XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System粪便
16S rRNA ngs粪便细菌菌群的测序...
目标。这项研究的目的是使用16S rRNA基因的下一代测序（NGS）来表征并可能区分健康和肥胖马的下肠道（粪便）细菌。方法。这项研究涉及7匹马（4匹马和3匹母马），年龄8-17岁：乌克兰鞍品种1-4匹马（马1运动马匹rebus，10 Y.O.，马匹2马匹2种马santes，15 Y.O.，15 Y.O.，15 Y.O.），重量吃水的5匹马（种马Tsyhan，8 Y.O.）和非透明马6和7（Mare Sne-Zhynka，10 Y.O.，Mare Rumba 12 Y.O.）马匹2、4、5和7是肥胖，马1、3和6是健康的。所有马匹都保留在州生物技术大学的马术中心，乌克兰教育与科学部（乌克兰哈尔基夫）。根据制造商的说明，使用Purelink微生物组DNAPuriÞ阳离子试剂盒（Invitrogen，USA）提取直肠粪便样品的总DNA。准备了细菌16S rRNA的库，我们使用了16S rRNA条形码试剂盒1-24（美国牛津纳米波尔）。为了净化所获得的库，磁性颗粒核元素清理和尺寸选择（Macherey-Nagel，德国根据推荐的快速测序放大器的建议协议 - 16S条形码（SQK-16SS024）（测序套件的手册）。这些条件基于Fujiyoshi等人（2020）中所述的16S rRNA基因扩增阳离子的标准方案，并确保细菌DNA跨各种群分类群的稳健扩增。结果。结论。细菌门的代表（Syn.肌动杆菌），纤维杆菌，小叶虫 - 螺旋杆菌（Syn.螺旋体），杆菌，富公司（Syn.芽孢杆菌），planctomycetota，verrucomicrobiota（Syn.verrucomicrobia），念珠菌Melainabacteria，kiritimatiellota和proteeobacteria（Syn.假单胞菌）。占主导地位的门是坚硬的，其份额是所有检测到的门的50％至82％。与杆菌的数量相比，健康马匹和肥胖马之间的数量差异很大。在健康马1,3和6中，这是企业和肥胖的马2,4,5和7的2.5、3.4和2.9倍，它是8.6、8.2、7.6和5.7倍。与杆菌相比，坚硬的人数在健康马匹和肥胖马之间发生了显着变化。在健康的马1、3和6中，牢固的数量分别为2.5、3.4和2.9倍，而在肥胖的马2、4、5和7中，牢固的数量分别为8.6、8.2、7.6、7.6和5.7倍。在肥胖的马匹2、4、5和7中观察到蛋白杆菌的数量增加，范围为25％至37％，而在健康运动马1、3和6中，蛋白质的水平在1.07至3.43％之间，这对于健康动物的微生物组典型。在研究的马匹粪便中检测到低水平的放线菌（分杆菌）：健康运动马3分别为0.09％，健康运动马3分别为0.09％，健康马匹6分别为0.15％。相比之下，肥胖的马2、4、5和7的水平分别从0.21％到0.48％。重要的是要注意，放线菌的门还包括BiÞ多杆菌属，在所研究的任何动物中均未检测到。在乌克兰第一次，我们对七个不同年龄，性别和品种的七匹马的下肠道（粪便材料）的细菌菌群进行了测序。在肥胖马的粪便中，细菌的细菌占主导地位（天细菌粉，粉状，裂缝），尤其是来自振荡性螺丝素和lachnospileceae的家族，并伴随着细菌的降低细菌（fcylumberimteroidota）（FC-fcbe）（FC-fc-
血斑卡上动物粪便物质的 DNA 提取方案
159 图 2. 实验设置以确定适用于 DBS 的 DNA 提取和纯化方案 160。测试的不同方法是 DNA_P1) QIAsymphony® PowerFecal® Pro DNA 161 试剂盒（目录号 938036，Qiagen），包括在 FastPrep-24™ Classic 162 上以 6 m/s 的速度进行 6 轮均质化 162 60 秒，中间休息 5 分钟，然后用 163 蛋白酶 K 600 mAU/ml（Qiagen）消化，然后在 QIAsymphony® SP 164 机器人（Qiagen）上进行自动纯化。DNA_P2) 执行与 DNA_P1 相同，但不进行蛋白酶 K 处理。 