4。Braun,T。P.,Eide,C。A.&Druker,B。J。对BCR-ABL1靶向疗法的反应和抗性。癌细胞卷。37 530–542预印本在https://doi.org/10.1016/j.ccell.2020.03.006(2020)。5。Cheng,H。C.,Qi,R。Z.,Paudel,H。&Zhu,H。J. 蛋白激酶和磷酸酶的调节和功能。 酶研究卷。 2011预印本在https://doi.org/10.4061/2011/794089(2011)。 6。 Bhullar,K。S.等。 以激酶为目标的癌症疗法:进步,挑战和未来的方向。 分子癌卷。 17预印本在https://doi.org/10.1186/s12943-018-0804-2(2018)。 7。 Grant,S。K.治疗蛋白激酶抑制剂。 细胞和分子生命科学卷。 66 1163–1177预印本在https://doi.org/10.1007/s00018-008-8539-7(2009)。 8。 Geraldes,P。&King,G。L.蛋白激酶C同工型的激活及其对糖尿病并发症的影响。 循环研究卷。 106 1319–1331预印本https://doi.org/10.1161/circresaha.110.217117(2010)。 9。 Silnitsky,S.,Rubin,S。J. S.,Zerihun,M。&Qvit,N。蛋白激酶作为治疗靶靶标的更新 - 第一部分:蛋白激酶C激活及其在癌症和心血管疾病中的作用。 国际分子科学杂志卷。 24预印本在https://doi.org/10.3390/ijms242417600(2023)。 10。 Pottier,C。等。 癌症中的酪氨酸激酶抑制剂:靶向治疗的突破和挑战。 11。Cheng,H。C.,Qi,R。Z.,Paudel,H。&Zhu,H。J.蛋白激酶和磷酸酶的调节和功能。 酶研究卷。 2011预印本在https://doi.org/10.4061/2011/794089(2011)。 6。 Bhullar,K。S.等。 以激酶为目标的癌症疗法:进步,挑战和未来的方向。 分子癌卷。 17预印本在https://doi.org/10.1186/s12943-018-0804-2(2018)。 7。 Grant,S。K.治疗蛋白激酶抑制剂。 细胞和分子生命科学卷。 66 1163–1177预印本在https://doi.org/10.1007/s00018-008-8539-7(2009)。 8。 Geraldes,P。&King,G。L.蛋白激酶C同工型的激活及其对糖尿病并发症的影响。 循环研究卷。 106 1319–1331预印本https://doi.org/10.1161/circresaha.110.217117(2010)。 9。 Silnitsky,S.,Rubin,S。J. S.,Zerihun,M。&Qvit,N。蛋白激酶作为治疗靶靶标的更新 - 第一部分:蛋白激酶C激活及其在癌症和心血管疾病中的作用。 国际分子科学杂志卷。 24预印本在https://doi.org/10.3390/ijms242417600(2023)。 10。 Pottier,C。等。 癌症中的酪氨酸激酶抑制剂:靶向治疗的突破和挑战。 11。蛋白激酶和磷酸酶的调节和功能。酶研究卷。2011预印本在https://doi.org/10.4061/2011/794089(2011)。6。Bhullar,K。S.等。以激酶为目标的癌症疗法:进步,挑战和未来的方向。分子癌卷。17预印本在https://doi.org/10.1186/s12943-018-0804-2(2018)。7。Grant,S。K.治疗蛋白激酶抑制剂。细胞和分子生命科学卷。66 1163–1177预印本在https://doi.org/10.1007/s00018-008-8539-7(2009)。8。Geraldes,P。&King,G。L.蛋白激酶C同工型的激活及其对糖尿病并发症的影响。循环研究卷。106 1319–1331预印本https://doi.org/10.1161/circresaha.110.217117(2010)。9。Silnitsky,S.,Rubin,S。J. S.,Zerihun,M。&Qvit,N。蛋白激酶作为治疗靶靶标的更新 - 第一部分:蛋白激酶C激活及其在癌症和心血管疾病中的作用。国际分子科学杂志卷。24预印本在https://doi.org/10.3390/ijms242417600(2023)。 10。 Pottier,C。等。 癌症中的酪氨酸激酶抑制剂:靶向治疗的突破和挑战。 11。