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World File Search System异质性
染色体外DNA（ecDNA）：肿瘤异质性、基因组重塑和耐药性的起源。
癌细胞基因组含有正常细胞中没有的环状染色体外 DNA (ecDNA) 元素。临床样本分析表明，它们在大多数癌症中很常见，它们的存在预示着不良预后。它们通常含有高表达的增强子和驱动致癌基因。环状 ecDNA 拓扑结构导致染色质开放构象并产生新的基因调控相互作用，包括与远端增强子的相互作用。着丝粒的缺失导致细胞分裂过程中 ecDNA 随机分布，并且编码在其上的基因以非孟德尔方式传播。ecDNA 可以整合到染色体 DNA 中和退出。特定 ecDNA 的数量会随着治疗而改变。这种重塑癌症基因组的动态能力挑战了长期存在的基本原理，为肿瘤异质性、癌症基因组重塑和耐药性提供了新的见解。
肿瘤内遗传异质性和克隆进化解读子宫内膜癌进展
通过下一代测序分析不同的肿瘤区域可以评估肿瘤内遗传异质性 (ITGH)，这种现象已在某些肿瘤类型中得到广泛研究，但在子宫内膜癌 (EC) 中的研究较少。在本研究中，我们试图使用全外显子组测序来表征 9 种不同 EC 的空间和时间异质性，并对所分析的 42 个原发性肿瘤区域和 30 个转移性样本进行靶向测序验证。此外，通过比较基因组杂交阵列评估了浆液性癌的拷贝数变异。从通过全外显子组测序鉴定的体细胞突变中，有 532 个通过靶向测序验证。基于这些数据，为每例重建的系统发育树使我们能够确定肿瘤的进化并将其与肿瘤进展、预后和复发性疾病的存在相关联。此外，我们研究了不明确的 EC 的遗传图谱，并使用获得的分子谱来指导为该患者选择潜在的个性化疗法，随后通过患者来源的异种移植模型的临床前测试验证了该疗法。总体而言，我们的研究揭示了分析不同肿瘤区域对解读 EC 中的 ITGH 的影响，这有助于做出最佳治疗决策。
通过结合 T 细胞结合双特异性抗体克服白血病异质性
摘要 背景 白血病约占人类所有癌症的 5%。尽管治疗方法取得了进展，但仍有相当多的患者死于该疾病。尽管进行了强化化疗或靶向治疗，但几种白血病亚型本质上对治疗的抵抗力更强。 方法 在这里，我们描述了基于人源化 IgG 框架使用 IgG(L)-scFv 格式针对急性淋巴细胞白血病 (ALL) 和急性髓细胞白血病 (AML) 上表达的两个靶点生成 T 细胞接合 (CD3) 双特异性抗体 (BsAb)。 结果 每种 BsAb 在体外和异种移植模型中均介导针对 ALL (CD19) 和 AML (CD33) 的强效抗白血病作用。重要的是，CD19 特异性 BsAb (BC250) 对血源性扩散有效，可防止携带 ALL 和伯基特淋巴瘤异种移植的小鼠转移到肝脏和肾脏。根据肿瘤生物发光和小鼠存活率的测量，BC250 比美国食品药品监督管理局 (FDA) 批准的 BsAb blinatumomab 更有效，可对抗体内所有异种移植瘤。此外，在混合表型急性白血病（双表型和双系白血病）的两种异种移植模型中，CD19 和 CD33 BsAb 的组合远优于单独使用任何一种 BsAb 的单一疗法。结论这些白血病特异性 BsAb 的选择性组合提供了在基于抗体的 T 细胞驱动免疫治疗的现代时代克服肿瘤异质性或克隆逃逸的潜力。
上皮性卵巢癌肿瘤微环境内的信号传导：肿瘤异质性的挑战
