1 宾夕法尼亚大学生物医学图像计算与分析中心,美国宾夕法尼亚州费城 19104 2 宾夕法尼亚大学放射学系,美国宾夕法尼亚州费城 19104 3 中国脑研究中心,北京 102206 4 宾夕法尼亚大学精神病学系,美国宾夕法尼亚州费城 19104 5 宾夕法尼亚大学 Penn/CHOP 寿命脑研究所,美国宾夕法尼亚州费城 19104 6 宾夕法尼亚大学神经病学系,美国宾夕法尼亚州费城 19104 7 宾夕法尼亚大学宾夕法尼亚成像与可视化统计中心,美国宾夕法尼亚州费城 19104 8 宾夕法尼亚大学生物统计学、流行病学和信息学系,美国宾夕法尼亚州费城 19104 9 宾夕法尼亚大学脑成像与刺激中心,美国宾夕法尼亚州费城 19104 10 宾夕法尼亚大学脑科学、转化、创新与调节中心宾夕法尼亚大学,美国宾夕法尼亚州费城 19104,美国 11 宾夕法尼亚大学抑郁和压力神经调节中心,美国宾夕法尼亚州费城 19104,美国 12 宾夕法尼亚大学神经科学、神经外科和生物工程系,美国宾夕法尼亚州费城 19104,美国 13 宾夕法尼亚大学宾夕法尼亚寿命信息学和神经影像中心,美国宾夕法尼亚州费城 19104,美国 *通讯作者:Yong.Fan@pennmedicine.upenn.edu
区域内皮细胞异质性是鼠肾血管发育的基础。Peter M Luo 1† , Neha Ahuja 1† , Christopher Chaney 1,3 , Danielle Pi 4 , Aleksandra Cwiek 5 , Zaneta Markowska 5 , Chitkale Hiremath 2,3 , Denise Marciano 2,3 , Karen K Hirschi 5 , M Luisa Iruela-Arispe 4 , Thomas J Carroll 3 , and Ondine Cleaver 1 * 1分子生物学系2个细胞生物学系和德克萨斯大学西南医学中心的3号内科,5323 Harry Hines Blvd.4美国西北大学Feinberg医学院的细胞与开发生物学系,美国伊利诺伊州60611,美国;罗伯特·H·卢里(Robert H. Lurie)综合癌症中心,美国伊利诺伊州芝加哥西北大学费恩伯格医学院,美国伊利诺伊州60611。 5弗吉尼亚大学医学院,夏洛茨维尔大学医学院。 罗伯特·伯恩(Robert M. Berne)心血管研究中心,弗吉尼亚大学夏洛茨维尔大学医学院。4美国西北大学Feinberg医学院的细胞与开发生物学系,美国伊利诺伊州60611,美国;罗伯特·H·卢里(Robert H. Lurie)综合癌症中心,美国伊利诺伊州芝加哥西北大学费恩伯格医学院,美国伊利诺伊州60611。5弗吉尼亚大学医学院,夏洛茨维尔大学医学院。罗伯特·伯恩(Robert M. Berne)心血管研究中心,弗吉尼亚大学夏洛茨维尔大学医学院。
对温度波动对全球国内生产总值 (GDP) 影响的计量经济学分析表明,较高的温度对温暖国家有害,对较冷国家有益,并且存在全球“最佳”温度 1 – 3 。然而,总体温度-GDP 关系是跨空间和经济部门的平均值,掩盖了异质性,歪曲了温度变化的成本或收益,并为缓解和适应政策提供了误导性指导。我们以欧洲为重点,使用行政区级的增加值 (GVA) 和 GDP 增长率数据来估计温度对国家、地区和行业层面经济增长的影响。与之前的全球研究不同,在欧洲,我们发现,在相对寒冷地区(年平均气温 0 至 14°C),高于平均水平的年份对 GVA 和 GDP 产生负面影响,而在较温暖地区(高于平均水平 14°C)高于平均水平的年份产生正面影响,而在极端地区(< 0°C 和 > 20°C),情况则相反。在整个欧洲,这种 U 型温度-GDP 增长关系意味着经济增长将发生 -0.14(95% CI:± 0.16)个百分点的变化,而不是 1 中的 +0.16(± 0.14)的收益。使用 RCP4.5(中位数 CMIP6),到 2100 年,年平均增长率将变化 -0.07(± 0.18)至 -1.23(± 0.38)个百分点,具体取决于实证规范。按部门和地区分类,边际温度效应高度不均匀,即使在国家内部也是如此。结果颠覆了正温度冲击有利于较冷地区的说法,指出了由专业化引起的区域脆弱性,并表明局部温度最适值,而不是全球温度最适值。JEL 分类:D31、D61、H43。关键词:经济增长、温度冲击、气候变化、空间异质性、欧洲。
