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World File Search System沉积物
粪便脂质标记与古代沉积物 DNA 相结合，可作为从土壤和沉积物中追踪过去畜牧业的工具
当考古材料缺失时，重建过去的环境可能具有挑战性。研究有机分子是克服这一缺点的一种方法，这些分子在环境中以痕迹的形式存在了数千年。粪便脂质标记物（类固醇和胆汁酸）和古代沉积物 DNA 提供了一种互补和交叉验证的分析工具，可以拓宽环境考古学中使用的方法范围。然而，人们对结合这两种方法的好处知之甚少。我们简要概述了目前对粪便脂质标记物和古代沉积物 DNA 的了解状况。我们确定了科学和方法上的差距，并提出了它们对更好地理解过去动态的人与动物关系的潜在相关性。通过这篇评论，我们旨在促进新的研究途径，既在既定学科中，也结合迄今为止很少结合的分析方法。
同时介绍单克隆免疫球蛋白沉积物和轻链近端微型肾小球病：案例报告和文献综述
与单克隆免疫球蛋白沉积物（PGNMID）和轻链近端微调（LCPT）同时出现增生性肾小球肾炎，提出了独特的诊断和治疗性挑战。pGNMID的特征是肾小球中的单克隆免疫球蛋白沉积，导致增殖性肾小球病理学，而LCPT涉及近端管细胞中的单克隆轻链沉积，从而导致微管区损伤。这两种疾病均在肾脏意义的单克隆性伽马病（MGRS）下分类，但它们在单个患者中的共存极为罕见。此病例报告详细介绍了肾病综合征和肾功能不全的患者的介绍，肾脏活检均显示PGNMID和LCPT。用硼替佐米，环磷酰胺和地塞米松治疗可实现临床缓解和明显的肾功能恢复。此病例强调了肾脏活检在诊断中的关键作用，尤其是在没有可检测的单克隆蛋白的情况下，并证明了靶向治疗在管理这种复杂的肾脏病理方面的功效。这些发现有助于更好地理解MGR，并可能指导类似情况的未来治疗策略。
乌干达基里尼亚西部湿地沉积物-水界面营养物动态及吸收/再动员
一维 HEC-RAS 在复杂河网中的洪水演算非稳定流中被广泛使用和熟知（Baldassarre 和 Montanari，2009），并且还有一个好处，就是它可以在互联网上免费获取。SOBEK-RURAL 在流体动力学计算中使用完整的圣维南方程，是一种在水力洪水演算中执行 1D 和 2D 非稳定流分析的有效软件（Deltares，2010）。此外，Deltares 免费为本研究工作提供 SOBEK-RURAL，即使它不是免费提供的。由于这些原因，1D HEC-RAS 和 1D2D SOBEK-RURAL 用于本研究工作，但是有许多可用的水力和水文建模软件程序。
从印度洋中脊北部深海沉积物中分离出的革兰氏阳性发酵细菌对钒酸盐的还原作用
钒的氧化状态决定了它的迁移率和毒性，已有报道称多种微生物存在异化钒酸盐还原反应，突出了该途径在钒污染修复和生物地球化学循环中的潜在意义。然而，到目前为止，已知的大多数能够还原钒酸盐的微生物都是属于变形菌门的革兰氏阴性呼吸道细菌。在本研究中，我们从北部中印度洋脊的深海沉积物中分离出一株嗜热杆菌 VROV1 菌株，并研究了其还原钒的能力以及钒酸盐对其细胞代谢的影响。一系列培养实验表明，分离的菌株在发酵过程中能有效地将 V(V) 还原为 V(IV)，即使在 mM 水平上也是如此，而且这种还原涉及直接的生物过程，而不是通过代谢产物的间接还原。钒影响微生物的碳和氮代谢。值得注意的是，在钒酸盐存在的情况下，丙氨酸产量会减少，这表明代谢通量从转氨反应转向钒酸盐还原。T. mesophilus VROV1 是继 Lactococcus raffinolactis 之后第二种被鉴定为能还原钒的革兰氏阳性细菌，但这些细菌属于不同的类别：T. mesophilus 被归类为梭菌，而 L. raffinolactis 被归类为芽孢杆菌。VROV1 去除钒酸盐的特定速率高达 2.8 pmol/细胞/天，与金属还原细菌相当，明显超过 L. raffinolactis。我们的研究结果扩大了细菌领域内钒酸盐还原生物的分布。鉴于 T .嗜温杆菌及其近亲，我们推测发酵钒酸还原对钒的全球生物地球化学循环的影响可能比以前认为的更大。
古老的DNA保存在热带湖沉积物的鱼类化石中
