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人类多能干细胞衍生的睾丸类器官的构建和
Rufei Huang 1# , Huan Xia 1# , Tao Meng 1# , Yufei Fan 1 , Xun Tang 1 , Yifang Li 1 , Tiantian
LDB1调节多能性中的基因表达和染色质结构，
抽象染色质组织是干细胞多能和分化的关键因素。然而，尚未探索增强子循环蛋白LDB1在干细胞中的作用。我们使用CRISPR/CAS9编辑产生了LDB1（ - / - ）胚胎干细胞（ESC），并观察到LDB1损失后关键干细胞因子SOX2和KLF4的降低。源自LDB1（ - / - ）ESC的胚胎体（EB）显示出谱系特异性标记的表达降低，并且能力受损能够经历末端分化为红细胞。差异基因表达，包括LIN28介导的自我更新途径基因，在WT和LDB1（ - / - ）ESC和EB之间观察到，但在分化为成红细胞细胞后最为明显。LDB1占据了超级增强剂，包括多能基因的超级增强剂，以及多能因素。LDB1损失导致ESC和EB中的全球染色质可及性降低。有条件的LDB1缺陷小鼠在骨髓细胞上显示造血干细胞标记降低，LIN28途径的失调。因此，LDB1功能对于ESC和EB发育至关重要，在分化为红细胞时变得越来越重要。关键字：
幼稚的人类多能干细胞保持胚胎，胚外和胚泡产生潜力
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年1月20日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2025.01.17.633522 doi：Biorxiv Preprint
使用人多能干细胞衍生的人类肢体骨骼发育进行建模
预印本（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2025年1月10日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.09.631479 doi：Biorxiv Preprint
使用患者衍生的多能干细胞
Yuanyuan Qin 1* , Parth Chhetri 1* , Elizabeth Theusch 1* , Grace Lim 1 , Sheila Teker 1 , Yu-Lin Kuang 1 , Shahrbanoo Keshavarz Aziziraftar 2 , Mohammad Hossein Mehraban 2 , Antonio Munoz-Howell 1 , Varun Saxena 3 , Dounia Le Guillou 4 , Aras N. Mattis 2,5,6，Jacquelyn J. Maher 4,5，Marisa W. Merisa W. 1,5,7 1加利福尼亚大学旧金山分校儿科学系2加利福尼亚州旧金山3 Kaiser Southerente Southerente Southerente South San Francisco San San Francisco Uncilent of California San San Francisco 5 Ucsf live of Cactornia of Cactornia Medicine and Stem Cell Research, University of California San Francisco 7 Institute of Human Genetics, University of California, San Francisco *Contributed equally Corresponding Author : Marisa Medina 5700 Martin Luther King Jr. Way Oakland, CA 94609 Marisa.medina@ucsf.edu Keywords : Functional lipid assessment, MASLD cohorts, precision medicine, individual susceptibility, patient-derived IPSC，MASLD预防策略电子单词计数：2000个数字和表数：2利益冲突陈述：ANM是Biomarin Pharmaceuticals，Pliant Therapeutics，Regeneron Pharmaceuticals和Hepatx的顾问。财政支持声明：这项工作得到了CIRM DISC2-12358（MWM，ANM），NIH R01 DK130391（MWM，ANM），NIH R01 DK132129（ANM），ANM），以及由Sandler Fundation的部分资金，由Sandler Fundation（MANM）（MMWMWM）（MMWMWM）资助。通过CIRM IT1-06563（JJM），R21DK118380（JJM）和UCSF肝脏中心P30 DK026743提供了。。作者贡献概念化 - MWM方法论 - AMH，VS验证 - GL正式分析 - MWM，YQ，GL，ET调查 - YQ，PC，PC，GL，ST，ST，YK Resources - SKA，MHM，MHM，DLG，ANM，ANM，JJM，JJM