Pallab Barai 1 , Till Fuchs 2,3 , Enrico Trevisanello 2,3 , Hong Keun Kim 1 , Felix H. Richter 2,3 , Jürgen Janek 2,3 , Venkat Srinivasan 1 * 1 Argonne National Laboratory, Lemont, IL, USA 60439 2 Institute of Physical Chemistry, Justus Liebig University Giessen, Heinrich-Buff-Ring 17,35392,德国吉森3材料研究中心(ZFM),Justus-Liebig-University Giessen,Heinrich-Buff-Ring 16,D-35392 Giessen,德国,德国
•如果ml_method ==“ gam”,则可以为z和x的components指定IND_LIN_Z和IND_LIN_X,以线性建模。•如果ml_method ==“ xgboost”,则可以指定max_nrounds,k_cv,ropand_stopping_rounds,vectors eta和max_depth。•如果ml_method ==“ RandomForest”,可以指定num.trees,num_mtry(要尝试的不同mtry值的数字)或向量mtry,vector max.deppth,num_min.node.node.node.size(num_min.node.size)•要指定不同的滋扰功能恢复的不同参数,ml_par应该是列表的列表:ml_par_d_xz(nui-sance函数e [d | z,x]的参数,iv_method“ mliv” mliv“ mliv”和“ mliv_direct”),ml_par_par_d_duis funcorme etu | iv_method“线性”,“ mliv”和“ mliv_direct”),ml_par_f_x(nui-sance函数的参数“ mliv”和“ mliv_direct”),ml_par_z_x(nuisance函数e [z | x]的参数,iv_method“ lineariv”)。a_deterministic_x
2型糖尿病(T2D)是一种异质性疾病,它通过不同的病理生理过程1,2和通常针对细胞3,4型特定的分子机制而发展。在这里,为了表征跨祖先群体对这些过程的遗传贡献,我们汇总了来自2,535,601个个体(39.7%不是欧洲血统)的全基因组关联研究数据,包括428,452例T2D病例。我们识别出1,289个独立的关联信号,该信号在全基因组显着性(p <5×10 -8)上,映射到611个基因座,据我们所知,其中145个基因座先前未报告。我们定义了T2D信号的八个非重叠簇,其特征是心脏代谢性状关联的不同曲线。这些簇在开放染色质的细胞类型特异性区域差异富集,包括胰岛,脂肪细胞,内皮细胞和肠内分泌细胞。我们在另外279,552个不同血统的个体中,包括30,288例T2D病例,并在另外279,552个个体中建立了特定于集群的多基因分数5,并测试了它们与T2D与T2D相关的血管结局的关联。特定于群集的多基因评分与跨祖先组的冠状动脉疾病,外周动脉疾病和终末期糖尿病性肾病有关,强调了与肥胖相关过程在血管癌症发展中的重要性。我们的发现表明,将多功能基因组研究数据与单细胞表观基因组学进行了整合,以解散驱动T2D发展和发展的病因异质性。这可能会提供一条优化全球访问遗传知情糖尿病护理的途径。
图 1 化学异质性诱导裂纹停止作为防止氢脆的措施的概念,以及具有奥氏体内部异质 Mn 分布的高强度钢的微观结构。a,概念示意图。b,电子背散射衍射 (EBSD) 相加图像质量 (IQ) 图,显示奥氏体-铁素体双相微观结构。c,基于扫描电子显微镜 (SEM) 的能量色散 X 射线光谱 (EDX) 图,揭示了微观结构中的整体 Mn 分布模式。化学缓冲区是奥氏体相内 Mn 高度富集 (14~16 at.% Mn) 的区域(其中一些以椭圆框标记)。d,高角度环形暗场扫描透射电子显微镜 (HAADF-STEM) 观察和 EDX 分析,显示在一个奥氏体晶簇甚至一个奥氏体晶粒内存在多个富 Mn 区。分别从标记的圆形和矩形框拍摄的选区电子衍射 (SAED) 和高分辨率 TEM (HR-TEM) 图像放在 STEM 图像的右侧。EDX 线轮廓是从 EDX 图中箭头标记的区域拍摄的。
