药用植物已获得其生物活性化合物的可见性,其抗氧化剂,抗菌和抗真菌特性可用于各种应用,例如在药品,食品和生物控制行业中。秘鲁是一个富含植物群的国家,它具有多种植物物种,但是,对具有药理潜力的生物活性化合物的研究很少。因此,本研究的目的是评估秘鲁高地众所周知的四藻蛋白克里斯塔塔(Tetraglochin cristata)新鲜叶片提取物的抗氧化,抗菌和抗真菌活性。canghy样品,以比较由于环境和高度差异而导致的财产变异性。提取物针对两种类型的细菌,金黄色葡萄球菌和大肠杆菌,以及两种真菌,白色念珠菌和阴茎公共。使用DPPH方法评估抗氧化活性。 结果表明抗氧化活性很高,cusco样品的半末端抑制浓度(IC 50)为(92.3±1.3)μg/ml,arequipa样品为(98.2±1.7)μg/ml。 此外,提取物有效地抑制了P. commun,显示出较高的抗真菌活性。 这项研究强调了CANGHY生物活性化合物的药理潜力以及地理多样性在这些特性变异性中的重要性。抗氧化活性。结果表明抗氧化活性很高,cusco样品的半末端抑制浓度(IC 50)为(92.3±1.3)μg/ml,arequipa样品为(98.2±1.7)μg/ml。此外,提取物有效地抑制了P. commun,显示出较高的抗真菌活性。这项研究强调了CANGHY生物活性化合物的药理潜力以及地理多样性在这些特性变异性中的重要性。
常见 B 型 DNA 和其他 DNA 构象之间的动态结构转变为基因表达提供了额外的调控层。1–4 G-四链体 (G4) 和 i-基序 (iM) 是两类重要的非规范 DNA 结构,分别在人类基因组中某些富含鸟嘌呤和胞嘧啶的区域形成。由于 iM 结构是通过堆叠插入的半质子化胞嘧啶碱基对 (C+:C) 形成的,因此最初认为 iM 的形成需要弱酸性 pH 值,然而,现在已经确定这些结构是在细胞环境中的生理 pH 值下形成的。5,6 G4 结构由 pi 堆叠的平面 G 四联体形成,其中每个 G 四联体由四个鸟嘌呤碱基组成,通过 Hoogsteen 氢键结合在一起,并通过生理相关的阳离子进一步稳定。 7–10 G4 和 iM 折叠机制已用于预测它们在基因组中形成的倾向以及它们在调控区域中的过度表达。5,11 此外,它们的结构特征
基因启动子处的 DNA-蛋白质相互作用在基因表达中起着至关重要的作用。人类细胞的启动子富含富含鸟嘌呤的序列,这些序列可以形成四链 G-四链体 (G4) 结构。G4 正在成为基因调控中一类独特的基于结构的调控元件,它们与蛋白质的相互作用对于 G4 的作用至关重要。目前,我们对 G4-蛋白质相互作用的理解主要是基于个案,没有系统信息。在这项工作中,我们使用来自 ENCODE 项目的数据检查了共识 G4 形成区 G4(+) 周围 1,183 种人类 DNA 结合蛋白(包括转录因子、组蛋白及其修饰酶)的空间占有率。我们发现 G4(+)、其近端侧和远端侧是三个主要的蛋白质结合位点。几乎所有蛋白质在这些位点上都富集或耗尽,这可能是由于竞争或位点之间的时空转换,导致不同程度的变化或持久性,在细胞/组织类型内或跨细胞/组织类型。值得注意的是,组蛋白被排除在 G4(+) 的近端之外,它们与 G4(+) 的结合分别通过乙酰化和甲基化打开和关闭。此外,远端优先富集 H3K23me2 和 H3K4me2。我们的实验还揭示了相应的 G4-蛋白质相互作用模式。总之,我们的结果表明 G4 在动态定义和协调基因启动子处的染色质结构和 DNA-蛋白质相互作用以进行转录调控方面发挥着普遍作用,而这项任务不太可能通过基于序列的 DNA 识别来完成。