24预印本在https://doi.org/10.3390/ijms242417600(2023)。10。Pottier,C。等。癌症中的酪氨酸激酶抑制剂:靶向治疗的突破和挑战。11。癌症卷。12 https://doi.org/10.3390/cancers12030731(2020)的预印本。Barouch-Bentov,R。&Sauer,K。激酶中耐药性的机制。有关研究药物的专家意见。20 153–208预印本在https://doi.org/10.1517/13543784.2011.546344(2011)。12。Lin,J。J. &Shaw,A。T.抵抗力:肺癌的靶向疗法。 癌症趋势。 2 350–364预印本在https://doi.org/10.1016/j.trecan.2016.05.010(2016)。 13。 de Santis,S。等。 克服对激酶抑制剂的抗性:慢性髓样白血病的范例。 Oncotargets and Therapy Vol。 15 103–116 https://doi.org/10.2147/ott.s289306(2022)的预印本。 14。 Drilon,A。等。 下一代TRK激酶抑制剂在TRK融合阳性固体瘤患者中获得了对先前TRK激酶抑制的耐药性。 癌症Discov 7,963–972(2017)。 15。 Schoepfer,J。等。 发现Asciminib(ABL001),这是BCR-ABL1酪氨酸激酶活性的变构抑制剂。 J Med Chem 61,8120–8135(2018)。 16。 OU,X.,Gao,G.,Habaz,I。 A.,&Wang,Y。对酪氨酸激酶抑制剂靶向疗法的抗性机制和克服策略。 Medcomm,5(9),E694。 https://doi.org/10.1002/mco2.694(2024)。 17。 Cohen,P。,Cross,D。&Jänne,P.A。 伊马替尼20年后的激酶药物发现:进步和未来方向。 nat Rev Drug Discov 20,551–569。Lin,J。J.&Shaw,A。T.抵抗力:肺癌的靶向疗法。癌症趋势。2 350–364预印本在https://doi.org/10.1016/j.trecan.2016.05.010(2016)。 13。 de Santis,S。等。 克服对激酶抑制剂的抗性:慢性髓样白血病的范例。 Oncotargets and Therapy Vol。 15 103–116 https://doi.org/10.2147/ott.s289306(2022)的预印本。 14。 Drilon,A。等。 下一代TRK激酶抑制剂在TRK融合阳性固体瘤患者中获得了对先前TRK激酶抑制的耐药性。 癌症Discov 7,963–972(2017)。 15。 Schoepfer,J。等。 发现Asciminib(ABL001),这是BCR-ABL1酪氨酸激酶活性的变构抑制剂。 J Med Chem 61,8120–8135(2018)。 16。 OU,X.,Gao,G.,Habaz,I。 A.,&Wang,Y。对酪氨酸激酶抑制剂靶向疗法的抗性机制和克服策略。 Medcomm,5(9),E694。 https://doi.org/10.1002/mco2.694(2024)。 17。 Cohen,P。,Cross,D。&Jänne,P.A。 伊马替尼20年后的激酶药物发现:进步和未来方向。 nat Rev Drug Discov 20,551–569。2 350–364预印本在https://doi.org/10.1016/j.trecan.2016.05.010(2016)。13。de Santis,S。等。 克服对激酶抑制剂的抗性:慢性髓样白血病的范例。 Oncotargets and Therapy Vol。 15 103–116 https://doi.org/10.2147/ott.s289306(2022)的预印本。 14。 Drilon,A。等。 下一代TRK激酶抑制剂在TRK融合阳性固体瘤患者中获得了对先前TRK激酶抑制的耐药性。 癌症Discov 7,963–972(2017)。 15。 Schoepfer,J。等。 发现Asciminib(ABL001),这是BCR-ABL1酪氨酸激酶活性的变构抑制剂。 J Med Chem 61,8120–8135(2018)。 16。 OU,X.,Gao,G.,Habaz,I。 A.,&Wang,Y。对酪氨酸激酶抑制剂靶向疗法的抗性机制和克服策略。 Medcomm,5(9),E694。 https://doi.org/10.1002/mco2.694(2024)。 