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真菌对磷酸盐的溶解是陆地生态系统养分循环的重要过程,尤其对于植物生长发育必需的元素磷的可用性而言。磷通常以不溶性形式存在于土壤中,例如铁、铝和钙的无机磷酸盐,这限制了植物根部对其的吸收。然而,磷酸盐溶解真菌能够通过分泌有机酸和磷酸酶将可用的磷酸盐释放到环境中,将这些不溶性形式转化为植物可利用的磷酸根离子。该机制不仅在植物营养方面发挥着关键作用,而且在陆地生态系统的可持续性方面也发挥着关键作用,有助于有效的磷循环和提高农业生产力。本研究的目的是通过巴西亚马逊西部微生物收集中心的三种具有散生菌目形态特征的真菌菌株,对不同磷酸盐源的溶解能力进行分子鉴定和表征。首先,重新激活这些细胞系,并使用 2% CTAB 方法进行 DNA 提取。接下来,进行 CaM(钙调蛋白)区域的扩增,作为物种鉴定的分子标记,然后进行测序和系统发育分析。为了确保分析的稳健性,基于相关物种序列的比对,采用了最大似然法,并进行了 1000 次重复。为了评估无机磷酸盐的溶解潜力,在含有三种不同形式的不溶性磷酸盐的培养基中对分离物进行体外定性测试:磷酸铁(FePO₄)、磷酸铝(AlPO₄)和磷酸钙(Ca₃(PO₄)₂)。将真菌在28°C的恒温下培养四天。磷酸盐的溶解度通过溶解指数来量化,该指数是一个参数,表示真菌在培养基中在其菌落周围产生溶解晕的能力。该指数是根据溶解晕的直径与真菌菌落直径的比率计算得出的。系统发育分析证实,所研究的三种菌株属于 Talaromyces sayulitensis 种。在进行的测试中,Talaromyces sayulitensis 菌株表现出溶解不同来源的无机磷酸盐的高潜力,在所有测试介质中呈现溶解晕。在含有磷酸铝(AlPO₄)的培养基中观察到最高的溶解率。这些结果表明,Talaromyces sayulitensis 具有显著的溶解各种形式磷酸盐的能力,作为一种有前途的生物技术工具,它可以提高贫瘠土壤中磷的利用率,促进植物生长,并有助于可持续农业实践。
b“蛋白质折叠是一个细微的过程,由原代氨基酸序列和细胞蛋白质质量控制机制编码并取决于错误折叠的蛋白质可以汇总成有毒的寡聚物或淀粉样蛋白原纤维,并与包括阿尔茨海默氏症和帕金森氏病以及II型糖尿病在内的疾病有关。这些淀粉样蛋白沉积物具有共同的跨结构,无论其主要氨基酸序列如何。最近的研究表明,生物分子冷凝物的形成是某些淀粉样蛋白蛋白质固有的另一种共同点。冷凝物的新兴生物物理特性可以调节蛋白质聚集;因此,了解淀粉样蛋白形成的结构和动力学基础以及蛋白质质量控制机制对于理解蛋白质错误折叠疾病和治疗剂的下游发展至关重要。本期特刊需要进行多样化和全面的概述,这些概述说明了来自生物物理,生化或细胞生物学观点的蛋白质错误折叠和神经退行性疾病。”
摘要:超极化的核磁共振(NMR)提供了一组方法,可以显着解决NMR的灵敏度问题。溶解动态核极化(D-DNP)提供了一种独特而通用的方法,可检测13 C NMR信号,其灵敏度通过几个数量级增强。D-DNP的扩展应用范围现在涵盖了自然13 C丰度时对复杂混合物的分析。但是,在该区域中,它仅限于代谢物提取物。在这里,我们报告了自然丰度时生物氟-urine-的第一个DNP增强的13 C NMR分析,为这种具有挑战性的样本提供了前所未有的分辨率和敏感性。我们还表明,可以通过标准添加程序检索有关多个靶向代谢物的准确定量信息。
