摘要哺乳动物NF-κBp52:p52同型二聚体及其辅因子Bcl3激活了具有中央G/c碱基对(BP)的κB位点的转录,而其对κB位点不活跃,具有中央A/T BP。To understand the molecular basis for this unique property of p52, we have deter- mined the crystal structures of recombinant human p52 protein in complex with a P-selectin(PSel)- κ B DNA (5 ′ -GGGGTGACCCC-3 ′ ) (central bp is underlined) and variants changing the central bp to A/T or swapping the flanking bp.与当前所有具有中央A/T BP的NF-κB-DNA复合物结构相比,DNA中央区域的结构显示了将近两倍的小凹槽。Microsecond molecular dynamics (MD) simulations of free DNAs and p52 bound complexes reveal that free DNAs exhibit distinct preferred conformations, and p52:p52 homodimer induces the least amount of DNA conformational changes when bound to the more transcriptionally active natural G/C-centric PSel- κ B, but adopts closed conformation when bound to the mutant A/T and swap DNAs due to their狭窄的小凹槽。我们的结合测定进一步表明,熵偏爱的快速动力学与较高的转录活性相关。总体而言,我们的研究揭示了与NF-κB复合物中κBDNA的新颖构象,并指出了由DNA构象和动态状态决定的结合动力学的重要性,在控制NF-κB的转录激活中。
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CCCTC结合因子(CTCF)结合了其11个串联锌(ZF)DNA结合域的哺乳动物ChR量型的增强子和启动子的数十含量。除了12-15 bp的核序列外,某些CTCF结合位点还包含上游和 /或3'下游motifs。在这里,我们分别描述了人类CTCF重叠部分的两个结构,包括ZF1 – ZF7和ZF3 – ZF11与DNA的复合体中的ZF1-ZF7和ZF3 – ZF11,它们将核心序列与3'下游或5'上游基序一起结合在一起。像常规的串联ZF阵列蛋白一样,ZF1 – ZF7 fol-DNA的右手扭曲,每个填充物均占据并识别一个在DNA Major Grove中的三个碱基对的三重态。Zf8 pla ys独特的作用,充当跨DNA或gro的间隔物,并定位ZF9 – ZF11,使其与DNA进行交叉接触。我们将ZF1 – ZF7和ZF8 – ZF11的TW O子分组之间的差异归因于每个纤维内两个位置-6和-5处的残基,而ZF1-ZF7的残基和ZF8 – ZF8 – ZF8 – ZF8-ZF8 – ZF8 – ZF8的ZF1 – ZF7的残基和较小的残基。ZF8也富含碱性氨基酸,该氨基酸使盐桥允许在较小的含量中添加到DNA磷酸盐。较高的特异性Ar ginine-鸟氨酸和谷氨酰胺 - 腺嘌呤相互作用,用于ZFS的常规碱基相互作用位置在常规的碱基相互作用位置上进行补充,也适用于ZF9 – ZF11所采用的跨链相互作用。ZF1 – ZF7和ZF8-ZF11之间的差异可以比例化结构,并且可以促进高实用性CTCF结合位点的识别。
摘要:来自结核分枝杆菌(MTB)的MBTI是Mg 2+依赖性的水杨酸酸盐合酶,属于综合剂利用酶(CUE)家族。作为采购铁的基本参与者,MBTI促进了感染宿主中MTB的生存和致病性。因此,它在过去十年中成为了结核病抗病毒疗法的创新,潜在的靶标。在这种情况下,已经将5-苯基氟烷-2-羧酸鉴定为有效的MBTI抑制剂。在2020年描述了MBTI与该类别成员的第一个共结构结构,显示了采用开放式构造的酶。由于与结合口袋相邻的环的迁移率很高,因此在电子密度图中未定义大部分氨基酸链,因此阻碍了旨在结构驱动配体优化的计算工作。在此,我们报告了MBTI的一种新的高分辨率共结晶结构,其基于Furan的衍生物,其中酶的封闭形成允许在绑定的抑制剂的情况下追踪整个活性位点口袋。此外,我们描述了MBTI的新晶体结构,并与已知的抑制剂甲基AMT复杂化,这表明体外效力与观察到的酶构象无关。这些发现将证明是通过基于理性结构的药物设计方法来提高本系列效力的基本。
