粉末因子可以定义为打破岩石单位体积或吨(t)所需的爆炸物数量(kg)。通过爆破岩石的前景的特征是爆炸物的特定消费。在过去的几十年中,研究人员提出了几种精确的方法,以预测爆炸操作中的粉末因子或特定电荷,而不是通过试验爆炸。该领域的研究集中在岩体质量特性,爆破材料和爆破几何形状之间的关系上,以建立粉末因子。同样,已经研究了在洞穴理论中体现的特定能量和粒径之间的相互作用,而粒径较少依赖于当地条件。在本文中,已经审查了基于经验和洞穴理论建模的粉末因子估计方法,以及在表面基准爆破和地下隧道操作中的机器学习方法。还讨论了完整岩石特性对粉末因子分配的影响以及粉末因子选择对爆破后条件的影响。最后,在这方面指出了粉末因子估计中遇到的常见挑战。
转录活性模式通过调节元素(例如启动子或增强子)在我们的基因组中编码,这些元素矛盾地含有相似的序列特异性转录因子(TF)结合位点1-3的类似分类。了解这些序列基序如何编码多个,通常重叠的基因表达程序对于理解基因调节以及非编码DNA中的突变如何在疾病4,5中表现出来至关重要。在这里,通过使用自然遗传变异,内源性TF蛋白水平的扰动以及对自然和合成调节元件的大量平行分析,从单个转录起始位点(TSS)的角度研究基因调节,我们显示TF结合对转录起始的影响取决于位置。分析与TSS相对于TSS的TF结合位点的发生,我们确定了具有高度优先定位的几个基序。我们表明,这些模式是TF独特的功能曲线的组合 - 许多TF,包括诸如NRF1,NFY和SP1之类的规范激活剂,激活或抑制转录启动,这取决于其相对于TSS的精确位置。因此,TFS及其间距共同指导转录启动的位点和频率。更广泛地,这些发现揭示了TF结合位点的类似分类如何根据其空间构型产生不同的基因调节结果,以及DNA序列多态性如何促进转录变异和疾病,并强调TSS在解码我们基因组的调节性信息中的关键作用。
。CC-BY-NC 4.0 国际许可(未经同行评审认证)是作者/资助者,其已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是
病毒-宿主共同进化常常会促使病毒逃逸免疫。然而,植物抗病毒的自然变异是否富含已知赋予植物必需抗病毒防御能力的 RNA 干扰 (RNAi) 途径基因仍不清楚。本文,我们报告了两项全基因组关联研究筛选,以探究野生采集的拟南芥种质对地方性黄瓜花叶病毒 (CMV) 的定量抗性的自然变异。我们证明,在两次筛选中与抗性显着相关的排名最高的基因可调控哥伦比亚-0 生态型中的抗病毒 RNAi。一个对应于减少休眠 5 (RDO5) 的基因通过促进病毒衍生的小干扰 RNA (vsiRNA) 的扩增来增强抗性。有趣的是,第二个基因被指定为抗病毒 RNAi 调节器 1 (VIR1),它抑制抗病毒 RNAi,因此通过 CRISPR/Cas9 编辑使其基因失活可增强 vsiRNA 的产生和 CMV 抗性。我们的研究结果确定了抗病毒 RNAi 防御的正向和负向调节器,它们可能在病毒-宿主共同进化中发挥重要作用。
我们在无限量子量子系统的无限时间和时间订购的相关器的无限时间平均值周围的时间波动方面提供了界限。对于物理初始状态,我们的边界预测了时间波动随系统大小的函数的指数衰减。我们在数值上验证了混乱和相互作用的可集成自旋1 /2链的预测,该链满足了我们边界的假设。另一方面,我们从分析和数字上显示的是,对于XX模型,这是一个具有间隙脱合性的非互动系统,temporal波动衰减的多项式衰减具有多种多态的系统大小,用于运算符的系统大小,该操作员位于费米昂表示中,并且在非局部op-ertors的系统大小中呈指数下降。我们的结果表明,相关器的长期时间波动的衰减不能用作混乱的可靠度量或缺乏混乱的指标。