临床特征和诱导多能干细胞（IPSC）疾病模型的Harel-Yoon综合征模型由复合杂合ATAD3A变体引起
ATPase家族AAA含有域的蛋白3a（ATAD3A）富含线粒体膜，对于维持线粒体结构和功能至关重要。 ATAD3A基因的变体可以导致Harel Yoon综合征（Hayos），这是神经，心血管和其他系统的发育缺陷。 这项研究旨在从患者的体细胞（Zjuchyli001-A）和阴性对照（Zjuchyli002-A）中开发出诱导的多能干细胞（IPSC），作为对ATAD3A变异疾病的病因的进一步研究的有效工具。 我们描述并分析了Proband及其家人的临床表现。 从概率和阴性对照中收集并将其重新编程为IPSC。 此外，我们测量了IPSC中的ATAD3A表达水平，以确认这些细胞系的有效性。 Proband和她的姐姐都病重病，并有复合杂合的ATAD3A变体（F459S/T498NF*13）。 他们的父母是这些变体的载体，没有任何临床表现。 两个变体都位于ATAD3A蛋白的ATPase结构域上。 细胞系Zjuchyli001-A和Zjuchyli002-A呈现多能干细胞的典型特征。 与Zjuchyli002-A相比，Zjuchyli001-A的ATAD3A表达水平显着降低。 这项研究从ATAD3A的复合杂合变体的患者中产生了IPSC，并且是负面对照，作为阐明ATAD3A变体相关疾病的分子机制的有价值工具。ATPase家族AAA含有域的蛋白3a（ATAD3A）富含线粒体膜，对于维持线粒体结构和功能至关重要。ATAD3A基因的变体可以导致Harel Yoon综合征（Hayos），这是神经，心血管和其他系统的发育缺陷。 这项研究旨在从患者的体细胞（Zjuchyli001-A）和阴性对照（Zjuchyli002-A）中开发出诱导的多能干细胞（IPSC），作为对ATAD3A变异疾病的病因的进一步研究的有效工具。 我们描述并分析了Proband及其家人的临床表现。 从概率和阴性对照中收集并将其重新编程为IPSC。 此外，我们测量了IPSC中的ATAD3A表达水平，以确认这些细胞系的有效性。 Proband和她的姐姐都病重病，并有复合杂合的ATAD3A变体（F459S/T498NF*13）。 他们的父母是这些变体的载体，没有任何临床表现。 两个变体都位于ATAD3A蛋白的ATPase结构域上。 细胞系Zjuchyli001-A和Zjuchyli002-A呈现多能干细胞的典型特征。 与Zjuchyli002-A相比，Zjuchyli001-A的ATAD3A表达水平显着降低。 这项研究从ATAD3A的复合杂合变体的患者中产生了IPSC，并且是负面对照，作为阐明ATAD3A变体相关疾病的分子机制的有价值工具。ATAD3A基因的变体可以导致Harel Yoon综合征（Hayos），这是神经，心血管和其他系统的发育缺陷。这项研究旨在从患者的体细胞（Zjuchyli001-A）和阴性对照（Zjuchyli002-A）中开发出诱导的多能干细胞（IPSC），作为对ATAD3A变异疾病的病因的进一步研究的有效工具。我们描述并分析了Proband及其家人的临床表现。从概率和阴性对照中收集并将其重新编程为IPSC。此外，我们测量了IPSC中的ATAD3A表达水平，以确认这些细胞系的有效性。Proband和她的姐姐都病重病，并有复合杂合的ATAD3A变体（F459S/T498NF*13）。他们的父母是这些变体的载体，没有任何临床表现。两个变体都位于ATAD3A蛋白的ATPase结构域上。细胞系Zjuchyli001-A和Zjuchyli002-A呈现多能干细胞的典型特征。与Zjuchyli002-A相比，Zjuchyli001-A的ATAD3A表达水平显着降低。这项研究从ATAD3A的复合杂合变体的患者中产生了IPSC，并且是负面对照，作为阐明ATAD3A变体相关疾病的分子机制的有价值工具。
2024; 20（15）：6255-6278。 doi：10.7150/ijbs.100113研究论文来自人类诱导的多能干细胞的细胞外囊泡表现出独特的MIC
