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World File Search System复合体
Pinotsis-and-Miller-2023-Cerebral-Cortex.pdf
近几十年来，神经科学发生了范式转变。过去，我们关注的是单个神经元的特性（James 1890；Queenan 等人 2017）。现在人们逐渐意识到，信息的存储和处理依赖于空间分布的、动态的神经元组合（Fujisawa 等人 2008；Buschman 等人 2011；Yuste 2015），称为神经集合（Buschman 等人 2012；Tayler 等人 2013；Pfau 等人 2013；Pinotsis 等人 2017；Pinotsis 和 Miller 2017）或印迹细胞（Thompson 1976；Josselyn 等人 2015）。蛋白质诱导（Gordon 等人，1980 年）、立即早期基因 (IEG) 表达（Guzowski 等人，2005 年）和光遗传学（Fenno 等人，2011 年）等技术可以识别参与记忆存储和回忆的神经元集合（Ryan 等人，2015 年；Tonegawa 等人，2015b 年）。此外，最近的实验发现许多大脑区域同时存在维持相同记忆的神经集合，这被称为印迹复合体（Poo 等人，2016 年；Roy 等人，2019 年）。在 Roy 等人 (2019 年) 的研究中，他们使用蛋白质 cFos 和 IEG 绘制了总共 247 个大脑区域，其中发现 117 个区域在回忆恐惧记忆时会被显著重新激活。因此，记忆并非存储在单个大脑区域，而是分散在多个区域和神经集合中。早期的记忆巩固理论（Squire 和 Alvarez 1995）和多重痕迹理论（Nadel 和 Moscovitch 1997）也发现记忆存储在多个区域，形成印迹复合体。这些印迹复合体通过由单突触或多突触连接形成的印迹通路连接在一起（Tonegawa 等人 2015a）。
Aire 依赖性基因经历 Clp1 介导的 3'UTR 缩短，与胸腺中更高的转录稳定性有关
摘要 免疫系统避免自身免疫性疾病的能力依赖于胸腺细胞对自身抗原的耐受性，而胸腺髓质上皮细胞 (mTEC) 的自身抗原的表达和呈递主要由 Aire 在转录水平上控制，并可能在其他未被认识的水平上受到调节。Aire 敏感基因的表达受多种分子因子的影响，其中一些属于 3' 端加工复合体，这表明它们可能通过影响 3'UTR 缩短来影响转录本的稳定性和水平。我们发现 Aire 敏感基因在 mTEC 中表现出对短 3'UTR 转录本异构体的明显偏好，这一特征先于 Aire 的表达，并与 3' 端加工复合体优先选择近端 polyA 位点相关。通过 RNAi 筛选和慢病毒小鼠的生成，我们发现一个因子 Clp1 可促进 3'UTR 缩短，而这又与更高的转录稳定性和 Aire 敏感基因的表达有关，揭示了在 mTEC 中对 Aire 激活表达的转录后水平控制。
太空机构的高级自动化
基于评估的结果，确定了四个无自动化潜力的概念。六个概念确实具有自动化潜力，对于其中三个概念，原型已经开发和构建。这包括通过MATLAB编程的两种过程自动化方法和旨在替换手动钻探过程的3D打印电线钻工具（见图6）。在钻井过程中不要扭动单个电线的要求使该工具复合体。
西太平洋棘冠海星的形态学和分子分析
棘冠海星 (COTS) 以在种群爆发期间吞食石珊瑚而破坏珊瑚礁而闻名。先前的研究表明，棘冠海星由四个物种组成，统称为 A. planci 物种复合体。尽管有可用的在线数据库序列，但太平洋 COTS 群（称为 Acanthaster solaris 或 Acanthaster cf. solaris）缺乏全面的形态描述和博物馆凭证标本。因此，本研究旨在使用形态特征和部分 CO1 线粒体基因对位于内格罗斯岛南部的两个地点的 COTS 标本进行表征。获得了大小、颜色、硬度、叉状棘、足尖棘和无足尖棘以及手臂的形态学和形态测量数据。收集了管足进行 DNA 条形码编码。使用 Kimura 2 参数替换模型确定了内格罗斯岛南部和 A. planci 物种复合体的参考序列之间的遗传分化。来自 SNI 的标本具有灰蓝色的无口体色，整个中央圆盘上分布着黑红色的斑点。体色变为灰白色，当动物暴露在空气中时，斑点会变得更红。它们全身有六种刺和微小的叉尾。从内格罗斯岛南部收集的所有 COTS 个体都与该物种复合体的太平洋群融合，标记为 Acanthaster cf. solaris 。内格罗斯岛南部序列和太平洋进化枝之间的种内遗传分歧分别为 0.192 和 0.38%。我们的结果证实了 A. cf. solaris 在菲律宾的存在，并提供了来自印度洋-太平洋地区的物种更全面的形态学描述。该物种的凭证标本存放在西利曼大学罗道夫·B·冈萨雷斯自然历史博物馆。
