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World File Search System形态发生
在胚胎青蛙脑中形态发生的生物发电期间的信息整合
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是此预印本版本的版权持有人，该版本发布于2023年2月10日。 https://doi.org/10.1101/2023.02.09.527696 doi：Biorxiv Preprint
鲨鱼启发的牙齿形态发生的通用模型揭示了表型过渡中的发育不对称
源于遗传和生物力学因素之间的动态相互作用所产生的发展复杂性，使基因型和表型在进化中的变化方式变化。作为范式系统，我们探讨了发育因素的变化如何产生典型的牙齿形状过渡。由于牙齿发育主要是在哺乳动物中研究的，因此我们通过研究鲨鱼中牙齿多样性的发展为更广泛的理解做出了贡献。为此，我们建立了一个通用但现实的，数学的数学模型。我们表明，它重现了牙齿发育的关键特征，以及小斑点catsharks scyliorhinus canicula的真实牙齿形状变化。我们通过与体内实验进行比较来验证我们的模型。引人注目的是，我们观察到牙齿形状之间的发育过渡往往是高度退化的，即使对于复杂的表型也是如此。我们还发现，参与牙齿形状转变的发育参数集往往不对称地取决于该过渡的方向。一起，我们的发现为我们对发展变化如何导致自适应表型变化和特质在复杂的，表型高度多样化的结构中的理解提供了宝贵的基础。
Wnt11 作用于皮肌节细胞，引导轴上肌节形态发生
摘要 背部轴肌或称背轴肌是覆盖脊髓和椎骨以及活动脊椎动物躯干的基本结构。迄今为止，形成背轴肌节的形态发生过程的潜在机制尚不清楚。为了解决这个问题，我们使用了青鳉 zic1/zic4 增强子突变体双臀鳍 ( Da )，它表现出腹侧化的背部躯干结构，导致背轴肌节形态受损和神经管覆盖不完全。在野生型中，背部皮肌节 (DM) 细胞在体节发生后降低其增殖活性。随后，一部分未分化为肌节群的 DM 细胞开始形成独特的大突起，向背部延伸以引导背轴肌节向背部运动。相反，在 Da 中，DM 细胞保持高增殖活性并主要形成小突起。通过结合 RNA 和 ChIP 测序分析，我们揭示了 Zic1 的直接靶标，这些靶标在背部体节中特异性表达，并参与发育的各个方面，例如细胞迁移、细胞外基质组织和细胞间通讯。其中，我们确定 wnt11 是调节 DM 细胞增殖和前伸活动的关键因子。我们提出，背侧肌节的背部延伸由非成肌性 DM 细胞亚群引导，并且 wnt11 使 DM 细胞能够驱动背侧肌节覆盖神经管。
迈克尔·莱文（Michael Levin）作品内容的TGD视图
3形态发生的TGD视图12 3.1可能基于TGD的形态发生视图。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 12 3.2膜电位和间隙连接连接如何定义形态遗传程序？ 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 13 3.2.1事实。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 13 3.2.2与目标电动编码有关的问题。 。 。 。3形态发生的TGD视图12 3.1可能基于TGD的形态发生视图。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。12 3.2膜电位和间隙连接连接如何定义形态遗传程序？。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。13 3.2.1事实。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。13 3.2.2与目标电动编码有关的问题。。。。。。。。。。。。。。13 3.3如何产生潜在的梯度？。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。14 3.4 MB的状态如何充当进化模板？。。。。。。。。。。。15 3.4.1平面分裂会发生什么？。。。。。。。。。。。。。。。。16 3.5一些问题。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。16
星形胶质细胞HMGB1调节出生后星形胶质细胞形态发生和脑血管成熟
1神经科学计划，渥太华医院研究所，加拿大安大略省奥塔瓦2免疫学，渥太华大学，渥太华大学，安大略省，加拿大安大略省6个数字技术，加拿大国家研究委员会，渥太华，安大略省，加拿大安大略省7号医学科学司7，不列颠哥伦比亚省维多利亚大学，加拿大维多利亚大学8神经科学系8，神经科学系，加拿大卡尔顿大学，加拿大9诺，萨尔群岛，萨尔群岛。巴西圣保罗10耶鲁大学医学院，部门病理学，美国纽约州纽黑文病理学，美国纽约州纽黑文
在锂提取中精确离子筛分的聚酰胺膜互层的纳米形态发生
