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开发和验证墨西哥人口中临床用途的多变量基因型妊娠糖尿病预测算法：对敏感性机制的见解
摘要简介妊娠糖尿病（GDM）在墨西哥诊断不足。通过预测建模的早期GDM风险分层有望改善预防保健。我们开发了一个综合遗传和临床变量的GDM风险评估模型。使用“ Cuido Mi Embarazo”（CME）（CME）同类群的研究设计和方法数据用于开发（107例，469例对照），以及来自“MónicaPreteliniSáenz”母体围产期医院（HMPMPS）群体的数据，用于外部效力（32案例）（32例），1992案例，1992.32 conteration（32 Contractation（32），1992案例，1992案例，199.99例，199.99例（32例）。2小时的口服葡萄糖耐受性测试（OGTT），在24-28妊娠周进行了75 g葡萄糖，用于诊断GDM。选择了114个具有预测能力的单核苷酸多态性（SNP）进行评估。OGTT期间收集的血液样本用于SNP分析。将CME队列随机分为训练（70％的队列）和测试数据集（占队列的30％）。将培训数据集分为10组，9组以构建预测模型和1个用于验证。使用测试数据集和HMPMPS队列进一步验证了该模型。结果十九个属性（14个SNP和5个临床变量）与结果显着相关。 GDM预测回归模型中包括11个SNP和4个临床变量，并应用于训练数据集。该算法具有很高的预测性，曲线（AUC）下的面积为0.7507，灵敏度为79％，特异性为71％，并且有足够的功能来区分病例和对照。在进一步验证后，培训数据集和HMPMPS队列的AUC分别为0.8256和0.8001。结论我们使用遗传和临床因素开发了一个预测模型，以鉴定有患GDM风险的墨西哥妇女。这些发现可能有助于对GDM风险升高并支持个性化患者建议的代谢功能有更深入的了解。
利用作物基因型特异性根土相互作用来提高农学效率
1 全球农业和食品系统学院，爱丁堡大学，中洛锡安郡，英国，2 全球玉米计划，国际玉米和小麦改良中心 (CIMMYT)，津巴布韦哈拉雷，3 可持续农业食品系统，国际玉米和小麦改良中心 (CIMMYT)，津巴布韦哈拉雷，4 遗传资源计划，国际玉米和小麦改良中心 (CIMMYT)，墨西哥-韦拉克鲁斯，特斯科科，墨西哥，5 可持续农业食品系统，国际玉米和小麦改良中心 (CIMMYT)，肯尼亚内罗毕，6 全球小麦计划，国际玉米和小麦改良中心 (CIMMYT)，墨西哥-韦拉克鲁斯，特斯科科，墨西哥，7 捐助者关系，国际玉米和小麦改良中心 (CIMMYT)，墨西哥-韦拉克鲁斯，特斯科科，墨西哥，8 生态科学，詹姆斯·赫顿研究所，阿伯丁，美国英国，9 全球玉米计划，国际玉米和小麦改良中心（CIMMYT），肯尼亚内罗毕
杜氏肌营养不良症的 DMD 基因型和运动功能
来自杜波维茨神经肌肉中心 (FM、MC、AYM)、NIHR 大奥蒙德街医院生物医学研究中心、大奥蒙德街儿童健康研究所、伦敦大学学院和英国大奥蒙德街医院信托基金；波士顿分析集团 (JS、GS、HL、MJ、ID)；马萨诸塞州剑桥协作轨迹分析项目 (JS、SJW)；加州大学戴维斯分校物理医学与康复系和儿科 (CM)；比利时鲁汶大学医院儿童神经病学 (NG)；荷兰莱顿大学医学中心神经病学系 (EHN)；伍斯特马萨诸塞大学医学院儿科 (BW)；英国牛津大学儿科系 MDUK 牛津神经肌肉中心 (LS) 和比利时列日大学 CHU 儿科分部列日神经肌肉中心 (LS)；英国纽卡斯尔大学及纽卡斯尔医院 NHS 基金会约翰沃尔顿肌肉萎缩症研究中心 (VS, MG)；荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心唐德斯神经科学中心康复系 (IJMdG)；俄亥俄州辛辛那提儿童医院医学中心 (CT) 和辛辛那提大学医学院 (CT)；意大利罗马天主教大学 Fondazione Policlinico Gemelli IRCCS 儿科神经病学系 (EM)；以及荷兰莱顿大学医学中心人类遗传学系 (AA-R.)。