DNA双链断裂修复途径的选择与调控
图 1 DSB 修复途径总览 .DSB 发生后 , Ku70-80 会最先结合上来 , 如果不发生末端切除 , 会继而招募 DNA-PKcs, ligase IV, XRCC4 等 cNHEJ 核心因子介导 cHNEJ 修复途径 .如果末端发生 MRN-CtIP 介导的末端切除 , 则会产生 ssDNA 抑制 cNHEJ 修复途 径 .短程切除和长程切除产生的 ssDNA 可以通过链内退火进行修复 , 分别被称为 alt-EJ 和 SSA.长距离切除产生的 ssDNA 也可以 在 BRCA2-PALB2-BRCA1 复合体的帮助下和 RAD51 形成核蛋白纤维 , 进行同源找寻和连入侵过程 , 从而进入 HR 修复途径 .HR 途径又可以分为 BIR, SDSA 和 DSBR Figure 1 Overview of DSB repair pathways.The broken ends are first recognized and bound by Ku70-80.Without end resection, other cNHEJ core factors, such as DNA-PKcs, ligase IV, XRCC4, would be recruited to DSBs to mediate cNHEJ pathway.When MRN-CtIP-mediated resection occurs, the generated ssDNA will inhibit cNHEJ pathway.ssDNA from short-range and long-range resection can anneal in-strand to resolve the damages, termed Alt-EJ and SSA, respectively.ssDNA from long-range resection can also be bound by RAD51 to form nucleoprotein filament under the help of BRCA2-PALB2-BRCA1 complex.Nucleoprotein filament carry out homologous searching and strand invasion, promoting HR pathway.The HR pathway could be divided into BIR, SDSA and DSBR
一个共享的古老增强子元件差异地调节果蝇腿部发育过程中的 bric-a-brac 串联基因重复
基因复制和转录增强子的出现/修饰被认为对动物进化过程中表型创新做出了巨大贡献。尽管如此，人们对基因复制后增强子如何进化以及调控信息如何在复制基因之间重新连接知之甚少。果蝇 bric-a-brac (bab) 复合体由串联旁系同源基因 bab1 和 bab2 组成，为解决这些问题提供了范例。我们之前描述了一种调节发育足中 bab2 表达的基因间增强子 (名为 LAE)。我们在此显示直接与 LAE 结合的 bab2 调节子也控制跗骨细胞中的 bab1 表达。通过 CRISPR/Cas9 介导的基因组编辑切除 LAE 表明，这种增强子似乎参与了 bab1 和 bab2 在腿部组织中共表达，但并不是严格必需的。相反，LAE 增强子对于沿近端-远端足轴的旁系同源物特异性 bab2 表达至关重要。染色质特征和表型挽救实验表明，LAE 功能部分冗余，腿特异性调控信息与 bab1 转录单元重叠。系统基因组学分析表明 (i) bab 复合体起源于 Cyclorrhapha dipteran 亚系早期祖先单基因的复制，以及 (ii) LAE 序列在 Brachycera 亚目中很早就已进化固定，因此早于基因复制事件。这项工作为增强子提供了新的见解，特别是关于它们的出现、维持和进化过程中的功能多样化。
犬类感染性呼吸道疾病复合物的通知（...