fi g u r e 3在映射的分类法分配的鱼类化石的绘图读物中损坏。（a）胞质脱氨基的事后损害沿映射的测序读数不均匀地分布。在参考为c的读取中t的组合分数和a引用为g的a在映射的读取中的位置绘制了从3'端计数或5'端计数。由于这种化学改变在单链的悬垂中尤为普遍，因此明显的c> t和g>的相对丰度在读取末端的变化表明了真实的古代DNA。连接每个图的左右部分的虚线仅用于说明目的。（b）单个样品中单链悬垂（δs）中脱氨基的细胞固体的比例，以及在陆地环境下24°C环境温度在24°C环境温度下按样品年龄的预期δs模型。（c）读取针对其各自的核参考基因组的分类学样本映射的长度分布。超过最大读取长度的插入物中的人工峰通过忽略最后3 bp箱中的计数而省略了。读取长度很短，而对于aDNA也是如此。面板B中的传说适用于所有面板。ci，置信区间； nt，核苷酸。
寡头海洋沉积物中的氧化潜力
抽象平台公司使用算法管理技术来控制其用户。尽管数字市场在使用这些技术方面有所不同，但很少有研究问为什么。这个问题在理论上是结果。经济社会学在特定的侧重于市场参与者的嵌入式活动，以解释市场中的竞争和估值动态。但是，限制性平台几乎无法给市场参与者留下任何自主权。因此，分析关注对其相互作用是否有意义取决于平台的限制程度，将问题转变为一阶分析问题。本文认为，我们可以解释为什么平台通过专注于为他们的构建的设计逻辑而采用越来越限制的架构。平台将市场视为将软件计算与人类互动相结合的搜索算法。如果该算法要求参与者遵循狭窄的行为脚本，则该平台应变得更加限制。这取决于对集中计算的需求，可以标准化所需的输入的程度以及用户之间的兴趣不一致。本文讨论了如何动员这些标准以解释四种说明性案例的架构。
孢粉学和沉积物 DNA 分析，了解
马达加斯加岛过去一千年的景观和人口 科学背景 马达加斯加距离东非仅 200 公里，是亚洲南岛人种和非洲班图人种的独特交汇地。这些群体带来了农业实践、植物、家畜和各种文化表现形式，至今仍留下了这种融合的明显痕迹。 Madeogen 项目旨在重建这些殖民的脉络、人口的扩散以及过去 3,000 年来它们对岛屿景观的各种影响。这项研究采用跨学科方法，结合古生态学、人类遗传学和民族生态学，以了解长期的社会生态动态。 博士后目标 博士后研究员将专注于使用两种互补方法进行古生态学研究：
从复杂的陆地栖息地恢复高度连续的基因组，揭示了超过 15,000 种新的原核生物物种，并扩大了对土壤和沉积物微生物群落的表征
基因组对于理解微生物生态学和进化至关重要。高通量、长读长 DNA 测序的出现使得从环境样本中大规模恢复微生物基因组成为可能。然而，由于这些环境极其复杂，扩大土壤和沉积物的微生物基因组目录一直具有挑战性。在这里，我们对在丹麦收集的 154 个土壤和沉积物样本进行了深度、长读长纳米孔测序，并通过优化的生物信息学流程恢复了 15,314 个新微生物物种的基因组，其中包括 4,757 个高质量基因组。恢复的微生物基因组涵盖 1,086 个新属，并为 612 个先前已知的属提供了第一个高质量参考基因组，将原核生物生命树的系统发育多样性扩大了 8%。长读长组装体还能够恢复数千个完整的 rRNA 24 操纵子、生物合成基因簇和 CRISPR-Cas 系统，而这些系统在之前的陆地基因组目录中都未被充分代表且高度碎片化。此外，将恢复的 MAG 整合到公共基因组数据库中可显著提高土壤和沉积物宏基因组数据集的物种级分类率，从而增强陆地微生物组表征。通过这项研究，我们证明了长读长 29 测序和优化的生物信息学能够以经济高效的方式从高度复杂的生态系统中恢复高质量的微生物 30 基因组，而生态系统仍然是最大的未开发生物多样性来源，可用于扩展基因组数据库和填补生命之树的空白。32
草稿关于水生和沉积物的更新指南...
4间或实验室内的可重复性定义为在不同实验室或在同一实验室使用特定方案（在可重复条件下）在同一实验室获得的两个单个测试结果之间的绝对差异，预计可预期为95％的概率。（经合组织，2005年）。请注意，TGS可能已在此GD完成后发布。
碳酸盐系统中的流体混合如何影响关键矿物沉积物的形成？
关键矿物质和金属的主要沉积物（例如铜，钴，铅和锌）通常发生在碳酸盐沉积物内的断层，断裂或其他高孔隙区域的直接附近。这种矿化可以在这些碳酸盐托管的渗透性网络中混合到现有的液体中，使断层，断裂或高孔隙率区域的形成日期。所得的液体混合以及与周围碳酸盐岩的相关化学交换在系统内部产生不平衡，从而诱导矿化。流体岩石相互作用实验表明，随着流体中的CA含量的增加，随着它溶解在周围的碳酸盐中，它可以作为Zn-PB矿物沉淀的催化剂[1]，并在与H 2 s含H 2 s碳含量时产生与Spherite（Zns）降水有关的缓冲效果。这些发现与研究H 2 S-地形系统中的合并腐蚀和尺度的实验中的爆发岩沉淀之间的联系是一致的[2]。数值建模显示出对碳酸盐中的baryte形成的相似作用[3]。