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哺乳动物大脑中的分布式强化学习
分布式强化学习 (dRL) —— 学习预测的不仅是平均回报，还有回报的整个概率分布 —— 在广泛的基准机器学习任务中取得了令人印象深刻的表现。在脊椎动物中，基底神经节强烈编码平均值，长期以来被认为是实现 RL 的，但对于该回路中的神经元群是否、在何处以及如何编码有关奖励分布高阶矩的信息知之甚少。为了填补这一空白，我们使用 Neuropixels 探针来敏锐地记录执行经典条件反射任务的训练有素、缺水的小鼠的纹状体活动。在几个表征距离测量中，与相同奖励分布相关的气味彼此之间的编码相似度要高于与相同平均奖励但不同奖励方差相关的气味，这与 dRL 的预测一致，但不是传统 RL。光遗传学操作和计算建模表明，遗传上不同的神经元群编码了这些分布的左尾和右尾。总的来说，这些结果揭示了 dRL 与哺乳动物大脑之间显著的融合程度，并暗示了同一总体算法的进一步生物学专业化。
Transformer 碱基编辑器在哺乳动物细胞和小鼠中的设计与应用
将载脂蛋白 B mRNA 编辑酶、催化性多肽样胞苷脱氨酶与催化功能受损的 Cas 蛋白（例如 nCas9 或 dCas9）融合，提供了一种新型基因编辑技术，即碱基编辑，可高效地实现靶向碱基替换。然而，在碱基编辑中观察到全基因组和全转录组脱靶突变，这引发了对治疗应用的安全性担忧。之前，我们开发了一种新的碱基编辑系统，即 transformer 碱基编辑器 (tBE)，可在哺乳动物细胞和小鼠中诱导高效编辑，且不会观察到全基因组或全转录组脱靶突变。这里我们描述了设计和应用 tBE 的详细方案。本方案包括设计单向导 RNA (sgRNA) 和辅助 sgRNA 对、构建构建体、确定全基因组和转录组范围的脱靶突变、生产含有 tBE 的腺相关病毒、将腺相关病毒递送到小鼠体内以及检查体内编辑效果的步骤。使用 sgRNA-辅助 sgRNA 对，tBE 的高精度碱基编辑可以在 2-3 周内（在哺乳动物细胞中）或 6-8 周内（在小鼠中）完成。整个过程可以由研究人员使用分子生物学、生物信息学和小鼠饲养的标准技术共同完成。
罗宾斯空军基地哺乳室概要.xlsx
设施 房间 POC 电话 房间号 一般位置 状态 编辑日期.1 设施 Synergy 478-918-7610 121 项目 Synergy，西南区 活跃 2022 年 12 月 20 日 Synergy 12 478-222-2665 更衣室 地下室更衣室 活跃 2021 年 11 月 2 日 12 91 478-222-2415 105 560 AMXG，2 楼 活跃 2022 年 9 月 9 日 91 125 478-222-2834 220 北侧，2 楼 活跃 2021 年 10 月 22 日 125 140 478-327-3374 38-A 活跃 2021 年 10 月 25 日 140 155 478-327-9229 6 DLA 航空，东段，靠近东墙 活动 2022 年 9 月 9 日 155 155 478-327-9229 21A DLA 航空，东段，靠近西墙 活动 2022 年 9 月 9 日 155
跨哺乳动物组织的通用DNA甲基化年龄
衰老通常被认为是随机细胞损伤的结果，可以使用DNA甲基化轮廓准确地估计，这是泛组织表观遗传钟的基础。在这里，我们使用了来自哺乳动物甲基化财团的11,754个甲基化阵列，证明了普遍的泛哺乳动物时钟的发展，该甲基化阵列包括185种哺乳动物物种的59种组织类型。这些预测模型以高精度估算哺乳动物组织年龄（r> 0.96）。年龄偏差与人类死亡率风险，小鼠体形轴突变和热量限制相关。我们鉴定出具有甲基化水平的特定细胞，这些甲基化水平随着许多物种而随着年龄的增长而变化。这些位点高度富含多孔抑制性复合物2结合位置，几乎与哺乳动物发育，癌症，肥胖和寿命有关。我们的发现提供了新的证据，表明衰老在进化上是保守的，并与所有哺乳动物的发育过程交织在一起。
来自各种哺乳动物的多能干细胞的生殖细胞...