摘要 DNA 双链断裂 (DSB) 的修复对于保持基因组完整性至关重要。因此,定义 DSB 修复的潜在机制将增强我们对这些途径中的缺陷如何导致人类疾病的理解,并可能导致发现新的治疗干预方法。在这里,我们在 U2OS 细胞中建立了一组 HaloTagged DNA 损伤反应因子,这使得荧光 HaloTag 配体能够进行浓度依赖性蛋白质标记。在这些修复因子的内源位点处基因组插入 HaloTag 可保持表达水平,蛋白质保持适当的亚细胞定位、形成病灶的能力并在功能上支持 DSB 修复。我们系统地分析了总细胞蛋白质丰度,测量了激光诱导的 DNA 损伤位点的募集动力学,并通过活细胞单分子成像确定了扩散动力学和染色质结合特性。我们的工作表明,Shieldin 复合物(端接的关键因子)并不存在于预组装状态,并且这些因子在 DSB 处的相对积累具有不同的动力学。此外,活细胞单分子成像揭示了 MDC1 和染色质之间的组成性相互作用,该相互作用由其 PST 重复域介导。总之,我们的研究证明了单分子成像的实用性,可以为 DNA 修复提供机制见解,这将成为表征活细胞中 DNA 修复因子的生物物理特性的强大资源。
1 康普顿斯大学生物学院遗传学、生理学和微生物学系, 28040 马德里, 西班牙; luisserr@ucm.es (LJS); jdepablo@ucm.es (JADP-M.) 2 Jiménez Díaz 大学医院基金会健康研究所,Jiménez Díaz 大学医院基金会,28040 马德里,西班牙; mariano.garcia@quironsalud.es (MG-A.); rocio.olivera@quironsalud.es (RO-S.); damian.garcia@uam.es (DG-O.) 3 马德里自治大学外科系,28049 马德里,西班牙 4 西班牙罕见疾病生物医学研究网络中心 (CIBERER) 能源、环境和技术研究中心 (CIEMAT) 创新造血疗法部分化和细胞计数部门,28040 马德里,西班牙;jc.segovia@ciemat.es * 通信地址:aliras@ucm.es
特应性皮炎(AD)是一种皮肤炎症性疾病,其中机会性病原体金黄色葡萄球菌既普遍又丰富。S.金黄色葡萄球菌具有几种分泌的毒力因子,这些因子在感染模型中具有良好的功能,但尚不清楚这些细胞外微生物因子是否在AD的背景下是否相关。为了解决这个问题,我们设计了一种与文化无关的方法来检测和量化在皮肤部位表达的金黄色葡萄球菌毒力因子。我们利用rnase-h - 依赖性多重PCR进行了从胶带中提取的反转录的RNA的前透明化,这些RNA从具有不同严重程度的皮肤部位采样的患者的胶带条中提取,并评估了使用qPCR使用QPCR的S. aureus毒力因子的表达。我们观察到疾病严重程度增加的位点可行的金黄色葡萄球菌丰度增加,并且在AD皮肤部位表达了许多毒力因子。令人惊讶的是,与非静电对照相比,我们没有观察到病变部位的毒力因子的任何显着性。总体而言,我们利用了一个可靠的测定法直接检测和量化AD皮肤病变部位的可行金黄色葡萄球菌及其相关的毒力因子。该方法可以扩展以研究各种皮肤病学部位的皮肤微生物基因的表达。
简单总结:黑色素瘤每年影响全球超过 300,000 人。黑色素瘤患者治疗的最新进展,例如靶向治疗和免疫治疗,提高了非晚期疾病患者的生存率。然而,有相当一部分患者仍然难以治愈或产生耐药性。黑色素瘤的发生、疾病进展和对治疗的耐药性是表观遗传调控的过程。新兴的临床前和临床研究阐明了表观遗传药物除了化疗、放疗和其他疗法之外,还可以预防耐药性或增强上述疗法的治疗效果的机制。在这篇综述中,我们评估了表观遗传学在黑色素瘤进展和对靶向和免疫疗法的耐药性中的作用。此外,我们还讨论了最近的临床前和临床报告,这些报告评估了使用表观遗传药物作为佐剂来增强黑色素瘤患者目前的治疗方法。