DNA_P3) ZymoBIOMICS™ DNA Miniprep Kit (Zymo Research Corp., Irvine, CA, USA) 经 FastPrep-24™ Classic 匀浆化后，以 6m/s 的速度匀浆 60 秒，共 6 轮，中间间隔 5 分钟。DNA_P4) MagNA Pure 96 DNA 和 Viral NA 小容量试剂盒在 MagNA Pure 96 仪器 (Roche, Basel, Switzerland) 上进行，采用蛋白酶 K 预处理步骤和标准缓冲液，使用针对双链 DNA 和下一代测序优化的 DNA Blood ds SV 方案。其中，DNA_P1、DNA_P2、DNA_P3 和 DNA_P4 用于从模拟物、空白和猪粪便中提取 DNA，DNA_P1 在所有研究动物的粪便上进行性能测试，此外还对阳性和空白对照进行了三份重复测试。使用 DNA_P1 从牛、马、犬、羊和猪的粪便中提取 DNA，并在 Illumina NovaSeq 上进行测序，从每个样本中生成 >2000 万个 PE 读数。这些数据集用于告知所需的测序工作量。
调节肠道轴和粪便微生物组在肝硬化中的关键作用
在肠道菌群中，细菌是最近基于非培养的分子技术的出现，例如16S核糖体核糖核酸（RRNA）基因测序和shot弹枪元素分析，允许细菌的表征以及其潜在的作用，而不必在其范围内表征它们，而不必在其范围内进行表征。16S测序放大了这个高度保守的1,500个碱基对基因（在所有细菌和古细菌中发现），以允许属水平鉴定。这在很大程度上被元基因组方法取代，这些方法将样品中所有脱氧核糖核酸（DNA）序列。宏基因组方法提供了更高的系统发育分辨率，从而允许物种水平的鉴定，还可以提供有关细菌基因功能的信息。其他技术，例如转录组学
治疗抑郁症的粪便菌群移植的当前景观
抑郁症，预计是全球疾病负担的主要贡献者，是一种复杂的疾病，具有多种症状，包括情绪障碍和认知障碍。传统治疗（例如药物和心理疗法）通常会缺乏，促使人们采取了替代干预措施。最近的研究强调了肠道菌群在心理健康中的重要作用，影响了情绪和神经调节。粪便微生物群移植（FMT），从健康供体中输注粪便中的粪便中，是通过恢复肠道微生物平衡来减轻抑郁症状的有希望的策略。微生物甲状腺（MGB）轴代表了一种关键途径，通过该途径可以通过该途径能够纠正营养不良并调节神经精神上的结果。临床前研究表明，FMT可以增强神经化学物质并减少炎症标志物，从而减轻抑郁行为。此外，FMT在临床环境中表现出了希望，改善了抑郁症患者的胃肠道症状和整体生活质量。审查强调了肠脑轴在抑郁症中的作用，以及需要进一步研究以验证FMT的长期安全性和效率，确定特定的治疗性微生物菌株，并制定有针对性的微生物调节策略。促进我们对FMT的理解可以彻底改变抑郁症治疗，将范式转移到微生物组靶向疗法上。
分析多发性硬化症中粪便菌群移植的有效性
供体选择是FMT中非常关键的一步。尽管来自FDA的基于证据的指南含糊不清，但通常通过进行初步访谈来评估捐助者的危险因素，临床检查，粪便检查，以检测艰难梭菌，沙门氏菌，志贺氏菌，志甲基，shigella，Campylobacter，Escherichia coli，Giari，Giardia和Helminths和Helminths。还进行了血液学筛查，以检测巨细胞病毒，Ebstein Barr病毒和乙型肝炎A，B和C。完全的血液计数，C反应蛋白，肝功能测试和肾功能测试。一般排除标准包括传染病风险因素，慢性疾病，近期抗生素使用，新出现的胃肠道症状，最近摄入有害物质以及无法经常捐款，孕妇，哺乳母亲和吸烟者[14,15,18]。自体FMT（已加工和重新引入自态微生物）也有效地恢复肠道微生物群[19]。
关于动物粪便厌氧消化的微生物学和技术见解：评论
摘要：动物粪便的厌氧消化导致可再生能量（沼气）和富含营养的生物肥料的产生。该技术的进一步好处是减少了肥料储存过程中否则会发生的温室气体排放。由于动物粪便使厌氧的消化成本效益并进一步推进了较高甲烷产量的技术，因此最重要的是，要找到改善瓶颈的策略至关重要鸡肉，鸭子或猪粪。本综述总结了不同动物粪便的特征，并洞悉了潜在的微生物机制，从而导致厌氧消化过程引起挑战性问题。在高氨气过程中的保留时间和有机负荷速率放在了高氨气中的保留时间和有机负荷速率上，应设计和优化，以支持耐受高氨疾病的微生物，例如酸性乙酸乙酸替代性乙酸氧化细菌和氢蛋白毒素。此外，总结了用于稳定和增加动物粪便的甲烷产量的运营管理，包括支撑物质，添加微量元素或掺入氨去除技术。审查是最终的，讨论了概述动物粪便厌氧消化过程的可疑操作方法所需的研究，以规避过程不稳定性并改善过程性能。