人们越来越认识到肿瘤微环境（由肿瘤细胞、周围基质细胞和基质元素组成）在促进和维持 EOC 化学耐药性、复发和转移方面的作用 (8-10)。传统上，细胞毒性化疗的目的是作用于 EOC 肿瘤细胞本身，使其死亡 (11)。然而，表征 EOC 化学耐药机制的尝试表明，肿瘤细胞内部（肿瘤细胞内在）以及基质细胞和肿瘤细胞之间的信号传导（肿瘤细胞外在）都存在许多信号传导途径 (6,12,13)。这种焦点转移揭示了 EOC 信号传导中新的复杂层次，这可能是有希望的临床前发现与未能成功转化为有效临床疗法之间令人沮丧的分歧的根本原因。
评论文章细胞可塑性对前列腺肿瘤异质性和治疗反应的影响
摘要：上皮-间质转化 (EMT) 是一种谱系可塑性的动态过程，在此过程中上皮癌细胞获得间质特性，使其能够转移到远处器官。本综述探讨了目前对谱系可塑性和表型重编程如何推动前列腺癌进展至致死阶段、导致治疗耐药性的理解，并强调了在前列腺肿瘤微环境 (TME) 中克服 EMT 表型的策略。新兴证据表明，前列腺肿瘤细胞可以进行谱系转换，在抗雄激素疗法和紫杉烷类化疗后采用替代生长途径。这些适应性机制支持肿瘤存活和生长，强调需要更深入地了解驱动前列腺癌分化的过程，包括神经内分泌分化和谱系可塑性。全面了解这些机制将为创新治疗策略铺平道路。有效靶向具有高可塑性和治疗脆弱性的前列腺癌细胞有望克服治疗耐药性和预防肿瘤复发。这些进步对于开发有效的前列腺癌治疗方法和改善患者生存结果至关重要。
细菌、真菌和癌细胞的耐药性和持久性：非遗传异质性的作用
细菌、真菌和癌细胞群在接受治疗后的一个共同特征是，存在耐受性和持久性细胞，这些细胞能够存活，有时甚至在通常具有抑制或致死浓度的药物存在下也能生长，这是由群体中单个细胞之间的非遗传差异所致。在这里，我们回顾和比较了有关细菌、真菌和癌细胞中药物存活的数据，以揭示共同的特征和细胞途径，并指出它们的独特之处。这种比较工作还允许跨领域思想的相互交流。我们特别关注基因表达变异性在细胞间非遗传异质性出现中的作用，因为它代表了大多数持久性现象起源的可能共同的基本分子过程，并且可以进行监测和调整以帮助改善治疗干预。
记忆诊所环境中萎缩异质性和进展的可推广数据驱动模型
记忆诊所患者是代表各种病理衰老的各种病因的异质种群。尚不清楚如先前在阿尔茨海默氏病患者中所描述的那样，在这组老年人中，脑萎缩的时空进展模式是否普遍且具有临床意义。为了揭示不同的萎缩亚型，我们将亚型和阶段推理（持续）算法应用于来自Delcode队列的813名参与者（平均值±标准偏差，年龄= 70.67±6.07岁，女性，52％女性）的基线结构MRI数据（平均值±标准偏差）。参与者的认知能力下降（n = 342），轻度认知障碍（n = 118）或阿尔茨海默氏症类型的痴呆症（n = 68）的认知认知下降（n = 342），轻度认知障碍（n = 118）或痴呆症（n = 68）。萎缩亚型。PACC-5在长达240周内进行了PACC-5轨迹。测试基线萎缩亚型和阶段是否在明显的认知障碍前预测了临床trajec por，我们分析了PACC-5轨迹和轻度认知障碍者的认知障碍参与者和主观认知能力下降的人。边缘 - 优势和海马育萎缩亚型。边缘 - 主导萎缩造成了内侧颞叶的影响，其次是进一步的颞区，最后是其余的皮质区域。海马比萎缩最初发生在基线时，该亚型与年龄更大，阿尔茨海默氏病生物标志物水平，APOE ϵ4 Carrihersip和宽松的认知障碍有关。
通过肺癌患者的生存预测的定量病理特征来表征肿瘤异质性
