工程蛋白质有可能解决生物医学、能源和材料科学中的许多问题,但在实践中创造出成功的设计却很困难。这一挑战的一个重要方面是蛋白质序列和三维结构之间的复杂耦合,而找到一种可行设计的任务通常被称为逆蛋白质折叠问题。在这项工作中,我们引入了一种基于图形表示的给定三维结构的蛋白质序列条件生成模型。我们的方法通过关注那些在序列中是长距离但在三维空间中是局部的蛋白质,有效地捕捉蛋白质中复杂的依赖关系。这种基于图的方法在速度和可靠性方面都比传统和其他基于神经网络的方法有所提高,并借助深度生成模型向快速和有针对性的生物分子设计迈出了一步。
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到2050年,世界的预计人口将为100亿。[1]与如此庞大的人口规模相关的最艰巨的可持续性挑战之一将是处理所有塑料产品[2],即Poly-ersers的生产和回收。[3]毫不奇怪,在全球范围内进行聚合物回收的研究努力。机械回收倾向于导致原始材料,但质量较低。[4]一个更好的可能性是化学回收,[5,6],即[7]化学[7] [7]或生物学[8]将聚合物催化为其组成单体,以便将它们重新聚合到同一质量的质量Mate-Mate-Mate-Rial,或A NEW(CO CO)。[9,10]另一种方法是将聚合物重新利用为不同的增值化学物质(升级)。[11-15]两种方法都是闭环,即与统一经济原则兼容。[16]
摘要 蛋白质是细胞中的关键分子,其丰度不仅在基因表达水平而且在转录后水平受到广泛调控。在这里,我们描述了一种酵母基因筛选方法,该方法能够系统地表征蛋白质丰度调控在基因组中的编码方式。该筛选方法结合了 CRISPR/Cas9 碱基编辑器来引入点突变,并对内源性蛋白质进行荧光标记以方便流式细胞仪读数。我们首先使用单个 gRNA 以及正向和负向选择筛选对酵母中的碱基编辑器性能进行了基准测试。然后,我们研究了 16,452 种基因扰动对代表各种细胞功能的 11 种蛋白质丰度的影响。我们发现了数百种调控关系,包括 GAPDH 同工酶 Tdh1/2/3 与 Ras/PKA 通路之间的新联系。许多已识别的调节因子特定于这 11 种蛋白质中的一种,但我们还发现了一些基因,这些基因在受到扰动时会影响大多数测试蛋白质的丰度。虽然更具体的调控因子通常作用于转录,但广泛的调控因子往往在蛋白质翻译中发挥作用。总的来说,我们的新筛选方法为蛋白质调控网络的组成部分、规模和连通性提供了前所未有的见解。
多面体蛋白纳米局量作为疫苗平台取得了很大的成功(1-3),并且是生物制剂递送的有前途的车辆(4-7)。因此,人们对设计能够显示大量抗原或包装更大的更大的碳的更大且更复杂的结构有很大的兴趣。然而,常规的多面体是所有亚基都具有相同局部环境的最大闭合结构(8-11),因此访问更大,更复杂的封闭结构需要打破局部对称性。病毒通过在独特的环境(伪对称)(12)中放置化学不同但结构上相似的链条或利用相同的亚基来解决这个问题,或者利用在不同环境中采用不同构象的相同亚基(准对象)(13-15)(13 - 15),以访问具有更高的三角形(T)数量(13)结构(13),具有较大的亚基和互联剂和较大的子燃料。设计更大,更复杂的纳米焦点的一种有希望的途径是从定期的多面体纳米局(t = 1)开始,该纳米局(t = 1)是由对称的同构构构建块构建的,这些构建块的分离式环状布置是通过在假异构的异构体中代替这些构建块的隔离循环排列,然后通过将t = 4和大型结构与其他结构结合在一起,并与这些其他结构相结合。在这里,我们提供了这种设计方法的高级几何概述,以说明如何使用设计多样性和设计经济之间的权衡方向来实现不同的设计成果,正如在两篇随附的论文中实验证明的那样,Lee等人(16)和Dowling等人(17)。
