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塑料蛋白乙酰转移酶GNAT1与GNAT2形成复合物，但它们的相互作用对于状态转变
蛋白质N-乙酰化是真核生物中最丰富的翻译和后翻译的修饰之一，将其扩展到血管植物内的叶绿体。最近，在拟南芥中揭示了一种新型的塑料酶家族，该酶家族包括八个表现出双赖氨酸和N末端乙酰化活性的乙酰基转移酶。其中，GNAT1，GNAT2和GNAT3揭示了明显的系统发育接近，形成了称为NAA90的亚组。我们的研究着重于特征性GNAT1，与状态过渡乙酰转移酶GNAT2密切相关。与GNAT2相比，GNAT1对状态转变并不是必需的，并且与高光条件下的野生型相比，没有明显的表型差异，而GNAT2突变体受到了严重影响。然而，GNAT1突变体显示出类似于GNAT2突变体类似的类似类似类似的类囊体膜。对重组GNAT1的体外研究表明，在合成底物肽上表现出耐药的N端乙酰化活性。 通过N末端乙酰基团在两个独立的GNAT1敲除线中通过N末端乙酰基团在体内确认了这种活性。 这将塑料蛋白上的几个乙酰化位点归因于GNAT1，反映了GNAT2的底物光谱的子集。 此外，共免疫沉淀与质谱法相结合，揭示了GNAT1和GNAT2之间的牢固相互作用，以及GNAT2与GNAT3的显着关联 - NAA90中的第三个乙酰转移酶。 这些发现引入了质体代谢中乙酰化依赖性调节中的新型调节层。对重组GNAT1的体外研究表明，在合成底物肽上表现出耐药的N端乙酰化活性。通过N末端乙酰基团在两个独立的GNAT1敲除线中通过N末端乙酰基团在体内确认了这种活性。这将塑料蛋白上的几个乙酰化位点归因于GNAT1，反映了GNAT2的底物光谱的子集。共免疫沉淀与质谱法相结合，揭示了GNAT1和GNAT2之间的牢固相互作用，以及GNAT2与GNAT3的显着关联 - NAA90中的第三个乙酰转移酶。这些发现引入了质体代谢中乙酰化依赖性调节中的新型调节层。这项研究揭示了叶绿体中至少存在两个乙酰基转移酶络合物的存在，因此复合物的形成可能对整个乙酰基转移酶活性的细节具有关键作用。
通过CRISPR/CAS9和多个RAAVS 成功建立了基于病毒复制元素的衣原体叶绿体中的外源基因表达系统 散装转录组分析，inmoose，python中的综合多摩管开源环境 标题：在神经退行性疾病的小鼠模型中自动评估区域脑萎缩的工具 揭示了来自单个人类皮肤部位的共生菌群的多样性 探索1 ... 中的遗传转化和基因组编辑 诱惑：纵向微生物组研究的时间信息降低 白血病蛋白PHF6和PHIP形成一种染色质复合物，抑制髓样白血病 靶向trem2-tyrobp跨膜结合的药物筛查 Klebphacol：Klebsiella的社区驱动资源... 干细胞因子抑制purkinje细胞的调节 牛的牛外胚层细胞 丰富的测量结果揭示了人类肠道微生物组中的裂解与裂解性之间的平衡 稳定的登革热病毒2包膜亚基疫苗重定向中和抗体1
我们感谢Ben Humphreys，Gaya Amarasinghe，Daisy Leung和Ting Wang的评论和建议，Robert Fulton，Catrina Fronick，Paul Cliften提供了技术帮助。这项工作得到了Siteman Cancer Center的共享资源投资计划的部分支持。
正离子模式天然电喷雾电离质谱法中 DNA 复合物的带电
