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World File Search System组织学
使用综合的DICECT和组织学工作流对大鼠大脑的多尺度成像
pH 7.4）并在4ºC下与以下主要抗体一起孵育：（1）小鼠单克隆抗白蛋白（PRV）抗体（no。235，Swant Inc.，瑞士Marly），稀释1：1000； （2）小鼠单克隆抗纤维纤维抗原蛋白（GFAP）（no。） 3670，细胞信号技术，美国马萨诸塞州丹佛市），稀释1：500;或（3）山羊多克隆抗DARPP-32（no。 SC-271111，圣克鲁斯生物技术，美国德克萨斯州达拉斯），稀释1：200。 在4°C的PBS中孵育24小时0.1M Triton X-100，其中包含3％驴血清（no。 SC-2044，圣克鲁斯生物技术）。 冲洗后，在两个小时的室温下与以下二次抗体之一的一种与偶联的荧光染色体一起孵育两小时，将组织免受光的保护：（1）Alexa Fluor 488驴抗小鼠（no。235，Swant Inc.，瑞士Marly），稀释1：1000； （2）小鼠单克隆抗纤维纤维抗原蛋白（GFAP）（no。3670，细胞信号技术，美国马萨诸塞州丹佛市），稀释1：500;或（3）山羊多克隆抗DARPP-32（no。SC-271111，圣克鲁斯生物技术，美国德克萨斯州达拉斯），稀释1：200。在4°C的PBS中孵育24小时0.1M Triton X-100，其中包含3％驴血清（no。SC-2044，圣克鲁斯生物技术）。冲洗后，在两个小时的室温下与以下二次抗体之一的一种与偶联的荧光染色体一起孵育两小时，将组织免受光的保护：（1）Alexa Fluor 488驴抗小鼠（no。A32766 Thermo Fisher Scientific）稀释1：500;或（2）Alexa Fluor 488驴抗山羊（no。705-545-147杰克逊实验室，
HERBS：啮齿动物脑空间的组织学电子数据注册
过去十年，啮齿动物的记录技术取得了巨大进步，使用户可以同时从多个大脑区域采样数千个神经元。这促使人们需要数字工具包来帮助整理解剖数据，但是，现有工具要么功能有限，要么要求用户精通编码才能使用它们。为了解决这个问题，我们创建了 HERBS，这是一种针对啮齿动物用户的综合新工具，它通过用户友好的图形用户界面提供广泛的功能。在实验之前，HERBS 可用于规划植入电极、靶向病毒注射或示踪剂的坐标。实验后，用户可以注册记录电极位置（例如 Neuropixels、四极体）、病毒表达或其他解剖特征，并以 2D 或 3D 形式可视化结果。此外，HERBS 可以描绘组织切片中多次注射的表达并获得单个细胞计数。 HERBS 中的区域划分基于来自 Sprague Dawley 大鼠脑 Waxholm 空间图集或 Allen 小鼠脑图集的带注释的 3D 体积。HERBS 允许用户滚动浏览数字脑图集，并提供自定义角度切片，并支持将组织切片自由转换为图集切片。此外，HERBS 还允许用户使用来自单个动物的组织重建 3D 脑网格。HERBS 是一个多平台开源 Python 包，可在 PyPI 和 GitHub 上获取。
机器学习根据MRI纹理分析预测犬胶质瘤的组织学类型和等级
大脑的恶性肿瘤，尤其是高级神经胶质瘤（HGG），是人类已知的最致命的肿瘤之一，尽管经过数十年的深入研究，但生存率很低[1-4]。手术切除与辅助无线电/化学疗法相结合是HGG的一线治疗[5-7]，切除程度的增加与更好的患者生存率相关[8-11]。因此，在大多数情况下，完全或接近总切除术是至关重要的，并且仍然是神经外科医生的最终目标。然而，腹膜组织的过度侵略性切除倾向于对患者的神经功能造成额外和持久或永久损害，对患者的生活质量和预后产生负面影响[12]。因此，对脑肿瘤患者进行手术仍然是太广泛和太少切除之间的挑战。此外，清楚地鉴定了脑肿瘤组织以及周围的健康或不太浸润的组织，包括其潜在雄辩的纤维区域对于获得最佳的临床结果至关重要。可以注意到，这种方法不仅可以在检测脑肿瘤的检测中有用，还可以在术中分化其他脑组织病理学（例如创伤后受伤的大脑[13]）[13]，在这种情况下，受影响和未受影响的组织的明显分化是本质的。现代脑外科手术的当前局限性包括周围健康脑和肿瘤组织之间的对比度不佳，以及缺乏通过A
人类和猪急性自发性心肌梗死后心脏淋巴结的形态和组织学变化
