2019年3月8日,刊登了计算机科学和数学博士学位(课程数学),并带有Europaeus博士。博士学位(MAT/08 NOW NOW MATH-05/A)用于研究低秩分解模型,优化算法及其应用。主管:Nicoletta del Buono教授。论文标题:从生物医学和其他现实世界数据中提取知识的非负矩阵因素化。2015年7月16日,具有完整分数和荣誉的数学硕士学位。来自意大利巴里·阿尔多·莫罗大学的学位。 数值分析中的论文标题为“ Analisi di微阵列Tramite la fattorizzazione non Negativa”。 2012年12月14日数学学士学位。 来自意大利巴里·阿尔多·莫罗大学(Bari Aldo Moro)的学位。 在数值分析中的论文标题为:“ di equazioni lineari a tratti per le reti di geni”。来自意大利巴里·阿尔多·莫罗大学的学位。数值分析中的论文标题为“ Analisi di微阵列Tramite la fattorizzazione non Negativa”。2012年12月14日数学学士学位。来自意大利巴里·阿尔多·莫罗大学(Bari Aldo Moro)的学位。在数值分析中的论文标题为:“ di equazioni lineari a tratti per le reti di geni”。
arr(X,Y)x1,(1-22)x2 全基因组染色体 SNP 微阵列 (Reveal) 分析正常。根据下文所述的本报告标准,在 277 万个区域特异性 SNP 和结构靶标中未检测到显著的 DNA 拷贝数变化或拷贝中性区域。当发现新的临床重要基因时,可以根据要求重新检查档案记录。方法:使用 Cytoscan ® HD Accel 平台进行 SNP 微阵列分析,该平台使用 2,029,441 个非多态性拷贝数探针和 743,130 个 SNP 探针进行 LOH/AOH 分析和关系评估。该阵列的平均基因内间距为 0.818 kb,平均基因间距为 1.51 kb。从提供的样本类型中提取总基因组 DNA,用 Xce1 消化,然后连接到 Xce1 接头。纯化并定量 PCR 产物。将纯化的 DNA 破碎,用生物素标记,并与 Cytoscan ® HD Accel 基因芯片杂交。使用染色体分析套件分析数据。分析基于 GRCh37/hg19 组装。此测试由 LabCorp 开发并确定其性能特征。它尚未获得食品和药物管理局的批准或认可。阳性评价标准包括:* DNA 拷贝数损失 >200 kb 或在具有至少一个 OMIM 基因的已知临床重要区域之外增加 >500 kb。* DNA 拷贝数增加/损失在或包括已知 25 kb 或更大的临床重要基因内。* 如果患者结果显示单个染色体中存在 >20 Mb 间质或 >10 Mb 端粒的长连续纯合区域(印迹染色体分别为 15 和 8 Mb),则建议进行 UPD 测试。 * 如果一个区域的连续纯合性大于 8 Mb,但低于 UPD 报告标准,则报告为隐性疾病风险增加。 * 多条染色体内连续纯合性大于 8 Mb 表明存在共同祖先。这些区域具有潜在的隐性等位基因风险。 * 由于存在大量连续的短片段(与地理或社会有限的基因库相关),报告在第 99 个百分位处存在高水平的等位基因纯合性。 SNP 染色体微阵列无法检测: * 真正平衡的染色体变异 * 序列变异
初步筛查后,对胎儿遗传疾病风险较高的孕妇,可以进行绒毛膜绒毛取样或羊膜穿刺术;然而,这两项检测都属于侵入性检查,大约每 455 到 900 例孕妇中就有 1 例存在流产风险 (1)。虽然非整倍体的检测最初依靠核型分析,但染色体微阵列分析的发展提高了分辨率,增加了产前检测的疾病数量 (2)。直接比较,在超声检查发现胎儿异常的情况下,染色体微阵列分析的诊断率比核型分析高出 6% (3)。自 2011 年以来,无细胞 DNA 筛查已实现商业化,减少了诊断程序的使用。母体血液中高达 10% 的循环 DNA 来自胎儿胎盘,无细胞 DNA 筛查利用这些 DNA 来扩增和分析目标序列 (4)。然而,专业协会警告称,无细胞 DNA 筛查仍然是一种筛查工具,不应取代确认性诊断检测 (5)。随着基因组测序的出现,我们在子宫内检测疾病的能力在速度和灵敏度上都有所提高 (4,6)。然而,由于假阳性结果、诊断率低、成本高以及检测出意义不明的变异 (7),在临床实践中,如果没有事先筛查或临床发现的具体指征,不鼓励进行全外显子组测序。