1纽卡斯尔大学癌症中心,纽卡斯尔大学生物科学研究所,中央大道,纽卡斯尔 - 泰恩,泰恩河畔纽卡斯尔和佩戴NE1 3BZ,英国,2合成有机化学,分子与材料研究所,Radboud University nijmegen,Nijmegen,Nijmegeld 1,Toernooiveld 1,Toernooiveld 1,Toernooiveld 1,nijmegen,Nijmegen,Nijmegen,The Nijmegen,The Nijmegen,The Nijmegen,The Nijmegen,netherland,代谢组学,莱顿大学医学中心,Albinusdreef 2,2333 Za Leiden,荷兰,4个Glycotherapeutics B.V.肌肉骨骼研究,肿瘤学和代谢系,Sheffinfiled大学,医学院,Beech Hill Rd,Beech Hill Rd,Sheffiffiffiffiffiffiffiffiard,约克郡S10 2RX,英国,7生物分子化学研究所,分子和材料研究所,Radboud Universit
Rombola A.G.,Torri C.,Vassura I.,Venturini E.,Reggiani R.,Fabbri D.(2022)。生物炭修订对两年野外实验中农业土壤的有机物和溶解有机物组成的影响。总环境科学,812,1-11 [10.1016/j.scitotenv.2021.151422]。
摘要。气体监测是理解地下环境中天然气的交换,扩散和迁移过程的先决条件,这与多种应用有关,例如CO 2的地质隔离。在这项研究中,将三种不同的技术(微型GC,红外和拉曼光谱镜)部署在一个实验性的钻孔上,以进行CO 2注射后的监测目的。的目的是开发一种实时化学监测装置,通过在井眼内的水中测量溶解的气体浓度,但也通过与井孔水平的平衡中的气体收集系统在表面上进行测量。但是,必须校准所有三种技术以提供最准确的定量数据。为此,实现了实验室中的第一个校准步骤。需要进行新的校准,以确定水中或气体收集系统中的气体浓度和/或浓度。用于气相分析,微型-GC,FTIR光谱和拉曼光谱法。对于CO 2,CH 4和N 2进行了Mi-CRO-GC的新校准,不确定性从±100 ppm到1.5 mol%,具体取决于散装浓度和气体类型。先前对CO 2和CO 2,N 2,O 2,CH 4和H 2 O校准了FTIR和RAMAN光谱仪,其精度为1 - 6%,具体取决于浓度尺度,气体和光谱仪。溶解的CO 2。预测溶解的CO 2浓度的不确定性分别为±0.003 mol kg 1和±0.05 bar。
摘要矿物磷(P)来源的潜在短缺以及向循环经济的转变激发了在农业中引入新形式的P肥料。但是,P在新肥料中的溶解度及其植物的利用能力可能很低。 在本实验中,我们在P(28 mg P 2 O 5 kg -1)中孵育了63天的农业土壤,在存在一系列有机和无机性较差的P形式的情况下,在新化肥中常见:羟基磷酸盐(p-Ca),磷酸盐(P-CA),phosprate and phospration(p-ca),P-fe酸(P-CA),phytic Adict and phytic Adict(P-CA) p-org(p-mix)。 纤维素和硝酸钾(KNO 3)在孵育开始时加入刺激性微生物活性。 我们包括三倍超磷酸(TSP)的阳性对照和无p应用的阴性对照(有和没有纤维素和KNO 3)。 ,我们评估了随着时间的推移,我们评估了Nahco 3提取物(OLSEN P)中不同可溶的P形式的命运,作为可用植物可用的P.土壤微生物生物量的代理,真菌与细菌比率,土壤含量,土壤含量,酶促活性,酶促酶,含量酶,酸性酶和酸性酶和酸盐酶含量和酸盐酶,酸磷脂酶磷酸盐酶,含水液磷酸盐磷酸盐酶磷酸盐酶磷酸盐酶磷酸盐酶磷酸盐酶磷酸盐酶,含水量和酸味酶磷酸盐酶磷酸盐含量。