从粪便和肠道样品中分离微生物DNA的下一代套件
用Qiaamp PowerFecal DNA（1）或Qiaamp PowerFecal Pro DNA（2）试剂盒分离出重复的1.8 ml白色念珠菌培养物的DNA。b，由第一代Qiaamp PowerFecal DNA KIT B或新的Qiaamp PowerFecal ProFecal Pro DNA Kit c制备了三个供体的粪便样品（200 mg）的C DNA。DNA。
粪便菌群与炎症性肠病的肠外表现有关
摘要简介：大部分炎症性肠病患者（IBD）经历了胃肠道外IBD相关的炎症状况，称为肠外表现（EIM），进一步降低了生活质量，在极端情况下，可能会危及生命。EIMS的发病机理仍然未知，尽管肠道菌群改变是IBD患者的众所周知的特征，但其与EIMS的关系仍然很少研究。这项研究旨在比较有没有EIM的IBD患者的肠道菌群。方法：该研究中总共包括131名IBD患者，其中86例具有EIMS（IBD-EIM）史，而45例没有（IBD-C）。粪便样品接受了16S rRNA测序。放大序列变体（ASV）映射到SILVA数据库。比较了IBD-EIM和IBD-C之间的多样性指数和距离矩阵。使用自定义多重模型统计分析方法鉴定了差异丰富的ASV，并使用稀疏相关性（SPARCC）（SPARCC）鉴定了共同相关细菌的模块，并且与患者EIM状态有关。结果：IBD患者和EIMS患者表现出疾病活性增加，体重指数，粪便钙骨蛋白钙蛋白酶水平升高以及循环单核细胞和中性粒细胞。微生物学上，IBD-EIM比IBD-C（Mann-Whitney's Test，p = .01）和独特的粪便微生物群组成（方差的置换多变量分析；加权Unifrac，r 2 = 0.018，p = .01）。共有26个ASV在IBD-EIM和IBD-C之间表现出不同的相对丰度，包括减少的Agathobacter和Blautia和IBD-Eim组中的Eggerthella lenta增加。SPARCC分析确定了27个细菌共同关联模块，其中3个与EIM（逻辑回归，p <.05）呈负相关，其中包括重要的健康相关细菌，例如Agathobacter和Agathobacter和Faecalibacterium。结论：EIMS IBD患者的粪便菌群与没有EIM的IBD患者不同，对于EIM发病机理可能很重要。
健康成年猫中主要粪便微生物群的时间变化
简单摘要：肠道菌群的组成和功能的改变与慢性肠病有关；但是，探索了肠道菌群的时间变异性。这项研究旨在评估健康成年猫中猫营养不良指数和核心细菌分类群的时间变化。包括从17只成年宠物猫那里收集的142个粪便样品。基于QPCR的猫营养不良指数用于评估粪便菌群。结果显示，在整个研究过程中，所有健康成年猫的猫营养不良指数中的时间稳定性。在两个月的单个猫中，猫营养不良指数始终在参考间隔内，并且大多数靶向细菌保留在其各自的参考间隔内。虽然观察到个体变异，但与疾病状况和抗生素使用相比，影响的幅度很小。总而言之，我们的发现表明，在没有扰动的情况下，健康成年猫中猫营养不良指数的时间稳定性。
炎症性肠病 (IBD) 中的粪便钙卫蛋白
自 2021 年 11 月 1 日起，如果满足特定条件，FC 检测将可享受 Medicare 退款。年龄≤50 岁且胃肠道症状提示炎症性或功能性肠病持续超过 6 周的患者，并向医生就诊；已排除感染性原因且恶性肿瘤可能性评估为低，且无临床警报。在任何 12 个月期间最多可进行 1 次检测。年龄≤50 岁且胃肠道症状提示炎症性或功能性肠病且无临床警报的患者，向专科胃肠病专家就诊，其初始粪便钙卫蛋白检测结果不确定（50-100 微克/克），且专科医生认为最初不需要进行内窥镜检查。在任何 12 个月期间最多可进行 1 次检测。查看 MBS Online 了解详情。