XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System测序
5mC 选择性脱氨酶的发现及其在碱基分辨率甲基化位点超灵敏直接测序中的应用
摘要 挖掘噬菌体中的新酶活性对于开发新的生物技术工具仍然很重要。在本研究中，我们使用 MetaGPA（一种将宏基因组数据中的基因型与表型联系起来的方法）来识别脱氧胞苷脱氨酶，这是一种与宏病毒组中的胞嘧啶修饰高度相关的蛋白质家族。出乎意料的是，这些脱氨酶的一个子集在单核苷酸和单链 DNA 底物中都表现出对 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 的偏好，而不是胞嘧啶 (C)。在甲基化组测序工作流程中，这些酶优先脱氨 5mC，这使得甲基化胞嘧啶能够直接转化，同时完全消除任何未修饰胞嘧啶的背景脱氨。这种直接转换允许以单碱基分辨率精确识别甲基化位点，具有无与伦比的灵敏度，为基因组和甲基化组的同时测序提供了广泛的应用。
高通量测序对晚期固体癌症液体活检的临床影响
1早期癌症试验中心“ CLIP2”，Chu Timone，公共援助H pitales de Marseille，Aix-Marseille University，法国13005 Marseille； etienne.gouton@gmail.com（例如）; nausicaa.malissen@ap-hm.fr（N.M.）; nicolas.andre@ap-hm.fr（N.A。）; arnaud.jeanson@ap-hm.fr（A.J.）; annick.pelletier@ap-hm.fr（A.P.）; Albane.testo-ferry@ap-hm.fr（A.T.-F。）; caroline.gaudy@ap-hm.fr（C.G.-M。）; laetitia.dahan@ap-hm.fr（L.D.）; emeline.tabouret@ap-hm.fr（E.T。）; thomas.chevalier@ap-hm.fr（T.C.）; laurent.greillier@ap-hm.fr（L.G.）2种皮肤病学和皮肤癌系，AIX Marseille大学，APHM，CRCM INSERM U1068，CNRS U7258，CHU TIMONE，13005 MARSEILLE，法国Marseille 3 Smartc单位，Cancérologiede Marseille的研究中心 Hospitals of Marseille, Aix-Marseille University, 13005 Marseille, France 5 Institute of Neurophysiopathol, Aix-Marseille University, Aphm, CNRS, INP, neuro-oncology service Chu Timone, 13005 Marsille, France 6 Department of Medical Oncology, CHU Timone, Marseille, Aix-Marseille University, 13005 Marseille, France 7 Multidisciplinary CNRS，INSERM，CRCM，APHM，13015 MARSEILLE，法国Marseille *通讯：Pascale.tomasini@ap-hm.fr
使用长阅读的RNA测序推进基因组注释：Igdrion设施的见解
1。van Dijk El，Jaszczyszyn Y，Naquin D，ThermesC。测序技术的第三次革命是测序技术的简短历史。遗传学趋势2018; 34：666–81。 2。 di Tommaso P，Chatzou M，Floden EW，Barja PP，Palumbo E，NotredameC。NextFlow启用可重现的计算工作流程。 NAT Biotechnol 2017; 35：316–9。 3。 Chen Y，Sim A，Wan YK，Yeo K，Lee JJX，Ling MH等。 与BAMBU的长阅读RNA-seq数据中的上下文感知的转录本定量。 NAT方法2023; 20：1187–95。 4。 Wucher V，Legeai F，HédanB，Rizk G，Lagoutte L，Leeb T等。 feefnc：长期非编码RNA注释及其应用于狗转录组的工具。 核酸研究2017; 45：1-12。遗传学趋势2018; 34：666–81。2。di Tommaso P，Chatzou M，Floden EW，Barja PP，Palumbo E，NotredameC。NextFlow启用可重现的计算工作流程。NAT Biotechnol 2017; 35：316–9。3。Chen Y，Sim A，Wan YK，Yeo K，Lee JJX，Ling MH等。 与BAMBU的长阅读RNA-seq数据中的上下文感知的转录本定量。 NAT方法2023; 20：1187–95。 4。 Wucher V，Legeai F，HédanB，Rizk G，Lagoutte L，Leeb T等。 feefnc：长期非编码RNA注释及其应用于狗转录组的工具。 核酸研究2017; 45：1-12。Chen Y，Sim A，Wan YK，Yeo K，Lee JJX，Ling MH等。与BAMBU的长阅读RNA-seq数据中的上下文感知的转录本定量。NAT方法2023; 20：1187–95。4。Wucher V，Legeai F，HédanB，Rizk G，Lagoutte L，Leeb T等。feefnc：长期非编码RNA注释及其应用于狗转录组的工具。核酸研究2017; 45：1-12。