评估2-2种型型糖尿病和心血管患者中印度人口中的2-2基因型：病例对照研究
引言糖尿病是一种非传染性疾病，正在肆虐工业化和发展中国家。在2011年，全球3.66亿个人受到影响，到2030年，这一数字预计将攀升至近5.52亿[1]。糖尿病是一种慢性，体内高血糖水平带来的威胁生命的代谢疾病。2型糖尿病的进展缓慢，在早期阶段很难检测到[2]。T2DM最严重的结果之一是CVD。同样，在过去的两到三十年中，全世界都出现了CVD流行病。在1990年，据估计，工业化国家的CVD造成了530万人的死亡，而欠发达国家的可比数量在8到900万之间（即相对超过70％）[3]。此外，患有T2DM的人中有一半患有冠状动脉疾病，中风或心脏病发作[4]。HP是肝脏在包括IL-1，IL-6和TNF（肿瘤坏死因子）在内的肝脏中产生的糖蛋白。hp是一种
表型和基因型抗生素易感性谱图从赞比亚卢萨卡的转诊医院中分离出从血液感染中分离出来的革兰氏阴性细菌
血液感染（BSI）是由抗菌抗菌（AMR）革兰氏阴性菌（GNB）引起的，是发病率和死亡率的重要原因。第三代头孢菌素（3GC）多年来一直用作BSI和其他侵入性感染的经验治疗；但是，它们的过度使用可以促进扩展的光谱β-乳乳糖酶（ESBLS）的出现。 因此，这项研究旨在确定流行病学，临床和微生物学特征，以及抗菌耐药性对赞比亚卢萨卡一家推荐医院BSI结果的影响。 这是在赞比亚卢萨卡的一家转诊医院进行的六个月前瞻性研究。 作为常规诊断和患者护理的一部分，从发烧的患者中收集了细菌培养的血液样本，并使用Vitek 2紧凑型仪器进行了病原体鉴定和抗菌敏感性测试。 使用聚合酶链反应方法确定 ESBL和质粒介导的喹诺酮抗性（PMQR）相关基因。 使用结构化数据收集表收集患者信息，并在CSPRO 7.6中输入。 在Whonet和Stata版本14中分析了数据。 总共分离了88个GNB，其中76％为肠杆菌，14％的鲍曼尼杆菌和8％的铜绿假单胞菌。 对第三代和第四代头孢菌素的抵抗力分别为75％和32％。 值得注意的是，侵入性经验治疗，碳青霉烯耐药性（7％），多药耐药性（83％）和ESBL产生剂（76％）的高患病率（68％）。 与e相比。第三代头孢菌素（3GC）多年来一直用作BSI和其他侵入性感染的经验治疗；但是，它们的过度使用可以促进扩展的光谱β-乳乳糖酶（ESBLS）的出现。因此，这项研究旨在确定流行病学，临床和微生物学特征，以及抗菌耐药性对赞比亚卢萨卡一家推荐医院BSI结果的影响。这是在赞比亚卢萨卡的一家转诊医院进行的六个月前瞻性研究。作为常规诊断和患者护理的一部分，从发烧的患者中收集了细菌培养的血液样本，并使用Vitek 2紧凑型仪器进行了病原体鉴定和抗菌敏感性测试。使用聚合酶链反应方法确定 ESBL和质粒介导的喹诺酮抗性（PMQR）相关基因。使用结构化数据收集表收集患者信息，并在CSPRO 7.6中输入。在Whonet和Stata版本14中分析了数据。总共分离了88个GNB，其中76％为肠杆菌，14％的鲍曼尼杆菌和8％的铜绿假单胞菌。对第三代和第四代头孢菌素的抵抗力分别为75％和32％。值得注意的是，侵入性经验治疗，碳青霉烯耐药性（7％），多药耐药性（83％）和ESBL产生剂（76％）的高患病率（68％）。与e相比。大肠杆菌是BSI的病因，感染鲍曼尼杆菌（OR = 3.8）的患者的死亡几率明显更高。在接受3GC的患者中，死亡的几率也更高。