1，Hyashi K，Ohta H，Kurimoto K，Saitou M（2011111111 11通过多能干细胞在培养中对小鼠生殖细胞指定途径的重构。单元格，146，519 -2, Gafni O, Weinberger L, Mansour AA, Manor YS, Chom- sky E, Ben-Yosef D, Kalma Y, Viukov S, Maza I, Zviran A, Rais Y, Shipony Z, Mukamel Z, Krupalnik V, Zerbib M, Geula S, Caspi I, Schneir D, Shwartz T, Gilad S, Amann-Zalcenstein D，Benjamin S，Amit I，Tanay A，More-S-RWA R，Novershtern N，Hanna JH（2013年，新型人类基态幼稚的多能干细胞的脱颖而出。 自然，504，282 - 3，Irie N，Weinberger L，Tang WWC，Kobayashi T，Viukov S，Manor YS，Dietmann S，Hanna JH，Surani MA（2015 17是人类原始LOM LOM细胞脂肪的关键特征。 单元格，160，253 - 4, Sasaki k, yokayashi s, namurara t, okamoto i, yabot y, kurimoto k, ohta H, moritoki y, iwatani C, tsuciya h, nakura s, sekiguchi k, sakuma t, yamomomomomoto t, t, yamamoto s, yamamoto m, yamamoto m。 M（（2015年）在体外耐心诱导人类生殖细胞脂肪中的人类生殖细胞脂肪。 细胞干细胞，17，178 - 5，Kobayashi T，Zhang H，Tang WWC，Irie N，Withey S，Klipsch D，Syrirna，Dietmann S，Contreras，Webb R，Erlelegio R，Ellelegio R，Soup MA （2 自然，546，416 - 6，Tang WWC，Castillo-Venzor A，Gruhn WH，Kobayashi T，Penfold CA，Morgan MD，Sun D，Irie N，Surani MA （20222222222222222，Sequeential Enlancer State reamoulines Remoulines remoulines hu-man enferine hu-man enterline能力和指定。 nat Cell Biol，24，448 -2, Gafni O, Weinberger L, Mansour AA, Manor YS, Chom- sky E, Ben-Yosef D, Kalma Y, Viukov S, Maza I, Zviran A, Rais Y, Shipony Z, Mukamel Z, Krupalnik V, Zerbib M, Geula S, Caspi I, Schneir D, Shwartz T, Gilad S, Amann-Zalcenstein D，Benjamin S，Amit I，Tanay A，More-S-RWA R，Novershtern N，Hanna JH（2013年，新型人类基态幼稚的多能干细胞的脱颖而出。自然，504，282 -3，Irie N，Weinberger L，Tang WWC，Kobayashi T，Viukov S，Manor YS，Dietmann S，Hanna JH，Surani MA（2015 17是人类原始LOM LOM细胞脂肪的关键特征。 单元格，160，253 - 4, Sasaki k, yokayashi s, namurara t, okamoto i, yabot y, kurimoto k, ohta H, moritoki y, iwatani C, tsuciya h, nakura s, sekiguchi k, sakuma t, yamomomomomoto t, t, yamamoto s, yamamoto m, yamamoto m。 M（（2015年）在体外耐心诱导人类生殖细胞脂肪中的人类生殖细胞脂肪。 细胞干细胞，17，178 - 5，Kobayashi T，Zhang H，Tang WWC，Irie N，Withey S，Klipsch D，Syrirna，Dietmann S，Contreras，Webb R，Erlelegio R，Ellelegio R，Soup MA （2 自然，546，416 - 6，Tang WWC，Castillo-Venzor A，Gruhn WH，Kobayashi T，Penfold CA，Morgan MD，Sun D，Irie N，Surani MA （20222222222222222，Sequeential Enlancer State reamoulines Remoulines remoulines hu-man enferine hu-man enterline能力和指定。 