纳米过滤（NF）提供了一种可扩展且节能的方法，用于从盐湖中提取锂。然而，由于其水合离子半径的紧密相似性，锂与镁的选择性分离，尤其是在镁浓度高的盐水中，仍然是一个重大挑战。有限的LI + / mg 2 +当前NF膜的选择性主要归因于对孔径和表面电荷的控制不足。在这项研究中，我们报告了结合功能化的磺化carge胶以调节界面聚合过程的层间薄膜复合材料（ITFC）膜的发展。该集成的层间在控制胺基单体的扩散和空间分布中起着至关重要的作用，从而导致形成致密的纳米条纹聚酰胺网络。与常规的TFC膜相比，这些结构改进，包括精致的孔径和减少负电荷可显着提高LI + /Mg 2 +选择性（133.5）和渗透率增加2.5倍。此外，纳米条纹结构优化了膜过滤区域，同时最大程度地降低了离子传输抗性，从而有效克服了离子选择性和渗透性之间的传统权衡。这项研究强调了ITFC膜在达到高锂纯度和恢复的潜力，为大规模从盐水中提取大规模锂的途径有前途的途径。
移动性集线器和面向运输的开发（TOD）
我的研究1。建筑师（时髦移民朋克），运输爱好者和公共交通/TOD老师（#StockHolmschooloFtransit）2。城市形式对旅行的影响3。迁移1和运输形态发生（技术胚胎，社会技术系统，迁移率培养和形态发生过程）4。Urban（RE）可持续移动性/碳中立性/能源效率的设计
组织形态发生中的机制调节反馈回路：由机械应力调节的基因和顺式调节元件的功能分析
抽象的胃结构是胚胎发育的关键过程，是形成三线蛋白圆盘所必需的。这是囊泡细胞的分化和重新分布，形成三个胚胎层，这些胚胎将产生不同的功能组织（外胚层，中胚层和内胚层）。这种重组是通过涉及整个胚胎的特定细胞组的高度协调运动而发生的。Telest Medaka（Oryzias latipes）被选为实验动物模型。在该物种中，胃结构与Epibolia工艺同时发生。在此期间，细胞从动物极向植物极迁移，导致胚胎轴的形成，这是建立脊椎动物身体计划的基础。对表皮过程中发生的形态发生过程知之甚少。但是，与YAP家族成员一样，已经描述了某些要素的重要性。这些蛋白质是转录调节剂，从培养基接收信号和机械刺激，并将它们与遗传信号整合在一起。这是细胞正确迁移到胚胎中线的必要条件。如果这些信号受到放松管制，则可能无法正确发展胃，甚至可能会产生致命的影响。要更多地了解YAP在胃肠道中的作用，我们将研究YAP下游基因的参与（AFAP12，AKAP12B，EFS，EFS，GLIS2B，MARCKSL1A/B，ROCK2B，Synaptopodin和ved），在cytoskelet cytoskelectal重新组织中与细胞粘附和互动的互动过程中。为此，CRISPR-CAS9系统用于生成每个基因的敲除突变体。这种基因组编辑机制是一种根据细菌和古细菌的天然适应性免疫防御系统而适应的工具。该工具由两个组成部分组成：SGRNA，与基因组的靶序列相匹配的短片段和Cas9核酸内切酶，它们在同一位置引起双链DNA断裂。之后，细胞修复DNA的影响区域，导致基因组中的永久修饰。要执行数据分析，我们使用Stata统计软件。初步数据显示了AFAP12，MARCKSL1，VED和ROCK2B的研究中的特殊结果。在这些情况下，控制和敲除之间的表观进展似乎有所不同。
1 验证关键生物能源基因功能的途径...
事件摘要确定基因功能是主要生物能源作物高粱 (L.) Moench 的一个重要目标，特别是与其显著的非生物胁迫耐受性相关的基因。然而，对与这些性状相关的基因的详细分子理解有限。我们对高粱进行的深入转录组研究表明了这一点，研究表明其近 50% 的转录组尚未注释。在本报告中，我们描述了转化高粱所需的全套工具，以便验证和注释基因。我们首先努力修改一种转化方法，该方法使用形态发生基因 Baby Boom 和 Wuschel2（胚珠发育蛋白 2）来加快转化速度并扩大适宜的基因型。根据我们的经验，转化不含形态发生基因的 RTx430 需要约 18 到 21 周，而使用含有形态发生基因的方法生成 T 0 植物则需要约 10 到 12 周。利用形态发生基因还可以转化几种以前未转化或历史上难以转化的高粱基因型，即快速循环 SC187、保绿 BTx642、BTx623 和甜高粱 Ramada。为了通过工程验证候选基因，同时引入形态发生基因，开发了一种称为利他转化的共转化策略。为了完成对目标基因（八氢番茄红素去饱和酶）的编辑，我们创建了新的构建体，其中也包括形态发生基因。为了能够全面表征转化植物，我们采用了技术来确定高通量水平的拷贝数和事件的独立性。通过这些努力，我们创建了一条从农杆菌感染到高通量分子基因分型的完整途径，可用于确定基因功能并加快这种广泛种植的生物能源作物植物的基础遗传研究。
动态组织中的形态学模式
胚胎发生会整合形态发生 - 协调的细胞运动 - 具有形态学模式和细胞差异。虽然在很大程度上进行了独立研究，但形态发生和模式通常在早期胚胎中同时展开。然而，由于大多数模式形成模型都假设静态组织，细胞运动的影响仍不清楚。我们通过在动态组织中开发一个数学框架来解决这一差距，从而重新设计了细胞参考框架中的对流反应扩散模型，这是信号解释和命运决策最自然的。该框架（i）阐明了形态发生如何介导形态的传输和分隔：多细胞吸引力增强了细胞 - 细胞扩散转运，而驱虫剂则充当障碍，影响细胞命运诱导和分支。（ii）它正式化了动态组织中的细胞 - 细胞信号传导范围，解除形态发生运动并识别哪些细胞可以传达。（iii）它提供了两个非二维数字（通常与p的数字不同），以评估形态上的何时何地与构图相关。（iv）它阐明了细胞密度动力学在图案中的生成作用。我们将此框架应用于经典的图案模型，形态发生基序和鸟类胃胃数据。广义，我们的工作提供了一种定量的观点，可以使自然和合成胚胎中的动态组织合理化。