17。 Cohen,P。,Cross,D。&Jänne,P.A。 伊马替尼20年后的激酶药物发现:进步和未来方向。 nat Rev Drug Discov 20,551–569。de Santis,S。等。克服对激酶抑制剂的抗性:慢性髓样白血病的范例。Oncotargets and Therapy Vol。15 103–116 https://doi.org/10.2147/ott.s289306(2022)的预印本。14。Drilon,A。等。下一代TRK激酶抑制剂在TRK融合阳性固体瘤患者中获得了对先前TRK激酶抑制的耐药性。癌症Discov 7,963–972(2017)。15。Schoepfer,J。等。发现Asciminib(ABL001),这是BCR-ABL1酪氨酸激酶活性的变构抑制剂。J Med Chem 61,8120–8135(2018)。16。OU,X.,Gao,G.,Habaz,I。 A.,&Wang,Y。对酪氨酸激酶抑制剂靶向疗法的抗性机制和克服策略。 Medcomm,5(9),E694。 https://doi.org/10.1002/mco2.694(2024)。 17。 Cohen,P。,Cross,D。&Jänne,P.A。 伊马替尼20年后的激酶药物发现:进步和未来方向。 nat Rev Drug Discov 20,551–569。OU,X.,Gao,G.,Habaz,I。A.,&Wang,Y。对酪氨酸激酶抑制剂靶向疗法的抗性机制和克服策略。Medcomm,5(9),E694。https://doi.org/10.1002/mco2.694(2024)。 17。 Cohen,P。,Cross,D。&Jänne,P.A。 伊马替尼20年后的激酶药物发现:进步和未来方向。 nat Rev Drug Discov 20,551–569。https://doi.org/10.1002/mco2.694(2024)。17。Cohen,P。,Cross,D。&Jänne,P.A。 伊马替尼20年后的激酶药物发现:进步和未来方向。 nat Rev Drug Discov 20,551–569。Cohen,P。,Cross,D。&Jänne,P.A。伊马替尼20年后的激酶药物发现:进步和未来方向。nat Rev Drug Discov 20,551–569。https://doi.org/10.1038/s41573-021-00195-4(2021)。18。Leonetti,A。等。 在EGFR突变的非小细胞肺癌中对osimertinib的抗性机制。 英国癌症杂志卷。 121 725–737预印本在https://doi.org/10.1038/s41416-019-019-0573-8(2019)。 19。 Teuber,A。等。 基于Avapritinib的SAR研究推出了套件和PDGFRA中的结合口袋。 nat Commun 15,(2024)。 20。 Réa,D。&Hughes,T。P. Asciminib的发展,Asciminib是BCR-ABL1的新型变构抑制剂。 肿瘤/血液学的批判性评论卷。 171预印本在https://doi.org/10.1016/j.critrevonc.2022.103580(2022)。 21。 Jiang,Q.,Li,M.,Li,H。&Chen,L。Entectinib,一种新的多目标抑制剂,用于癌症治疗。 生物医学和药物治疗卷。 150预印本在https://doi.org/10.1016/j.biopha.2022.112974(2022)。Leonetti,A。等。在EGFR突变的非小细胞肺癌中对osimertinib的抗性机制。 英国癌症杂志卷。 121 725–737预印本在https://doi.org/10.1038/s41416-019-019-0573-8(2019)。 19。 Teuber,A。等。 基于Avapritinib的SAR研究推出了套件和PDGFRA中的结合口袋。 nat Commun 15,(2024)。 20。 Réa,D。&Hughes,T。P. Asciminib的发展,Asciminib是BCR-ABL1的新型变构抑制剂。 肿瘤/血液学的批判性评论卷。 171预印本在https://doi.org/10.1016/j.critrevonc.2022.103580(2022)。 21。 Jiang,Q.,Li,M.,Li,H。&Chen,L。Entectinib,一种新的多目标抑制剂,用于癌症治疗。 生物医学和药物治疗卷。 150预印本在https://doi.org/10.1016/j.biopha.2022.112974(2022)。