SAN 功能障碍可能导致复杂且致命的心律失常 [11, 12]，从而导致心房颤动和心力衰竭等心脏疾病，常导致晕厥和心源性猝死 [13, 14]。SAN 功能障碍的特征性体征包括持续性心动过缓、短暂或持续性窦性停搏以及心动过缓-心动过速综合征 [15, 16]，可在人类心肌梗死 (MI) 急性期观察到 [17, 18]。 SAN 中的胶原网络可以为节点细胞、血管、神经纤维和其他类型的支持细胞提供结构支撑，从而稳定地连接节点的所有组成部分。这种胶原还可以为起搏细胞提供机械保护，防止周围心肌收缩引起的过度拉伸 [19]。健康人类 SAN 由 35%–55%
连续肝脏常热机灌注对组织学胆管损伤严重程度的影响
静态冷藏（SCS）损伤了胆管，而常规机器灌注（NMP）的影响尚不清楚。在肝脏NMP的COPE试验的一个子研究中，我们研究了保存类型对组织学胆管损伤评分（BDIS）的影响。在保存结束时或重新灌注后至少有一个胆管活检的移植物。 bdis是通过评估周围腺体损伤，基质和壁画损失，出血和血栓形成来确定的。 一个双变量线性模型比较了组之间的BDI（估计，CI）。 分析了六十五个移植和85次活检。 用SCS保留了23个移植物和42个NMP，具有可比的基线特征，除了NMP中的冷缺血时间较短。 无论保存类型如何，BDI都会随着时间的推移而增加（p = 0.04）。 在NMP [8.02（7.40 - 8.65）]中，BDIS估计值高于SCS [5.39（4.52 - 6.26），p <0.0001]，无论时间如何。 每组中的一名患者出现缺血性胆管病，NMP保存的肝脏为6例。 在其他六个NMP移植物中，BDIS范围为7 - 12，而没有缺血性胆管病的发展。 总而言之，BDI会随着时间的推移增加，而NMP中较高的BDI并未增加缺血性胆管病。 因此，BDI可能会高估肝NMP后这种风险。在保存结束时或重新灌注后至少有一个胆管活检的移植物。bdis是通过评估周围腺体损伤，基质和壁画损失，出血和血栓形成来确定的。一个双变量线性模型比较了组之间的BDI（估计，CI）。分析了六十五个移植和85次活检。用SCS保留了23个移植物和42个NMP，具有可比的基线特征，除了NMP中的冷缺血时间较短。无论保存类型如何，BDI都会随着时间的推移而增加（p = 0.04）。在NMP [8.02（7.40 - 8.65）]中，BDIS估计值高于SCS [5.39（4.52 - 6.26），p <0.0001]，无论时间如何。每组中的一名患者出现缺血性胆管病，NMP保存的肝脏为6例。在其他六个NMP移植物中，BDIS范围为7 - 12，而没有缺血性胆管病的发展。总而言之，BDI会随着时间的推移增加，而NMP中较高的BDI并未增加缺血性胆管病。因此，BDI可能会高估肝NMP后这种风险。
BigBrainWarp 工具箱用于将 BigBrain 3D 组织学与多模态神经成像相结合
1 加拿大蒙特利尔麦吉尔大学蒙特利尔神经病学研究所和医院麦康奈尔脑成像中心；2 德国于利希研究中心神经科学与医学研究所（INM-1）；3 加拿大蒙特利尔康考迪亚大学计算机科学与软件工程系；4 英国伦敦大学学院威康信托神经影像中心；5 加拿大安大略省西安大略大学大脑与思维研究所；6 德国莱比锡马克斯普朗克人类认知与脑科学研究所奥托哈恩认知神经遗传学小组；7 德国于利希研究中心神经科学与医学研究所（INM-7）；8 加拿大伦敦西安大略大学舒立克医学与牙科学院医学生物物理学系
新西兰兔脑组织学染色方法中灰质与白质的区分
材料和方法：本研究使用 14 个月大的新西兰兔的脑组织。将脑组织横向切片，以使其适合组织学程序。为此，将脑组织放在毫米纸上，切成三等份。将获得的样本从同一侧从头到尾切成 10μm 厚，并用六种染色方法对载玻片进行染色。通过显微镜将每张载玻片拍摄为 jpeg 格式。将获得的切片图像传输到 Image J 程序以估计其面积。使用李克特量表调查染色方法是否适合确定脑中灰质和白质以及细胞群的边界。作为这些程序的结果，获得的数据的统计结果以表格和图形呈现。
四种神经炎症性疾病中灰质萎缩的独特虚拟组织学
灰质（GM）萎缩在多发性硬化症，神经肌炎选择性谱系障碍[NMOSD;抗Aquaporin-4抗体阳性（AQP4+）和 - 阴性（AQP4-）亚型]和髓磷脂少突胶质细胞糖蛋白抗体相关疾病（Mogad）。揭示这些疾病中脑萎缩的发病机理将有助于其鉴别诊断并指导治疗策略。确定多发性硬化症，AQP4+ NMOSD，AQP4-NMOSD和MOGAD中GM萎缩的神经生物学基础，我们进行了虚拟的组织学分析，该虚拟组织学分析将T1加权图像派生的GM Atrophy+ Gene表达与MultiCentRe COLES的患者相关联，与3224患者有关75例AQP4 -NMOSD患者，47例Mogad患者和2169名健康对照组患者。首先，使用Cohen d在具有多发性硬化症，AQP4+ NMOSD，AQP4- NMOSD或MOGAD或MOGAD和健康对照组之间的Cohen D之间确定了整个皮质和皮质下区域的GM间GM萎缩谱。