摘要。背景:与cast割的前列腺癌(CRPC)相关的死亡正在全球增加。因此,澄清激素相关肿瘤进展的机制和对抗雄激素药物的抗性对于制定适当治疗CRPC的策略是有用的。Galectin-3已显示通过调节肿瘤增殖,血管生成和凋亡,与多种癌症类型的肿瘤进展相关。材料和方法:我们使用XCelligence系统检查了肿瘤细胞的侵袭和迁移。对照LNCAP和半表达LNCAP(LNCAP-GAL-3)细胞用5%的木炭剥离血清培养雄激素耗尽的培养基。细胞单独使用或没有二氢睾丸激素或与MDV3100和Bicalutamide结合处理24小时;然后通过微阵列分析分析基因谱,并通过定量实时聚合酶链反应(QRT-PCR)确认mRNA表达。我们在小鼠模型中使用球体和异种移植肿瘤生长评估了肿瘤的生长。结果:与对照LNCAP细胞相比,在体外,LNCAP-GAL-3细胞以雄激素独立的方式促进了细胞迁移和侵袭。Galectin-3还增强了与锚定的生长和异种移植肿瘤的生长,即使在cast割后也可以增强。重要的是,Galectin-3大大增强了雄激素受体(AR)的转录活性,尤其是在用二氢睾丸激素治疗时。在微阵列和QRT-PCR分析中,Galectin-3增加了
基因组学分类,原核基因组的结构和组织。细菌基因的转录调节剂。细菌基因组中的可转座遗传元素。细菌操纵子和操纵片化的演变。岛屿和致病性和抗性的片段。真核基因组的结构和组织。重复和转座元素及其对基因组的影响。染色体中的端粒和亚电体区域。CpG甲基化和基因沉默。 酵母 - 两种杂交系统。 cDNA微阵列。 线粒体基因组的进化和结构。 基因组测序:整个shot弹枪基因组测序。 测序技术:Sanger毛细血管测序,Roche 454(焦磷酸测序),Illumina/Solexa,固体系统。 测序技术的优缺点。 Maxam-Gilbert测序。 ORF和启动子预测。 内含子和外显子预测。 基因注释。 主要基因组数据库。CpG甲基化和基因沉默。酵母 - 两种杂交系统。cDNA微阵列。线粒体基因组的进化和结构。基因组测序:整个shot弹枪基因组测序。测序技术:Sanger毛细血管测序,Roche 454(焦磷酸测序),Illumina/Solexa,固体系统。测序技术的优缺点。Maxam-Gilbert测序。ORF和启动子预测。 内含子和外显子预测。 基因注释。 主要基因组数据库。ORF和启动子预测。内含子和外显子预测。基因注释。主要基因组数据库。
一种通用的实验室方法,涉及将数千到数百万个已知核酸片段阵列结合到固体表面,称为“芯片”。然后将从研究样本(如细胞或组织)中分离的 DNA 或 RNA 浸泡在芯片上。样本和芯片固定片段之间的互补碱基配对通过荧光产生光,可以使用专门的机器进行检测。微阵列技术可用于研究和临床研究中的多种目的,例如测量基因表达和检测特定 DNA 序列(例如单核苷酸多态性)。
利用其高通量测序实验室,高级微阵列设施和新的最先进的细胞加工实验室,该小组致力于改善获得最新的精确和个性化医疗保健解决方案的机会,以改善患者的生活。有关更多信息,请访问www.mgrc.com.my.发行者:天鹅咨询公司SDN。bhd。代表马来西亚基因组学资源中心Berhad日期:2023年2月22日有关更多信息,请联系:jazzmin wan电话:+60 17-289 4110电子邮件:j.wan@swanconsultancy.biz amida baharim电话:
此快速参考指南旨在适用于经验丰富的用户,这些用户已经熟悉处理16件包幻灯片上的Angilent HT微阵列,以进行比较基因组杂交(CGH)。如果您是新用户,请参阅出版物G4132-90000,使用Agilent HT Microars-azymatic-emzymatic标记GDNA的高通量ACGH分析,该标记使用SERETAG HT KIT协议,这是该快速参考指南的全长版本。全长协议包括其他说明和详细信息,以及程序注释,套件内容的信息,所需的材料和设备以及故障排除提示。
描述分子生物学对于生物医学和自然科学的许多领域至关重要,包括遗传学,免疫学,细胞生物学,生物化学和取证。通过对不同生物体的比较研究,该主题将解释DNA和RNA研究中的基本概念和方法,从而扩展到分子生物学在更高级领域(例如基因组学)中的应用。受试者将包括DNA复制;基因表达的转录,转录后和表观遗传调节;微阵列和生物信息学简介。实践工作将提供熟悉分子生物学方法的机会,并着重于解决问题和分析技能的发展。可能需要学生前往另一个校园来接受这一主题。
在波士顿大学(BU)攻读生物医学工程博士学位时,她的研究重点是开发高度敏感和多重的过敏诊断平台。她设计了分层的底物设计,以校准和增强微阵列中的荧光信号,开发了基于蛋白质的光学生物传感器,以在复杂的生物流体中运行,LED并撰写了成功的赠款应用,并与BU技术开发办公室紧密合作。Margo还拥有材料科学,工程和音乐表演的学士学位。在大学期间,Margo致力于改善医疗设备的表面生物相容性。