Foods,M.,Della,G.,Tartar,I.,Gandini,G.,G.G.,Salvo,A.,Rosati,M。(2022)。在Caso中接近生日宽广的野心。期刊行为,50,23-29 [10,1016/j.jveb.2022.01,002]。
杂志在波兰评估参数教育和科学部长中的40分。附件是17.2023号教育与科学部长的环境。32318。有期刊的唯一标识符:201159。分配的科学学科:物理文化科学(医学和健康科学领域);健康科学(医学科学和健康科学领域)。2019年的部长朋克 - 现年40分。从17.07.2023 LP起的教育与科学部长的发展。32318。辞职的科学学科:物理文化科学(医学科学与健康科学的COOM);卫生选举(Enon医学与健康科学)。 ©作者2023;本文在波兰托伦(Torun)的尼古拉斯(Nicolauss)的尼古拉斯(Nicolauss of Nicolauss)开放式尼古拉斯(Nicolauss of Nicolauss)开放式访问中发表了本文。 This article is distracted under the therms of the Creative Commons Attribation Attribation Noncommercial License y permits ann noncommercial zse, distraction, and reproducation in an an an an an an a medium, provided the ariginal a carhor (s) and source are归功于。 这是根据创意共享属性归因于非商业授权人共享的Ackenses许可的AN OPEN ACCES文章。 (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/),只要适当地引用了工作,就可以在任何媒介中不受限制,非商业用途,分发和复制。 汽车宣布TER与利益的利益没有冲突,即本文的出版。 收到:08.03.2023。辞职的科学学科:物理文化科学(医学科学与健康科学的COOM);卫生选举(Enon医学与健康科学)。 ©作者2023;本文在波兰托伦(Torun)的尼古拉斯(Nicolauss)的尼古拉斯(Nicolauss of Nicolauss)开放式尼古拉斯(Nicolauss of Nicolauss)开放式访问中发表了本文。 This article is distracted under the therms of the Creative Commons Attribation Attribation Noncommercial License y permits ann noncommercial zse, distraction, and reproducation in an an an an an an a medium, provided the ariginal a carhor (s) and source are归功于。 这是根据创意共享属性归因于非商业授权人共享的Ackenses许可的AN OPEN ACCES文章。 (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/),只要适当地引用了工作,就可以在任何媒介中不受限制,非商业用途,分发和复制。 汽车宣布TER与利益的利益没有冲突,即本文的出版。 收到:08.03.2023。辞职的科学学科:物理文化科学(医学科学与健康科学的COOM);卫生选举(Enon医学与健康科学)。©作者2023;本文在波兰托伦(Torun)的尼古拉斯(Nicolauss)的尼古拉斯(Nicolauss of Nicolauss)开放式尼古拉斯(Nicolauss of Nicolauss)开放式访问中发表了本文。This article is distracted under the therms of the Creative Commons Attribation Attribation Noncommercial License y permits ann noncommercial zse, distraction, and reproducation in an an an an an an a medium, provided the ariginal a carhor (s) and source are归功于。