糖对根结的糖基因型耐药性的定量和定性评估，Meloidogyne Incognita
1个糖作物研究所，糖作物疾病和害虫研究，农业研究中心，吉萨，埃及，埃及2，生物技术系埃及吉萨（Giza）的农业研究中心，5植物保护和生物分子诊断部，ARID土地耕地研究所，科学研究与技术应用，新博格·阿拉伯，阿拉伯，埃及，埃及，埃及，6个植物学系，埃及学系，Zagazig University，Zagazig and Zagazig，Zagazig，Zagazig，Zagazig，Zagazig，Zagazig，Genertic and genticn and egyptic，埃及，埃及，埃及，埃及，埃及。萨达特城大学，萨达特城大学，埃及，农业植物学8号农业学院（萨巴巴沙），亚历山大大学，亚历山大，埃及，
根际豌豆基因型的根际菌群对羊膜菌根真菌接种的种群反应
摘要：对三方共生中豆类根际的这项研究的研究重点是共生体之间的关系，而较少的整体根际微生物组。，我们使用了一种实验模型，该模型与AM真菌接种（根瘤菌异常和AM物种混合）的不同花园豌豆基因型来研究它们对土壤微生物主要营养基团的人群水平以及根茎微生物群落中的结构和功能关系的影响。实验是在植物的两个物候周期上进行的。分析：微生物种群密度定义为CUF/G A.D.S.和AMF（％）的根定植率。 我们发现，AMF对微切菌和放线菌的密度有证明的显性作用，朝着还原的方向，表明拮抗作用，以及氨化，磷酸盐 - 溶解和自由生命的非同营养性氮杂杆菌细菌在刺激方向，指示相互关系的指示。 我们确定基因型对于固定矿物质NH 4 + -N和细菌根茎的细菌种群的形成是决定性的。 我们报道了与土壤氮和磷离子可用性相关的营养基团之间的显着双向关系。 微生物群落中营养基团之间保存的比例表明结构和功能稳定性。和AMF（％）的根定植率。我们发现，AMF对微切菌和放线菌的密度有证明的显性作用，朝着还原的方向，表明拮抗作用，以及氨化，磷酸盐 - 溶解和自由生命的非同营养性氮杂杆菌细菌在刺激方向，指示相互关系的指示。我们确定基因型对于固定矿物质NH 4 + -N和细菌根茎的细菌种群的形成是决定性的。我们报道了与土壤氮和磷离子可用性相关的营养基团之间的显着双向关系。微生物群落中营养基团之间保存的比例表明结构和功能稳定性。
Kim，B。H.，Choi，Y.H.，Yang，J.J.，Kim，S.，Nho，K.，Lee，J.M。，＆Alzheimer's Disision神经影像学计划。 （2020）。识别新的Gen 尼古丁促进了链球菌链球菌外多糖合成，细胞聚集和总乳酸脱氢酶活性 道路建设项目的临时交通控制装置检测 骨细胞EGLN1/PHD2通过FGF23 辐射诱导的光子疗法与质子治疗的淋巴细胞减少症患者患者 燃烧的余烬：朝着更透明和强大的气候变化风险评估 硬化蛋白耗竭会诱导小鼠的骨髓炎症 等离子体P-TAU217预测常染色体显性阿尔茨海默氏病的体内脑病理学和认知 使用与身体部位的约束融合进行自动驾驶的计算有效的行人检测 通过联合多任务稀疏规范相关分析和分类来识别诊断特异性基因型 - 表型关联 非遗传性视网膜疾病的基因治疗 结合tau低聚物并抑制供体提取物的病理播种的构象抗体的晶体结构 祖先古细菌用吡咯氨酸扩大了遗传密码 贝叶斯自适应阶段I/II/II临床试验设计延迟...
