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World File Search System碱基对
伊朗人口中线粒体基因组SNP的单倍群结构和遗传变异分析
引言人线粒体DNA（mtDNA）是圆形双链体，由16 569个碱基对（BPS）组成。1 mtDNA变体是在没有进行重组的情况下进行母体传播的，从而使它们在连续的世代上积累。mtDNA的这种特征使其成为研究人群遗传学，系统发育进化，人类迁移以及医学和法医研究的流行工具。许多关于mtDNA分析的研究已经发表。2-11线粒体单倍群包括具有相同累积mtDNA变体的个体，通常在特定地理区域中发现，并且可以通过母体谱系进行追踪。这些单倍体在线粒体系统发育树中构成不同的分支。某些单倍体主要与特定地理区域相关。单倍群L0 – L6通常在撒哈拉以南非洲人中发现，而R5 – R8，M2 – M6和M4 –
化学反应性理论分析微塑料的可能毒性：聚乙烯和聚酯作为例子
微塑料和纳米塑料在世界各地广泛。特别是聚乙烯（PE）和聚乙二醇二苯二甲酸酯或聚酯（PET）是最常见的聚体，用作塑料袋和纺织品。为了分析这两种聚合物的毒性，将具有不同单元数量的寡聚物用作模型。将低聚物用作聚合模板的使用先前已成功使用。我们从单体开始，并继续使用不同的低聚物，直到链长大于两个nm。根据量子化学的结果，PET比PE更好，因为它是更好的电子受体。此外，PET具有负电荷的氧原子，并且比与其他分子相比，可以促进更强的相互作用。我们发现PET形成了稳定的复合物，可以解离鸟嘌呤 - 酪氨酸核碱基对。这可能会影响DNA复制。这些初步理论结果可能有助于阐明微塑料和纳米塑料的潜在危害。
Fragaria vesca'Yellow Wonder' 的组装和注释...
摘要 野生二倍体草莓Fragaria vesca是栽培草莓的基础研究模型。目前可用的参考基因组仅限于两个密切相关的种质，即Hawaii 4和CFRA2339。广泛使用的模型种质‘Yellow Wonder’尚未有其参考基因组。在本研究中，使用Oxford Nanopore长读和Illumina短读的组合组装了第7代自交系‘Yellow Wonder’的基因组。这个220兆碱基对基因组的从头染色体规模组装包含34,007个基因，这些基因是通过从Hawaii 4基因组注释中移植过来进行注释的。基因组比较表明‘Yellow Wonder’基因组与之前发表的两个F. vesca种质，即Hawaii 4和CFRA2339相对不同。 “黄色奇迹”参考基因组的出现为草莓属植物增添了另一个重要的基因组资源，使草莓的研究得以快速进展。
肽融合提高主要编辑效率 1
Prime editing 是一种基于 CRISPR 的“搜索和替换”技术，可在没有双链断裂 (DSB) 或供体 DNA 模板 1 的情况下，在哺乳动物细胞中介导靶向 32 插入、删除和所有可能的碱基对碱基转换。Prime editing 34 酶 (PE2) 由与工程逆转录酶 (RT) 融合的 SpCas9 切口酶组成。35 PE2 通过 Prime editing 向导 RNA (pegRNA) 被招募到目标位点，该 RNA 除了标准基因组靶向间隔区和 SpCas9 结合发夹结构外，还包含 3' 序列，37 该序列充当融合 RT 的模板，以在一条切口 DNA 链上合成编程的 DNA 序列。当细胞 DNA 修复机制修复断裂的链时，这种 RT-39 延伸片段会与未编辑的片段竞争，而编辑后的序列有时会取代基因组中的原始序列 1,2。41
专刊
基因组编辑技术的发展提高了多种遗传性疾病的治疗前景。对于大多数遗传性疾病，高精度 DNA 校正将是可行的。事实上，诸如碱基编辑之类的技术使我们能够校正四种最常见的单碱基替换，而主要编辑可以安装数十个碱基对的任何替换、插入和/或删除。涉及双链 DNA 断裂 (DSB) 的核酸酶依赖性编辑方法通常会导致高比例的不受控制的编辑结果。碱基编辑和主要编辑技术具有更高的效率和更少的副产物，即使在缓慢分裂或不分裂的细胞中也是如此，这些细胞是成年动物中的大多数细胞。因此，这些技术是体内治疗性基因组编辑的有效药剂，不仅在动物模型中，而且在人类中也是如此。因此，我提议出版一期《细胞》特刊，介绍这些技术的惊人进展及其在开发遗传改良植物和真正的个性化医疗治疗中的快速应用。您忠实的，
湖泊生态系统中的砷毒性：腹膜生物转化和中国神秘的蜗牛生物蓄积Monique Rockefeller，Sarah Alaei和Alis
图4。砷矿甲基转移酶（ARSM）基因在鳟鱼湖，钢铁湖和基拉尼湖的周围DNA中检测到了PCR，使用靶向该基因保守区域的退化引物。从三个南部海湾声音湖中收集了植物，砷湖：鳟鱼湖（<1 ppb），钢铁湖（〜2 ppb）和基拉尼湖（〜20 ppb）。DNA以不同的浓度在聚合酶链反应（PCR）中用作模板，以不同的浓度：1 ng/ul，2 ng/ul和4 ng/ul。用两个引物对之一进行 PCR：与16S rRNA或ARSM基因互补。琼脂糖凝胶电泳。该图显示了用荧光染料，分子量（MW）梯子和可变标签可视化的凝胶。16S rRNA引物预计将导致111个碱基对（BP）的PCR产物，并且ARSM引物（MF1和MR2）预计将导致302至346 bp之间的PCR产物。
