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生长猪的粪便菌群谱及其与生长性能的关系
早期的肠道微生物群组成对仔猪的健康至关重要，影响了长期的微生物组发育和免疫力。在这项研究中，将肠道大坝的肠道菌群与三个生长阶段的三个芬兰猪农场中的后代进行了比较。在出生时（初始暴露阶段），断奶（过渡阶段）和屠宰（稳定阶段）分析了三个研究开发组（良好，良好，良好和过早）粪便菌群的差异。大坝乳杆菌科的舞蹈比出生时低于小猪。limosilactobacillus reuteri和氨基杆菌在大坝及其后代中主要表达。在初始暴露阶段，用乳杆菌科确定了17头仔猪（68％），在发育组之间不均匀地划分：85％的良好，37.5％的差，占早产猪的75％。开发组的良好是微生物多样性最高的，而开发小组的多样性最低。断奶后，小猪中乳杆菌科的丰度和多功能性减少，向大坝的微生物组转移。总而言之，尽管开发组和饲养环境，猪的粪便微生物群仍倾向于向类似的α和β多样性发展。
人类粪便转移后，饮食诱导的微生物组修饰对GDM的积极影响
我们最近在《肠道》中报道说，微生物对早期妊娠糖尿病（GDM）的诊断学涉及，从第一学期开始（T1），其他小组持续表明，在第二三中（T2）和第三三年（T2）（T3）（T3）（T3）中，女性患有Microtobiota dismbibiobios。2在继续进行T1研究时，我们现在有数据表明，饮食干预措施（GDM的首选和主要治疗方法）部分通过改变肠道菌群而有效。To elucidate the causal role of the microbiome on GDM, we performed faecal micro- biota transplant (FMT) of samples from age/body mass index-matched women with and without GDM (n=5 each, table 1 and online supplemental table 1) in T2 and in T3, following dietary inter- vention, to germ-free mice to elucidate microbiome-mediated effects of diet on GDM（图1A）。对供体样品的回顾性分析表明，无论三个月如何，各组之间的不同微生物组成（图1B，C）；没有发现差异丰富的分类单元。为了检查FMT对GDM表型的影响，进行了腹膜内葡萄糖耐受性测试。在每个三体中的组之间观察到葡萄糖代谢的变化（图1d，e）。在饮食干预之前，在T2女性的FMT的小鼠中，我们发现
AGA基于粪便微生物群的临床实践指南针对精选胃肠道疾病的疗法
背景和目的：粪便菌群 - 基于粪便的疗法包括常规的粪便菌群移植和美国食品和药物管理 - 批准的疗法，粪便菌群Live-JSLM和粪便菌群孢子Live-BRPK。美国胃肠道学协会（AGA）制定了该指南，以提供有关使用粪便微生物群 - 在患有卵泡菌群的基于粪便菌群疗法的建议；严重到暴发的C差异感染；炎症性肠道疾病，包括囊炎；和肠易激综合征。方法：该指南是使用等级（评估，评估，开发和评估）框架制定的，以优先考虑临床问题，确定以患者为中心的结果并进行证据综合。指南面板使用证据到决策框架来开发用于在特定的胃肠道条件下使用基于粪便菌群的疗法的建议，并为临床实践提供了实施考虑。结果：指南面板提出了7个建议。在具有复发性C差异感染的免疫能力成年人中，AGA建议选择使用基于粪便菌群 - 基于粪便的疗法，以完成护理标准抗生素以防止复发。在有反复发作的C差异感染的轻度或中度免疫功能低下的成年人中，AGA建议选择使用常规的粪便微生物群移植。在严重免疫受损的成年人中，AGA建议反对使用任何基于粪便菌群的疗法，以防止复发性C差异。在患有严重或暴发的C差异的成年人中，AGA建议选择使用常规的粪便菌群移植。AGA建议不使用常规的粪便菌群移植作为炎症性肠道疾病或肠易激综合征的治疗，除非在临床试验的背景下。结论：基于粪便菌群 - 基于粪便的疗法是预防精选患者反复发作的C差异的有效疗法。常规的粪便微生物移植是针对患有严重或暴发的C差异感染的精选成年人的辅助治疗，对护理抗生素的标准不反应。粪便微生物群移植尚不能推荐。
从山羊粪便，瘤胃液和瘤胃肠道的单宁降解细菌的隔离和鉴定
单宁蛋白是各种植物中存在的有毒多酚，由于其涩味和苦味而导致微生物攻击和植物保护。然而，家禽饮食中的单宁含量很高会导致消化不良，阻碍营养吸收和消化。有趣的是，占据动物瘤胃和胃肠道（GIT）的几种细菌可以耐受单宁蛋白，并通过挥动单肽酶降解它们。该研究旨在隔离和表征来自几个反刍动物标本的潜在降解细菌（TDB）。根据其在最小盐介质（MSM）琼脂上与0.2％单宁酸作为唯一的碳和能量来源，基于其单宁水解能力（MSM）琼脂分离的TDB。使用MSM琼脂平板上的单宁浓度增加，表征了分离株的最大单宁耐受性。此外，在五天的孵育中还评估了单胞酶活性。总共分离了42个单宁降解器，并根据产生的水解区域选择10个TDB进行进一步表征。分子鉴定表明脑杆菌（TDB536），麦尼比杆菌（TDB17），肌动杆菌鼻虫（TDB18、20、23、24、30、35）和葡萄球菌（TDB18、23、23、24、30、35）和葡萄球菌（TDB40）（TDB40）的存在。TDB17，TDB18和TDB24在1.0％时显示出最高的单宁酸耐受性，而TDB36和TDB40的耐受性为0.4％。每个TDB都显示不同的单胞酶活动，在五天的孵化期内，范围从11.56到42.08 U/mL。TDB5和TDB35在第2天的单旋酶活性明显更高（p <0.05）。同时，TDB23和TDB24在第4天显示最高的单胞酶（P <0.05）。在分离株中，粪便中的拟曲霉菌菌株AE6（TDB24）表现出最高的tannase活性（42.08 u/ml），并代表了最佳的TDB。孤立的菌株表明它们可以减少单宁饲料中单宁的抗鼻效应的能力。关键词：杆菌菌株，鉴定，单宁酶，单宁酸，单宁降解细菌