基因启动子处的 DNA-蛋白质相互作用在基因表达中起着至关重要的作用。人类细胞的启动子富含富含鸟嘌呤的序列,这些序列可以形成四链 G-四链体 (G4) 结构。G4 正在成为基因调控中一类独特的基于结构的调控元件,它们与蛋白质的相互作用对于 G4 的作用至关重要。目前,我们对 G4-蛋白质相互作用的理解主要是基于个案,没有系统信息。在这项工作中,我们使用来自 ENCODE 项目的数据检查了共识 G4 形成区 G4(+) 周围 1,183 种人类 DNA 结合蛋白(包括转录因子、组蛋白及其修饰酶)的空间占有率。我们发现 G4(+)、其近端侧和远端侧是三个主要的蛋白质结合位点。几乎所有蛋白质在这些位点上都富集或耗尽,这可能是由于竞争或位点之间的时空转换,导致不同程度的变化或持久性,在细胞/组织类型内或跨细胞/组织类型。值得注意的是,组蛋白被排除在 G4(+) 的近端之外,它们与 G4(+) 的结合分别通过乙酰化和甲基化打开和关闭。此外,远端优先富集 H3K23me2 和 H3K4me2。我们的实验还揭示了相应的 G4-蛋白质相互作用模式。总之,我们的结果表明 G4 在动态定义和协调基因启动子处的染色质结构和 DNA-蛋白质相互作用以进行转录调控方面发挥着普遍作用,而这项任务不太可能通过基于序列的 DNA 识别来完成。
Chagas病是由Cruzi的寄生虫锥虫引起的,在全球范围内影响超过700万人。两种实际治疗方法分别是苯甲酸唑(BZN)和Nifurtimox,由于其高毒性导致患者被放弃治疗,从而引起严重的副作用。在这项工作中,我们建议DNA G四链体(G4)作为这种传染病的潜在治疗靶标。我们在T. Cruzi的基因组中发现了每100,000个核苷酸的174个PQ,并确认了三个频繁基序的G4形成。我们合成了一个基于二乙烯基乙烯(DTE)支架的14个四链体配体的家族,并证明了它们与这些已鉴定的G4序列的结合。几种DTE衍生物表现出与BZN相同浓度范围的四种不同菌株的t. cruzi菌株的表量的微摩尔活性。化合物L3和L4对T. cruzi sol菌株的血液中的活性形式(IC 50 = 1.5 - 3.3μm,Si = 25 - 40.9)具有出色的活性,比BZN高40倍,并且显示出更好的选择性指数。
取决于基因表达的协调变化,特别是在内侧前额叶皮层的垂直区域(ILPFC; Martin等,2000; Bruel-Jungerman等,2007; Alberini,2009)。近年来,我们和其他人表明,此过程涉及转录机械和表观基因组机制之间的严格控制相互作用(Campbell和Wood,2019年)。DNA在细胞中比RNA,蛋白质或脂质更为持久,因此其调节的机制是理解行为适应的关键(Marshall和Bredy,2016年)。尽管长期以来与神经元的可塑性和记忆长期以来一直与DNA和组蛋白的修饰有关(Vanyushin,2006; Bredy等,2007; Vecsey等,2007; Wei等,2012;Grä虫,2014; li et al。这是因为DNA结构和功能之间的关系主要归因于右手双螺旋,
6 1。分子胚胎学与遗传学研究所基因组神经病学系7(IMEG),库马托大学,库曼莫托,日本8 2。日本库曼莫托大学药学研究生院。9 3。日本库曼本北部10号医学科学研究生院神经病学系。11 4。日本托托里工程研究生院化学和生物技术系,日本托托里12大学13 14 *应向诺里氏菌Shioda和Yasushi Yabuki发言,16 Norifumi Shioda9 17 Norifumi Shioda9 17基因组神经病学系17日本Kumamoto 860-0811。 19电话:81-96-373-6633 20电子邮件:shioda@kumamoto-u.ac.jp 21 22 Yasushi Yabuki 23基因组神经病学系,分子胚胎学和遗传学研究所,Kumamoto University,24 Kumamoto University,24 Kumamoto University,24 Konjo,2-2-1 Honjo,2-2-1 Honjo,chuo-kumamamamamomoto,86-086-086-086-08。 