组成髓样恶性肿瘤的细胞的功能多样性,即遗传和表观遗传异质性在这种多样性中的各自作用,仍然知之甚少。 这个问题在慢性脊髓细胞性白血病(一种髓样肿瘤中)解决,其中临床多样性与遗传异质性有限。 To generate induced pluripotent stem cell clones, we reprogrammed CD34 + cells collected from a patient with a chronic myelomonocytic leukemia in which whole exome sequencing of peripheral blood monocyte DNA had identified 12 gene mutations, including a mutation in KDM6A and two heterozygous muta- tions in TET2 in the founding clone and a secondary KRAS (g12d)变形。 还对来自年龄匹配的健康供体的CD34 +细胞进行了再生。 我们捕获了患者观察到的一部分遗传异质性,即 我们分析了五个具有两个遗传背景的克隆,没有KRAS(G12D)突变。 这些克隆的造血分化概括了患者疾病的主要特征,包括颗粒细胞和染色体症的过量生产。 这些分析还揭示了源自具有相似遗传背景的诱导多能干细胞克隆的造血细胞行为的显着差异,与有限的表观遗传变化相关。 这些分析表明,除了编码突变外,几个水平的隆内异质性可能参与疾病的尚未解释的临床异质性。组成髓样恶性肿瘤的细胞的功能多样性,即遗传和表观遗传异质性在这种多样性中的各自作用,仍然知之甚少。这个问题在慢性脊髓细胞性白血病(一种髓样肿瘤中)解决,其中临床多样性与遗传异质性有限。To generate induced pluripotent stem cell clones, we reprogrammed CD34 + cells collected from a patient with a chronic myelomonocytic leukemia in which whole exome sequencing of peripheral blood monocyte DNA had identified 12 gene mutations, including a mutation in KDM6A and two heterozygous muta- tions in TET2 in the founding clone and a secondary KRAS (g12d)变形。还对来自年龄匹配的健康供体的CD34 +细胞进行了再生。我们捕获了患者观察到的一部分遗传异质性,即我们分析了五个具有两个遗传背景的克隆,没有KRAS(G12D)突变。这些克隆的造血分化概括了患者疾病的主要特征,包括颗粒细胞和染色体症的过量生产。这些分析还揭示了源自具有相似遗传背景的诱导多能干细胞克隆的造血细胞行为的显着差异,与有限的表观遗传变化相关。这些分析表明,除了编码突变外,几个水平的隆内异质性可能参与疾病的尚未解释的临床异质性。
胶质母细胞瘤多形(GBM)是最具侵略性的脑肿瘤形式,5年生存率小于10%。数据支持在肿瘤质量中选择细胞群体(称为脑肿瘤引发细胞(BTICS))是GBM生长的驱动因素。尽管这些细胞的真实起源是有争议的,但从生理上讲,这些细胞具有正常神经干细胞的不成熟特性。将它们高度抵抗药物治疗,放射线并在移植到小鼠中时以高速率形成肿瘤。增加了GBM的复杂性是事实是,并非所有肿瘤都是相同的。大多数患者可以使用现代遗传工具将至少3种不同的GBM“亚型”分组。该项目以令人兴奋的数据为基础,表明在脑发育过程中,在正常的神经干细胞中发现了独特的细胞周期调节剂SPY1(或其他组的RINO),但是它控制了BTIC的扩展。了解GBM异质质量中哪些特定的BTIC种群是由SPY1驱动的,以及这是否取决于亚型,可能代表新颖有效的治疗策略。
自我更新和分化能力的改变是癌症的一个特征,许多肿瘤是由发育不成熟的表型的细胞组成的。在控制细胞命运决定的过程方面研究最为广泛的恶性肿瘤中,急性髓系白血病 (AML) 是一种以存在大量类似于髓系祖细胞的“母细胞”为特征的疾病。传统上,AML 细胞的定义特性被认为是异常的自我更新和分化受阻,而“分化疗法”一词是用来描述促进白血病母细胞成熟的药物。然而,从理论上讲,认为这些药物“解除”分化的简单观点与癌症干细胞 (CSC) 假说相矛盾,该假说认为肿瘤是分层组织的,而支持癌症生长的 CSC 保留了发展到发育更成熟状态的能力。在此,我们将回顾最近的发展,这些发展为稳定状态下和治疗反应中的非遗传异质性提供了前所未有的见解,并为旨在改变癌症细胞命运决定的治疗提出了一个新的概念框架。