Kim，B。H.，Choi，Y.H.，Yang，J.J.，Kim，S.，Nho，K.，Lee，J.M。，＆Alzheimer's Disision神经影像学计划。 （2020）。 鉴定了与阿尔茨海默氏病中皮质厚度相关的新型基因：系统生物学方法的神经影像学方法。 阿尔茨海默氏病杂志，75（2），531-545。 https://doi.org/10.3233/jad-191175Kim，B。H.，Choi，Y.H.，Yang，J.J.，Kim，S.，Nho，K.，Lee，J.M。，＆Alzheimer's Disision神经影像学计划。（2020）。鉴定了与阿尔茨海默氏病中皮质厚度相关的新型基因：系统生物学方法的神经影像学方法。阿尔茨海默氏病杂志，75（2），531-545。 https://doi.org/10.3233/jad-191175
通过模拟基因型固定，揭示了在进化保守位点对基于 CRISPR 的基因驱动的抵抗力
基于 CRISPR 的归巢基因驱动可以设计为破坏必需基因，同时偏向其自身的遗传，从而在实验室中抑制蚊子种群。这类基因驱动依赖于 CRISPR-Cas9 对目标序列的切割和从同源染色体中复制（“归巢”）基因驱动元件。然而，预计对切割有抗性但仍保持必需基因功能的靶位突变将被强烈选择。针对不易容忍突变的功能受限区域应该会降低抗性的概率。序列水平的进化保守性通常是功能约束的可靠指标，尽管一个保守序列与另一个保守序列之间实际的潜在约束水平可能有很大差异。在这里，我们在疟疾媒介冈比亚按蚊中生成了一种新型成虫致死基因驱动 (ALGD)，其靶向蚊子发育过程中所需的单倍体必需基因 (AGAP029113) 中超保守的靶位，该基因满足种群抑制基因驱动靶位的许多标准。然后，我们设计了一种选择方案，以实验性地评估在其靶位产生和随后选择基因驱动抗性突变的可能性。我们在笼养种群中模拟了基因驱动接近固定的情景，其中对抗性的选择预计最强。对目标基因座的连续采样显示选择了单个、恢复性的、符合框架的核苷酸替换。我们的研究结果表明，仅靠超保守并不能预测对靶位抗性具有抗性的位点。我们的体内抗性评估策略有助于验证候选基因驱动目标的抗性恢复力，并有助于改善对野外种群中基因驱动入侵动态的预测。
咖啡基因型中多种抗病基因的标记辅助聚合（阿拉比卡咖啡）
摘要：使用抗性品种是控制由真菌 Hemileia vastatrix 引起的咖啡叶锈病的最有效策略。为了协助开发此类品种，与咖啡抗性小种 I 和 II 以及 H. vastatrix 的致病型 001 的两个基因座相关的扩增片段长度多态性 (AFLP) 标记被转换为序列特征扩增区 (SCAR) 和切割扩增多态性位点 (CAPS) 标记。总共在抗性和易感亲本以及来自 F 2 群体的 247 个个体中验证了 2 个 SCAR 标记和 1 个 CAPS 标记。在使用开发的标记进行基因分型并使用 H. vastatrix 小种 II 进行表型分析的 F 2:3 和回交 (BCrs 2 ) 群体中评估了这些标记对标记辅助选择 (MAS) 的效率。这些标记在 MAS 中显示出 90% 的效率。因此，开发的标记与与其他抗锈病基因相关的分子标记一起用于 F 3:4 和 BCrs 3 咖啡选择。使用与咖啡浆果病 (CBD) 抗性相关的两个标记分析选定的植物，旨在进行预防性育种。具有所有抗性位点的 F 3:4 和 BCrs 3 个体的 MAS 是可行的。我们的表型和基因型方法可用于开发具有多种基因的咖啡基因型，这些基因赋予咖啡叶锈病和 CBD 抗性。