受监控。 在孵育开始时,TSP在所有处理中显示出最高的OLSEN P,而P-FE显示出比其他可溶的P形式更高的OLSEN P但是,P在新肥料中的溶解度及其植物的利用能力可能很低。在本实验中,我们在P(28 mg P 2 O 5 kg -1)中孵育了63天的农业土壤,在存在一系列有机和无机性较差的P形式的情况下,在新化肥中常见:羟基磷酸盐(p-Ca),磷酸盐(P-CA),phosprate and phospration(p-ca),P-fe酸(P-CA),phytic Adict and phytic Adict(P-CA) p-org(p-mix)。纤维素和硝酸钾(KNO 3)在孵育开始时加入刺激性微生物活性。我们包括三倍超磷酸(TSP)的阳性对照和无p应用的阴性对照(有和没有纤维素和KNO 3)。,我们评估了随着时间的推移,我们评估了Nahco 3提取物(OLSEN P)中不同可溶的P形式的命运,作为可用植物可用的P.土壤微生物生物量的代理,真菌与细菌比率,土壤含量,土壤含量,酶促活性,酶促酶,含量酶,酸性酶和酸性酶和酸盐酶含量和酸盐酶,酸磷脂酶磷酸盐酶,含水液磷酸盐磷酸盐酶磷酸盐酶磷酸盐酶磷酸盐酶磷酸盐酶磷酸盐酶,含水量和酸味酶磷酸盐酶磷酸盐含量。受监控。在孵育开始时,TSP在所有处理中显示出最高的OLSEN P,而P-FE显示出比其他可溶的P形式更高的OLSEN P
热蛋白质组分析 (TPP) 和高通量蛋白质组整体溶解度变化 (PISA) 检测等高通量技术的进步彻底改变了我们对药物-蛋白质相互作用的理解。尽管有这些创新,但缺乏用于对稳定性和溶解度变化数据进行交叉研究分析的综合平台,这是一个重大瓶颈。为了解决这一差距,我们推出了 DORSSAA(基于稳定性/溶解度变化检测的药物-靶标相互作用组学资源),这是一个交互式且可扩展的基于网络的平台,用于系统分析和可视化蛋白质组稳定性和溶解度变化检测数据集。目前,DORSSAA 拥有 480,456 条记录,涵盖 37 种细胞系和生物体、39 种化合物和 40,004 个潜在蛋白质靶标。通过其用户友好的界面,该资源支持比较药物-蛋白质相互作用分析并促进可操作治疗靶标的发现。我们利用白血病细胞系联合治疗中 DHFR-甲氨蝶呤相互作用和药物-靶标相互作用的两个案例研究,证明了 DORSSAA 在跨实验条件识别蛋白质-药物相互作用方面的实用性。该资源使研究人员能够加速药物发现并增强我们对蛋白质行为的理解。
热蛋白质组分析 (TPP) 和蛋白质组整体溶解度变化 (PISA) 等高通量技术的进步彻底改变了我们对药物-蛋白质相互作用的理解。尽管有这些创新,但缺乏用于对稳定性和溶解度变化数据进行交叉研究分析的综合平台,这是一个重大瓶颈。为了解决这一差距,我们推出了 DORSSAA(基于稳定性/溶解度变化分析的药物靶标相互作用组学资源),这是一个基于网络的交互式平台,用于系统分析和可视化蛋白质组稳定性和溶解度变化分析数据集。DORSSAA 拥有 480,456 条记录,涵盖 37 种细胞系和生物体、39 种化合物和 40,004 个潜在蛋白质靶标。通过其用户友好的界面,该资源支持比较药物-蛋白质相互作用分析并促进可操作治疗靶标的发现。我们通过白血病细胞系联合治疗中 DHFR-甲氨蝶呤相互作用和药物-靶标相互作用的两个案例研究,证明了 DORSSAA 在跨实验条件识别蛋白质-药物相互作用方面的实用性。该资源使研究人员能够加速药物发现并增强我们对蛋白质行为的理解。