这是根据创意共享属性归因于非商业授权人共享的Ackenses许可的AN OPEN ACCES文章。(http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/),只要适当地引用了工作,就可以在任何媒介中不受限制,非商业用途,分发和复制。汽车宣布TER与利益的利益没有冲突,即本文的出版。收到:08.03.2023。修订:30.04.2023。接受:21.05.2023。发布:31.05.2023。
摘要 简介:尽管取得了巨大进展,但仍然需要新的治疗靶点和策略,特别是对于某些转移性癌症(乳腺癌、结直肠癌、胰腺导管腺癌和透明细胞肾癌)。离子通道可被视为良好的癌症生物标志物和抗肿瘤治疗靶点。考虑到 hERG1 钾通道是抗肿瘤治疗的新靶点,这些概念尤其重要。 涵盖领域:大量证据表明,hERG1 在人类癌症中异常表达,特别是在侵袭性癌症中。一个相关的基石是发现,在癌细胞中,该通道以一种非常特殊的构象存在,严格与整合素受体的 β1 亚基结合。hERG1/β1 整合素复合物不会出现在心脏中。基于这一证据,我们开发了一种新型单链双特异性抗体 (scDb-hERG1-β1),该抗体特异性靶向 hERG1/β1 整合素复合物,并在临床前实验中发挥抗肿瘤作用。专家意见:由于许多 hERG1 阻断剂会产生严重的心脏毒性作用(室性心律失常),因此不能将 hERG1 阻断用于抗肿瘤治疗,因此必须确定不同的策略来特异性靶向癌症中的 hERG1。通过双特异性抗体 scDb-hERG1-β1 靶向 hERG1/β1 整合素复合物可以克服此类障碍。
光合作用是由太阳的单个光子1-3引发的,作为弱光源,在叶绿素吸收带1中,每秒最多每秒几十个光子每秒传递几十个光子。在过去的40年中,在过去的40年中,许多实验和理论工作探索了在光合作用中吸收光合作用的事件,从而吸收了强烈的超短激光脉冲2-15。在这里,我们使用单个光子在环境条件下激发了紫色细菌的紫obacter sphaeroides的轻度收获2(LH2)复合物,分别包含9和18个细菌氯植物分子的B800和B850环。B800环的激发在大约0.7)ps中导致电子能量转移到B850环,然后在约100-FS的时间尺度上快速B850至B850 Energy Transfers在850–875时(参考)NM(参考)。16–19)。使用宣传的单光子源20,21以及一致计数,我们建立了B800激发和B850 Fuoresence发射的时间相关函数,并证明这两个事件都涉及单个光子。我们还表明,每个检测到的插入光子光子的概率分布支持这样一种观点,即吸收后单个光子可以驱动随后的能量传递和实现发射,因此,通过扩展,光合作用的主要电荷分离。一个分析随机模型和蒙特卡洛数值模型捕获了数据,进一步缔结了单个光子的吸收与自然光收获复合物中单个光子的发射相关。
尽管如此,缺乏特异性是癌症化学疗法最重要的缺点之一。30要克服不良的选择性,采用可以激活的前药或可以在特定地区传递的药物已成为有前途的策略。31例如,实体瘤环境(最常见的癌症形式)通常是特征 - 低氧32和略微酸度,33 - 35个可用于激活前药或输送药物的特性。在此观点下,羧基钠(II,III)化合物也很有趣,因为它们具有氧化还原电位在逻辑上可访问。22,36,37可以在缺氧条件下降低,并且可能在高水平的谷胱甘肽存在下,在肿瘤环境中38
在修复链间交联 (ICL) 期间,会产生 DNA 双链断裂 (DSB)。范康尼贫血症 (FA) 核心复合物被募集到 ICL,通过同源重组 (HR) 促进该 DSB 的高精度修复。然而,FA 核心复合物是否也促进 ICL 独立 DSB(例如由电离辐射或核酸酶诱导的 DSB)的 HR 仍存在争议。在这里,我们在基于 CRISPR/Cas9 的筛选中将 FA 核心复合物成员 FANCL 和 Ube2T 鉴定为 HR 促进因子。使用同源细胞系模型,我们进一步证明了 FANCL 和 Ube2T 及其泛素化底物 FANCD2 的 HR 促进功能。我们表明 FANCL 和 Ube2T 以 FANCM 依赖的方式定位在 DSB 上,并且是 FANCD2 在 DSB 上积累所必需的。从机制上讲,我们证明 FANCL 泛素连接酶活性是 CtIP 在 DSB 上积累所必需的,从而促进末端切除和 Rad51 加载。总之,这些数据表明 FA 核心复合物和 FANCD2 在促进 ICL 和 DSB 修复方面具有双重基因组维护功能。