金属介导的DNA纳米技术3D
摘要：含有金属介导的DNA（MMDNA）碱基对的DNA双螺旋已经由嘧啶：嘧啶对之间的Ag +和Hg 2+离子构建，并具有纳米电子学的承诺。MMDNA纳米材料的合理设计是不切实际的，没有完整的词汇和结构描述。在这里，我们探讨了结构性DNA纳米技术的可编程性，以使其成立的使命是为生物分子结构确定的衍射平台进行自组装。我们采用了张力三角形来通过X射线衍射和MMDNA构建的概括性设计规则来构建MMDNA对的全面结构库。我们发现了两种结合模式：N3-主导，中心对称对和由5位环修饰驱动的主要凹槽粘合剂。能量间隙计算显示，MMDNA结构的最低未居住的分子轨道（LUMO）中显示了额外的水平，使它们具有吸引力的分子电子候选物。
从土耳其棉铃虫中分离的棉铃虫单核多角体病毒 (HearNPV-TR) 的基因组序列分析
对棉铃虫单核多角体病毒（HearNPV-TR）全基因组进行了测序，并与现有的其他分离物基因组进行了比较。HearNPV-TR基因组长130.691个碱基对，G+C含量为38.9%，有137个开放阅读框（ORF），每个ORF长150个核苷酸。鉴定出5个同源重复序列（hrs）和2个杆状病毒重复ORF（bro-a和bro-b）。系统发育分析表明，HearNPV-TR与HaSNPV-C1、HaSNPV-G4、HaSNPV-AU和HasNPV较接近，但在hr 3、hr 5区域及bro-a基因存在明显差异。对HearNPV-TR与其他棉铃虫NPVs的38个核心基因序列进行成对Kimura-2参数分析，结果表明这些序列间的遗传距离均小于0.015个替换/位点，限制性内切酶分析结果显示基因组间的差异表明hr3、hr5区域及bro-a基因可能对HearNPV-TR的毒力具有一定影响。
药物代谢中多晶型基因CYP的分析
摘要异种生物学是一种外国物质的化合物，以药物，致癌物，食物添加或其他成分的形式进入人体。输入的异物将由酶代谢，其中一种是与生理化合物代谢有关的酶细胞色素P450 monooksgenase（CYP）对人体很重要。酶的异生物代谢分为两个阶段，旨在形成更多的极性异种生物学，从而更容易消除身体。许多研究承认，代谢药物的酶和转运蛋白的遗传多态性的存在可以显着影响个体对药物反应时的变化。SNP之一（单核苷酸多态性）是最常见的遗传突变类型，它在个体内或个体之间改变了单个碱基对。数据库在SNP方面发展，因为该开发使用了生物信息学方法，因此可以在更大和较广泛的人类基因组中识别SNP在人类基因组中的鉴定。关键字：异生物学，细胞色素P450酶，SNP（单
研究与发展杂志，第1卷。 15（2015）
2昆虫学分公司，Skuas T-K，Srinagar-190 025，J＆K，印度 *通讯作者：mdniamat@hotmail.com摘要DNA条形码是一种自然发生在每个生物中的基因组中的遗传特征。 通常用于所有动物群的基因区域之一是线粒体细胞色素氧化酶1基因（CO1）中的648个碱基对区域，由于物种高度构象而引起的高多晶型，它已被有效地用于识别鸟类，蝇，蝴蝶，鱼类和许多其他动物群。 保罗·赫伯特（Paul Herbert，2003）发表了一篇题为“通过DNA条形码的生物学识别的论文，该论文在科学家之间就DNA条形码的有用性作为一种有效的技术来提高了认识。 在本出版物后的一十年研究中，DNA条形码已迅速发展成为一种工具，该工具可用于解决全球许多环境，农业，健康和保护问题。 它在疾病和害虫控制，市场欺诈检测和保护濒危物种方面也有应用。 本文回顾了球球菌，trichogrammatidae和Syrphidae的DNA条形码的当前状态。 关键字：球球菌，Trichogrammatidae，Syrphidae，DNA条形码，线粒体细胞色素氧化酶12昆虫学分公司，Skuas T-K，Srinagar-190 025，J＆K，印度 *通讯作者：mdniamat@hotmail.com摘要DNA条形码是一种自然发生在每个生物中的基因组中的遗传特征。通常用于所有动物群的基因区域之一是线粒体细胞色素氧化酶1基因（CO1）中的648个碱基对区域，由于物种高度构象而引起的高多晶型，它已被有效地用于识别鸟类，蝇，蝴蝶，鱼类和许多其他动物群。保罗·赫伯特（Paul Herbert，2003）发表了一篇题为“通过DNA条形码的生物学识别的论文，该论文在科学家之间就DNA条形码的有用性作为一种有效的技术来提高了认识。在本出版物后的一十年研究中，DNA条形码已迅速发展成为一种工具，该工具可用于解决全球许多环境，农业，健康和保护问题。它在疾病和害虫控制，市场欺诈检测和保护濒危物种方面也有应用。本文回顾了球球菌，trichogrammatidae和Syrphidae的DNA条形码的当前状态。关键字：球球菌，Trichogrammatidae，Syrphidae，DNA条形码，线粒体细胞色素氧化酶1