STMGP：全基因组关联或全基因组测序研究数据
通过培训数据构建预测模型，并通过平滑阈值多变量遗传预测（STMGP）方法预测测试数据表型，其中包含基因环境（GXE）相互作用，其中将GXE相互作用线性添加到具有边际效应的STMGP模型中。数据必须采用Plink二进制格式和边际测试p值（即通过PLINK软件计算每个变体的测试），即使对于具有大量变体的数据，也可以快速计算。通过CP型标准选择最佳的P值截止。可以接受定量和二进制表型，其中必须以PLINK FAM FAM FORGAT或SEPARATE文件（PLINK格式，即FID和IID需要）。环境变量需要通过指定列名来在协变量文件中。
单细胞 DNA 测序描绘了奥希替尼耐药患者中多个驱动变异的克隆进化
1 巴黎萨克雷大学，古斯塔夫鲁西，INSERM U981，维尔瑞夫； 2 药物开发部（DITEP），Gustave Roussy，维尔瑞夫； 3 维尔瑞夫古斯塔夫鲁西肿瘤医学系； 4 PRISM 研究所，Gustave Roussy，维尔瑞夫； 5 巴黎萨克雷大学 INSERM 生物统计学和流行病学办公室，Gustave Roussy，Oncostat U1018，标记为 Ligue Contre le Cancer，Villejuif； 6 实验和转化病理学平台（PETRA）、基因组平台 - 分子生物病理学单位（BMO）和生物资源中心、AMMICA、INSERM US23/CNRS UMS3655、Gustave Roussy、巴黎萨克雷大学、维尔瑞夫； 7 维尔瑞夫古斯塔夫鲁西医学生物学和病理学系； 8 介入放射学系，Gustave Roussy，维尔瑞夫； 9 法国马赛艾克斯马赛大学、法国国立科学研究院、法国国家健康与医学研究院、法国马赛临床医学研究中心
生物制药的测序解决方案
PACBIO测序溶液的出色精度为您提供了细胞和基因治疗开发所需的工具。这种准确性使您能够快速加速新型腺相关病毒（AAV）衣壳的工程和发现，监测和评估杂质并评估病毒整合。跨PACBIO平台的综合变体检测提供了CRISPR-CAS9基因编辑结果的全部表征，包括小和大插入或删除，以及目标构造集成站点。最后，PACBIO测序技术的精度使您可以确认转基因的正确表达和剪接以及细胞和基因治疗开发中使用的细胞系的身份和基因组完整性。
RFLP，PCR和下一代测序
简介 - DNA指纹是一种革命性的分子技术，用于根据其独特和变异的遗传模式来识别个体。通过DNA指纹识别，我们发现基因组中卫星DNA区域之间的差异。这些卫星DNA区域是重复的DNA的拉伸，未针对任何特定蛋白质编码。它们以丰富的形式存在，并用于人类的DNA分析，因为它们描绘了很高的多态性，并且已知是DNA指纹的基础。这项技术是由Alex Jeffrey在1984年发现的，自发现以来，已彻底改变了法医学，父亲鉴定，医学诊断和进化研究。DNA指纹识别的另一个名称是DNA分析，因为它根据脱氧核糖核酸DNA的特定区域中的独特基因组成来识别个体，特别是短串联重复率。有几种可以在限制片段长度的帮助下用于DNA Brina的方法
微生物学中的新一代测序
警告本文件是国防陪审团批准的长期工作的果实。文档的知识产权完全是作者的知识产权。用户必须根据有效的立法尊重版权，并遵守通常的良好利用规则，如纸上的出版物：尊重原始作品，报价，禁止知识抢劫等。它可以通过Dumas Open档案馆（国防后的记忆储备）提供给任何感兴趣的人。如果您想与他或她的作者联系，我们邀请您在线咨询医生，药剂师和妇女的目录。格勒布大学医学图书馆药房的联系：bump-theses@univ-grenoble-alpes.fr
研究助理/助理 – ARTIC 测序项目
剑桥大学正在寻找一位积极主动的研究助理或博士后研究员，加入 Ian Goodfellow 教授和 Jenny Molloy 博士的实验室，参与一项由 Wellcome Trust 资助的激动人心的项目，该项目的重点是将基因组监测置于疫情应对的核心。ARTIC 网络是一项全球计划，旨在通过实时基因组测序增强病原体检测和疫情应对。该职位专注于开发和验证传染病监测的测序协议，特别是在资源有限的环境中。研究助理级别的任命取决于拥有博士学位。已提交但尚未获得博士学位的人将被任命为研究助理，一旦获得博士学位，将改为研究助理。
从没有原始信号的纳米孔测序数据中对DNA修饰的定量检测灵活的，实时的，点播测序
在发布时正确的信息。可能会发生变化。牛津纳米孔技术，车轮图标，Elysion，Epi2Me，Gridion，Minion，Mintion，Minknow和Promethion是注册的商标或牛津Nanopore Technologies PLC在各个国家 /地区的商标应用程序。本文所包含的信息可以受牛津纳米孔技术待定的专利或专利保护。所有其他品牌和名称都是其各自所有者的财产。©2025牛津纳米孔技术plc。保留所有权利。牛津纳米孔技术产品不适用于健康评估或诊断，治疗，缓解，治愈或预防任何疾病或病情。BR_1223（en）_v4_29Jan2025