然后将GM萎缩谱分别与从艾伦人脑图集提取的基因表达水平分别在空间上相关。最后，我们使用亚组分析探索了临床功能相关的GM萎缩的虚拟组织学，该分析通过身体残疾，疾病持续时间，复发次数，病变负担和认知功能进行分层。多发性硬化症显示出严重的GM萎缩模式，主要涉及皮层核和脑干。AQP4+ NMOSD显示出明显的GM萎缩的广泛模式，主要位于枕骨Tex和小脑中。AQP4- NMOSD显示出轻度的GM萎缩模式，主要位于额叶和顶叶皮层。mogad显示GM萎缩主要涉及额叶和颞皮质。High expres sion of genes specific to microglia, astrocytes, oligodendrocytes and endothelial cells in multiple sclerosis, S1 pyram idal cells in AQP4+ NMOSD, as well as S1 and CA1 pyramidal cells in MOGAD, had spatial correlations with GM atrophy profile, while no atrophy profile-related gene expression was found in AQP4 - NMOSD。与四种NeuroInflam疾病中的临床纤维相关GM萎缩的虚拟组织学主要指向共享的神经元和内皮细胞。独特的潜在虚拟组织学模式是小胶质细胞，星形胶质细胞和少突胶质细胞，用于多发性巩膜； AQP4+ NMOSD的星形胶质细胞；和摩盖德的少突胶质细胞。神经元和内皮细胞是在这些神经炎症性疾病中共有的靶标。这些发现可能有助于对这些疾病的鉴别诊断，并促进最佳治疗策略的使用。
人工智能的反馈提高了初级内镜医师对胃病变组织学预测的学习
使用人工智能辅助图像分类器对初级内镜医师进行胃病变组织学预测培训的初步效果。方法 在具有五个卷积层和三个完全连接层的卷积神经网络上构建人工智能图像分类器，通过 2,000 个未放大的内镜胃图像训练 Resnet 主干。独立验证集由来自 100 个胃病变的另外 1,000 个内镜图像组成。六名初级内镜医师审查了验证集的第一部分，然后向其中三名（A 组）披露人工智能的预测，而其余三名（B 组）未提供此信息。所有内镜医师都独立审查了验证集的第二部分。结果 AI 的总体准确率为 91.0 %（95 % CI：89.2 – 92.7 %），敏感度为 97.1 %（95 % CI：95.6 – 98.7 %），特异度为 85.9 %（95 % CI：83.0 – 88.4 %），ROC 曲线下面积 (AUROC) 为 0.91（95 % CI：0.89 – 0.93）。在两个验证集中，AI 的准确度和 AUROC 均优于所有初级内镜医师。在第二个验证集中，A 组内镜医师的表现有所提高，但 B 组内镜医师没有提高（准确度为 69.3 % 到 74.7 %；P = 0.003）。结论 训练后的 AI 图像分类器可以准确预测胃病变中是否存在肿瘤成分。人工智能图像分类器的反馈还可以加快初级内窥镜医师预测胃病变组织学的学习曲线。
使用 VERDICT-MRI 全面表征脑肿瘤：通过组织学验证的细胞和血管测量评估
摘要：本研究旨在扩展 VERDICT-MRI 框架以建模脑肿瘤，从而能够全面表征肿瘤内和肿瘤周围区域，特别关注细胞和血管特征。在 21 名患有不同类型脑肿瘤且具有各种细胞和血管特征的患者中，我们获取了具有多个 b 值（范围从 50 到 3500 s/mm 2 ）、扩散时间和回声时间的扩散 MRI 数据。我们根据不同类型的细胞内、细胞外和血管区室与信号的组合，拟合了一系列扩散模型。我们使用简约标准比较了这些模型，同时力求对所有关键组织学脑肿瘤成分进行良好表征。最后，我们评估了在区分肿瘤组织型方面表现最佳的模型的参数，使用 ADC（表观扩散系数）作为临床标准参考，并将其与组织病理学和相关灌注 MRI 指标进行了比较。在脑肿瘤中，VERDICT 的最佳模型是一个三室模型，该模型考虑了各向异性受阻和各向同性限制扩散以及各向同性伪扩散。VERDICT 指标与低级别神经胶质瘤和转移瘤的组织学外观相符，并反映了组织病理学在肿瘤内多个活检样本之间发现的差异。组织型之间的比较表明，在细胞含量高的肿瘤（胶质母细胞瘤和转移瘤）中，细胞内分数和血管分数往往较高，定量分析表明，随着神经胶质瘤等级的增加，肿瘤核心内的细胞内分数（fi）值呈升高趋势。我们还观察到，与胶质母细胞瘤和 WHO 3 胶质瘤周围的浸润性水肿相比，转移瘤周围的血管源性水肿中自由水分数呈更高的趋势，