XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System操纵子
噬菌体 x 右侧操纵子的核苷序列
限制性片段。为了制备微克量的 Hin 375、Hin 550 和 Hae 790（见图 1），将含有示踪量 lambda [32p]_ DNA（2 X 106 cpm）的 5 mg 纯化 lambda DNA 用 Hin（7）或 Hae（6）消化，乙醇沉淀，重悬于 500 ul DNA 缓冲液（5 mM NaCi、10 mM Tris-HCl，pH 7.4、1 mM EDTA）中，在含有 TBE（1）缓冲液的 3.5% 聚丙烯酰胺凝胶（6 mm X 20 cm X 40 cm）上以 320 V 电泳 23 小时。通过放射自显影定位含有适当限制性片段的凝胶部分，切除，并通过苯酚提取去除 DNA（10）。如前所述，从含有 32P 的 DNA 中分离出高比活度标记的限制性片段（2）。通过聚丙烯酰胺凝胶电泳确定每个片段的链长（1、2）。
长度16S- ITS-23S rRNA操纵子序列
收到2024年2月2日； 2024年5月7日接受；于2024年6月7日发布：1 Doherty应用微生物基因组学，微生物学和免疫学系，墨尔本大学Peter Doherty感染与免疫学研究所，792 Elizabeth Street，Melbourne VIC 3000，澳大利亚澳大利亚墨尔本街792号； 2爱尔兰科克摩尔帕克的Teagasc食品研究中心； 3爱尔兰科克大学科克大学科克大学科克大学的APC微生物组和微生物学院； 4 Vistamilk SFI研究中心，爱尔兰科克Teagasc Moorepark。*信件：John G. Kenny，John。Kenny@teagasc。IE关键字：Amplicons;数据库;长阅读测序；微生物组；纳米孔； rRNA。缩写：COV，变异系数； ESV，精确的序列变体； Grond，基因组衍生的核糖体操纵子数据库； GTDB，基因组分类数据库； IQR，四分位数范围；它的内部转录垫片； NR，非冗余； ONT，牛津纳米孔技术； RRN，16S-ITS-23S rRNA操纵子； rRNA，核糖体RNA； SD，标准偏差； Taxlca，集群中所有序列的最低祖先； Taxmaj，最低的分类学等级，其中所有序列中的所有序列都具有简单的多数协议； Taxrep，集群代表序列的源基因组分类学； UMIS，唯一的分子标识符。数据语句：文章或通过补充数据文件中提供了所有支持数据，代码和协议。本文的在线版本可以使用两个补充表。001255©2024作者
评估16S-ITS-23S操纵子测序的效率
使用0.01％的相对丰度截止的应用导致大多数物种级分类方法的提高F1得分（图。3a.i）。值得注意的是，在ATCC模拟社区的情况下，四种MM方法中的三种，MM_Fangorn-G，MM_Fangorn-R和MM_MIRROR在ONT和PACBIO数据集中均显示出大幅度的F1分数。但是，对于MCAP和MCGD社区，仅在ONT数据集中观察到这一显着增加。专门应用于PACBIO数据的QB方法在ATCC社区的所有五个相对丰度截止值中保持了一致的F1分数。但是，对于MCAP和MCGD社区的相同方法最初在NO（0％）和0.001％的截止值下表现出一致的F1分数，随后逐渐下降了0.001％的临界值。通常，在三个模拟社区中，相对丰度截止的实施没有
原核生物和病毒中的抗crispr操纵子的数据库
1美国北卡罗来纳州北卡罗来纳州Chapel山的遗传学系，内布拉斯加州大学食品科学与技术系Nebraska Food Food Center，NEBRASKA大学 - 林肯大学，美国东北68588，美国林肯市，美国北卡罗来纳州北卡罗来纳州北卡罗来纳州北卡罗来纳州北卡罗来纳州北卡罗来纳州北卡罗来纳州林肯市林肯市。伊斯兰堡，巴基斯坦，5计算机科学系，国立计算机和新兴科学大学（NUCES），伊斯兰堡，巴基斯坦，6，6感染与免疫计划，生物医学发现研究所和莫纳什大学微生物学系，澳大利亚3800，VIC 3800，VIC 3800，VIC 3800，澳大利亚7学院考文垂，英国1美国北卡罗来纳州北卡罗来纳州Chapel山的遗传学系，内布拉斯加州大学食品科学与技术系Nebraska Food Food Center，NEBRASKA大学 - 林肯大学，美国东北68588，美国林肯市，美国北卡罗来纳州北卡罗来纳州北卡罗来纳州北卡罗来纳州北卡罗来纳州北卡罗来纳州北卡罗来纳州林肯市林肯市。伊斯兰堡，巴基斯坦，5计算机科学系，国立计算机和新兴科学大学（NUCES），伊斯兰堡，巴基斯坦，6，6感染与免疫计划，生物医学发现研究所和莫纳什大学微生物学系，澳大利亚3800，VIC 3800，VIC 3800，VIC 3800，澳大利亚7学院考文垂，英国