在EGFR突变的非小细胞肺癌中对osimertinib的抗性机制。英国癌症杂志卷。 121 725–737预印本在https://doi.org/10.1038/s41416-019-019-0573-8(2019)。 19。 Teuber,A。等。 基于Avapritinib的SAR研究推出了套件和PDGFRA中的结合口袋。 nat Commun 15,(2024)。 20。 Réa,D。&Hughes,T。P. Asciminib的发展,Asciminib是BCR-ABL1的新型变构抑制剂。 肿瘤/血液学的批判性评论卷。 171预印本在https://doi.org/10.1016/j.critrevonc.2022.103580(2022)。 21。 Jiang,Q.,Li,M.,Li,H。&Chen,L。Entectinib,一种新的多目标抑制剂,用于癌症治疗。 生物医学和药物治疗卷。 150预印本在https://doi.org/10.1016/j.biopha.2022.112974(2022)。英国癌症杂志卷。121 725–737预印本在https://doi.org/10.1038/s41416-019-019-0573-8(2019)。19。Teuber,A。等。 基于Avapritinib的SAR研究推出了套件和PDGFRA中的结合口袋。 nat Commun 15,(2024)。 20。 Réa,D。&Hughes,T。P. Asciminib的发展,Asciminib是BCR-ABL1的新型变构抑制剂。 肿瘤/血液学的批判性评论卷。 171预印本在https://doi.org/10.1016/j.critrevonc.2022.103580(2022)。 21。 Jiang,Q.,Li,M.,Li,H。&Chen,L。Entectinib,一种新的多目标抑制剂,用于癌症治疗。 生物医学和药物治疗卷。 150预印本在https://doi.org/10.1016/j.biopha.2022.112974(2022)。Teuber,A。等。基于Avapritinib的SAR研究推出了套件和PDGFRA中的结合口袋。 nat Commun 15,(2024)。 20。 Réa,D。&Hughes,T。P. Asciminib的发展,Asciminib是BCR-ABL1的新型变构抑制剂。 肿瘤/血液学的批判性评论卷。 171预印本在https://doi.org/10.1016/j.critrevonc.2022.103580(2022)。 21。 Jiang,Q.,Li,M.,Li,H。&Chen,L。Entectinib,一种新的多目标抑制剂,用于癌症治疗。 生物医学和药物治疗卷。 150预印本在https://doi.org/10.1016/j.biopha.2022.112974(2022)。基于Avapritinib的SAR研究推出了套件和PDGFRA中的结合口袋。nat Commun 15,(2024)。20。Réa,D。&Hughes,T。P. Asciminib的发展,Asciminib是BCR-ABL1的新型变构抑制剂。肿瘤/血液学的批判性评论卷。171预印本在https://doi.org/10.1016/j.critrevonc.2022.103580(2022)。21。Jiang,Q.,Li,M.,Li,H。&Chen,L。Entectinib,一种新的多目标抑制剂,用于癌症治疗。 生物医学和药物治疗卷。 150预印本在https://doi.org/10.1016/j.biopha.2022.112974(2022)。Jiang,Q.,Li,M.,Li,H。&Chen,L。Entectinib,一种新的多目标抑制剂,用于癌症治疗。生物医学和药物治疗卷。150预印本在https://doi.org/10.1016/j.biopha.2022.112974(2022)。
。CC-BY 4.0 国际许可,根据 (未经同行评审认证)提供,是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者,此版本于 2022 年 6 月 9 日发布。;https://doi.org/10.1101/2022.06.07.495151 doi:bioRxiv 预印本