nat Cell Biol，24，448 -3，Irie N，Weinberger L，Tang WWC，Kobayashi T，Viukov S，Manor YS，Dietmann S，Hanna JH，Surani MA（2015 17是人类原始LOM LOM细胞脂肪的关键特征。单元格，160，253 -4, Sasaki k, yokayashi s, namurara t, okamoto i, yabot y, kurimoto k, ohta H, moritoki y, iwatani C, tsuciya h, nakura s, sekiguchi k, sakuma t, yamomomomomoto t, t, yamamoto s, yamamoto m, yamamoto m。 M（（2015年）在体外耐心诱导人类生殖细胞脂肪中的人类生殖细胞脂肪。 细胞干细胞，17，178 - 5，Kobayashi T，Zhang H，Tang WWC，Irie N，Withey S，Klipsch D，Syrirna，Dietmann S，Contreras，Webb R，Erlelegio R，Ellelegio R，Soup MA （2 自然，546，416 - 6，Tang WWC，Castillo-Venzor A，Gruhn WH，Kobayashi T，Penfold CA，Morgan MD，Sun D，Irie N，Surani MA （20222222222222222，Sequeential Enlancer State reamoulines Remoulines remoulines hu-man enferine hu-man enterline能力和指定。 nat Cell Biol，24，448 -4, Sasaki k, yokayashi s, namurara t, okamoto i, yabot y, kurimoto k, ohta H, moritoki y, iwatani C, tsuciya h, nakura s, sekiguchi k, sakuma t, yamomomomomoto t, t, yamamoto s, yamamoto m, yamamoto m。 M（（2015年）在体外耐心诱导人类生殖细胞脂肪中的人类生殖细胞脂肪。细胞干细胞，17，178 -5，Kobayashi T，Zhang H，Tang WWC，Irie N，Withey S，Klipsch D，Syrirna，Dietmann S，Contreras，Webb R，Erlelegio R，Ellelegio R，Soup MA （2自然，546，416 -6，Tang WWC，Castillo-Venzor A，Gruhn WH，Kobayashi T，Penfold CA，Morgan MD，Sun D，Irie N，Surani MA （20222222222222222，Sequeential Enlancer State reamoulines Remoulines remoulines hu-man enferine hu-man enterline能力和指定。nat Cell Biol，24，448 -7，Yamashiro C，Sasaki K，Yabuta Y，Kojima Y，成熟T，Okamoto I，Yokayashi S，Murase Y，Shirara Y，Shirane K，Sasaki K，Sasaki H，Sasaki H，Yamamoto T，Yamamoto T，Saitou M（ 201818年）Pluripot pluripot pluripot pluripot celped pluripot pluripot cel celed pluripot pluripot celed pluripot celed细胞的pluripot卷成pluripot。科学，362，356 -8，Hwang YS，Suzuki S，Seita Y，ITTO J，Sa Sato Y，Dog Y，Sato K，Sato K，Hermann BP，Sasaki K （2020020020重建了繁荣症状的spefiification in Verrom，该spefiification in Verrom a Verrom受到了诱发的PACECACE PAMAPOPOTENT SPOS SPOS细胞。nat commun，11，Kobayashi T，Kobayashi H，Goto T，Takashima T，Oakawa M，Ikeda H，Terada R，Yoshida F，Sanbo M，Ukida H，Kurrimoto K，Hirabayashi M （2020 U 2020 U型生殖器开发Kobayashi T，Kobayashi H，Goto T，Takashima T，Oakawa M，Ikeda H，Terada R，Yoshida F，Sanbo M，Ukida H，Kurrimoto K，Hirabayashi M （2020 U 2020 U型生殖器开发
罗宾斯空军基地哺乳室概要.xlsx