参考文献1。Presti，Daniele等。“肿瘤浸润淋巴细胞（TILS）是对实体瘤中检查点阻滞剂反应的预测生物标志物：系统评价。”肿瘤学/血液学的批判性评论177（2022）：103773。2。Kashyap，A.，Rapsomaniki等，2022。肿瘤异质性的定量：从数据获取到度量期产生。生物技术的趋势。3。Reinhard，E。等。，2001。图像之间的颜色传递。IEEE计算机图形和应用程序，21（5），pp.34-41。 4。 van der Walt，S。等，2014。Scikit-image：Python中的图像处理。 Peerj，2，P.E453。 5。 van Griethuysen等，2017。 计算放射系统以解码放射线型表型。 癌症研究，77（21），第E104-E107。 6。 Thibault，G。等，2013。 形状和纹理将应用于细胞核分类。 国际模式识别与人工智能杂志，27（01），第1357002页。 7。 Young，I.T。等，1986。 表征细胞核中染色质分布。 细胞仪：国际分析细胞学学会杂志，第7（5）页，第467-474页。 8。 Wu，P.H。等，2020。 单细胞形态编码转移性潜力。 Science Advances，6（4），P.EAAW6938。 9。 Gough，A.H。等，2014。 PLOS ONE，9（7），P.E102678。 10。 Gough，A。等，2017。IEEE计算机图形和应用程序，21（5），pp.34-41。4。van der Walt，S。等，2014。Scikit-image：Python中的图像处理。Peerj，2，P.E453。5。van Griethuysen等，2017。计算放射系统以解码放射线型表型。癌症研究，77（21），第E104-E107。6。Thibault，G。等，2013。形状和纹理将应用于细胞核分类。国际模式识别与人工智能杂志，27（01），第1357002页。7。Young，I.T。等，1986。表征细胞核中染色质分布。细胞仪：国际分析细胞学学会杂志，第7（5）页，第467-474页。8。Wu，P.H。等，2020。单细胞形态编码转移性潜力。Science Advances，6（4），P.EAAW6938。9。Gough，A.H。等，2014。PLOS ONE，9（7），P.E102678。10。Gough，A。等，2017。在高含量分析中识别和量化异质性：异质性指数在药物发现中的应用。生物学相关的异质性：指标和实用见解。SLAS发现：前进生活科学研发，22（3），第213-237页。
草地垂直高度异质性预测花朵和蜜蜂的多样性：无人机摄影方法
图1：这项研究的主要期望的图形摘要。基层生态系统（通过UAV pho-to-to-to-to-to to-to grammetric图像评估）具有复杂的垂直结构（从上图中的侧面和下部图中从上方看）和高环境异质性，预计将具有高的花朵多样性和高度的多样性和丰富性和丰富性（左图）。另一方面，HH低的草地地区可能具有较低的花朵多样性，蜜蜂的多样性和丰度（右图）。
量化肿瘤内异质性和免疫结构，由空间定量系统药理学模型
简单摘要：我们引入了一种新颖的方法，以定量验证一种称为“空间定量系统药理学（SPQSP））的混合时空方法的性能。该平台由一个描述肿瘤生长动力学，抗肿瘤免疫反应和免疫检查点治疗的隔室QSP模型组成，该模型在全患者和基于空间剂的模型中，描述了肿瘤以模拟抗PD-1治疗（免疫检查点抑制剂）对模拟内部内部肿瘤内的肿瘤的作用。从计算数字病理学中采用的四个空间指标以及癌细胞与免疫细胞的比率被用来将肿瘤微环境分为“冷”，“混合”和“分隔”模式，这与治疗的效率有关。本研究比较了肿瘤内异质性描述指标的能力，促进了对特定癌症类型的未来全面和有形研究，作为单药或联合疗法的不同疗法以及免疫病理学多路复用样本。使用数值模拟对肿瘤内异质性有更好的定量理解可以帮助设计更有效的治疗方法。