摘要：天然质谱 (nMS) 通过“软”电喷雾电离 (ESI) 保留非共价相互作用，从而深入了解生物大分子在其天然状态下的结构和动力学。对于天然蛋白质，获得的电荷数量与表面积和质量成比例。在这里，我们探索了高度带负电荷的 DNA 对蛋白质复合物 ESI 电荷的影响，发现质荷比降低以及变化较大。纯 DNA 组装体的电荷状态分布比蛋白质低，因为它们在气相中的密度较大，而蛋白质-DNA 复合物的电荷还可能受到 ESI 电荷分布、离子配对事件和 DNA 成分崩塌的影响。我们的研究结果表明，蛋白质-DNA 复合物的结构特征可能导致蛋白质的电荷状态低于预期。关键词：蛋白质-DNA 复合物、电荷状态分布、电喷雾电离 ■ 简介
广谱八幡抗噬菌体防御复合物感知基因组完整性
Owen T. Tuck, 1,2,10 Benjamin A. Adler, 2,3,10 Emily G. Armbruster, 4 Arushi Lahiri, 5 Jason J. Hu, 2,5 Julia Zhou, 5 Joe Pogliano, 4 和 Jennifer A. Doudna 1,2,3,5,6,7,8,9,11,* 1 加州大学伯克利分校化学系，美国加利福尼亚州伯克利市 94720 2 加州大学伯克利分校创新基因组学研究所，美国加利福尼亚州伯克利市 94720 3 加州大学伯克利分校加州定量生物科学研究所 (QB3)，美国加利福尼亚州伯克利市 94720 4 加州大学圣地亚哥分校生物科学学院，美国加利福尼亚州拉霍亚市 92093 5 加州大学伯克利分校分子与细胞生物学系， CA 94720，美国 6 加州大学伯克利分校霍华德休斯医学研究所，美国加利福尼亚州伯克利市 94720，美国 7 劳伦斯伯克利国家实验室 MBIB 部门，美国加利福尼亚州伯克利市 94720，美国 8 加州大学旧金山分校格拉德斯通研究所，美国加利福尼亚州旧金山市 94720，美国 9 加州大学伯克利分校生物工程系，美国加利福尼亚州伯克利市 94720，美国 10 这些作者贡献相同 11 主要联系人 *通信地址：doudna@berkeley.edu https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.09.020
差异化 - 复合物sputum-microbiome in患者 -
对国际健康的主要危害，结核分枝杆菌（MTB）是传染病，称为结核病（TB）。基于全球报告2020年的全球，印度尼西亚的结核病负担仅次于印度。国家数据报告说，估计的结核病病例数量在2022年和2021年保持稳定为969,000。然而，确认的结核病病例从2021年之间从443,235例增加到713,184 [1]。在印度尼西亚的东爪哇省，Soetomo医院博士担任转诊医院；另一方面，East Java是一个结核病区域，其发病率较高，尤其是萨拉巴亚市，2021年最高的结核病病例（4,475）[2]。在流行结核病区域中，患有慢性下呼吸道感染的肺结核患者具有重复感染（复发性结核病）[3]或来自环境中另一微生物的感染的危险因素。
B复合物对高潮的影响：对妇女的代谢健康和福利的影响
摘要：简介：最新情况是妇女生活中的一个过渡时期，其特征是激素变化影响代谢健康和一般福祉。雌激素减少与疾病的风险增加有关，例如代谢综合征和心血管疾病。b复合物，对于代谢和心理健康必不可少，可以减轻这些影响。目的：本研究旨在研究B族维生素对代谢健康和最佳妇女福祉的影响。方法论：使用特定的关键字和严格的包含标准在三个数据库（Scielo，Google Academic和PubMed）上进行了系统的审查。分析了75篇文章，其中9篇文章是通过提供有关B复合物补充作用的一致数据来选择的。结果和讨论：分析表明，维生素B6，B12和叶酸可有效降低同型半胱氨酸水平，从而有助于心血管健康。尽管有好处，但每种维生素及其组合的孤立作用仍然缺乏更多的研究，无法完全理解。结论：B族维生素对妇女在最高阶段中具有重要意义，但是需要进一步的研究来阐明补充的有效性及其对生殖健康和认知功能的影响。
