藜麦植物。折叠的变化是通过将经压力处理的植物的浓度划分为6天后的对照植物的浓度,然后对对照植物的浓度进行计算。差异的显着性是通过Benjamini和Hochberg方法确定的,具有错误的发现率(FDR)调整为.05为.05为截止值,并由asteriks标记。橙色显着下降,绿色显着增加。有三种生物学重复(n = 3)。数据代表了两个实验重复[可以在wileyonlinelibrary.com上查看颜色图]