在过去的几个月中，我们的医院注意到犬受感染性呼吸道疾病复合物（CIRDC）的影响，也称为狗窝咳嗽复合体。cirdc是由病毒或细菌（最常见的是bordetella）引起的上和下部气道的感染。与大多数CIRDC案例相反，CIRDC在7-10天内通过支持性护理（有时是添加抗生素）在7-10天内解决的，我们已经看到几例仅部分响应初始治疗或根本不反应。有些狗有严重的咳嗽，慢性或非分辨咳嗽，甚至进展到肺炎的问题（肺部感染，而不是仅在气道中）。
基于后继表示训练的神经网络的多模态认知图
认知地图是关于大脑如何有效组织记忆并从中检索上下文的一个概念。内嗅海马复合体与情景和关系记忆处理以及空间导航密切相关，被认为通过位置和网格细胞构建认知地图。为了利用认知地图的有希望的特性，我们使用后继表示建立了一个多模态神经网络，该网络能够模拟位置细胞动态和认知地图表示。在这里，我们使用由图像和词嵌入组成的多模态输入。网络学习新输入和训练数据库之间的相似性，从而成功学习认知地图的表示。随后，网络的预测可用于从一种模态推断到另一种模态，准确率超过 90%。因此，所提出的方法可以成为改进当前 AI 系统的基石，以便更好地理解环境和物体出现的不同模态。因此，特定模态与某些遭遇的关联可以在新情况下导致情境感知，当发生具有较少信息的类似遭遇时，可以从学习到的认知图中推断出更多信息。认知图，以大脑中的内嗅海马复合体为代表，组织和检索记忆中的情境，这表明像 ChatGPT 这样的大型语言模型 (LLM) 可以利用类似的架构来充当高级处理中心，类似于海马体在皮层层次结构中的运作方式。最后，通过利用多模态输入，LLM 可以潜在地弥合不同形式数据（如图像和文字）之间的差距，为情境感知和通过学习到的关联来扎根抽象概念铺平道路，解决人工智能中的基础问题。
欺凌和早期大脑发育
Linear Null 1 age + sex + SES + puberty + ICV + (1|subject) + (1|scan site) Linear Null 2 age + sex + SES + puberty + ICV + (1 + age|subject) + (1|scan site) Quadratic Null 1 Age + age 2 + sex + SES + puberty + ICV + (1|subject) + (1|scan site) Quadratic Null 2 age + age 2 +性别 + SES +青春期 + ICV +（1 +年龄|受试者） +（1 |扫描站点）线性ffx简单1个欺负受害者得分 +年龄 +年龄 + ses + ses + ses + ses + ses + icv + iCv +（1 | scan site） +（1 |扫描站点）线性ffx ffx ffx simple 2个欺负受害者2个欺负者分数 + se + ses + ses + ses + siply + siply sipper + puberty + puber frf（1 + quad） +（1 + quad frf sip） +（1 +）受害者得分 +年龄 +年龄2 +性别 + SES +青春期 + ICV +（1 |受试者） +（1 |扫描站点）二次FFX简单2个欺负受害者得分 +年龄 +年龄 +年龄 + 2 + ses + ses + ses + ses + ses + icv + iCV +（1 +年龄| |受试者）线性FFX复合体2欺负受害者得分 *年龄 +性别 +性 + ses + ses + icv +（1 +年龄|受试者） +（1 |扫描站点）二次ffx ffx复合体1个欺负受害者得分 *年龄 +年龄2 +年龄 + ses + ses + ses + ses + ses + ses + ses + ses + icv + icv +（1 | scan site） +年龄|受试者） +（1 |扫描位点）传奇：rfx =随机效果，ffx =固定效果，ROI =感兴趣的区域，ICV =颅内体积，年龄，年龄=基线的参与者年龄（几个月）。
大脑在睡眠期间选择性地收听陌生的声音
睡眠期间，大脑继续对环境刺激做出选择性反应。然而，这种反应的功能作用，以及它们是否反映了信息处理或感觉抑制，尚不完全清楚。在这里，我们向 17 位人类睡眠者（14 位女性）展示了他们自己的名字和两个陌生的名字，这些名字由熟悉的声音（FV）或陌生的声音（UFV）说出，同时在整晚的睡眠期间记录多导睡眠图。我们检测 K 复合体、睡眠纺锤波和微觉醒，并评估事件相关和频率反应以及对非快速眼动 (NREM) 睡眠期间呈现的不同刺激的试验间相位同步。我们表明，UFV 比 FV 引发更多的 K 复合体和微觉醒。当两种刺激都引起 K 复合波时，我们观察到更大的诱发电位、δ 波段（1 – 4 Hz）大脑反应更精确的时间锁定以及对 UFV 而非 FV 的高频（>16 Hz）范围的活动。至关重要的是，当听觉刺激不引起 K 复合波时，这些大脑反应差异会完全消失。我们的研究结果强调了大脑对听觉刺激的反应因与睡眠者的相关性而存在差异，并提出 K 复合波在睡眠期间调节感觉处理方面起着关键作用。我们认为，这种对外部感官信息内容特定的动态反应使大脑进入哨兵处理模式，在这种模式下，大脑参与睡眠期间正在进行的重要内部过程，同时仍保持处理重要外部感官信息的能力。