1。fondazione irccs ca'granda ospedale maggiore Policlinico，意大利米拉诺的fondazione irccs ca和Gene疗法单位。2。瑞士苏黎世大学医院医学肿瘤学和血液学系。3。ITB-CNR，国家研究委员会生物医学技术研究所，意大利分离。4。脑损伤和神经保护症实验室，急性脑和心血管损伤部，意大利米兰的Istituto di Ricerche Farmacogiche Mario Negri Irccs。5。San Raffaele科学研究所，意大利米拉诺神经科学部，神经科学部。 6。 意大利L'Aquila大学的生活，健康与环境科学系。 7。 Epiget Lab，米兰米兰大学临床科学与社区健康系。 8。 意大利米兰米兰比科卡大学生物技术与生物科学系。 9。 移植免疫学SC Trapianti Lombardia的实验室 - NITP。 fondazione irccs ca'granda ospedale maggiore Policlinico，意大利米兰。San Raffaele科学研究所，意大利米拉诺神经科学部，神经科学部。6。意大利L'Aquila大学的生活，健康与环境科学系。 7。 Epiget Lab，米兰米兰大学临床科学与社区健康系。 8。 意大利米兰米兰比科卡大学生物技术与生物科学系。 9。 移植免疫学SC Trapianti Lombardia的实验室 - NITP。 fondazione irccs ca'granda ospedale maggiore Policlinico，意大利米兰。意大利L'Aquila大学的生活，健康与环境科学系。7。Epiget Lab，米兰米兰大学临床科学与社区健康系。 8。 意大利米兰米兰比科卡大学生物技术与生物科学系。 9。 移植免疫学SC Trapianti Lombardia的实验室 - NITP。 fondazione irccs ca'granda ospedale maggiore Policlinico，意大利米兰。Epiget Lab，米兰米兰大学临床科学与社区健康系。8。意大利米兰米兰比科卡大学生物技术与生物科学系。9。移植免疫学SC Trapianti Lombardia的实验室 - NITP。fondazione irccs ca'granda ospedale maggiore Policlinico，意大利米兰。
了解胚胎干细胞中多能性命运转变的调节
胚胎干细胞（ESC）来自胚泡的内部细胞质量，类似于该组织的功能，但缺乏形成所有胚外结构的能力。MESC是瞬态细胞群，表达了2细胞（2C）胚胎的高水平转录本特征，并被鉴定为“ 2细胞类似细胞”（2clcs）。先前的研究表明，在重新引入早期胚胎后，2CLC可以有助于胚胎和胚外组织。大约1％的MESC从多能MESC动态过渡到2Clcs。然而，哺乳动物胚胎的稀缺性对整体细胞的分子表征构成了重要挑战。迄今为止，以前的研究探索了将多能细胞重编程为全能细胞的各种方法。虽然对维持ES多能性的分子调节网络有很好的了解，但多能ESC将重编程重新编程为整体细胞的过程以及对全能调节的相关分子机制仍然很熟悉。本综述综合了对ESC重编程为2CLC的调节途径的最新见解，探索了由转录调节剂，小分子和表观遗传变化调节的分子机制。目的是为研究人员的领域构建一个理论框架。
CRISPR屏幕在IPSC衍生的神经元中揭示了tau proteostasis 的原理 人类诱导的多能干细胞的扰动细胞图集 多态串联重复在免疫景观上形状的单细胞基因表达 蛋白质生成进化扩散 注释冷冻卷：机器学习挑战 胎盘猪中的胎盘HIGF1纳米颗粒基因治疗在肝脂质和葡萄糖代谢相关的信号通路中以胎儿性别特异性方式改善胎儿生长限制相关的变化 西尼罗河病毒在欧洲传播的生物气候建模，特别关注乌克兰 单元格中的信号：用于治疗的多模式和上下文化的机器学习基础 SPAMTP：空间代谢组学和转录组学数据的综合统计分析和可视化 使用捕获的离子迁移率和DDAP 通过成对的细胞表面和病毒1 增强了慢病毒基因递送到哺乳动物细胞 坏死性到凋亡信号轴是炎症性肠病的基础 Devider：多种单倍型的长阅读重建 pyr1生物传感器驱动的全基因组CRISPR筛选，用于改善Kluyveromyces Marxianus的单甲苯样产生 果糖-2,6-双磷酸盐恢复TDP-43病理 - bean（psophocarpus tetragonolobus）
蛋白质tau的抽象聚集定义了tauopathies，其中包括阿尔茨海默氏病和额颞痴呆。特定的神经元亚型有选择地容易受到tau聚集的影响，随后的功能障碍和死亡，但潜在的机制尚不清楚。系统地揭示了控制人类神经元中Tau聚集体积累的细胞因子，我们在IPSC衍生的神经元中进行了基于基因组CRISPRI的修饰筛网。屏幕发现了预期的途径，包括自噬，以及意外的途径，包括ufmylation和GPI锚构成。我们发现E3泛素连接酶CUL5 SOCS4是人类神经元中tau水平的有效修饰符，泛素化tau，与小鼠和人类中的auopanty的脆弱性相关。线粒体功能的破坏会促进tau的蛋白酶体错误处理，从而产生tau蛋白水解片段