25电话:81-96-373-6633 26电子邮件:yabukiy@kumamoto-u.ac.jp 27日本托托里工程研究生院化学和生物技术系,日本托托里12大学13 14 *应向诺里氏菌Shioda和Yasushi Yabuki发言,16 Norifumi Shioda9 17 Norifumi Shioda9 17基因组神经病学系17日本Kumamoto 860-0811。19电话:81-96-373-6633 20电子邮件:shioda@kumamoto-u.ac.jp 21 22 Yasushi Yabuki 23基因组神经病学系,分子胚胎学和遗传学研究所,Kumamoto University,24 Kumamoto University,24 Kumamoto University,24 Konjo,2-2-1 Honjo,2-2-1 Honjo,chuo-kumamamamamomoto,86-086-086-086-08。25电话:81-96-373-6633 26电子邮件:yabukiy@kumamoto-u.ac.jp 2725电话:81-96-373-6633 26电子邮件:yabukiy@kumamoto-u.ac.jp 27
对G4二级结构的分析表明,内源性G4基因组景观受到严格调节,只有700,000多个人类序列中,只有1-2%能够在体外生物物理折叠成G4结构(4)。据报道,G4S在癌细胞中的患病率增加(5),并且特别与患者衍生的侵袭性乳腺癌组织中高度表达和扩增的基因有关(6)。多个证据表明,与正常细胞相比,G4在癌细胞中检测到较高的G4量在癌症的生长和进展中起作用(7,8),这使得G4成为引人入胜的药物发现靶标(7,9)。G4似乎与癌症相关基因有关联,因为与正常细胞相比,在癌细胞中检测到更大的G4。实时跟踪G4,直接了解其生物学作用是一个新的基本生物学领域,并且可能为诊断和治疗癌症等疾病(10)开辟了新的途径(10)。此外,G4结构可以用作新的预后生物标志物和有效的治疗靶点
研究文章 | 细胞/分子 DNA G-四链体是一种调节记忆的转录控制装置 https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.0093-23.2024 收稿日期:2023 年 1 月 17 日 修订日期:2024 年 2 月 14 日 接受日期:2024 年 2 月 20 日 版权所有 © 2024 作者
猪血凝性脑脊髓炎病毒(PHEV),猪假拟南芥病毒(PRV),经典猪发烧病毒(CSFV)和日本的脑炎病毒(JEV)导致感染猪的神经学症状相似,及其对实验性诊断的差异性诊断。设计了四对特定引物和探针,分别针对PHEV N基因,PRV GB基因,CSFV 5'非翻译区域(5'UTR)和JEV NS1基因,并且开发了四倍的实时定量RT-PCR(QRT-PCR(QRT-PCR),以检测和分化的PHEV,pRV,pRV,pRV,pRV,pRV,&JEV。该测定显示高灵敏度,每种病原体的检测极限(LOD)为1.5×10 1拷贝/μL。该测定法仅检测到PHEV,PRV,CSFV和JEV,而没有与其他猪病毒交叉反应。测定内和测定间的变异系数(CVS)小于1.84%,可重复性很高。通过已发达的四倍体QRT-PCR测试了总共1,977个临床样本,包括组织样本和从中国广西省收集的全血样本,以及PHEV,PRV,PRV,CSFV和JEV的阳性率为1.57%(31/1,977),0.355%(7/1,1,97), (21/1,977)和0.10%(2/1,977)。也通过先前报道的QRT-PCR分析测试了这1,977个样品,这些方法的巧合率超过99.90%。发达的测定法被证明是快速,敏感和准确的,用于检测和分化PHEV,PRV,CSFV和JEV。