目的:本研究旨在通过使用美国FDA不良事件报告系统(FAERS)的数据进行药物守护性分析来研究非选择性RET激酶抑制剂与甲状腺功能障碍(TD)之间的潜在关联。方法:从FAERS数据库中获得非选择性RET MKI的数据,跨越2015年第一季度到2023年第四季度。不成比例分析用于量化与非选择性RET MKI相关的AE信号并识别TD AE。亚组分析和多元逻辑回归用于评估影响TD AES发生的因素。时间发作(TTO)分析和Weibull形状参数(WSP)测试。结果:描述性分析表明,与非选择性RET MKI相关的TD不良事件的趋势越来越大,报告的严重反应很明显。使用ROR,PRR,BCPNN和EBGM算法的不成比例分析始终显示出Sunitinib,Cabozantinib和Lenvatinib与TD不良事件之间的正相关。亚组分析基于年龄,性别和体重强调了对TD的差异敏感性,每个抑制剂都观察到了不同的模式。逻辑回归分析确定了独立影响TD不良事件发生的因素,强调了年龄,性别和体重在患者分层中的重要性。发出的时间分析表明用非选择性RET MKI治疗后TD不良事件的早期表现,随着时间的推移风险降低。结论:我们研究的结果表明使用非选择性RET MKI与TD AE的发生之间存在相关性。这可以为非选择性RET MKI的临床监测和风险识别提供支持。然而,需要进一步的临床研究来证实这项研究的结果。关键字:药物诱导的甲状腺功能障碍,非选择性RET MKIS,药物守流,FDA不良事件报告系统,临床监测
序列 MERPPGLRPG AGGPWEMRER LGTGGFGNVC LYQHRELDLK IAIKSCRLEL STKNRERWCH EIQIMKKLNH ANVVKACDVP EELNILIHDV PLLAMEYCSG GDLRKLLNKP ENCCGLKESQ ILSLLSDIGS GIRYLHENKI IHRDLKPENI VLQDVGGKII HKIIDLGYAK DVDQGSLCTS FVGTLQYLAP ELFENKPYTA TVDYWSFGTM VFECIAGYRP FLHHLQPFTW HEKIKKKDPK CIFACEEMSG EVRFSSHLPQ PNSLCSLVVE PMENWLQLML NWDPQQRGGP VDLTLKQPRC FVLMDHILNL KIVHILNMTS AKIISFLLPP DESLHSLQSR IERETGINTG SQELLSETGI SLDPRKPASQ CVLDGVRGCD SYMVYLFDKS KTVYEGPFAS RSLSDCVNYI VQDSKIQLPI IQLRKVWAEA VHYVSGLKED YSRLFQGQRA AMLSLLRYNA NLTKMKNTLI SASQQLKAKL EFFHKSIQLD LERYSEQMTY GISSEKMLKA WKEMEEKAIH YAEVGVIGYL EDQIMSLHAE IMELQKSPYG RRQGDLMESL EQRAIDLYKQ LKHRPSDHSY SDSTEMVKII VHTVQSQDRV LKELFGHLSK LLGCKQKIID LLPKVEVALS NIKEADNTVM FMQGKRQKEI WHLLKIACTQ SSARSLVGSS LEGAVTPQTS AWLPPTSAEH DHSLSCVVTP QDGETSAQMI EENLNCLGHL STIIHEANEE QGNSMMNLDW SWLTE
注意:介绍部分是您的一般知识,不应将其视为政策覆盖标准。
分子表示学习(MRL)长期以来在药物发现和材料科学领域至关重要,并且由于自然语言处理(NLP)和图形神经网络(GNN)的发展,它取得了重大进展。nlp将分子视为一维顺序令牌,而GNN则将它们视为二维拓扑图。基于通过不同的消息传递算法,GNN在检测化学环境和预测分子特性方面具有各种性能。在此,我们提出了定向的图形注意力网络(D-GAT):具有定向键的表达性GNN。我们策略成功的关键是按照指示图处理分子图,并通过缩放的点 - 产物注意机制来更新键状态和原子状态。这使模型可以更好地捕获分子图的子结构,即官能团。与其他GNN或消息传递神经网络(MPNN)相比,D-Gats的表现优于15个重要分子属性预测基准中的13个。
1 Aix-Marseille University,Inserm,MMG,13005 Marseille,法国; jean-camille.mattei@ap-hm.fr(J.C.M.); corinne.bouvier2@ap-hm.fr(C.B.