摘要:尽管青光眼是全球不可逆性失明的主要原因,但其发病机理尚不完全理解,而眼内压(IOP)是靶向这种疾病的唯一可修改的危险因素。已经提出了包括IOP在内的肠道微生物组和青光眼之间的几个关联。越来越多的证据表明,在眼表面上的微生物之间的相互作用称为眼表面微生物组(OSM)和泪液蛋白质(统称为泪液蛋白质组),也可能在诸如青光眼等眼疾病中起作用。这项研究旨在在青光眼患者中找到OSM和撕裂蛋白的特征。32个结膜拭子的全元基因组shot弹枪测序鉴定出肌动杆菌,富公司和蛋白质细菌是同类中的主要门。该物种仅在健康对照中发现,与青光眼患者相比,它们的结膜微生物组可能富含磷脂酶途径的基因。尽管OSM在OSM中存在较小的差异,但与对照组相比,患者表现出与免疫系统相关的许多撕裂蛋白的富集。与OSM相反,这强调了蛋白质组的作用,并可能引起免疫过程在青光眼中的参与。这些发现可能有助于设计针对青光眼和其他相关疾病的新治疗方法。
噬菌体FD,FL和OX174是已知的最小病毒之一。它们属于具有单链圆形DNA作为其遗传物质(1-4)的一组良好特征的副觉。他们的DNA的分子量约为2 x 106,仅包含有限数量的基因。fd和fl是丝状噬菌体,在血清学和遗传上相关。ox174是一个显然与丝状噬菌体无关的球形噬菌体。dev> deNhardt和Marvin(5)通过DNA-DNA杂交进行了表明,尽管这两种类型的噬菌体(即丝状和球形)在每种类型的DNA之间没有检测可检测的同源性,尽管在每种类型内部都有很高的同源性。最近,已经推出了一种相对较快的分馏和序列大嘧啶寡核苷酸的技术。已经确定了9-20个基碱残基的FD DNA中长嘧啶裂纹的序列(6)。在本报告中,提出了来自FL和OX174 DNA的大嘧啶产物的序列。将这些序列与先前从FD DNA获得的序列进行了比较。
学期学时20学期 - VI课程代码课程类型学会时间HQ-006古兰经强制性的翻译1 Chem-319物理化学I-I(化学动力学)强制性2 Chem-320物理化学化学(体温动力学)强制性2化学-321物理化学实验室强制性化学1 Chemistory 1 Chemistor 1 Chemistor 1 Chemistor 1 Comportor 2 Comprions 2 Comportion 1 Chemistor 1 Comportor 2 Comistry 1 Comportor 2 Cosistry 2 Comistry 1 Chemistry 1 Comportion 2 Comistor 2 Chem-323 Inorganic Chemistry-II (f-block elements) Compulsory 2 Chem-324 Inorganic Chemistry Lab Compulsory 1 Chem-325 Organic Chemistry-I (Reaction Mechanisms-I) Compulsory 2 Chem-326 Organic Chemistry-II (Spectroscopy) Compulsory 2 Chem-327 Organic Chemistry Lab Compulsory 1
简介:注意/多动症(ADHD)是一种神经发育障碍,该障碍通常表现为fig虫,是一种非目标的摩托车作用。许多研究表明,在不同条件下,刺激变化是一种自我调节的机制,以认知要求任务期间注意力和机敏性。烦恼也与反应时间变异性有关。然而,缺乏定义和量化的标准变量可能会导致跨研究的数据和可解释性问题的差异。此外,与青年人相比,成年人的青少年知识尚不清楚。本研究旨在设计一个框架,以量化有意义的填充变量,并将它们应用于认知任务,在患有多动症的成年人中,在认知任务(侧翼)上进行填充和表现之间的关系。
图。5:用酪蛋白钝化的悬臂背面的AFM图像在0.5pm T5溶液的溶液中孵育1.5h(箭头标记T5噬菌体或可能的酪蛋白聚集体)请注意,这里的条件与手稿中呈现的原位实验不同。