粪便抗生素耐药性基因通过土壤 - 塞尾食品链的分布转移
（gactachvgggtatctaatcc）和341F（cctacgggnggcwgcag）用于放大土壤封闭食物链系统中每个组件的V3-V4区域。Studies have shown that the V3-V4 region of the selected bacteria can reduce genomic heterogeneity and can be closer to the full-length comparison information than other variable regions(DONG-LEI S et al.,2013).The PCR amplification reaction consisted of 1 µL of 10 mM upstream and downstream primers (805 R primer with Barcode at the 5 ' end), 25 µL of Ex Taq酶，1 µL DNA模板和22 µL DDH2O形成50 µL×2反应系统。表4-1显示了特定的PCR扩增反应条件。放大后，通过DNA纯化和恢复试剂盒（Thermo Fisher）回收产物。确定纯化产物的浓度，并将每个样品与
食用花园中的粪便使用：繁荣花园和安全收获的最佳实践
您是否想知道将肥料涂在土壤上后发生了什么？将动物粪便应用于花园或蔬菜地块，从而增加了土壤动物群的丰富度，尤其是细菌，真菌和earth。因此，土壤呼吸和养分矿化增加。养分矿化是通过土壤微生物（例如死动植物）等有机材料的分解，它们将这些材料转化为可用的植物无机形式。您可能听说过，一茶匙土壤中的生物数量可能超过90亿。尽管土壤微生物仅占土壤体积的一小部分，但它们起着非常重要的作用。有机修正案（例如动物粪便）在农业土壤中的应用是传统园艺的替代实践，可改善土壤质量，提供养分和碳，促进微生物的多样性和活动，并改善土壤结构。
SARS-COV-2，胡椒温和的斑点病毒和crassphage的纵向和定量粪便脱落动力学
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证是根据作者/资助者提供的，他已授予Medrxiv的许可证，以永久显示预印本。（未通过同行评审认证）
SARS-COV-2，胡椒温和的斑点病毒和crassphage的纵向和定量粪便脱落动力学
在2019年冠状病毒病（COVID-19）中出现了基于废水的流行病学（WBE），这是一种可扩展且广泛适用的方法，用于社区级别监测感染性疾病负担。缺乏严重急性呼吸综合征2（SARS-COV-2）的高分辨率粪便脱落数据限制了我们将WBE测量与疾病负担联系起来的能力。在这项研究中，我们提出了SARS-COV-2 RNA的纵向，定量的粪便脱落数据，以及常用的粪便指标胡椒轻度斑驳病毒（PMMOV）RNA和Crass-like-Phage（Crassphage）DNA。来自48个SARS-COV-2感染者的脱落轨迹表明，SARS-COV-2 RNA粪便脱落的高度个性化的动态过程。提供了至少三个跨越超过14天的粪便样品的个体，有77％的个体有一个或多个样品对SARS-COV-2 RNA呈阳性。，我们在所有个体的至少一个样本中检测到PMMOV RNA，总体上96％（352/367）的样本中检测到了PMMOV RNA。crassphage DNA，并在所有样品的48％（179/371）中检测到。所有个体的粪便中PMMOV和Crassphage的几何平均浓度均为8.7×10 4
不饱和多孔介质中粪便指标细菌的运输和保留：瞬态水流的影响
摘要用于生产清洁饮用水的摘要，即在瞬态水流中不饱和区域中细菌重新启动的过程至关重要。尽管含有含水的含水层补给是处置病原体的有效方法，但人们担心沉淀后的重新固定。可以更好地了解最初保留在多孔培养基中的细菌如何由于瞬态水含量，运输实验和大肠杆菌和肠球菌摩拉维氏菌的建模而释放到地下水中。用细菌悬浮液接种沙丘砂柱后，以24小时的间隔进行了三个降雨事件。收集了从沙柱中的EF充足，以分析细菌突破曲线（BTC）。降雨实验后，确定了砂柱中的细菌分布。使用不同的模型概念（包括一站动力学附件/脱离（M1），Langmuirian（M2），Langmuirian和Blocking（M3）和两站点附件/分离（M4），使用不同的模型概念（M1），Langmuirian（M2）和两站附件（M4）对收集的BTC和ProFEL保留进行建模。接种后，几乎99％的细菌保留在土壤中。M1和M2细菌模型在观察到的浓度和建模浓度之间具有很高的一致性，并且附着和脱离是在水流中具有频率的多孔培养基中调节细菌运动的两种显着机制。在体验结束时，大多数细菌仍在5 cm至15 cm的深度范围内发现。我们的实验表明，大肠杆菌在沙质土壤中比大肠杆菌更可移动。这项研究的结果还表明，不饱和区是土壤表面和地下水微生物污染之间的重要障碍。需要进行后续研究，以完全理解调节在沙丘砂中未诱发的区域中细菌重新临床的变量。