-L。); Richardalexandre.rochwerger@ap-hm.fr(R.A.R.); florence.duffaud@ap-hm.fr(F.D.); solschwang@gmail.com(s.o.); sebastien.salas@ap-hm.fr(S.S.)2 Aphm,h [hôpital-Nord,Orthop Service and Trauma,13015 Marseille,法国Marseille,法国3 APHM,HOR,Pital de la Timone,病理解剖学和神经病理学的服务服务doriane.barets@ap-hm.fr(D.B.); nicolas.macagno@ap-hm.fr(N.M.)4 AIX-MARSELILLE大学,CNRS,INP,INP,Inst Neurophysiopathol,13005,法国Marseille,法国; mathieu.chocry@univ-amu.fr(m.c.); philippe.morando@univ-amu.fr(P.M.)5 Inserm,UMR 1037,31077法国图卢兹; Frederic.Chibon.fr 6 Aphm,Hortial肿瘤学服务,13005年,法国Marseille,7 Aphm,h。 13005 Marseille,法国9 APHM,生物资源中心,13005法国马赛 *通信:Carine.jiguguet-jiglaire@univ-amu.fr;这样的。: + 33-(0)49-132-4444†这些作者对这项工作也同样贡献。‡这些作者是共同的作者。
图5。TBK1和IKKβ结构域组织的结构比较。 a)TBK1 KU D135N结构,显示了激酶结构域(KD)和泛素样域(ULD),具有插图的TBK1和IKKβKD。 (b)位于IKKβ杂质内的TBK1 KU D135N结构显示与IKKβ的支架二聚域(SDD)的兼容性。 与SDD相互作用的残基以紫色突出显示。 注意。 改编自“转载体磷酸化的储罐结合激酶1的分子基础”。 https://doi.org/10.1073/pnas.1121552109。 Ser172的磷酸化触发TBK1激活所需的构象变化,TBK1和IKKβ结构域组织的结构比较。a)TBK1 KU D135N结构,显示了激酶结构域(KD)和泛素样域(ULD),具有插图的TBK1和IKKβKD。(b)位于IKKβ杂质内的TBK1 KU D135N结构显示与IKKβ的支架二聚域(SDD)的兼容性。与SDD相互作用的残基以紫色突出显示。注意。改编自“转载体磷酸化的储罐结合激酶1的分子基础”。https://doi.org/10.1073/pnas.1121552109。 Ser172的磷酸化触发TBK1激活所需的构象变化,https://doi.org/10.1073/pnas.1121552109。Ser172的磷酸化触发TBK1激活所需的构象变化,Ser172的磷酸化触发TBK1激活所需的构象变化,
1. 免疫原性细胞死亡:建立抗肿瘤免疫反应 10 1.1 调节性细胞死亡 10 1.1.1 细胞凋亡 10 1.1.2 坏死性凋亡 10 1.1.3 细胞焦亡 11 1.1.4 铁死亡 11 1.1.5 自噬性细胞死亡 12 框 1 .内在和外在凋亡 12 1.2 免疫原性细胞死亡 14 1.2.1 ATP,募集树突状细胞的基石 15 1.2.2 ANXA1,树突状细胞的指南针 16 1.2.3 钙网蛋白暴露引导肿瘤细胞摄取 17 1.2.4 HMGB1-TLR4 相互作用控制肿瘤抗原加工 18 1.2.5 ATP 的双重作用,从树突状细胞募集到 T 细胞启动 19 1.2.6 CXCL10,I 型干扰素的下游,募集/保留 T 细胞 19 表 1 . 免疫原性细胞死亡诱导剂(改编自 45 ) 21 1.3 ICD 诱导的肿瘤生长控制:体内证据 25 框 2 . ICD 背后的应激反应 28 1.4 ICD 的临床意义 30 1.4.1 ICD 作为化疗成功的预测因素 30 1.4.2 放射诱导的远隔效应 31
先天免疫系统对于抵御病原体入侵、有效控制感染以及触发适应性免疫反应以消除传染源至关重要。本研究揭示了微管亲和力调节激酶 2 (MARK2) 作为广谱抗病毒免疫调节剂的关键作用,具体通过其与鸟嘌呤核苷酸交换因子 H1 (GEF- H1) 的相互作用以及与 TANK 结合激酶 1 (TBK1) 的结合。至关重要的是,MARK2 的抗病毒功效取决于其激酶活性,特别是其在丝氨酸 645 位点磷酸化 GEF-H1 的能力。该磷酸化事件是激活 TBK1 的关键触发因素,从而导致诱导 I 型干扰素 (IFN-I) 和干扰素刺激基因 (ISG)。我们的结果表明,GEF-H1 是一种 ISG,并由 MARK2 促进。这些发现不仅证实了 MARK2 是 GEF-H1 的激酶,还揭示了 MARK2 增强宿主抗病毒防御的一种以前未被认识的机制。通过对 GEF-H1 进行策略性磷酸化来增强 IFN-I 信号,MARK2 显著增强了抗病毒免疫反应,为细胞防御机制的分子协调提供了新的见解。