吉泊汀和佐利氟达星如何稳定与细菌IIA型拓扑异构酶的DNA裂解复合物？1.金属结合位点的实验定义
摘要：21 世纪实验结构生物学面临的挑战之一是观察化学反应的发生。金黄色葡萄球菌 (S. aureus) DNA 旋转酶是一种 IIA 型拓扑异构酶，可产生暂时的双链 DNA 断裂来调节 DNA 拓扑结构。吉泊汀、佐利氟达星和喹诺酮类莫西沙星等药物可以稳定这些通常短暂的 DNA 链断裂并杀死细菌。在相同的 P6 1 空间群 (a = b ≈ 93 Å，c ≈ 412 Å) 中，已解析出含有吉泊汀前体 (2.1 Å GSK2999423) 或双裂 DNA 和佐利氟达星 (或其前体 QPT-1) 的未裂解 DNA 的晶体结构。这表明可能可以观察到该 P6 1 空间群中的两个 DNA 切割步骤（和两个 DNA 连接步骤）。这里，解决了这种晶体形式的 2.58 Å 异常锰数据集，并重新细化了这种晶体形式的四个先前的晶体结构（1.98 Å、2.1 Å、2.5 Å 和 2.65 Å）以阐明晶体接触。这些结构清楚地表明了单一移动金属机制——在附带的（第二篇）论文中提出。先前发表的酵母拓扑异构酶 II 的 2.98 Å 结构，它在晶体二重轴周围具有静态无序，被发表为在一个活性位点包含两种金属。这个 2.98 Å 酵母结构的重新细化坐标与其他 IIA 型拓扑异构酶结构一致，在两个不同的活性位点各只有一个金属离子。
抗抑制剂凝血复合物：Feiba NF/Feiba VF
Feiba 是一种抗抑制剂凝血复合物，适用于控制和预防带有抑制剂的血友病 A 和 B，以及用于围手术期管理和常规预防，以防止/减少出血发作频率。通过一项多中心随机前瞻性试验证明了疗效，该试验招募了 44 名带有抑制剂的血友病 A 患者、3 名带有抑制剂的血友病 B 患者和 2 名获得性因子 VIII 抑制剂患者。该试验旨在评估 Feiba 在治疗关节、粘膜、肌肉皮肤和紧急出血发作（如中枢神经系统出血和手术出血）方面的疗效。受试者以 50 单位/千克的剂量接受治疗，间隔 12 小时。93% 的发作出血得到控制，78% 的发作在 36 小时内通过一次或多次输注实现止血。最常见的不良反应（>5% 受试者）是贫血、腹泻、关节血肿、乙肝表面抗体阳性、恶心和呕吐。严重的药物不良反应是超敏反应和血栓栓塞事件，包括中风、肺栓塞和深静脉血栓形成。
高级肠道健康复合物*
近 2500 年后，科学证实了这一事实。人体含有约 100 万亿个微生物（微生物群），数量远远超过人体细胞。微生物群的最大部分（约 80%）位于大肠中，直接影响消化系统、免疫系统、神经系统和内分泌系统的功能。健康的微生物群由多达 1000 种不同的有益细菌组成，有益细菌与有害细菌的比例分别约为 85% 和 15%。这种多样性和比例可能会因不良饮食、毒性和压力等现代生活方式的影响而发生巨大改变。
功能性CAS的递送：DNA核蛋白复合物通过IV型分泌系统
我们开发了一种将CRISPR -CAS遗传工具引入细菌的不同方法。在细菌结合期间，松弛酶通过IV型分泌系统共同连接到DNA上。通过将CAS蛋白与弛豫酶融合在一起，我们观察到受体细胞中的功能性CAS活性，从而消除了这些细胞中核酸酶表达的需求。转移的DNA分子可以提供引导RNA和供体DNA，从而通过重组实现无缝的遗传修饰。我们还将松弛酶的融合到受体细胞中活性的基础编辑器。这些是迄今为止最大的蛋白质底物。此方法可以应用于任何受体细胞，尤其是野生 - 缺乏可用遗传工具的细菌菌株。