设施 房间 POC 电话 房间号 一般位置 状态 编辑日期.1 设施 Synergy 478-918-7610 121 项目 Synergy，西南区 活跃 2022 年 12 月 20 日 Synergy 12 478-222-2665 更衣室 地下室更衣室 活跃 2021 年 11 月 2 日 12 91 478-222-2415 105 560 AMXG，2 楼 活跃 2022 年 9 月 9 日 91 125 478-222-2834 220 北侧，2 楼 活跃 2021 年 10 月 22 日 125 140 478-327-3374 38-A 活跃 2021 年 10 月 25 日 140 155 478-327-9229 6 DLA 航空，东段，靠近东墙 活动 2022 年 9 月 9 日 155 155 478-327-9229 21A DLA 航空，东段，靠近西墙 活动 2022 年 9 月 9 日 155
怀孕和哺乳期间接种流感疫苗
1. 传染病网络。季节性流感感染 CDNA 国家公共卫生单位指南。网址： 网址： https://www.health.gov.au/sites/default/files/documents/2022/06/i nfluenza-infection-flu-cdna-national-guidelines-for-public-health-units.pdf 2017 年修订。2019 年发布。2023 年 7 月访问 2. Mosby LG、Rasmussen SA、Jamieson DJ。2009 年大流行性甲型流感 (H1N1) 在妊娠期的作用：文献系统评价。Am J Obstet Gynecol。2011 年 7 月；205(1):10-8 3. 美国疾病控制与预防中心。您应该了解的有关流感抗病毒药物的知识。 2022 年 12 月。可访问 https://www.cdc.gov/flu/treatment/whatyoushould.htm#pregnantw omen 2023 年 7 月访问 4. 澳大利亚政府卫生部。澳大利亚免疫技术咨询小组 (ATAGI) 临床建议，堪培拉，2023 年 3 月。关于 2023 年季节性流感疫苗管理的声明。可访问 https://www.health.gov.au/sites/default/files/2023-06/atagi-advic-on-seasonal-influenza-vaccines-in-2023_0.pdf 2023 年 7 月访问 5. 新南威尔士州政府卫生部。季节性流感疫苗接种 - 常见问题。网址：https://www.health.nsw.gov.au/immunisation/Pages/seasonal-flu-vaccines-faqs.aspx 更新于 2023 年 5 月。访问于 2023 年 7 月。 6. 国家免疫研究与监测中心 (NCIRS)。流感疫苗接种。常见问题。2023 年 3 月。网址：https://ncirs.org.au/sites/default/files/2023-03/Influenza%20vaccines-FAQs_7_Mar_2023.pdf 访问于 2023 年 7 月 7. 药物和哺乳数据库 LactMed。流感疫苗。网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK500990/ 更新于 2022 年 9 月。访问于 2023 年 7 月
定量分析和优化哺乳动物细胞中位点特异性蛋白生物结合
摘要：尽管有多种共价蛋白质修饰，但很少有用于定量细胞中蛋白质生物结合的技术。在这里，我们描述了一种通过与Halotag共价键形成在纤维素蛋白生物偶联中量化的新方法。这种方法利用不自然的氨基酸（UAA）诱变选择性地在蛋白质表面上安装小而生物串管的反应性手柄。我们利用了反电子二极管的快速动力学和高选择性 - 评估四嗪苯丙氨酸（TETF）与紧张的反甲环烯 - 氯酸酯（STCO-CA）（STCO-CA）和跨循环链烯（TETR-caclecten）（TETR-CATRE）的反应（TETF）与TETRECANE（TETRE）（TETER-CARORE（TETRE）。生物缀合后，叶绿素配体暴露于释放酶标记，以通过简单的蛋白质印迹分析直接定量生物缀合。我们证明了该工具的多功能性，以快速，准确地确定不同UAA/氯烷烃对的生物缀合效率以及对不同蛋白质的不同位点（包括EGFP和雌激素相关的受体ERR）的不同位点。■简介
核糖体DNA拷贝数与人类和其他哺乳动物的体重有关
。cc-by 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本发布于2023年8月6日。 https://doi.org/10.1101/2023.08.03.551775 doi：Biorxiv Preprint
哺乳动物脑中多晶镜神经元的突触和电路功能
哺乳动物脑中的神经元不限于释放单个神经递质，而是通常将神经递质的神经递质释放到突触后细胞上。在这里，我们回顾了整个哺乳动物中枢神经系统中发现的多晶月神经元的最新发现。我们重点介绍了最新的技术创新，这些创新使新的多晶镜神经元及其突触特性的研究成为可能。我们还专注于轴突末端和突触囊泡上神经递质corelease所需的机制和分子成分，以及多种晶状体神经元在多种脑电路中的一些可能功能。我们期望这些方法将导致对多晶镜神经元的机制和功能的新见解，它们在电路中的作用以及它们对正常和病理大脑功能的贡献。